Conjugative plasmids drive bacterial evolution and antibiotic resistance spread, yet their gene expression must be silenced to protect the host. A histone-like protein H-NS represses many mobile and sedentary xenogenes but fails to silence the conjugal transfer vir operon of R6K, a prototype IncX plasmid. Instead, R6K encodes its own H-NS homolog, Sfx, to repress the vir operon. Here, we show that, unlike other plasmid silencers that target promoters, Sfx cooperates with Rho factor to arrest transcription elongation. ChIP-seq reveals that Sfx and H-NS share similar DNA motifs and a preference
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlorine stress induces Escherichia coli O157:H7 (E. coli O157:H7) to enter the viable but non-culturable (VBNC) state, in which the bacteria evade traditional detection methods and exhibit enhanced tolerance, posing a serious threat to food safety. In this study, the E. coli O157:H7-WT, E. coli O157:H7-ΔarcA, and E. coli O157:H7-ΔrelA knockout strains were used. By combining checkerboard analysis, viability state detection, and determination of key gene expression throughout the whole process under sodium hypochlorite (SH) stress, cinnamon essential oil (CEO) stress, and combined SH and CEO s
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bloodstream infections (BSIs) pose significant risks to individuals with leukemia, and Escherichia coli stands out as a prevalent cause in these infections. This research sought to explore the impact of sub-inhibitory concentrations (sub-MIC) of ciprofloxacin, imipenem, ceftriaxone, and the combined use of ceftriaxone and ciprofloxacin on the expression of virulence factors and toxin-antitoxin genes in E. coli strains obtained from leukemia patients. Twelve clinical strains of E. coli that demonstrated resistance to ciprofloxacin, imipenem, and ceftriaxone and contained the chosen virulence an
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Multidrug-resistant (MDR) strains of Mycobacterium tuberculosis represent an obstacle to eradicating tuberculosis (TB) due to the low treatment success rate of MDR TB. Among them, the MDR B0/W148 clone has recently evolved from the M. tuberculosis Beijing lineage 2 and is widely disseminated in Russia and Europe. To get more insights into the genetic factors underlying the evolutionary success of the MDR M. tuberculosis B0/W148 clone in addition to environmental and patient-related features, we focused on two mutations specific to this clone that are found in the transcriptional re
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Serratia marcescens is an enteric bacterium that can function as an opportunistic pathogen with increasing incidence in clinical settings. This is mainly due to the ability to express a wide range of virulence factors and the acquisition of antibiotic resistance mechanisms. For these reasons, S. marcescens has been declared by the World Health Organization (WHO) as a research priority to develop alternative antimicrobial strategies. In this study, we found a PhoP-binding motif in the promoter region of transcriptional regulator RamA of S. marcescens RM66262. We demonstrated that the expression
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cationic antimicrobial peptides (AMPs) are active immune effectors of multicellular organisms and are also considered as new antimicrobial drug candidates. One of the problems encountered when developing AMPs as drugs is the difficulty of reaching sufficient killing concentrations under physiological conditions. Here, using pexiganan, a cationic peptide derived from a host defense peptide of the African clawed frog and the first AMP developed into an antibacterial drug, we studied whether sub-lethal effects of AMPs can be harnessed to devise treatment combinations. We studied the pexiganan str
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Uropathogenic Escherichia coli (UPEC) as the most important bacterial agent of urinary tract infections (UTIs) encompasses a wide treasure of virulence genes and factors. In due to this default, the aim of this research was to detect and identify some important virulence genes including cnf1, upaH, hlyA, ibeA, and cdtB in isolated UPEC pathotypes. In this research, clinical samples of urine were collected in Shahr-e-Qods, Tehran, Iran. The UPEC pathotypes were confirmed by standard biochemical tests. The DNAs of isolated bacteria were extracted. The genes of cnf1, upaH, hlyA, ibeA, and cdtB we
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BosR, a Fur family member, is essential for the pathogenesis of the Lyme disease pathogen, Borrelia burgdorferi. Unlike typical Fur proteins in which DNA binding represses gene expression, binding of BosR to the rpoS promoter directly activates rpoS transcription in B. burgdorferi. However, virtually nothing is known concerning potential structural features and amino acid residues of BosR that are important for protein function and virulence regulation in B. burgdorferi. Particularly, it remains unknown what structural motifs or residues of BosR coordinate Zn, although previous analyses have i
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The multiple antibiotic resistance (mar) operon of Escherichia coli is a paradigm for chromosomally encoded antibiotic resistance in enteric bacteria. The locus is recognised for its ability to modulate efflux pump and porin expression via two encoded transcription factors, MarR and MarA. Here we map binding of these regulators across the E. coli genome and identify an extensive mar regulon. Most notably, MarA activates expression of genes required for DNA repair and lipid trafficking. Consequently, the mar locus reduces quinolone-induced DNA damage and the ability of tetracyclines to traverse
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica causes systemic diseases (typhoid and paratyphoid fever), nontyphoidal septicemia (NTS), and gastroenteritis in humans and other animals worldwide. An important but underrecognized emerging infectious disease problem in sub-Saharan Africa is NTS in children and immunocompromised adults. A current goal is to identify Salmonella mutants that are not pathogenic in the absence of key components of the immune system such as might be found in immunocompromised hosts. Such attenuated strains have the potential to be used as live vaccines. We have used transposon-directed insertion
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neisseria meningitidis causes bacterial meningitis and septicemia. It evades the host complement system by upregulating expression of immune evasion factors in response to changes in temperature. RNA thermometers within mRNAs control expression of bacterial immune evasion factors, including CssA, in the 5'-untranslated region of the operon for capsule biosynthesis. We dissect the molecular mechanisms of thermoregulation and report the structure of the CssA thermometer. We show that the RNA thermometer acts as a rheostat, whose stability is optimized to respond in a small temperature range arou
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus suis (SS) is an important pathogen for pigs, and it is also considered as a zoonotic agent for humans. Meningitis is one of the most common features of the infection caused by SS, but little is known about the mechanisms of SS meningitis. Recent studies have revealed that small RNAs (sRNAs) have emerged as key regulators of the virulence in several bacteria. In the previous study, we reported that SS sRNA rss04 was up-regulated in pig cerebrospinal fluid and contributes to SS virulence in a zebrafish infection model. Here, we show that rss04 facilitates SS invasion of mouse brain
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nitrate assimilation has been well studied for Gram-negative bacteria but not so much in the Gram-positive actinomycetes up to date. In a rifamycin SV-producing actinomycete, Amycolatopsis mediterranei strain U32, nitrate not only can be used as a sole nitrogen source but also remarkably stimulates the antibiotic production along with regulating the related metabolic enzymes. A gene cluster of nasACKBDEF was cloned from a U32 genomic library by in situ hybridization screening with a heterogeneous nasB probe and confirmed later by whole genome sequence, corresponding to the protein coding genes
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although Bordetella pertussis contains and transcribes loci encoding type III secretion system (TTSS) homologues, expression of TTSS-associated proteins has been reported only for non-laboratory-adapted Irish clinical isolates. Here we confirm such a result for clinical isolates obtained from patients treated in Argentinean hospitals. Moreover, we demonstrate that the expression of TTSS-associated proteins is independent both of the year in which the isolate was obtained and of the types of polymorphic alleles for other virulence factors but is dependent on environmental growth conditions. Int
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Yersinia pestis, the causative agent of plague, is one of the most virulent microorganisms known. The outer membrane protein X (OmpX) in Y. pestis KIM is required for efficient bacterial adherence to and internalization by cultured HEp-2 cells and confers resistance to human serum. Here, we tested the contribution of OmpX to disease progression in the fully virulent Y. pestis CO92 strain by engineering a deletion mutant and comparing its ability in mediating pneumonic plague to that of the wild type in two animal models. The deletion of OmpX delayed the time to death up to 48 h in a mouse mode
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In some enterobacterial pathogens, but not in Escherichia coli, loss-of-function mutations are a common route to clinically relevant beta-lactam antibiotic resistance. We previously constructed an assay system for studying enterobacterial beta-lactam resistance mutations using the well-developed genetics of E. coli by integrating enterobacterial ampRC genes into the E. coli chromosome. Like the cells of other enterobacteria, E. coli cells acquire beta-lactam resistance by ampD mutation. Here we show that starvation and stress responses provoke ampD beta-lactam resistance mutagenesis. When star
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The bacterial Nramp family protein MntH is a divalent metal transporter, but mntH mutants have little or no phenotype in organisms where it has been studied. Here, we identify the mntH homologue of Bradyrhizobium japonicum, and demonstrate that it is essential for Mn(2+) transport and for maintenance of cellular manganese homeostasis. Transport activity was induced under manganese deficiency, and Fe(2+) did not compete with (54)Mn(2+) for uptake by cells. The steady-state level of mntH mRNA was negatively regulated by manganese, but was unaffected by iron. Control of mntH expression and Mn(2+)
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The secreton or type II secretion machinery of gram-negative bacteria includes several type IV pilin-like proteins (the pseudopilins) that are absolutely required for secretion. We previously reported the presence of a bundled pilus composed of the pseudopilin PulG on the surface of agar-grown Escherichia coli K-12 cells expressing the Klebsiella oxytoca pullulanase (Pul) secreton genes at high levels (N. Sauvonnet, G. Vignon, A. P. Pugsley, and P. Gounon, EMBO J. 19:2221-2228, 2000). We show here that PulG is the only pseudopilin in purified pili and that the phenomenon is not restricted to t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microorganisms belonging to the genus Brucella can infect humans and many species of animals. Virulence of the brucellae is thought to be essentially due to their capacity to survive and replicate within the phagocytic cells. However, many gaps remain in our understanding of this ability of brucellae to elude the bactericidal effects of host phagocytes, and basic questions remain unanswered. Identification of Brucella gene products which are related to intracellular survival, as well as those which contribute to the induction of protective immunity, is critical to elucidate the molecular mecha
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The glucosyl transferase gene (gtr) from bacteriophage phage X (SfX) caused partial conversion of serotype Y (group antigen 3, 4) to X (group antigen 7, 8) when introduced into a candidate vaccine strain of Shigella flexneri serotype Y (SFL124). The gtr gene caused conversion of O-antigens but did not eliminate the adsorption of the corresponding phage SfX. The hybrid strain expressing both group antigens 7, 8 and 3, 4 showed 75% protection when immunized guinea pigs were challenged with a wild-type S. flexneri serotype X strain. No protection was observed against serotype Y challenge, althoug
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.