The increase in multi drug resistance (MDR) amongst food-borne pathogens such as Escherichia coli O157:H7, coupled with the upsurge of food- … oM_EP32a, vB_EcoP_EP32b, and vB_EcoM_EP57) were composed of linear double-stranded DNA (dsDNA) with genome sizes 163,906, 156,698, and 130,723 bp and GC contents of 37.61, 37, and 39% respectively. Phages vB_EcoM_EP32a and vB_EcoP_EP32b genomes were classified under the class Caudoviricetes, Straboviridae family, and the new genus "Phapecoctavirus", while vB_ …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Siphonophores (Cnidaria: Hydrozoa) are pelagic colonial marine invertebrates with many highly specialized bodies (zooids) within a single co … omia species raises the possibility of reproductive isolation in sympatry. Phylogenetic analyses of genome size indicate Nanomia septata and Nanomia cara have similarly large genomes around 1.7 GB, while Nanomia bijuga and an undescribed species show a secondary reduction to 0.7 GB. These results highlight how genomic factors have shaped colony organization a …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Streptococcus pneumoniae remains a major global health threat, causing diseases ranging from mild respiratory infections to seve … resistance determinant genes, pan-genome structure, and recombination events.
RESULTS: The average genome size was ∼2.12 Mbp, with 1 988-2 205 coding sequences. WGS-based MLST identified five sequence types (ST236, ST320, ST386, ST671, ST695), with ST236 linked to serotypes 19A and 19F related to PMEN clones Taiwan19F-14 and CC271. Core genome analysis with …
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mycobacterium tuberculosis (Mtb) lineage 4 (L4) remains as a crucial component of the pathogen. Genetic factors potentiate the spread of Mtb, while the genomic feature and epidemic success at individual level of L4 strains have not been fully illustrated, especially in China. Therefore, the current study aimed to obtain additional understanding on the pan-genome architecture and transmission of the pathogen.
RESULTS: The results first revealed a low proportion of soft-core genes (28.66%) and high genetic diversity for Mtb L4 strains in eastern China. The pan-genome size increased …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Klebsiella variicola is an emerging bacterial pathogen commonly associated with opportunistic human infections.
METHODS: In this study, we characterized and analyzed the core genome of a β-lactam-resistant K. variicola subsp. variicola isolate from a human in Kunming, Yunnan, China.
RESULTS: The human-derived β-lactam-resistant K. variicola genome was assembled into 37 contigs, with a total genome size of 5,667,700 bp. K. variicola comprises multiple antimicrobial resistance (AMR) genes, including blaLEN-22, fosA, OqxA, and OqxB, as well as the virulence-associated factors fimH…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Pacific geoduck Panopea generosa (class Bivalvia, order Adapedonta, family Hiatellidae, genus Panopea) is the largest known burrowing bivalve with considerable commercial value. Pacific geoduck and other geoduck clams play important roles in maintaining ecosystem health for their filter feeding habit and coupling pelagic and benthic processes. Here, we report a high-quality chromosome-level genome assembly of P. generosa to characterize its phylogeny and molecular mechanisms of its life strategies. The assembled P. generosa genome consists of 19 chromosomes with a size of 1.47 Gb, a contig
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we present the molecular and insecticidal characteristics of an indigenous Bt isolate T405 toxic against the maize fall armyw … spension. The whole genome sequencing and assembly of T405 produced a total of 563 scaffolds with a genome size of 6,673,691 bp. The BLAST similarity search showed that 12 plasmids were distributed in this genome. Genome annotation revealed the presence of 6174 protein coding genes, 13 rRNA and 98 tRNA, in which 6126 genes were completely annotated for their …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Consumption of fermented Prunus mume fruit (maesil) sugar syrup raise a health concern due to the presence of the cyanogenic glucoside amygd … ated yeast. The whole-genome analysis revealed that the isolated yeast is Zygosaccharomyces rouxii (genome size 10 Mb, 39.25% of GC content). Of the 5250 genes (64.88%) predicted in the Z. rouxii genome, 5245 (99.90%) were annotated using NCBI Non-Redundant, UniProt, and InterProScan databases. The genome of the isolated Z. ruoxii harbored 2.03% of repeats an …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Poultry farming faces fowl cholera caused by Pasteurella multocida, yet genomic data are limited. Isolates from ISA Browns were identified using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDI-TOF) and sequenced (8.6, 1.4, and 1.3 M reads). De novo assemblies revealed genome sizes of ~2.4-2.5 Mb and guanine or cytosine (GC) content of ~40%.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
White spot syndrome virus (WSSV) poses a significant threat to shrimp aquaculture, leading to substantial economic losses. This study aims to evaluate the virulence and evolution of recent WSSV outbreaks in Japan. Shrimp infected with WSSV were collected from Okinawa, Miyakojima and Miyazaki prefectures, yielding a total of seven isolates. Through injection and immersion tests, the lethal dose 50% endpoints were determined. Genomic analysis revealed isolates with sizes ranging from 288 to 299 kbp, sharing ~99% nucleotide identity with the reference genome (CN01: NC_003225.3). Variant analysis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The size of the human head is highly heritable, but genetic drivers of its variation within the general population remain unmapped. We perform a genome-wide association study on head size (N = 80,890) and identify 67 genetic loci, of which 50 are novel. Neuroimaging studies show that 17 variants affect specific brain areas, but most have widespread effects. Gene set enrichment is observed for various cancers and the p53, Wnt, and ErbB signaling pathways. Genes harboring lead variants are enriched for macrocephaly syndrome genes (37-fold) and high-fidelity cancer genes (9-fold), which is not se
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis B virus (HBV) infection is one of the major global health problems, especially in economically under-developed or developing count … possible due to economic reasons. Although HBV is among the smallest viruses in terms of virion and genome size, it has numerous unique features that make it completely distinct from other DNA viruses. It has a partially double stranded DNA with highly complex genome organization, life cycle and natural history. Remarkably distinct from other DNA viruses, it …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Herpesviruses or herpesviral sequences have been identified in various bat species. Here, we report the isolation, cell tropism, and complete genome sequence of a novel betaherpesvirus from the bat Miniopterus schreibersii (MsHV). In primary cell culture, MsHV causes cytopathic effects (CPE) and reaches peak virus production 2 weeks after infection. MsHV was found to infect and replicate less efficiently in a feline kidney cell, CRFK, and failed to replicate in 13 other cell lines tested. Sequencing of the MsHV genome using the 454 system, with a 224-fold coverage, revealed a genome size of 22…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human adenovirus type 37 (HAdV-37) is a major etiologic agent of epidemic keratoconjunctivitis, a common and severe eye infection associated with long-term visual morbidity due to persistent corneal inflammation. While HAdV-37 has been known for over 20 years as an important cause, the complete genome sequence of this serotype has yet to be reported. A detailed bioinformatics analysis of the genome sequence of HAdV-37 is extremely important to understanding its unique pathogenicity in the eye.
RESULTS: We sequenced and annotated the complete genome of HAdV-37, and performed genomi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica serovar Dublin is highly adapted to cattle and a relatively rare cause of human infections. In Denmark S. Dublin has been endemic in the cattle population for many years. A national surveillance program in the cattle population was established at herd-level to reduce the occurrence of S. Dublin. In this study, we analyzed 421 S. Dublin genomes from cattle and food in order to determine the trend of S. Dublin's population size over time in Denmark and the impact of intervention in the cattle industry on the bacterial population size. A phylogenetic tree based on SNPs exhibit
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel human retrovirus (HTLV-II) was previously found associated with a T-cell variant of hairy-cell leukaemia. Molecular cloning demonstrates that the complete provirus genome is 8.8 kilobase pairs in size and is transmissible to uninfected cells. Two types of infectious deleted provirus were also characterized. The sequences of HTLV-II are distinct from those of HTLV-I.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stelechocarpus burahol (kepel) is valued for its aromatic fruits and medicinal leaves, yet its genomic and phytochemical features remain poorly characterized. This study estimated the nuclear DNA content of kepel leaves at 3.96 pg per haploid genome (genome size: 3873 Mbp) and comprehensively profiled their bioactive metabolites. Leaf extracts prepared with water and 70% ethanol, with or without pulsed electric field (PEF) treatment, were analyzed using HPLC-MS, UHPLC-QTOF-MS, HPLC-DAD, and GC-MS. Leaf extracts showed the highest phenolic and flavonoid contents, with PEF markedly improving eth…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Vibrio parahaemolyticus is a major foodborne pathogen that contaminates aquatic products and causes great economic losses to aqu … 0 min) and a small burst size (13 plaque-forming units). R16F has a linear double-stranded DNA with genome size 139,011 bp and a G + C content of 35.21%. Phylogenetic and intergenomic nucleotide sequence similarity analysis revealed that R16F is distinct from currently known vibriophages and belongs to a novel genus. Several genes (e.g., encoding ultraviolet …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
1. Salmonella enterica remains the key cause of salmonellosis in poultry, causing high morbidity and mortality. Due to the unprecedented resistance of S. enterica to antibiotics, bacteriophages have emerged as a powerful alternative to conventional antibiotics treatment for salmonellosis.2. In this study, a strain was isolated from infected broiler chickens and whole-genome sequencing (WGS) identified the strain SFD-01 as S. enterica subsp. enterica. Bioinformatics analyses revealed that the genome was 4.6 Mb in size with 4559 coding sequences (CDS), 77 tRNAs and 4 rRNAs. Additionally, 119 vir
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The scaly-sided merganser, Mergus squamatus, is an Endangered piscivorous duck which has been declining since the late 1900s due to habitat loss, over-hunting, and climate change. Despite being a species of global conservation concern and subject to ex- and in-situ conservation efforts, genomic research has been limited, hindering our understanding of its population genetic status and evolutionary history. In this study, we present the first fully annotated, chromosome-level genome for the scaly-sided merganser, generated using Oxford Nanopore long reads, Illumina short reads, and Hi-C sequenc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования