Genetically engineered mouse models have advanced cancer research, but they fail to mimic some human diseases. Rats offer a powerful alternative for modeling human cancers that are inadequately represented in mice, yet their use has been constrained by technical barriers to genome editing. Here, we report somatic genome editing in rats and apply this approach to model estrogen receptor (ER)-positive breast cancer, which accounts for approximately 70% of human cases but remains poorly represented in mice. The resulting rat tumors reproduce hallmarks of human ER+ breast cancer, including ductal
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Malignant phyllodes tumors (MPTs) are rare fibroepithelial breast tumors with no standard treatment for metastatic or recurrent cases. Comprehensive genomic profiling (CGP) has been conducted for MPT; however, its association with treatment remains unclear.
METHODS: A retrospective study was conducted on patients with advanced or recurrent MPTs treated with chemotherapy between 2013 and 2022 at two hospitals, analyzing clinical data, CGP, treatment outcomes, and survival.
RESULTS: Five patients with metastatic MPTs who had received chemotherapy were identified. The median age was
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mountain systems are natural laboratories for evolution, where rugged topography and ecological heterogeneity restrict gene flow. In the Hengduan Mountains, Neotetracus sinensis (N. sinensis), the sole species of its genus, occupies cool montane forests and has limited dispersal. Here we assemble a high-quality reference genome and resequenced individuals from two isolated ranges in Yunnan, specifically Gaoligong Mountains (GLG) and Wuliang Mountains (WL), to test how geographic isolation shapes genomic variation. Genome-wide SNPs reveal clear population structure, with PCA and phylogeny conco
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Formaldehyde is a highly reactive and cytotoxic compound, and its efficient detoxification is essential for cellular survival. This requirement is particularly critical in methylotrophic microorganisms, where formaldehyde serves as a central intermediate in methanol assimilation. Despite the toxicity of this compound, methylotrophic and methanotrophic bacteria have evolved mechanisms that allow limited tolerance, yet the isolation of highly resistant variants remains extremely challenging due to the intrinsic difficulties of cultivating and purifying these organisms. Here, we report the isolat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A targeted sequencing and genome mining approach for delftibactin-like biosynthetic pathways revealed three distinct biosynthetic gene cluster architectures (BGC del, dlc and dlp) encoded in genomes of members of the genus Delftia. Comparative metabolomic analysis guided the isolation and characterization of a yet unreported metallophore, delftichelin A from Delftia deserti DSM1621 (previously named Delftia acidovorans DSM1621). Prediction of BGC architecture and A domain specificity was in line with the structure analysis uncovering previously unreported differences in amino acid composition
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Members of the genus Pseudoalteromonas are ecologically versatile marine bacteria involved in nutrient cycling, chemical signaling, and competition for resources via bioactive compound production. Here, we characterize the genomic and functional diversity of 19 Pseudoalteromonas isolates from the bivalve Anadara tuberculosa to elucidate ecological strategies enabling coexistence in host-associated environments. Whole-genome sequencing and phylogenomic inference revealed extensive genomic diversity, with most isolates affiliated with recognized taxa and two genomically distinct lineages represe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: LONP1 encodes an ATP-dependent protease essential for maintaining mitochondrial homeostasis. LONP1 variants have been associated with cerebral-ocular-dental-auricular-skeletal anomalies syndrome, pediatric cataract, congenital diaphragmatic hernia, and neurodevelopmental disorders; moreover, these variants can be inherited in both autosomal recessive and autosomal dominant modes.
METHODS: We conducted a retrospective analysis of the clinical data and genetic test results of a Chinese boy diagnosed as having mitochondrial encephalopathy. Subsequently, we evaluated the pathogenicity
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Patients with von Hippel-Lindau (VHL) disease develop multiple distinct kidney cysts and clear cell renal cell carcinomas (ccRCCs) throughout their lifetime. Although cysts are typically considered precursors of ccRCC, no molecular evidence of cysts to tumor progression was provided to date, due to the lack of an accurate molecular characterization of these lesions. We performed a comprehensive molecular characterization of four kidney cysts and six ccRCCs obtained from the same VHL-disease patient, thus all sharing the same genetic germline and host environment. We combined whole genome seque
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Benchmark datasets for assessing polyploid genome assembly are limited because real polyploid genomes often contain unknown structural variations, complex repeats, and heterogeneous divergence among homologous copies. In this study, a minimal, fully controlled virtual dataset is provided for reproducible benchmarking of triploid de novo assembly using short reads. A 1-Mbp haploid reference sequence is generated and iteratively mutated to produce three genome copies (A-C) across 100 mutation steps, creating a divergence gradient that transitions from nearly identical to moderately diverged trip
СтатьяDatasetПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sirenomelia is a rare and lethal congenital malformation representing the most severe form of caudal dysgenesis, with a stillbirth rate of up to 53%. The genetic basis of sirenomelia remains poorly understood. Consequently, in this study, we aimed to comprehensively characterize genomic variants and explore potential pathogenic mechanisms in sirenomelia.
METHODS: Whole-genome resequencing was performed on peripheral blood mononuclear cells from one patient with sirenomelia and one matched healthy newborn. Variants were identified and prioritized using the gnomAD and ClinVar popula
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glyphosate is a widely used non-selective herbicide associated with ecological and human health concerns due to its environmental persistence, highlighting the need for effective remediation strategies. Among available approaches, microbial enzyme-mediated degradation represents a promising biological solution. This study aimed to enrich and characterize glyphosate-degrading microbial consortia from coffee plantation soils, validate glyphosate and aminomethylphosphonic acid (AMPA) degradation by chromatographic analyses, and integrate genome-based functional annotation with comparative structu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To identify molecular features associated with earlier progression to definitive therapy amongst patients with localized prostate cancer (PCa) managed on active surveillance (AS).
METHODS: We performed a retrospective pilot study of 7 patients with low- to intermediate-risk PCa undergoing serial multiparametric MRI (mpMRI)-targeted biopsies of the same lesion while on AS, who all proceeded to definitive therapy. Time-to-treatment (TTT) was defined as years from first biopsy on AS to definitive therapy. Laser-capture microdissection was used to separate tumor epithelium, benign glan
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methanol is a sustainable, low-cost feedstock produced from CO2 or non-food biomass. We report the complete genome sequence of Methylobacillus glycogenes strain PKM581, a soil-derived obligate methylotroph enriched on methanol. The genome comprises a single circular chromosome of 3,397,625 bp.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phosphonates are chemically distinctive natural products characterized by a stable carbon-phosphorus (C-P) bond and are traditionally associated with a limited number of well-studied bacterial genera. We performed comparative genome mining of four publicly available Chelatococcus asaccharovorans genomes along with related Chelatococcus species to investigate their potential for phosphonate biosynthesis. Genome analysis using antiSMASH identified putative phosphonate biosynthetic gene clusters (BGCs) in two of the four C. asaccharovorans strains, whereas no phosphonate BGCs were detected in the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bafilomycin and concanamycin analogs (1-3) are microbial natural products with potent V-ATPase inhibitory activity. Despite their promising therapeutic potential, limited access to these plecomacrolide scaffolds has constrained their broader bioactivity evaluation. Here, we report an integrative approach combining genome mining, strain engineering, and molecular networking to expand the chemical diversity of natural concanamycin analogs. Genome analysis identified a concanamycin-like biosynthetic gene cluster in Streptomyces humidus with a unique genetic architecture, suggesting that it may en
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transfer RNAs (tRNAs) are essential components of the translation machinery. Their abundance and diversity shape decoding capacity as well as the efficiency and accuracy of protein synthesis. Because tRNA abundance is encoded in the genome through tDNA copy number, chromosomal organization, and cis-regulatory sequences controlling transcription, these features are expected to influence the translational system. However, the principles governing nuclear tDNA organization remain poorly understood. Here, we analyzed nuclear tDNA repertoires across 53 photosynthetic eukaryotes spanning major Archa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polycystic ovary syndrome (PCOS) and its underlying features remain poorly understood. In this genetic study (n = 544,513), we expand the number of genetic loci from 16 to 29, and additionally identify 31 associated plasma proteins. Many risk-increasing loci were associated with later age at menopause, underscoring the reproductive longevity related to an increased oocyte number and/or availability across the lifespan. Hormonal regulation in the etiology of this condition, through metabolic and reproductive features, was emphasized. The proteomic analysis highlighted metabolic biology known to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Postmenopause is commonly associated with vasomotor symptoms, musculoskeletal discomfort, weight gain, gastrointestinal (GI) disturbances, and increased cardiometabolic and autoimmune risk. A 52-year-old woman presented with hot flashes, weight gain, joint stiffness and pain, and abdominal bloating. Genomic profiling revealed variants affecting methylation, detoxification, and metabolic regulation. Functional testing identified global sex hormone decline, impaired Phase II estrogen metabolism, vitamin D insufficiency, an atherogenic lipid profile, increased intestinal permeability, and elevate
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Clostridioides difficile infection (CDI) imposes considerable medical and economic burdens on patients and healthcare systems due to its high recurrence rate and treatment refractoriness. Recurrent CDI (rCDI) may result from a relapse of the same strain or reinfection by a different strain. However, the genetic and evolutionary features of strains causing rCDI remain poorly understood. Therefore, in this study, CDI strains were collected from patients with ≥2 clinically defined infections. Through antimicrobial susceptibility testing and whole-genome sequencing (WGS), we investigat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Antimicrobial peptides (AMPs) are considered alternatives to classical antibiotics due to limited resistance developm … ted in the membrane biosynthesis genes pssA and clsB. In vivo infection models, targeted functional genomics, and comprehensive phenotypic cross-resistance testing will be required to validate our results.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования