Oral HPV DNA and circulating tumor (ct) HPV DNA in plasma were evaluated as potential biomarkers for HPV-associated head and neck cancer (HNC). Samples from HNC patients (n = 132), including 23 oropharyngeal cancers (OPC), and non-HNC controls (n = 10) were analyzed. HPV status was determined using a multiplex bead-based test (E7-MPG) applied to formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues (n = 90), plasma (n = 141), gargle samples (n = 141), and oral swabs (n = 142). HPV DNA was detected in 25.8% of HNC tissues, 12% of plasma samples, 20.6% of gargles and 7% of oral swabs with HPV16 as the…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lymphoma is a common hematological malignancy with diverse morphological and immunophenotypic characteristics that may affect treatment and outcomes. Thus, accurate differential diagnosis is crucial, and molecular genetic testing is valuable. We aimed to investigate the genetic characteristics of Korean patients with lymphoma using a next-generation sequencing (NGS)-based targeted panel.
METHODS: We designed a panel covering 588 genes clinically and diagnostically relevant in lymphoma through a literature review and performed targeted panel sequencing of 34 formalin-fixed paraffin…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We aim to investigate the molecular heterogeneity of Burkitt lymphoma (BL) by analyzing the impact of age and Epstein-Barr virus (EBV) infection on protein expression in tumor tissues. Using liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS), we performed proteomic analysis on 10 formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) BL tissue samples (5 adults, 5 pediatric; stratified by EBV status) alongside clinical data from 273 BL patients. Clinically, pediatric patients showed higher lactate dehydrogenase (LDH) levels and advanced tumor stages (P < 0.05), while EBV-positive cases exhibited unique metastat…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pilonidal sinus disease (PSD) is a chronic inflammatory condition thought to result from the insertion of external hairs through the epiderm … ferences between PSD and HS. Using 70 patient tissues and 19 normal skin controls in formalin-fixed paraffin-embedded tissues, protein expressions of cytokeratin 5/6, KLK7, filaggrin, envoplakin, and EPHA2 were analyzed in the epithelium of PSD and HS lesions using immunohistochemistry. Additionally, iron levels, hair shaft presence, and multinucleated mac …
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-resolution single-cell spatial proteomics offers transformative insights into cellular diversity, architecture, interactions, and funct … he same specimen. Utilizing this technique, we quantified 38 proteins within a human formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tonsil tissue, which represents the highest target multiplexing capacity achieved to date using tyramide signal amplification (TSA) methods. Analysis of ∼500,000 individual cells in the same tissue revealed distinct cell clusters bas …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Oropharyngeal squamous cell carcinoma (OPC) associated with high-risk human papillomavirus (HPV), particularly HPV-16, generally shows favorable outcomes yet paradoxically exhibits a high incidence of early lymphatic metastasis. The immune mechanisms underlying this phenomenon remain unclear.
METHODS: We conducted an exploratory spatial transcriptomic analysis using the GeoMx Digital Spatial Profiler on formalin-fixed, paraffin-embedded samples from six patients with palatine tonsil-derived OPC. Tumor tissue regions (TTRs) and lymphoid follicular regions (LFRs) were compared acc…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral infections in humans and animals are increasing, and retrospective studies using formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) samples reveal recurring outbreaks over past decades. However, the impact of pre-analytical factors like fixation and autolysis on immunohistochemistry (IHC) remains insufficiently understood. To examine how autolysis, fixation duration (6-72 h) and formalin concentration (2.5-25%) influence histology and IHC of canine distemper virus (CDV, Morbillivirus canis), interferon-β (IFN-β), and selected IFN-stimulated genes (ISGs), the study was conducted using an in vitro m…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microinfarcts and microhemorrhages are characteristic lesions of cerebrovascular disease. Although multiple studies have been published, the … s Alzheimer's Disease Research Center brain bank with hematoxylin and eosin-stained formalin-fixed, paraffin-embedded sections across 3 anatomical areas: frontal, parietal, and occipital lobes (40 WSIs with microinfarcts and/or microhemorrhages, 26 without). We propose a multiple field-of-view prediction step to mitigate false positives. We report screenin …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Studies spanning decades provide important information about the epidemiology and occurrence of a broad range of diseases that affect the central nervous system (CNS) of dogs. This study analyzed records and formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) CNS tissue samples from necropsied dogs with neuropathologic changes between 1962 and 2022. A total of 134,854 animals, including 20,117 dogs, were submitted for necropsy during this time span. Of these dogs, 2646 displayed alterations of the CNS. Degenerative and non-suppurative inflammatory lesions were the most common changes, accounting for 35.6%…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HIV infection and comorbid methamphetamine (METH) use contribute significantly to neurocognitive impairment, yet the molecular brain alterations remain poorly defined. We employed confocal Raman micro-spectroscopy on formalin-fixed, paraffin-embedded cortical sections from Control (HIV-METH-), HIV + METH-, and HIV + METH + individuals, analyzing spectra (950-1800 cm-1) via SVD and classification modeling. Key Raman bands were biochemically assigned and correlated with gene expression data from QPCR. Distinct spectral profiles emerged across cohorts. HIV + and HIV + METH + brains showed reduced…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Asthma is a recognized risk factor for nontuberculous mycobacterial (NTM) pulmonary infections, yet the precise routes of infection and diss … we utilized a three-dimensional merged whole block imaging (WBI) technique. Fifteen formalin-fixed paraffin-embedded tissue blocks from the resected lung were individually scanned using a custom-built micro-computed tomography system, reconstructed, and combined to generate merged-WBI. Three core merged-WBIs revealed that the remodeled asthma-associated a …
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Piscine lactococcosis poses a significant threat to a wide range of cultured and wild fish populations worldwide, typically presenting as ac … t pathogens in 146 field tissue samples, including tissues preserved in 70% ethanol, formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues and tissues fixed on FTA cards. Compared to classical bacteriology, the multiplex qPCR assay yielded higher detection rates and enabled precise identification of the causative species of piscine lactococcosis. Overall, the mu …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Scabies, caused by Sarcoptes scabiei var. hominis, remains difficult to diagnose in histological routine when mite fragments are sparse or degraded. We explored whether Fourier-transform infrared (FTIR) microscopy can detect chitin-associated spectral signatures of scabies mites in formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) human skin sections and distinguish them from surrounding host tissue. FFPE sections from six patients with histologically confirmed crusted scabies were analysed by FTIR imaging, univariate mapping of selected bands, and multivariate image analysis within the 1000-1200 cm-1 c…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Colorectal cancer liver metastasis (CRLM) and hepatocellular carcinoma (HCC) are both high incidence tumors in China. In certain poorly differentiated cases they can exhibit comparable imaging and pathological characteristics, which impedes accurate clinical diagnosis. The use of protein-based techniques with tissue slides offers a more precise means to assess pathological changes and has the potential to assist with tumor diagnosis.
METHODS: A simple in situ protein digestion protocol was established for protein fingerprint analysis of paraffin-embedded tissue slide samples. Addi…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Well-differentiated neuroendocrine tumor (NET) and poorly differentiated neuroendocrine carcinoma (NEC) are distinct entities with different … ive for synaptophysin, chromogranin A, cluster of differentiation 56 (CD56), and focally hepatocyte paraffin 1. p53 showed wild-type expression. The Ki-67 labeling index was 27% at the hot spot. Eleven months after the surgery, he died of a cerebral hemorrhage without evidence of recurrent liver cancer. The intermediate degree of differentiation and the mo …
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/PURPOSE: This retrospective immunohistological pilot study aimed to investigate the influence of natural killer group 2, member D … istocompatibility complex class I chain-related molecule (MIC) A/B, was evaluated in formalin-fixed paraffin-embedded tumor tissues via immunohistochemistry assays. Furthermore, the patients' electronic medical records were reviewed. Multivariate Cox regression analysis was conducted, and data were expressed as adjusted hazard ratios [HRs] with 95% confide …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liver fibrosis (LF) is a clinical disorder characterized by inflammation and excessive accumulation of extracellular matrix (ECM). This stud … ed hepatic inflammation, ECM accumulation, and HSC activation. IHC staining of Ki-67 and hepatocyte paraffin-1 revealed that PFD enhanced liver regeneration. The research confirmed that PFD gradually downregulated elevated eIF6, P311, and TGF-β levels in BDL-induced LF. These findings suggest that PFD could be a potential treatment for LF, as it may help a …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To investigate the ocular safety profile of topical perchlorate as a potential preventive treatment for nasolacrimal obstruction as … Seven days after the first dose, the rats were euthanized and OU were harvested, fixed, embedded in paraffin, and stained with H&E and Masson's trichrome using standard techniques.
RESULTS: The data collected over the 7 days revealed no behavior changes or ocular complications in any of the 3 study groups. Pathologic analysis of the corneas revealed norma …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The Colorectal Cancer Subtyping Consortium established four Consensus Molecular Subtypes (CMS) in colorectal cancer: CMS1 (microsatellite-instability [MSI], Immune), CMS2 (Canonical, epithelial), CMS3 (Metabolic), and CMS4 (Mesenchymal). However, only MSI tumour patients have seen a change in their disease management in clinical practice. This study aims to characterise the proteome of colon cancer CMS and broaden CMS's clinical utility.
METHODS: One-hundred fifty-eight paraffin samples from stage II-III colon cancer patients treated with adjuvant chemotherapy were analysed throug…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ground glass hepatocytes (GGHs) have been associated with hepatocellular carcinoma (HCC) recurrence and poor prognosis. We previously demonstrated that pre-S expression in some GGHs is resistant to current hepatitis B virus (HBV) antiviral therapies. This study aimed to investigate whether integrated HBV DNA (iDNA) is the primary HBV DNA species responsible for sustained pre-S expression in GGH after effective antiviral therapy. We characterized 10 sets of micro-dissected, formalin-fixed-paraffin-embedded, and frozen GGH, HCC, and adjacent hepatitis B surface antigen-negative stained tissues f…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования