INTRODUCTION: Tryptophan metabolism is known to affect tumor immunity. However, the value of tryptophan metabolism-related genes (TMRGs) in predicting prognosis and reflecting immune status in skin cutaneous melanoma (SKCM) is not yet clear.
METHODS: We analyzed transcriptomic and clinical data of 457 patients with SKCM to elucidate the expression patterns of TMRGs and their links with survival and the tumor immune microenvironment. Unsupervised clustering and Cox regression were used to identify prognostic genes and build a TMRG-based risk model, which was then tested in independent cohorts.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gastric cancer is among the deadliest cancers worldwide, and gastric intestinal metaplasia is a key precancerous phase. Understanding the molecular drivers of abnormal proliferation in intestinal metaplasia (IM) is vital for identifying biomarkers and therapeutic targets.
MATERIALS AND METHODS: Using single-cell RNA sequencing, we characterized the cellular and molecular dynamics of gastric epithelial tissues across disease stages: control, chronic superficial gastritis, and IM.
RESULTS: We identified nine cell types, predominantly epithelial cells, that exhibited increased proli
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Smoking cessation decreases lung cancer progression; however, its effects on precancerous lesions and the underlying mechanisms remain unclear. This study established a mouse model of precancerous pulmonary nodules and employed single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and immune repertoire sequencing (IR-seq) to elucidate the regulatory mechanisms by which smoking cessation influences the development of lung precancerous lesions.
METHODS: A B[a]P-induced mouse model of pulmonary precancerous lesions was established after 6 weeks of B[a]P treatment. Lung nodules were identified via m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Intratumoral heterogeneity of malignant epithelial cells limits prognostic stratification and therapeutic development in NPC, yet transcriptionally distinct malignant epithelial states and their associated molecular programs remain poorly characterized. We aimed to identify clinically relevant malignant epithelial states and define their associated molecular programs in NPC.
METHODS: Fresh normal nasopharyngeal tissue, primary NPC, and nodal metastases were profiled by scRNA-seq, yielding 27,330 cells. Malignant epithelial states were characterized by transcriptomic reclustering,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Non-small cell lung cancer (NSCLC) remains one of the leading causes of cancer-related mortality worldwide, largely due to late-stage diagnosis. Although histopathology is the gold standard, there is a need for reliable molecular biomarkers to improve early detection and support less invasive diagnostic strategies. SMAD4, a known tumor suppressor, has been implicated in cancer progression, but its diagnostic relevance in NSCLC requires further investigation. This study aimed to evaluate SMAD4 mRNA expression in NSCLC and assess its association with clinicopathological features and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gastric cancer (GC) is a leading cause of cancer-related deaths due to late diagnosis. Altered glycolytic metabolism, notably the Warburg effect, plays a critical role in tumorigenesis, offering potential for early detection and targeted therapy.
METHODS: We combined single-cell omics and computational modeling to map and validate glycolytic biomarkers in GC. A novel interquartile range (IQR)-based approach was developed to assess glycolytic activity at the single-cell level, focusing on glycolysis-related genes (GRGs). The results were verified by in vitro and in vivo experiments
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is a highly lethal malignancy with limited available prognostic tools. There is a need to develop robust molecular signatures to improve risk stratification and identify potential therapeutic targets.
METHODS: A 12-gene mitochondrial-related prognostic signature was developed using machine learning. The performance was compared with signatures developed using other algorithms and published signatures. The detailed synergistic role and molecular mechanism of signature gene CAMK2A and THEM4 was investigated. Additionally, an immunohistochemica
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Papillary thyroid carcinoma (PTC) is one of the most common endocrine malignancies, with varying levels of risk and clinical behavior. A better understanding of the molecular characteristics could improve molecular diagnosis and risk assessment. In this study, we performed whole transcriptomic sequencing on 113 PTC cases, including 70 high-risk and 43 low-risk Chinese patients. Comparative transcriptional profiling analysis revealed two functionally distinct patterns of gene dysregulation between the risk subtypes. Low-risk PTCs showed significant upregulation of immune-related genes and incre
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cervical cancer is a prevalent malignancy among women, yet the involvement of neutrophils in its tumor microenvironment remains insufficiently explored. This study utilized single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) to delineate neutrophil subsets and elucidate their roles in disease progression and prognosis. Analysis of 20 cervical biopsy samples across different disease stages identified five neutrophil subsets (N0-N4), among which the N4 subset exhibited a marked increase during disease advancement. Spatial transcriptomics and tissue microarray analyses revealed that N4 neutrophils are enriche
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Investigating the pivotal role of CTHRC1 in the tumor microenvironment of triple-negative breast cancer (TNBC).
METHOD: The RNA transcriptomic data obtained from the Cancer Genome Atlas and single-cell sequencing data from TNBC in Gene Expression Omnibus (GEO) were acquired and subjected to analysis. A comprehensive investigation was conducted with a specific focus on characterizing CTHRC1 in TNBC and its correlation with invasive genes. Furthermore, additional analyses were performed to explore the relationship between CTHRC1, tumor immune cell infiltration, and immunotherapy in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The tumor microenvironment has a significant input on prognosis and also for predicting clinical outcomes in various types of cancers. However, tumor tissue is not always available, thus, rendering peripheral blood a preferable alternative in the search for prognostic and predictive gene signatures. Head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) constitutes a quite heterogeneous disease characterized by poor prognosis. Therefore, the discovery of novel therapeutics based on prognostic gene signatures for effective disease governance is of paramount importance. In this study, we report for the f
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Advanced esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) is characterized by molecular heterogeneity and distinct patterns of immune cell infiltration. Regulatory T cells (Tregs), in particular, play a critical role in shaping an immunosuppressive tumor microenvironment (TME), which is associated with poor clinical outcomes.
METHODS: We developed a prognostic model by integrating GEO-derived bulk RNA sequencing data and single-cell transcriptome. Model predictions were confirmed through RT-qPCR, Western blot, and immunohistochemistry on clinical specimens, while in vitro assays (CCK8, t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Many preclinical hypotheses, including reciprocal feedback activation between the androgen receptor (AR)-PI3K pathway in PTEN loss and AR signaling inhibitor-induced "BRCAness" regardless of BRCA1/2 status, have struggled to translate into clinical benefit for patients with metastatic prostate cancer. This gap in translatability, particularly in metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC), may stem from a limited understanding of prostate cancer evolution. A key challenge is the correlation between early-stage tumor genetics and mCRPC. By examining clinical, genomic, and m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bladder cancer is the most common malignant tumor of the urinary tract. In this study, 90 lupane triterpene derivatives, previously synthesized in the laboratory, were systematically evaluated for their potential effects against bladder cancer by cytotoxicity screening against five urinary tumor cell lines. Bioinformatics and molecular dynamics methods were used to investigate the mechanism of action of compound 27 in depth. Most of the derivatives effectively inhibited tumor cell growth, and structure-activity relationship analysis revealed that introducing an indole moiety significantly enha
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Renal medullary carcinoma (RMC) is a rare but highly aggressive kidney cancer that resists conventional therapies. To identify therapeutic targets, this study employs histopathologic, genomic, and transcriptomic profiling of 25 RMC samples. TROP2, EPCAM, CLDN6, and CDH6 are significantly overexpressed compared with other renal and solid tumors. Pathway analyses indicate Hippo pathway upregulation and a tumor microenvironment rich in fibroblasts and neutrophils. We subsequently explore treatment of four heavily pretreated patients, all with high TROP2 expression, using sacituzumab govitecan, a
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mature aggressive B-cell lymphomas, such as Burkitt lymphoma (BL) and Diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL), show variations in microRNA (miRNA) expression. The entity of High-grade B-cell lymphoma with 11q aberration (HGBCL-11q) shares several biological features with both BL and DLBCL but data on its miRNA expression profile are yet scarce. Hence, this study aims to analyze the potential differences in miRNA expression of HGBCL-11q compared to BL and DLBCL. We evaluated the expression profiles of 2083 miRNAs in 25 HGCBL-11q, 7 BL, 131 DLBCL, and tonsils using the HTG EdgeSeq miRNA whole tran
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: CALGB 40903 (Alliance) was a phase II single arm multicenter trial conducted in postmenopausal patients diagnosed with estrogen-receptor (ER) positive breast ductal carcinoma in situ (DCIS) without invasion. Patients were treated with the aromatase inhibitor (AI) letrozole for 6 months prior to surgery with change in magnetic resonance imaging (MRI) enhancement volume compared to baseline as the primary endpoint. In the current study, we performed sequence analysis of pre- and post-treatment specimens to determine gene expression and DNA copy number parameters associated with treatmen
СтатьяКлиническое исследование II фазыМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peritoneal metastases (PM) in colorectal cancer (CRC) is associated with a dismal prognosis. Identifying and exploiting new biomarkers, signatures, and molecular targets for personalised interventions in the treatment of PM in CRC is imperative. We conducted transcriptomic profiling using RNA-seq data generated from the primary tissues of 19 CRC patients with PM. Using our dataset established in a previous study, we identified 1422 differentially expressed genes compared to non-metastatic CRC. The profiling demonstrated no differential expression in liver and lung metastatic CRC. We selected 1
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Long noncoding RNAs (lncRNAs) play a critical role in gastric cancer (GC) progression and metastasis. However, research comprehensively exploring tissue-derived lncRNAs for predicting peritoneal recurrence in patients with GC remains limited. This study aims to investigate the transcriptional landscape of lncRNAs in GC with peritoneal metastasis (PM) and to develop an integrated lncRNA-based score to predict peritoneal recurrence in patients with GC after radical gastrectomy.
METHODS: We analyzed the transcriptome profile of lncRNAs in paired peritoneal, primary gastric tumor, and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pediatric adrenocortical tumors (ACT) are rare aggressive neoplasms with heterogeneous prognosis. MicroRNA (miRNA) signatures have been associated with cancer diagnosis, treatment response, and outcomes of several types of cancer. However, the role played by miRNAs in pediatric ACT has been poorly explored. In this study, we have evaluated the expression of miR-483-3p and miR-630 in 67 pediatric ACT and 19 non-neoplastic adrenal samples, the effects of the modulations of these miRNAs, and their relationship with the TGF-β pathway in the H295R and H295A cell lines. Deregulation of both miRNAs w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования