In drug discovery, it is not sufficient for a lead compound to exhibit high binding affinity for the target protein alone. It is equally important to predict an optimal pharmacokinetic (PK) profile that reflects the physicochemical properties of the compound. In this study, we aimed to predict human PK by jointly employing physiologically based pharmacokinetic (PBPK) simulation and chemical graph convolutional neural networks (CGCNN) models. Using a hybrid approach that combines PBPK simulation with CGCNN models, we successfully constructed a model capable of predicting human area under the co
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Machine learning models have emerged as powerful tools for drug discovery of lead compounds. Nevertheless, despite notable advances in model architectures, research on more reliable and physicochemical-based descriptors for molecules and proteins remains limited. To address this gap, we introduce the Fragment Integral Spectrum Descriptor (FISD), aimed at utilizing the spatial configuration and electronic structure information of molecules and proteins, as a novel physicochemical descriptor for virtual screening models. Validation demonstrates that the combination of FISD and a classical neural
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The small-molecule inhibitor of ataxia telangiectasia and Rad3-related protein (ATR), elimusertib, is currently being tested clinically in various cancer entities in adults and children. Its preclinical antitumor activity in pediatric malignancies, however, is largely unknown. We here assessed the preclinical activity of elimusertib in 38 cell lines and 32 patient-derived xenograft (PDX) models derived from common pediatric solid tumor entities. Detailed in vitro and in vivo molecular characterization of the treated models enabled the evaluation of response biomarkers. Pronounced objective res
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dyslexia is a genetic and heritable disorder that has yet to discover the treatment of it, especially at the molecular and drug intervention levels. This review provides an overview of the current findings on the environmental and genetic factors involved in developmental dyslexia. The latest techniques used in diagnosing the disease and macromolecular factors findings may contribute to a higher degree of development in detangling the proper management and treatment for dyslexic individuals. Furthermore, this review tried to put together all the models used in the current dyslexia research for
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ageing is the greatest risk factor of late-onset neurodegenerative diseases. In the realm of sporadic tauopathies, modelling the process of biological ageing in experimental animals forms the foundation of searching for the molecular origin of pathogenic tau and developing potential therapeutic interventions. Although prior research into transgenic tau models offers valuable lessons for studying how tau mutations and overexpression can drive tau pathologies, the underlying mechanisms by which ageing leads to abnormal tau accumulation remains poorly understood. Mutations associated with human p
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endogenous Cushing's syndrome is characterized by unique clinical features and comorbidities, and progress in the analysis of its genetic pathogenesis has been achieved. Moreover, prescribed glucocorticoids are also associated with exogenous Cushing's syndrome. Several animal models have been established to explore the pathophysiology and develop treatments for Cushing's syndrome. Here, we review recent studies reporting animal models of Cushing's syndrome with different features and complications induced by glucocorticoid excess. Exogenous corticosterone (CORT) administration in drinking wate
ОбзорСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) is a progressive neurodegenerative disorder. Familial AD accounts for less than 1% of cases, while sporadic AD (SAD) accounts for over 95%. Mild cognitive impairment (MCI) is the critical transition phase from normal aging to AD dementia. Understanding the pathological progression from MCI to AD and the mechanisms underlying SAD is essential. Rodent models, including transgenic and non-transgenic models, are vital tools for developing effective AD therapies. However, transgenic models primarily mimic familial AD and poorly replicate MCI and the complex pathological fea
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite antiretroviral therapy's success in human immunodeficiency virus (HIV) management, no cure or preventive vaccine exists; three-dimensional (3D) human tissue models-emerging from biomedical research, tissue engineering, and microfluidics-offer new potential, yet a scientometric analysis of their progress remains lacking. We reviewed the current status of three in vitro 3D models for HIV research: organoids, organ-on-a-chip, and 3D bioprinting. We conducted a bibliometric comparative analysis of 3D human tissue models in HIV research. A total of 852 documents published between 2014 and 2
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objectives of the International Society for Hepatic Encephalopathy and Nitrogen Metabolism Commission were to identify well-characterized animal models of hepatic encephalopathy (HE) and to highlight areas of animal modelling of the disorder that are in need of development. Features essential to HE modelling were identified. The best-characterized animal models of HE in acute liver failure, the so-called Type A HE, were found to be the hepatic devascularized rat and the rat with thioacetamide-induced toxic liver injury. In case of chronic liver failure, surgical models in the rat involving end
РекомендацииСтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Here, we present a protocol for evaluating auditory function and synaptic molecular-structural integrity in mice, specifically female GluA3-knockout (GluA3KO) mice raised in quiet or ambient sound levels. We describe steps for combining auditory brainstem response recordings, immunofluorescence, and electron microscopy. We detail procedures for assessing hearing function, the expression and localization of α-amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic acid (AMPA)-type glutamate receptor subunits, and the ultrastructure of cochlear-ribbon synapses. This protocol provides a reproducible framew
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While chronic heart failure (CHF) treatment has considerably improved patient prognosis and survival, the therapeutic management of acute heart failure (AHF) has remained virtually unchanged in the last decades. This is partly due to the scarcity of pre-clinical models for the pathophysiological assessment and, consequently, the limited knowledge of molecular mechanisms involved in the different AHF phenotypes. This scientific statement outlines the different trajectories from acute to CHF originating from the interaction between aetiology, genetic and environmental factors, and comorbidities.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic myelomonocytic leukemia (CMML) includes components of both myelodysplastic syndrome and myeloproliferative neoplasms and is associated with a characteristic peripheral monocytosis. CMML is caused by the proliferation of an abnormal hematopoietic stem cell clone and may be influenced by microenvironmental changes. The disease is rare and has undergone revisions in its classification. We review the recent classification strategies as well as diagnostic criteria, focusing on CMML's genetic alterations and unique pathophysiology. We also discuss the latest molecular characterization of the
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Marfan syndrome (MS) is a congenital disorder of the connective tissue characterized by aortic dilation with frequent progression to aortic aneurysms requiring surgical intervention. Although mutations in the fibrillin-1 (FBN1) gene have been recognized as the genetic cause of MS a long time ago, only recently deeper knowledge of the molecular mechanisms underlying fibrillin-1 biology and the crucial role of transforming growth factor-β and angiotensin II receptor type 1 antagonists have been elucidated. This review focuses on the most commonly used animal models to investigate the molecular m
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Combined molecular dynamics (MD) and quantum mechanical/molecular mechanical (QM/MM) calculations were performed on the crystal structure of the reduced membrane-bound [NiFe] hydrogenase (MBH) from Ralstonia eutropha to determine the absolute configuration of the CO and the two CN(-) ligands bound to the active-site iron of the enzyme. For three models that include the CO ligand at different positions, often indistinguishable on the basis of the crystallographic data, we optimized the structures and calculated the ligand stretching frequencies. Comparison with the experimental IR data reveals
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The paper describes a method for the estimation of solubility (log S) of a series of 45 barbiturates employing 26 molecular descriptors. The molecular descriptors used being distance-based topological indices, information indices, valence connectivity index, shape indices, first-order Randic index. In addition, an indicator parameter was also used. The regression analysis has shown that an R(2) value of 0.885 was obtained in multi-parametric regression analysis. The results are discussed critically using a variety of statistical parameters. The predictive powers of the models were discussed by
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular mimicry is a hallmark of the pathogenesis of rheumatic fever where the streptococcal group A carbohydrate epitope, N-acetyl glucosamine, and the a-helical coiled-coil streptococcal M protein structurally mimic cardiac myosin in the human disease, rheumatic carditis, and in animal models immunized with streptococcal M protein and cardiac myosin. Recent studies have unraveled the potential pathogenic mechanisms by which the immune response against the group A streptococcus attacks the rheumatic valve leading to chronic rheumatic heart disease. Both B- and T-cell responses are involved
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Given the clinical impact of LMNA cardiomyopathies, understanding lamin function will fulfill a clinical need and will lead to advancement in the treatment of heart failure. A multidisciplinary approach combining cell biology, atomic force microscopy (AFM), and molecular modeling was used to analyse the biomechanical properties of human lamin A/C gene (LMNA) mutations (E161K, D192G, N195K) using an in vitro neonatal rat ventricular myocyte model.
METHODS AND RESULTS: The severity of biomechanical defects due to the three LMNA mutations correlated with the severity of the clinical phenot
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Reliable biomarkers for predicting neoadjuvant chemotherapy (NAC) response in triple-negative breast cancer (TNBC) remain limited. We explored whether RecurIndex-derived molecular features were associated with total pathological complete response (tpCR).
METHODS: Seventy-four patients with TNBC treated with dose-dense NAC were analyzed. Associations between RecurIndex risk scores, 18 core genes, and tpCR were assessed using logistic regression and ROC analyses. Clinical-molecular models were internally validated by bootstrap resampling. Public single-cell RNA-seq data were used fo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding the toxicological mechanisms of food contaminants is critical for assessing risks to human health. This review comprehensively examines their adverse effects, tracing the pathway from molecular initiation to systemic organ-level damage. A central focus is placed on the growing trust on computational methods as ethical and practical alternatives to traditional animal testing. The discussion encompasses a multi-scale assessment, detailing atomic-level interactions through Density Functional Tight Binding Molecular docking and Molecular Dynamics (MD) simulations, analyses of toxicit
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiovascular calcification is a multifactorial and complex process involving an array of molecular mechanisms eventually leading to calcium deposition within the arterial walls. This process increases arterial stiffness, decreases elasticity, influences shear stress events and is related to an increased risk of morbidity and mortality associated with cardiovascular disease. In numerous in vivo and in vitro models, warfarin therapy has been shown to cause vascular calcification in the arterial wall. However, the exact mechanisms of calcification formation with warfarin remain largely unknown,
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.