Primary gene amplification, the mutation from one copy of a gene per genome to two or more genes per genome is a major mechanism of oncogene overexpression. We previously developed a system in the yeast Saccharomyces cerevisiae to phenotypically detect primary amplifications of a reporter cassette, ADH4:CUP1. We present here the sequence analysis of novel joints from four independent, spontaneous circular amplifications identified by the ADH4:CUP1 system. All four novel joints consist of C(1-3) A telomeric repeats joined to short (14- to 16-bp) CA-rich tracts between ADH4 and the telomere of c…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As an increasing number of gene alterations have been discovered in intrahepatic cholangiocarcinoma (ICC), molecular targets are promising for the diagnosis and treatment of distinct subpopulations carrying unique molecular signatures. C-MET amplification is associated with a variety of tumors, including ICC; however, the characteristics of this alteration have not been assessed in ICC. By determining the ratios of C-MET/chromosome enumeration probe (CEP) 7 double-colour probes, we evaluated the presence of C-MET amplification in a cohort of 133 ICC tumors by fluorescence in situ hybridization
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The amplicon on 8p11.2 is reported to be found in up to 10% of breast carcinomas. It has been demonstrated recently that this amplicon has four separate cores. The second core encompasses important oncogene candidates, including the fibroblast growth factor receptor 1 (FGFR1) gene. Recent studies have demonstrated that specific FGFR1 amplification correlates with gene expression and that FGFR1 activity is required for the survival of a FGFR1 amplified breast cancer cell line.
METHODS: FGFR1 amplification was analysed in tissue microarrays comprising a cohort of 880 unselected brea
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Direct sequencing of specific regions of genomic DNA became feasible with the invention of the polymerase chain reaction (PCR) which permits amplification of specific regions of DNA. Recently, human mitochondrial DNA was amplified and directly sequenced. Using a thermostable DNA polymerase of T. aquaticus (Saiki, R.K. et al., manuscript in preparation) in the PCR, we have applied a combination of PCR and direct sequence analysis of the amplified product to a human single-copy gene. We studied the genomic DNA of five patients with beta-thalassaemia whose mutant alleles were uncharacterized, and
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Individuals with alpha(α)-thalassaemia usually have evidence of microcytosis but showed normal haemoglobin A2 and F, except those with three or four gene deletions or those with abnormal Haemoglobin (Hb) such as Hb Constant Spring (HbCS). Definitive diagnosis requires molecular analysis. Multiplex amplification refractory mutation system (ARMS) and gap PCR are reliable for detecting common α-gene mutations; however, many rare or novel mutations remain unidentified. Using principle of primer-specific amplification, abnormality analysed is primer-dependent. This study aimed to comp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Disregulation of urokinase plasminogen activator (uPA) was assessed in 134 breast cancer specimens. Overexpression of uPA was determined by immunohistochemistry using the specific monoclonal antibody, #394. Gene amplification was assessed by differential polymerase chain reaction, using primers designed to amplify a 111 bp segment of the uPA gene. Overexpression of uPA was detected in 33% of breast cancers, including 4 of 21 in situ carcinomas, 7 of 14 lobular and 2 of 10 tubular carcinomas. Overexpression of uPA did not correlate with the presence or absence of oestrogen receptors. uPA gene a…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mini-exon gene is unique and is tandemly repeated in the Leishmania genome. The transcribed region is highly conserved, but the non-transcribed spacer region is distinct in length and in sequence among different Leishmania species. The usefulness of PCR amplification of the Leishmania mini-exon gene was examined for molecular epidemiology of visceral and cutaneous leishmaniasis. We previously described a PCR method for amplification of the mini-exon gene and obtained positive amplification in bone marrow aspirates of patients with visceral leishmaniasis in China. In this study, we have clo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Embryonal brain tumors, which include medulloblastoma and the more aggressive supratentorial primitive neuroectodermal tumor (sPNET), comprise one of the largest group of malignant pediatric brain tumors. We observed in high resolution array comparative genomic hybridization and polymerase chain reaction analyses that several different components of the CDK/CYCLIND/pRB regulatory complex, including the CDK4/6 and CCND1/2 loci, are targets of gene amplification in medulloblastoma and sPNET. CDK6 and CCND1 gene amplification were respectively most common and robust, and overall CDK/CYCLIND gene …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Primary gene amplification, the mutation from one gene copy per genome to two or more copies per genome, is a major mechanism of oncogene overexpression in human cancers. Analysis of the structures of amplifications can provide important evidence about the mechanism of amplification formation. We report here the analysis of the structures of four independent spontaneous circular amplifications of ADH4:CUP1 in the yeast Saccharomyces cerevisiae. The structures of all four amplifications are consistent with their formation by a breakage-fusion-bridge (BFB) mechanism. All four of these amplificat…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amplification of markers centred on band q13 of human chromosome 11 is a consistent feature in a subset of oestrogen receptor positive breast cancers. Although the amplification was initially scored via FGF3/INT2, which has strong credentials as a mammary oncogene, current data suggest that some other gene on 11q13 provides the driving force for amplification. Here we have reviewed our understanding of the amplified DNA, the genes it encompasses and the evidence in favour of two candidate oncogenes, CCND1 and EMS1. As well as being among the most frequently amplified markers in the region, the
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: The purpose of this study was to analyze the protein overexpression and gene amplification of HER2 in endometrial carcinoma (EC) and to evaluate its role as a prognostic factor in Korean women. Methods: A tissue microarray (TMA) was constructed from samples from 191 patients with diverse histologic types of EC. HER2 protein expression and gene amplification status were analyzed using immunohistochemistry (IHC) and silver in situ hybridization (SISH), respectively. All patients were treated and followed up at a single tertiary medical center in Seoul, Korea, between July 2009 and Oct…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & OBJECTIVE: Although the concordance between immunohistochemistry (IHC) and fluorescence in situ hybridization (FISH) is generally high for HER2 scores of 3+ and 1+, discrepancies remain in cases scored as IHC 2+. This study aimed to evaluate HER2/neu gene amplification using FISH in breast cancer patients with IHC 2+ and to examine associated clinicopathological characteristics.
METHODS: This retrospective study included tissue samples from 369 women diagnosed with invasive ductal carcinoma of the breast and an equivocal HER2 IHC score (2+). These samples were further assessed fo…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To construct the recombinant secretion type BCG-Eg95 vaccine of Echinococcus granulosus (rsBCG-Eg95).
METHODS: BCG-Ag85B signal sequence with 117 bp and Eg95 gene with 471 bp were amplified from the genome of BCG and pGEX-4T-Eg95 by PCR, respectively. BCG-Ag85B signal coding gene and Eg95 gene were cloned into E. coli-BCG shuttle-vector pMV261 to get the recombinant plasmid pSMEg95, which was confirmed by restriction endonuclease digestion, PCR amplification and gene sequencing. These recombinant plasmids were introduced into BCG by electroporation for the construction of rsBCG-Eg9
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The aim of this study was to investigate ErbB2 expression in osteochondroma and its relationship with clinicopathologic features … not statistically significant (p=0.336). However, 13 of the 30 (43.3%) osteochondromas showed ErbB2 gene amplification, which was failed to be observed in any of the non-neoplastic bone tissue. ErbB2 gene amplification in osteochondroma was significantly higher compared with that in non-neoplastic bone tissue (p=0.001). In addition, the ErbB2 gene amplification was …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Our understanding of the rapid adaptation of bacteria to resist novel drugs is growing beyond known mechanisms such as mobile genetic elemen … t failure also demonstrates amplification, highlighting the potential relevance of this β-lactamase gene amplification-mediated HR. These data provide insights into factors controlling dynamics of HR and how bacteria can use gene amplification to flexibly confront new antibiotic threats.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular assays related to cell proliferation correlate with stage and/or survival in a variety of tumors. We immunostained formalin-fixed, paraffin-embedded tissue sections from 61 patients with gastric adenocarcinoma (21 biopsy and 40 gastrectomy specimens) for cyclin A, cyclin B1, p34cdc2, p120, MIB1, and proliferating cell nuclear antigen (PCNA) by automated methods. HER-2/neu gene amplification was analyzed by automated fluorescence in situ hybridization (FISH). Immununostains, FISH results, and pathologic stage were compared with length of survival. Forty-three percent of the cases show…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fifty-five isolates of Escherichia coli from septicaemic neonatal foals were used to validate five real-time pcr assays targeting different known virulence factor genes: curli fibre (csgD), ferric hydroxamate uptake (fhuA), type 1A pilin (fimA), aerobactin (lutA) and yersiniabactin (fyuA). A pcr assay targeting a universal sequence of the bacterial 16S rrna gene served as quality control. The pcr assays showed good analytical specificity and sensitivity on the basis of sequencing the pcr products, their lack of cross-reactivity with non-E coli organisms, high amplification efficiency and a lim
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The spike (S) protein of the severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) is important for vaccine development. S(TR2) (an 88 kDa truncated SARS-CoV TW1 S protein carrying the S fragments S-74-253, S-294-739, and S-1129-1255) is capable of expressing a major form of glycoprotein as endo H-sensitive (∼115 kDa) in CHO cells. To establish stable expressing cell clones, we transfected CHO/dhFr-cells with the amplifiable vectors ISID (IRES-driven dhfr) and ISIZ (SV40-driven dhfr) to select stepwise MTX, and observed enhanced ∼115 kDa glycoform generation through gene amplification. Foll…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Angiosarcoma is a rare, devastating malignancy with few curative options for disseminated disease. We analyzed a recently published genomic data set of 48 angiosarcomas and noticed recurrent amplifications of HOXA-cluster genes in 33% of patients. HOXA genes are master regulators of embryonic vascular development and adult neovascularization, which provides a molecular rationale to suspect that amplified HOXA genes act as oncogenes in angiosarcoma. HOXA amplifications typically affected multiple pro-angiogenic HOXA genes and co-occurred with amplifications of CD36 and KDR, whereas the overall
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования