BACKGROUND: Exogenous lipoid pneumonia (ELP) is a rare disease and its diagnosis is often mistaken or delayed. Secondary infection with rapidly growing non-tuberculous mycobacteria is a rare complication of lipoid pneumonia.
CASE PRESENTATION: A 38-year-old man presented with fever, cough, sputum, chest tightness, and shortness of breath. He had a 2-year history of allergic rhinitis and used liquid paraffin-containing menthol nasal drops daily. A chest CT scan showed multiple patchy ground glass opacities with blurred borders in both lungs, which were located in the inner pulmonary field and …
ОбзорКлинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alpha-1 Type Ⅲ Collagen (COL3A1) encodes the Collagen alpha-1(Ⅲ) chain, which is a fibrillar collagen that exists in extensile connective tissues. Few studies have reported its role in tumorigenicity. In the present study, we identified that COL3A1 protein and mRNA expression levels were considerably up-regulated in esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) cells in comparison with normal esophageal squamous epithelial cells (P < 0.05). Immunohistochemical (IHC) analysis of 114 paraffin-embedded archived ESCC tissues demonstrated that COL3A1 expression was positively correlated with the postop…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endometrial cancer (EC) is one of the most common types of cancer of the female reproductive system. EC is classified into two types (EC1 an … controls. Tumor tissues or healthy endometrial tissues were dissected from archival formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) using laser capture microdissection (LCM). RNA was isolated from collected material and the expression of selected miRNAs was determined using the real-time qPCR. We found that miR-23b, miR-125b-5p, miR-199a-3p, miR-221-3p, and miR-4 …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several in vitro and in vivo studies have shown that the mammalian target of rapamycin (mTOR) inhibitor sirolimus (rapamycin) suppresses thy … espiration and ATP levels. Immunohistochemical stain of caspase-3 and cytochrome C was performed on paraffin-embedded tissue. The treated animals exhibited a dose-dependent reduction in weight gain despite adequate food intake. Sirolimus produced significant thymic derangements, manifested by dose-dependent tissue involution, increased cortical apoptotic b …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Endometrioid endometrial carcinomas (EEC) are the most commonly diagnosed malignancies of the female genital tract. Myometrial in … tern was evaluated in hematoxylin-eosin-stained sections. Pan-cytokeratin staining was performed on paraffin-embedded blocks of lymph nodes for cases without lymph node metastasis.
RESULTS: The MELF pattern was observed in 29 (29.8%) patients. It was significantly associated with lymphovascular invasion (p<0.001), pathologic stage (p=0.048), infiltrative …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein misfolding is a prominent pathological hallmark of neurodegenerative disorders, including Alzheimer's disease (AD). Studies have sho … MCAAD to disease-relevant protein aggregates, and combined the two probes to examine formalin-fixed paraffin-embedded mouse and human brain samples. Coupled with quantitative spectral phasor analysis, the dual-probe staining approach revealed remarkable heterogeneity of protein aggregates across the samples. Distinct emission spectra were consistent with c …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The worm Enchytraeus buchholzi is a new record species for Shaanxi, China, and a key pest on American ginseng Panax quinquefolium. To distinguish the species, the authors prepared its whole mounts and paraffin-embedded sections, and microscopically observed, photographed and measured. Besides, we conducted an experimental study on its DNA barcode. RESULTS: Cells, tissues and organs related to nervous, digestive, circulatory, excretory and reproductive systems were found, photomicrographed and described, including: prostomium, peristomium, segments, clitellum, pygidium, lateral and ventral cha…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Neoadjuvant therapy regimens followed by surgery represent the current standard treatment of locally advanced oesophageal adenoc … Tumor Budding Consensus Conference (ITBCC) in H&E-stained whole tissue slides of 278 formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) resected oesophageal adenocarcinomas with a poor response (> 10% vital residual tumour) to neoadjuvant therapy.
RESULTS: We could demonstrate a strong positive correlation (p < 0.05) between the budding group, ypN stage and UICC tum …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nodal mature T-cell lymphomas (nMTCL) comprises a heterogeneous group of rare malignancies with aggressive biological behavior and poor prog … ic impact remains unknown in nMTCL. In this study, we conducted Sanger sequencing of formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) diagnostic tumor samples using a target-panel to search for recurrent mutations involving the IDH-1/IDH-2, TET-2, DNMT3A and RhoA genes in 59 cases of nMTCL. For the first time, we demonstrated that high-TMB, defined by the presence …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Next-generation sequencing holds unprecedented throughput in terms of informational content to cost. The technology has entered the scene in … encing and helps identify problematic samples, such as those retrieved from archived formalin-fixed paraffin-embedded tissue.
МетаанализСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Formalin fixation, albeit an outstanding method for morphological and molecular preservation, induces DNA damage and cross-linking, which can hinder nucleic acid screening. This is of particular concern in the detection of low-abundance targets, such as persistent DNA viruses. In the present study, we evaluated the analytical sensitivity of viral detection in lung, liver, and kidney specimens from four deceased individuals. The samples were either frozen or incubated in formalin (±paraffin embedding) for up to 10 days. We tested two DNA extraction protocols for the control of efficient yields …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Advanced cholangiocarcinoma has a poor prognosis. Molecular targeted approaches have been proposed for patients after progression under first-line chemotherapy treatment. Here, molecular profiling of intrahepatic cholangiocarcinoma in combination with a comprehensive umbrella concept was applied in a real-world setting.
METHODS: In total, 101 patients received molecular profiling and matched treatment based on interdisciplinary tumour board decisions in a tertiary care setting. Parallel DNA and RNA sequencing of formalin-fixed paraffin-embedded tumour tissue was performed using la…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long interspersed nuclear element 1 (LINE-1) bisulfite pyrosequencing is a widely used technique for genome-wide methylation analyses. We aimed to investigate the effects of experimental and biological factors on its results to improve the comparability. LINE-1 bisulfite pyrosequencing was performed on colorectal tissue (n = 222), buffy coat (n = 39), and plasma samples (n = 9) of healthy individuals and patients with colorectal tumors. Significantly altered methylation was observed between investigated LINE-1 CpG positions of non-tumorous tissues (p ≤ 0.01). Formalin-fixed, paraffin-embedded …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In addition to patient-related systemic factors directing the immune response, the pathomechanisms of appendicitis (AP) might also include insufficient drainage leading to inflammation caused by decreased peristalsis. Genetic predisposition accounts for 30%-50% of AP. M. Hirschsprung (HSCR), also characterized by disturbed peristalsis, is associated with variants in the RET proto-oncogene. We thus hypothesized that RET variants contribute to the etiology of AP.
METHODS: DNA from paraffin-embedded appendices and clinical data of 264 children were analyzed for the RET c.135A>G varia…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To present the pathologic analysis of female urethral strictures obtained during reconstructive urethroplasty.
METHODS: Nine separate female urethral tissue specimens were obtained during dorsal vaginal graft urethroplasty by a single surgeon (S.P.P.). Samples were serially sectioned and fixed in 10% formalin 6 to 12 hours before routine processing in paraffin blocks. Serial 5-µm sections were subjected to H&E, Masson trichrome, and elastin staining. End point analysis included evaluation for epithelial hyperplasia and cell type, mucosal edema, degree of fibroblast/inflammatory cel…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spi-B, a member of the E26 transformation-specific (ETS) family of transcription factors, plays an important role in B cell differentiation. Spi-B also functions in development of diffuse large B-cell lymphoma; thus, we hypothesized that it may participate in leukemogenesis of B-cell acute lymphoblastic leukemia (B-ALL). To test this hypothesis, we first generated an anti-Spi-B monoclonal antibody that recognized Spi-B on formalin-fixed, paraffin-embedded tissue sections. This antibody, designated S28-5, selectively stained B cell nuclei at the pre-plasma cell stage (including centrocytes and …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cotyledonoid dissecting leiomyoma (CDL) is much less common than typical leiomyoma. Macroscopically, it displays multinodular, e … d. An intraoperative frozen section showed an angioleiomyoma with edema. However, the postoperative paraffin section confirmed a diagnosis of CDL. No abnormalities were observed at the 6-month follow-up visit.
CONCLUSIONS: Despite its seemingly malignant gross appearance, CDL, based on its microscopic appearance, is a rare benign tumor and has a favorable …
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lymphomas affecting the sublingual glands are extremely rare and very few case reports are currently available. Therefore, the aim of the current study is to describe the clinicopathological features of a series of lymphomas involving the sublingual glands.
METHODS: Cases diagnosed in four pathology services were assessed and the formalin-fixed paraffin-embedded tissue blocks were retrieved for diagnosis confirmation. Clinical data were obtained from patients' medical files.
RESULTS: We obtained seven cases of lymphomas in the sublingual glands, representing two follicular lympho…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Subtype B HIV-1 reservoirs have been intensively investigated, but reservoirs in other subtypes and how they respond to antiretroviral therapy (ART) is substantially less established. To characterize subtype C HIV-1 reservoirs, we implemented postmortem frozen, as well as formalin fixed paraffin embedded (FFPE) tissue sampling of central nervous system (CNS) and peripheral tissues. HIV-1 LTR, gag, envelope (env) DNA and RNA was quantified using genomic DNA and RNA extracted from frozen tissues. RNAscope was used to localize subtype C HIV-1 DNA and RNA in FFPE tissue. Despite uniform viral load…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: High-risk human papillomavirus (HR-HPV) can cause oropharyngeal squamous cell carcinoma (OpSCC). The revised 8th edition of the AJCC Staging Manual now stages OpSCC by incorporating p16 immunohistochemistry (IHC), the surrogate marker for HPV status. This study assessed the prognostic values of p16 and HPV markers.
METHODS: We identified 244 OpSCC patients diagnosed between 2000 and 2008 from the British Columbia Cancer Registry with enough tissue to conduct experiments. Formalin-fixed, paraffin-embedded tissue sections were stained for p16 IHC, RNA in situ hybridization (ISH) HPV…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.