INTRODUCTION: Multiple pathogens can infect the canine reproductive and central nervous systems, including organisms that are zoonotic, such as Brucella canis, pathogenic Leptospira spp., Anaplasma phagocytophilum, Histoplasma capsulatum, and Blastomyces dermatitidis. In this study, we developed a targeted next-generation sequencing (tNGS) panel to identify common infectious agents related to neurologic and reproductive disease in canines while incorporating less common zoonotic agents into a single test.
METHODS: Primer pools were developed to detect 34 pathogens and used in two multiplex PC
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although recent evidence suggests that myeloid clonal hematopoiesis (M-CH) may influence lymphoma clinical outcome, its impact in mantle cell lymphoma (MCL) remains unclear. Here, we report a comprehensive next-generation sequencing-based analysis of the M-CH mutational landscape at baseline and follow-up in patients enrolled in the Fondazione Italiana Linfomi MCL0208 phase 3 trial, evaluating lenalidomide maintenance vs observation after chemoimmunotherapy and autologous stem cell transplantation (ASCT) in untreated young patients with MCL. Overall, 254 of 300 (85%) enrolled patients (median
СтатьяКлиническое исследование III фазыПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Respiratory droplets are the main way in which the COVID-19 pandemic's causal agent, severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2), spreads. Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) receptors, especially in lung cells, allow the virus to enter host cells. However, ACE2 expression in intestinal cells has sparked worries about possible fecal transfer, particularly in poor-sanitation areas like India.
METHODS: Between July 2021 and July 2024, clinical (nasopharyngeal, saliva, and stool samples) and sewage samples were collected from outpatient departments and sewage trea
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
T-cell lymphoblastic lymphoma (T-LBL) is an aggressive lymphoma that primarily affects children and young adults, and a comprehensive understanding of its molecular features is crucial for improving patient outcomes. In this study, 552 patients were included, with targeted next-generation sequencing of 262 lymphoma-associated genes performed on tumour samples from 119 patients. The associations between mutations and survival rates, as well as relapse and other clinical factors, were analysed. The results demonstrated that pleural effusion (PE) invasion was significantly associated with adverse
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Subareolar sclerosing ductal hyperplasia (SSDH) is a distinct type of complex sclerosing hyperplastic lesion first described by Rosen in 1987. There have been rare studies investigating SSDH; however, no genetic study has been performed to date.
METHODS AND RESULTS: Seven SSDH cases, diagnosed between 2013 and 2024, were identified. All were subjected to next-generation sequencing (523 genes). Patient ages ranged from 40 to 74 years (median = 46). All lesions were located in the subareolar region. Each showed the characteristic appearance of the lesion, as described in the seminal study
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This case report highlights a rare instance of Pasteurella multocida meningitis in a 2-month-old infant, complicated by subdural empyema. The pathogen was identified using next-generation sequencing (NGS), despite negative bacterial cultures, underscoring the diagnostic challenges. The strain was predicted to be resistant to meropenem and ampicillin, necessitating a tailored treatment approach. The strain was likely transmitted through a neighbor's dog, emphasizing the complexity of P. multocida transmission. This case underscores the importance of advanced diagnostic techniques and personaliz
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An illustration of the importance of manual data review for identifying rare intronic variants adjacent to homopolymers is presented here. A 14-year-old male with Niemann-Pick Type C disease confirmed biochemically was only found to have a heterozygous pathogenic variant by molecular analysis. A manual review of the Next Generation Sequencing (NGS) data identified a c.709C>T; p.Pro237Ser variant, which was likely not reported initially because it is consistently classified as benign or likely benign. A rare association of the c.709C>T variant with a second intronic NPC1 variant (c.1947 + 5G>C)
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background and Aim: The immunological interactions between soil-transmitted helminths (STHs) and herpes simplex virus type 2 (HSV-2), particularly in the context of co-infection, are poorly understood. Next-generation sequencing (NGS) offers a powerful approach to explore these complex immune responses and uncover potential therapeutic targets. This study leveraged NGS and bioinformatic tools to investigate transcriptional changes and immunological pathways in female genital tract (FGT) tissues of BALB/c mice acutely infected with Nippostrongylus brasiliensis (Nb), HSV-2, or co-infected. Metho
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: While most sporadic adult-onset neurodegenerative diseases have only a minor monogenic component, given several recently identified late adult-onset ataxia genes, the genetic burden may be substantial in sporadic adult-onset ataxias. We report systematic mapping of the genetic landscape of sporadic adult-onset ataxia in a well-characterised, multi-centre cohort, combining several multi-modal genetic screening techniques, plus longitudinal natural history data.
METHODS: Systematic clinico-genetic analysis of a prospective longitudinal multi-centre cohort of 377 consecutive patients
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Since we reported the first parechovirus A3-associated myalgia (PeVA3-M) outbreak in Yamagata in 2008 as an emerging disease, we have investigated PeVA3 infections as part of the National Epidemiological Surveillance of Infectious Diseases, Japan, in sentinel hospitals and clinics and also performed a specific symptomatic surveillance targeting PeVA3-M. As PeVA3-M has only been reported from Japan, it is necessary to continue the above surveillance. In our surveillance from July 2022 to December 2023, we found 31 PeVA3 infections, including three confirmed or suspected PeVA3-M cases, using PCR
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To discover microRNA (miRNA)-RNA transcript interactions dysregulated in brains from persons with HIV-associated neurocognitive disorder (HAND), we investigated RNA expression using machine learning tools.
DESIGN: Brain-derived host RNA transcript and miRNA expression was examined from persons with or without HAND using bioinformatics platforms.
METHODS: By combining next generation sequencing, droplet digital (dd)PCR quantitation of HIV-1 genomes, with bioinformatics and statistical tools, we investigated differential RNA expression in frontal cortex from persons without HIV [HIV
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The central nervous system (CNS) is highly susceptible to infections that can lead to severe neurological morbidity and mortality. Despite advances in diagnostic technologies, a significant proportion of encephalitis and meningitis cases remain etiologically undiagnosed, underscoring the need for novel pathogen discovery approaches. Here, we report the identification of a novel unclassified RNA virus, provisionally named hucaurvirus ("human CSF-associated unclassified RNA virus"), in the cerebrospinal fluid (CSF) of a pediatric patient with unexplained meningoencephalitis, using metagenomic ne
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acute respiratory infections (ARIs) are a leading cause of pediatric morbidity and mortality globally, yet comprehensive pathogen epidemiology in children remains understudied. This study aimed to characterize the pathogen profiles, co-infection patterns, and epidemiological trends of pediatric ARIs in Xiantao, China, using targeted next-generation sequencing (tNGS).
METHODS: A retrospective analysis was conducted on 4,330 children hospitalized with ARIs from May 2022 to September 2023. Oropharyngeal swab specimens were tested by tNGS for 96 pathogens via ultra-multiplex PCR and h
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human papillomavirus-associated oropharyngeal squamous cell carcinoma (HPV-OPSCC) is clinically and biologically distinct from HPV-negative counterparts, differing in prognosis, failure patterns, and patient demographics. Although outcomes are generally favorable for HPV-OPSCC, large randomized trials have not confirmed the safety or efficacy of treatment de-escalation. Liquid biopsy approaches, particularly those measuring circulating tumor HPV DNA (ctHPVDNA), have emerged as promising tools for risk stratification, treatment response monitoring, and early recurrence detection. Technologies s
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tuberculosis poses a rare but life-threatening complication for patients undergoing hematopoietic stem cell transplantation. In a case series spanning January 2020 to January 2024, we evaluated the application of metagenomic Next-Generation Sequencing in the early diagnosis of tuberculosis in patients following allogeneic hematopoietic stem cell transplantation. We identified 9 cases of post-transplant tuberculosis, predominantly pulmonary, with 1 case of disseminated disease. In early fluid samples from patients with post-transplant active tuberculosis, metagenomic next-generation sequencing
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prompt identification and management of donor-derived infections post-kidney transplantation are critical. This study aims to assess the effectiveness of metagenomic next-generation sequencing (mNGS) in detecting pathogens within donor organ preservation fluids and recipient wound drainage fluids, with a comparison made against conventional culture methods.
METHODS: This study involved 141 kidney transplant patients (May 1st, 2020 to Jan 31st, 2024). Donor organ preservation fluids and recipient wound drainage fluids were collected and analyzed by mNGS and conventional culture. Pa
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The rapid detection of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis is essential for managing drug-resistant tuberculosis (DR-TB). This study evaluated the performance of molecular assays compared to phenotypic drug susceptibility testing (pDST) and targeted next-generation sequencing (T-NGS).
METHODS: We retrospectively analyzed 40 presumptive pulmonary DR-TB cases in Rio de Janeiro from 2018 to 2022. Xpert MTB/RIF Ultra (Xpert Ultra) and Line Probe Assay (LPA; MTBDRplus = LPA-1, MTBDRsl = LPA-2) were performed directly on clinical respiratory specimens, with pDST serving as the
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Identify specific Human Papilloma Virus (HPV) genomic status by HPV capture technique coupled with next-generation sequencing (NGS) in patients with early cervical cancer (ECC) regarding 2018 FIGO stages and correlate these statuses with prognosis. HPV sequencing by Capture technique coupled with NGS was performed on 34 tumors samples of ECC patients without histologically sentinel lymph node (SLN) metastasis in a retrospective study. NGS data were analyzed in our in-house VIROCAPT2 pipeline to determine precise HPV genomic status such as the complete sequence of HPV genome, its integration or
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Difficulties in microbiologically confirming childhood tuberculosis (TB) can result in delayed treatment and increased disease severity.
METHODS: In this study, we for the first time used whole genome next-generation sequencing (NGS) to detect cell-free DNA (cfDNA) from Mycobacterium tuberculosis (MTB) in plasma from children.
RESULTS: We enrolled 94 children with active TB and 32 children with other respiratory infections. Combining NGS with probe capture enrichment (targeted cfNGS) showed higher coverage and detecting capability than did NGS alone. The targeted cfNGS showed sli
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & AIMS: Recent advances in molecular profiling have enabled the identification of potential therapeutic targets for biliary tract cancer (BTC). However, in patients with BTC, molecular profiling is hindered by challenges in obtaining adequate tissue samples. Circulating tumor DNA (ctDNA) may offer an alternative to tissue-based analysis. Herein, we aimed to assess the concordance between ctDNA and tissue genomic profiling in a large cohort of Asian patients with advanced BTC, and to evaluate the feasibility of liquid biopsy in BTC treatment.
METHODS: This study included patients wi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования