BACKGROUND: As public awareness of environmental issues grows and research on ecological pollutants advances, mounting evidence indicates that Methyl-4-hydroxybenzoate (MEP) is associated with the development of various diseases. This study aims to uncover the key genes and underlying molecular mechanisms by which MEP influences osteoporosis (OP).
METHODS: This study integrates network toxicology, molecular docking, and molecular dynamics simulation approaches. Potential targets of the environmental contaminant were identified using the Comparative Toxicogenomics Database (CTD). In contrast,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dentinogenesis Imperfecta (DI) is a rare genetic disorder that disrupts the structure and mechanical integrity of dentin, often through alterations to the collagen matrix. In cases associated with Osteogenesis Imperfecta, DI arises from COL1A1 or COL1A2 variants (DI type I). The multiscale mechanisms linking alterations of the collagenic scaffold to dentin microstructural defects remain poorly understood. In this proof-of-concept study, we employed a multimodal 3D characterization framework combining biochemical assays and advanced imaging techniques to investigate the relationship between col
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The emergence of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) led to the COVID-19 pandemic, which resulted in millions of deaths globally and had profound social, economic, and political consequences. Although effective vaccines and antiviral therapies have substantially reduced the global burden of COVID-19, the continued emergence of viral variants highlights the need for next-generation effective vaccine strategies capable of providing broader and more durable immune response.
METHODS: In this work, we provide an immunoinformatic approach for multi-epitope vacci
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background Diabetes mellitus, particularly type 2 diabetes mellitus (T2DM), is a chronic metabolic disorder characterized by persistent hyperglycemia. Alpha-glucosidase inhibitors like miglitol delay carbohydrate absorption, thereby reducing postprandial glucose levels. Momordica charantia (bitter melon) has demonstrated hypoglycemic effects in various studies, yet its interactions with pharmaceutical antidiabetic agents remain poorly understood. This study investigates the molecular interactions between M. charantia phytoconstituents and miglitol's enzymatic targets using in silico methods. M
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The integration of artificial intelligence with protein engineering has created unprecedented opportunities for enzyme discovery and the enhancement of overall catalytic performance. In this study, a novel nitrilase, BhNIT, was identified from Bradyrhizobiumhuanghuaihaiense through a computationally assisted screening strategy. Using BhNIT as the target protein for engineering, we established DeepPCD as an integrated computationally guided workflow that organizes sequence-design, structure-filtering, stability-assessment, evolutionary-compatibility, and molecular dynamics analyses to prioritiz
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Minimum miscibility pressure (MMP) governs CO2-enhanced oil recovery (EOR) and concurrent CO2 storage. However, nanoconfinement within shale-relevant mineral pores can reshape the miscibility pathway and bias bulk-derived criteria. In this study, molecular dynamics simulations coupled with NMR relaxation theory reveal the microscopic mechanisms of miscibility under nanoscale confinement and introduce a method for predicting the MMP based on the proton longitudinal relaxation time (T1). The results indicate that enhanced mass transport in the calcite adsorption region induces a curved meniscus,
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Programming biological function-designing bespoke proteins to perform specified molecular tasks-is a foundational goal of molecular engineering. However, current design models remain fundamentally limited1-3: they typically require either natural proteins as starting points for optimization or manual reformulation of functional goals as geometric and sequence-level constraints to guide candidate generation. Here we introduce Pinal, a 16-billion-parameter foundation model that designs candidate proteins from natural-language descriptions of desired function. Trained on 1.7 billion synthetically
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
4-(Methylnitrosamino)-1-(3-pyridyl)-1-butanone (NNK) is a tobacco-specific nitrosamine implicated in tobacco-related lung carcinogenesis. Its biological effects in vivo depend substantially on metabolic conversion to NNAL and cytochrome P450-mediated formation of reactive intermediates. In this study, predicted NNK-associated proteins were integrated with lung cancer transcriptomic data sets, followed by network analysis and machine-learning-based feature prioritization. Five genes, SNAI2, PLAU, DNMT3A, FAP, and CCNB1, were prioritized based on their contributions to the multigene classificati
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular polarizability tensors beyond the dipole-dipole level are key inputs to polarizable force fields, polarizable embedding, and machine-learned response models, yet routines to compute them exist in few quantum chemistry codes and are largely confined to atom-centered Gaussian basis sets. We present a general, backend-agnostic implementation of moment-based point-charge perturbation that removes this restriction. The molecular charge density is perturbed by external point charges available in any QM/MM-capable code, whether real-space-grid, plane-wave, or atom-centered, and the dipole-d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Juvenile Huntington's disease (jHD) is a severe genetic disorder with combined neurodegenerative and neurodevelopmental features, characterized by early onset and markedly reduced life expectancy. Despite extensive efforts, drug development has been largely unsuccessful and no effective therapy capable of mitigating the pathological phenotype is currently available. Here, we investigated the potential of the FDA-approved drug iloperidone to ameliorate disease-related phenotypes in cortical neurons differentiated from patient-derived induced pluripotent stem cells. Given previous reports indica
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: In recent years, there has been a rapid expansion in the development of new protein therapeutics in the pharmaceutical industry. Problematically, proteins are conformationally and colloidally marginally stable, and thus it is necessary to formulate them using buffering and stabilizing agents.
METHODS: In this study, we use experimental and computation techniques to evaluate the aggregation pathway, as well as the stabilizing properties of a range of excipients on a model protein; bovine serum albumin (BSA).
RESULTS: Our results show that polar excipients (L-arginine and trimethylami
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Black Sesame Seeds (BSS) are consumed as an edible herbal food with medicinal food homology and possess potent antioxidant properties; however, their metabolic compositions and corresponding antioxidant efficacies substantially vary across different geographical origins. This study investigates the underlying multi-component and multi-target antioxidant mechanisms of BSS from various geographical origins. An integrated computational and experimental approach combining UHPLC-Q-Exactive Orbitrap MS/MS-based metabolomics, network pharmacology, and molecular docking was employed. Metabolomic profi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spatial transcriptomics enables the systematic exploration of how gene expression patterns are organized within intact tissues, yet effective analysis remains difficult due to the complexity of spatial dependencies and multi-scale tissue architectures. Here, we present the Spatial Graph Frequency Network (SGFN), a deep learning framework that integrates graph signal processing, graph attention, and contrastive learning to jointly model spatial topology and molecular features. Central to SGFN is a frequency-domain enhancement module that decomposes spatial graphs into multi-scale spectral compo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Triple-negative breast cancer (TNBC) is an aggressive and therapeutically challenging subtype of breast cancer lacking estrogen, progesterone, and HER2 receptors. Sphingosine kinase 1 (SphK1), a key enzyme in the sphingosine-1-phosphate (S1P) signaling pathway, has been implicated in TNBC progression, metastasis, and chemoresistance. In this study, we employed a comprehensive computational and experimental approach to design and validate small interfering RNA (siRNA) molecules targeting SphK1 for therapeutic intervention. A panel of siRNAs was designed using multiple bioinformatic algorithms a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Studies have shown onion peels to have potential anticancer effects on prostate cancer (PCa) development but with limited understanding of the underlying mechanisms. Therefore, this study aimed to explore potential bioactive compounds, molecular mechanisms, target proteins, and synergistic interactions of onion peels against PCa development. This study employed literature searching and pharmacokinetic property prediction to identify candidate compounds in onion peels. Swiss Target Prediction and Similarity Ensemble Approach were used to screen for potential compounds' targets, while GeneCards
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer is one of the leading causes of global morbidity and mortality and is characterized by its high heterogeneity, genomic instability and adaptive plasticity. Applying Darwin's theory of evolution, the concept of tumor evolution has improved our understanding of the biological behavior of advanced cancer, while technological limitations have long left how to dynamically characterize the evolutionary process unsolved. In recent years, the development of high-throughput sequencing, single-cell and spatial omics, lineage tracing, computational modeling, and noninvasive biopsy technology has h
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Reactive oxygen species (ROS) are critical regulators of tumor development and progression, yet their clinical significance and cellular mechanisms remain poorly defined in hepatocellular carcinoma (HCC).
METHODS: A comprehensive computational approach was employed to investigate ROS-related heterogeneity in HCC and to develop a prognostic model. Transcriptomic analyses at the bulk and single-cell levels were integrated to assess cellular differentiation, metabolic activity, and intercellular signaling. Machine learning techniques were applied to construct a clinically interpretab
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diisononyl phthalate (DINP), a widely used plasticizer, has raised increasing concerns regarding its carcinogenic potential, but its specific role in gastric cancer (GC) remains unclear. This study employed an integrated strategy combining computational toxicology, network toxicology, and multi‑omics analysis to investigate the molecular mechanisms linking DINP to GC. Toxicity prediction indicated significant carcinogenic potential for DINP. Network toxicology revealed that the shared hub genes between DINP and GC were significantly enriched in pathways critical for chemical carcinogenesis, im
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumor-immune cell crosstalk critically shapes the progression of non-small cell lung cancer (NSCLC), yet the mechanisms underlying exosome-mediated immune suppression remain incompletely understood. Here, we identify a previously unrecognized exosomal lncRNA-mediated immunoregulatory axis targeted by the natural compound Ophiopogonin D (OP-D). Transcriptomic profiling and mechanistic rescue experiments revealed that Lewis lung carcinoma (LLC)-derived exosomal MALAT1 suppresses dendritic cell (DC) maturation by increasing SIRT1 expression and attenuating p65 phosphorylation. Computational model
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Xanthoxylin (XAN) is a phenolic compound with well-known bioactivities, including antitumor action, that is exclusively found in the Zanthoxylum genus, commonly known as Szechuan pepper. The interplay between pharmacologically active agents and serum albumin is essential and relevant to pharmacokinetics and pharmacodynamics. This study examines the interaction between XAN and human serum albumin (HSA) using spectroscopic techniques and molecular docking, thereby expanding the scope of previous research, which has primarily focused on bovine serum albumin (BSA). The slight differences in the am
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования