Since the 1990s West Nile virus (WNV) has become an increasingly important public health problem and the cause of outbreaks of neurological disease. Genetic analyses have identified multiple lineages with many studies focusing on lineage 1 due to its emergence in New York in 1999 and its neuroinvasive phenotype. Until recently, viruses in lineage 2 were not thought to be of public health importance due to few outbreaks of disease being associated with viruses in this lineage. However, recent epidemics of lineage 2 in Europe (Greece and Italy) and Russia have shown the increasing importance of
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycoplasma gallisepticum, a significant respiratory and reproductive pathogen of domestic poultry, has since 1994 been recognized as an emergent pathogen of the American house finch (Carpodacus mexicanus). Epizootic spread and pathognomonic characteristics of house finch-associated Mycoplasma gallisepticum (HFMG) have been studied as a model of an emergent to endemic pathogen in a novel host. Here we present comparative analysis of eight HFMG genomes, including one from an index isolate and seven isolates separated spatially and temporally (1994-2008) across the epizootic, and notably having d
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The O-acyl isopeptide (1) of islet amyloid polypeptide (IAPP), which contains an ester moiety at both Ala8-Thr9 and Ser19-Ser20, was prepared by sequential segment condensation based on the O-acyl isopeptide method. Isopeptide 1 possessed nonaggregative properties, retaining its random coil structure under the acidic conditions; this suggests that the insertion of the O-acyl isopeptide structures in IAPP suppressed aggregation of the molecule. As a result of the rapid O-to-N acyl shift of 1 under neutral pH, in situ-formed IAPP adopted a random-coil structure at the start of the experiment, an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peptides within the knottin family have been shown to possess inherent stability, making them attractive scaffolds for the development of therapeutic and diagnostic agents. Given its remarkable stability to proteases, the cyclic peptide kalata B1 was employed as a scaffold to create a large knottin library displayed on the surface of E. coli. A library exceeding 10(9) variants was constructed by randomizing seven amino acids within a loop of the kalata B1 scaffold and screened using fluorescence-activated cell sorting to identify peptide ligands specific for the active site of human thrombin.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple genotypes of GB virus C (GBV-C)-a non-pathogenic flavivirus-have been identified to date, although they are not uniformly distributed worldwide. It has also been suggested that GBV-C genotype may play a role in modulating HIV disease; however, the prevalence and genotype distribution of GBV-C has not been adequately studied in most countries. Among 408 HIV positive subjects in Germany, 97 (23.8%) had detectable GBV-C RNA. Based on sequencing of the 5' untranslated region (5'-UTR), the GBV-C genotypes were 1 (n=8; 8.2%), 2 (n=81; 83.5%), and 3 (n=2; 2.1%), as well as a unique genotype
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biodegradation of synthetic compounds has been studied extensively, but the metabolic diversity required for catabolism of many natural compounds has not been addressed. 5-Nitroanthranilic acid (5NAA), produced in soil by Streptomyces scabies, is also the starting material for synthetic dyes and other nitroaromatic compounds. Bradyrhizobium JS329 was isolated from soil by selective enrichment with 5NAA. When grown on 5NAA, the isolate released stoichiometric amounts of nitrite and half of the stoichiometric amounts of ammonia. Enzyme assays indicate that the initial step in 5NAA degradation is
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fitness epistasis, the interaction among alleles at different loci in their effects on fitness, has potentially important consequences for adaptive evolution. We investigated fitness epistasis among amino acids of a functionally important region of the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) exterior envelope glycoprotein (gp120). Seven mutations putatively involved in the adaptation of the second conserved to third variable protein region (C2-V3) to the use of an alternative host-cell chemokine coreceptor (CXCR4) for cell entry were engineered singly and in combinations on the wild-type g
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The venom of marine cone snails contains a variety of conformationally constrained peptides utilized by the animal to capture prey. Besides numerous conotoxins, which are characterized by complex disulfide patterns, other peptides with only a single disulfide bridge were isolated from different conus species. Here, we report the synthesis, structure elucidation and biological evaluation of the novel C-terminally amidated decapeptide CCAP-vil, PFc[CNSFGC]YN-NH(2), from Conus villepinii. The linear precursor peptide was generated by standard solid phase synthesis. Oxidation of the cysteine resid
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The flavivirus envelope protein is the dominant antigen in eliciting neutralizing antibodies and plays an important role in inducing immunologic responses in the infected host. It has been shown that highly sulfated forms of heparin sulfate can bind to the envelope protein and are involved in flavivirus infection. Among the three structural domains, domain III is the major antigenic domain of the envelope protein. We have prepared an extended form of the JEV domain III protein with residues ranging from 261 to 402 and determined its heparin binding sites. Based on NMR, fluorescence spectroscop
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The choice of adequate methods for epidemiological purposes remains a challenging problem in Neisseria gonorrhoeae molecular monitoring. In this study, the collection of geographically unrelated gonococci (n = 103) isolated in Russian clinics was comparably tested by (i) a traditional serotyping scheme, (ii) por typing, (iii) Neisseria gonorrhoeae multiantigen sequence typing (NG-MAST), and (iv) multilocus sequence typing (MLST). It is shown that, according to sequencing data, a third of the strains carried new porB1 alleles, as well as tbpB ones, and more than half of the samples had new sequ
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The striatum, a major component of the brain basal nuclei, is central for planning and executing voluntary movements and undergoes lesions in neurodegenerative disorders such as Huntington disease. To perform highly integrated tasks, the striatum relies on a complex network of communication within and between brain regions with a key role devoted to secreted molecules. To characterize the rat striatum secretome, we combined in vivo microdialysis together with proteomics analysis of trypsin digests and peptidomics studies of native fragments. This versatile approach, carried out using different
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The lengths of von Willebrand factor (VWF) concatamers correlate with hemostatic potency. After secretion in plasma, length is regulated by hydrodynamic shear force-dependent unfolding of the A2 domain, which is then cleaved by a specific protease. The 1.9-A crystal structure of the A2 domain demonstrates evolutionary adaptations to this shear sensor function. Unique among VWF A (VWA) domains, A2 contains a loop in place of the alpha4 helix, and a cis-proline. The central beta4-strand is poorly packed, with multiple side-chain rotamers. The Tyr-Met cleavage site is buried in the beta4-strand i
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the changing epidemiology, outbreaks of Hepatitis A Virus (HAV) have been reported from different parts of India. To characterize HAV strains circulating in India (1995-2008), 6 full genome sequences of the predominant genotype, IIIA, were determined. Further, applying the Bayesian Markov Chain Monte Carlo (MCMC) framework to the full genomes of Indian HAV strains as well as other global strains (human as well as simian), we derived the mean nucleotide substitution rate and evolutionary timescales with emphasis on the age of genotype III and IIIA strains. The genomic length of all the 6 H
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A dimer of 156-residue b subunits forms the peripheral stator stalk of eubacterial ATP synthase. Dimerization is mediated by a sequence with an unusual 11-residue (hendecad) repeat pattern, implying a right-handed coiled coil structure. We investigated the potential for producing functional chimeras in the b subunit of Escherichia coli ATP synthase by replacing parts of its sequence with corresponding regions of the b subunits from other eubacteria, sequences from other polypeptides having similar hendecad patterns, and sequences forming left-handed coiled coils. Replacement of positions 55-11
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-chain insulin (SCI) analogs provide insight into the inter-relation of hormone structure, function, and dynamics. Although compatible with wild-type structure, short connecting segments (<3 residues) prevent induced fit upon receptor binding and so are essentially without biological activity. Substantial but incomplete activity can be regained with increasing linker length. Here, we describe the design, structure, and function of a single-chain insulin analog (SCI-57) containing a 6-residue linker (GGGPRR). Native receptor-binding affinity (130 +/- 8% relative to the wild type) is achie
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clostridium botulinum produces seven antigenically distinct neurotoxins [C. botulinum neurotoxins (BoNTs) A-G] sharing a significant sequence homology. Based on sequence and functional similarity, it was believed that their three-dimensional structures will also be similar. Indeed, the crystal structures of BoNTs A and B exhibit similar fold and domain association where the translocation domain is flanked on either side by binding and catalytic domains. Here, we report the crystal structure of BoNT E holotoxin and show that the domain association is different and unique, although the individua
СтатьяПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microcystis aeruginosa is one of the most prevalent bloom-forming cyanobacteria and has been the cause of increasing public health concern due to the production of hepatotoxins (microcystins). To investigate the genetic diversity, clonality and evolutionary genetic background with regard to the toxicity of M. aeruginosa, a multilocus sequence typing (MLST) scheme was developed, based on seven selected housekeeping loci (ftsZ, glnA, gltX, gyrB, pgi, recA and tpi). Analysis of a collection of 164 isolates from Japan and other countries identified 79 unique sequence types (STs), revealing a high
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent work has identified a growing body of evidence that subtle changes in noncoding sequences can result in significant pathology. These mutations, which would have been called silent polymorphisms in the past, affect gene transcription and mRNA splicing and lead to drastic changes in gene expression. Previous work from our lab has characterized the murine flexed-tail (f) mutation, which encodes Smad5, a transcription factor that functions downstream of the receptors for bone morphogenetic proteins (BMPs). f/f mice are unable to rapidly respond to acute anemia. Our analysis of these mice le
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hepatitis C virus (HCV) envelope genes encoding glycoproteins E1 and E2 exhibits a high degree of variability that gives rise to differing phenotypic traits; including alterations in receptor-binding affinity and immune recognition and escape. This study aims to elucidate the relationship of the evolutionary patterns for HCV envelope glycoproteins to viral persistence.
METHODS: HCV quasispecies were characterized in specimens collected every two to six months from a cohort of acutely HCV-infected subjects. We evaluated two individuals who spontaneously cleared viremia and three in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In India, rabies is enzootic and is a serious public health and economic problem. India has a large population of stray dogs which, together with a lack of effective control strategies, might have led to the persistence of rabies virus (RV) in the canine population. Our objective was to study the molecular epidemiology of RV isolates in India based on nucleotide sequence analysis of 29 RV isolates originating from different species of animals in four states. Here we have analyzed two sets of sequence data based upon a 132-nucleotide region of the cytoplasmic domain (CD) of the G gene (G-CD) an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования