Many wildlife conservation efforts focus on the effects of one pathogen, but for many conservation efforts to be successful, researchers require an understanding of ecological processes that may include multiple co-occurring pathogens. We developed a multiplex quantitative PCR (qPCR) assay to detect four pathogens in eastern box turtles (Terrapene carolina carolina), including frog virus 3 (FV3), Terrapene herpesvirus 1 (TerHV1), box turtle Mycoplasma sp. (BTMyco), and Terrapene adenovirus (TerAdv). TaqMan™ primer probes were designed using previously published assays with four different fluor
СтатьяВалидационное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bovine tuberculosis (bTB) is a chronic disease caused by members of the Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) that ultimately leads to the development of progressive granulomatous lesions. Although the disease is widespread, especially in crossbred cattle in Ethiopia, routine investigations and surveillance are lacking. Thus, the aim of this study was to determine the prevalence, associated risk factors, and species of mycobacteria causing bTB in slaughtered cattle at four slaughterhouses in Central Ethiopia.
METHODS: Postmortem examination of 7,640 cattle was conducted using
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Beak atrophy and dwarfism syndrome (BADS) is commonly caused by co-infection with duck circovirus (DuCV) and novel goose parvovirus (NGPV). Therefore, concurrent detection of both viruses is important for monitoring and limiting BADS, although such a diagnostic test has not been reported. In this study, we developed a duplex, SYBR Green I-based real-time polymerase chain reaction (PCR) assay to enable the simultaneous detection of DuCV and NGPV. The assay readily distinguished between the two viruses, based on their different melting temperatures (Tm), where the Tm for DuCV was 80 °C and that
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular diagnostics are increasingly used in the blood bank industry. A device that can combine simultaneous detection of multiple targets with the flexibility of inclusion of emerging pathogens is desirable for testing blood products. A highly multiplexed blood-borne pathogen panel (BBPP) using dual-label probe chemistry (TaqMan assays) was developed for simultaneous detection and discrimination of 17 viral pathogens in human plasma samples and 13 bacterial and protozoan pathogens in human blood samples on the OpenArray platform. The custom BBPP OpenArray plate was tested for specificity an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Following the success of nucleic acid-based detection in virology and bacteriology, multiplex real-time PCRs are increasingly used as first-line diagnostics in clinical parasitology, replacing microscopy. The detection and quantification of parasite-specific DNA in faeces is highly sensitive and specific and allows for cost-effective high-throughput screening. In this paper we discuss the clinical consequences of this radical change in diagnostic approach, as well as its potential drawbacks. In the Netherlands, routine diagnostic laboratories have been pioneering the implementation of multiple
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To develop a rapid, sensitive and specific assay method, based on multiplex real time PCR for identifying Vibrio cholerae and distinguishing Vibrio cholerae O139 serotype from Vibrio cholerae.
METHODS: Cholera toxin A subunit gene (ctxA) and glycosyltransferase gene (LPSgt) were chosen as targets according to Vibrio cholerae and Vibrio cholerae O139 serotype, and then the primers and TaqMan-MGB probe were designed. The 5'end of probes was labeled with FAM and VIC fluoresceins respectively while the 3'end of probes was labeled with MGB. The PCR reaction was optimized systematically.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) lacks sensitive molecular biomarkers for early detection of disease recurrence and monitoring. Recurrent splice variants (SVs) offer promising diagnostic potential for capturing tumor-specific signals in circulating blood. In this study, we report a multiplex reverse transcription-polymerase chain reaction sequencing assay to quantify ccRCC-specific SVs in tumor tissue and plasma samples.
METHODS: A 56-target reverse transcription-polymerase chain reaction panel was designed to amplify 27 previously identified ccRCC-associated SVs, 24 matche
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dengue virus (DENV) is one of the most prevalent arboviral threats worldwide. The virus is associated with a high health and economic burden mainly in tropical and subtropical regions. Available molecular tools however fail to correctly serotype and sequence sylvatic DENV-2 (DENV-2/GVI) which in known to circulate in forests in West Africa and Malaysia. The recent emergence of human case linked to this virus variant in Southern Senegal raises concerns about the correct detection and characterization of the virus for public health purposes. Here we developed and validate new sets of oligonucleo
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Swine harbors a genetically diverse population of swine influenza A viruses (IAV-S), with demonstrated potential to transmit to the human population, causing outbreaks and pandemics. Here, we describe the development of a one-step, triplex real-time reverse transcription-polymerase chain reaction (rRT-PCR) assay that detects and distinguishes the majority of the antigenically distinct influenza A virus hemagglutinin (HA) clades currently circulating in North American swine, including the IAV-S H1 1A.1 (α), 1A.2 (β), 1A.3 (γ), 1B.2.2 (δ1) and 1B.2.1 (δ2) clades, and the IAV-S H3 2010.1 clade. W
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Fexuprazan is a novel potassium-competitive acid blocker that provides rapid and potent acid suppression and may serve as an a … ice daily for 10 days. Clarithromycin resistance was assessed by dual-priming oligonucleotide-based multiplex polymerase chain reaction for 23S rRNA point mutations, and cytochrome P450 2C19 genotyping was performed for subgroup analysis.
RESULTS: A total of 93 patients were enrolled, and 88 completed the eradication therapy. The eradication rates were 90.3% (84/93) in the intentio …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Congenital human herpesvirus 6 (HHV6) infection occurs in 1% of the general population and may result from the transmission of an inherited chromosomally integrated HHV6 (iciHHV6) or transplacental infection. It is mostly asymptomatic.
CASE REPORTS: Case 1: a 29th-week-old female preterm newborn, admitted to the neonatal intensive care unit, became clinically unstable and irritable on the 20th day of hospitalization. Cranial ultrasound, revealed a significant posthemorrhagic tetraventricular dilation, with signs of ventriculitis. Investigations revealed HHV6 positivity on cerebr
СтатьяКлинический случайОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To develop a multiplex polymerase chain reaction (PCR) assay for the rapid detection of Brucella ovis, Actinobacillus seminis, Histophilus somni in fresh ram semen samples.
DESIGN: The multiplex assay was based on the single PCR assays published for the detection of A seminis and B ovis, and the forward primer published for the detection of H somni; an alternative reverse primer for H somni was designed in this study.
PROCEDURE: Culture and PCR of 295 fresh semen samples were carried out.
RESULTS: The multiplex PCR was far more successful in the detection of H somni (45/295) than…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The diagnosis of cutaneous leishmaniasis (CL) is typically based on microscopic examination of Giemsa-stained smear. However, this method can lead to false negative and false positive results. Therefore, the study aimed to identify L. major and L. tropica species by investigating microscopically negative smears suspected of CL using the multiplex nested polymerase chain reaction (PCR) method.
MATERIALS AND METHODS: This study was conducted on 227 microscopically negative specimens from individuals suspected of having CL referred to the CL Treatment and Diagnosis Center in Gonbad-e
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sexually transmitted infections (STIs) remain a significant global public health challenge. The rapid and precise identification of these pathogens is crucial for effective diagnosis and treatment. Current polymerase chain reaction (PCR)-based assays, despite their widespread use, present several limitations in clinical settings, including high costs and technical complexity. To address these challenges, we developed a portable and automated microfluidic nucleic acid detection device for multiplex detection of three sexually transmitted pathogens via the fluorescence quantitative PCR (qPCR) as
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A multiplex reverse transcriptase-polymerase chain reaction (multiplex RT-PCR) assay was developed and subsequently evaluated for its efficacy in the detection of multiple viral infections simultaneously, in swine. Specific primers for each of the 3 RNA viruses, North American genotype porcine reproductive and respiratory syndrome virus, Japanese encephalitis virus, and swine influenza virus, were used in the testing procedure. The assay was shown to be highly sensitive because it could detect as little as 10-5 ng of each of the respective amplicons in a single sample containing a composite of
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To accurately discriminate between individual metacercariae of Paragonimus heterotremus and P. westermani occurring in Thailand, polymerase chain reaction (PCR)-based molecular methods were established and subjected to an evaluation. We first amplified and sequenced the second internal transcribed spacer (ITS2) region of the nuclear ribosomal DNA of the two species. Based on their nucleotide differences, P. heterotremus and P. westermani were unequivocally discriminated from each other. These nucleotide differences were further utilized to select the ApaL1 endonuclease site for PCR-restriction
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Third-generation cephalosporin resistance is often mediated by TEM- and SHV-type beta-lactamases in Enterobacteriaceae. TEM-type and OXA-1 enzymes are the major plasmid-borne beta-lactamases implicated in amoxicillin-clavulanic acid resistance in Escherichia coli isolates. We have developed a rapid and simple multiplex polymerase chain reaction (PCR) which discriminates bla(TEM), bla(SHV) and bla(OXA-1) genes by generating fragments of 516, 392 and 619 bp respectively. Multiplex PCR analysis of 51 amoxicillin-clavulanate resistant E. coli isolates detected bla(TEM) and bla(SHV) genes in 45 and…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Preimplantation genetic diagnosis was performed in 122 embryos obtained by IVF from 11 patients carriers of haemophilia, Duchenne's muscular dystrophy, Barth's syndrome, cystic fibrosis, Pelizaeus-Merzbacher syndrome or Rett's syndrome. After multiplex polymerase chain reaction (PCR) or fluorescence in situ hybridization (FISH) analysis with multiple probes, 28 embryos diagnosed as not affected were replaced. Of these, eight implanted (28%) and produced three ongoing pregnancies, three deliveries of four babies and a biochemical pregnancy. However, one case screened for cystic fibrosis was mis…
Клиническое исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A traditional nested reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) assay specific for eastern equine encephalomyelitis (EEE) virus was designed to multiplex with a previously described West Nile (WN) virus nested RT-PCR assay. Differentiation of EEE and WN was based on base pair size of the amplified product. One hundred fifty-seven mammalian and avian brain tissues were tested by EEE/WN nested multiplex RT-PCR, EEE nested RT-PCR, and WN nested RT-PCR, and results were compared with other diagnostic test results from the same animals. Serological and virus isolation testing confirme
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Veterinary radiology & ultrasound : the official journal of the American College of Veterinary Radiology and the International Veterinary Radiology Association2024eng
An 8-year-old neutered male Maltese dog presented with a month-long history of progressive nonambulatory tetraparesis. MRI revealed a well-defined, centrally nonenhanced, T1-weighted hypointense, extradural structure located in the vertebral canal at the level of the C5 vertebral body. CT demonstrated a hypoattenuating, space-occupying structure in the same area. Surgery revealed a long, narrow parasite in the epidural space. An adult Dirofilaria immitis was confirmed by multiplex polymerase chain reaction (PCR) assay. This is a novel report describing the MRI and CT features of cervical epidu…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования