High-fidelity single-nucleotide-resolution mapping of abasic (AP) sites in mammalian genomes remains technically challenging due to low abundance and high background. Here we present DEPACE-seq (Dual-End PAB-Conjugated Endo IV-Cleaved Sequencing), a robust and easy-to-implement method for precise genome-wide profiling of AP sites. DEPACE-seq employs an N-pyrrolyl-alanine-2,2'-(ethylenedioxy)bis(ethylamine)-biotin (PAB) probe that selectively conjugates AP sites via a mild Pictet-Spengler reaction. The resulting PAB-AP adducts are efficiently and specifically cleaved by endonuclease IV, while r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs (miRNAs) are key regulators of numerous physiological and pathological processes and hold substantial promise for disease diagnosis and therapeutic evaluation. Although a variety of quantitative miRNA assays have been reported, none are suitable for real-time monitoring of miRNA release from live cells due to prolonged assay times, insufficient sensitivity, or interference from complex sample matrices. Herein, we report a novel amplification-free assay based on hybridization of a single-stranded DNA (ssDNA) probe to the target miRNA and fluorescence readout of the resulting DNA-RNA h
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background. Numerous countries use the EXTEL HEMO-AUTO MC quantitative faecal immunochemical test (qFIT) to screen for faecal haemoglobin. We aimed to determine if bacterial 16S rRNA gene sequencing results from the leftover qFIT cassettes would be stable over time and comparable with larger volume faecal collection protocols.Methods. Four qFIT probe samples were taken from each of sixteen fresh healthy volunteer stool samples, and sequencing results were compared after 0, 4, 7 and 14 days to provide a baseline control and mimic postage and sample processing conditions in cancer screening prog
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: This study aims to analyze and compare salivary periodontal pathogens in patients with concomitant periodontitis (CP) and rheumatoid arthritis (RA) versus those with CP alone. METHODS: A total of 62 patients with CP + RA, 29 patients with CP alone, and 24 healthy controls were included. Periodontal parameters, including sulcus bleeding index (SBI), periodontal pocket probing depth (PPD), and clinical attachment loss (CAL), as well as RA-related indices, erythrocyte sedimentation rate, C-reactive protein, anti-cyclic citrullinated peptide antibody (anti-CCP), and rheumatoid factor (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The crosstalk between cancer cells and cancer-associated fibroblasts (CAFs) plays a pivotal role in maintaining immunosuppressive tumor microenvironment (iTME) and promoting tumor progression and metastasis. Herein, we first verify that the presence of CAFs significantly promotes colorectal cancer progression and causes an iTME in mouse model and publicly available single-cell data. Then, we constructed a ferritin-based dual-targeting delivery system, named HFAI (mHFn-FAPI@ATMi/ICG), to prevent communications between cancer cells and CAFs to enhance colorectal cancer immunotherapy. Indeed, mou
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of the "super fungus" Candida auris poses a significant threat to human health, given its multidrug resistance and high mortality rates. Therefore, developing a new antifungal strategy is necessary. Our previous research showed that Baicalein (BE), a key bioactive compound from the dried root of the perennial herb Scutellaria baicalensis Georgi, has strong fungistatic properties against C. auris. Nevertheless, the antifungal activity of BE against C. auris and its mechanism of action requires further investigation. In this study, we explored how BE affects this fungus using vario
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Cervical cancer is fourth the most common cancer in women worldwide. Due to the prevalence of human papillomavirus (HPV) in the population (80-90%), scientists are likely to discover even more associations of this pathogen with other diseases in the future. In recent years, In Situ Hybridization (ISH) assays that use automated signal-detecting methods in formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) cervical tissue, such as the enzyme-categorized signal-detecting system, have shown a higher sensitivity. Objectives and Methods: To evaluate automatic signal detection of ISH assay for dete
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcriptional regulation of azole resistance in the filamentous fungus Aspergillus fumigatus is a key step in development of this problematic clinical phenotype. We and others have previously described a C2H2-containing transcription factor called FfmA that is required for normal levels of voriconazole susceptibility and expression of an ATP-binding cassette transporter gene called abcG1 . Null alleles of ffmA exhibit a strongly compromised growth rate even in the absence of any external stress. Here we employ an acutely repressible doxycycline-off form of ffmA to rapidly deplete FfmA protei
ПрепринтСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Echinococcosis is a neglected tropical zoonotic infection that affects both the human and livestock populations. In Pakistan, the infection is long-standing, but data on its molecular epidemiology and genotypic characterization in the southern Punjab region are limited. The aim of the current study was the molecular characterization of human echinococcosis in southern Punjab, Pakistan.
METHODS: Echinococcal cysts were obtained from a total of 28 surgically treated patients. Patients' demographic characteristics were also recorded. The cyst samples were subjected to further proce
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The oligomeric amyloid-β (oAβ) is a reliable feature for an early diagnosis of Alzheimer's disease (AD). Therefore, the objective of this study was to demonstrate imaging of oAβ deposits using our developed DNA aptamer called ob5 conjugated with gadolinium (Gd)-dodecane tetraacetic acid (DOTA) as a contrast agent for early diagnosis of AD using MRI. An oAβ-specific aptamer was developed by amide bond formation and conjugated to Gd-DOTA MRI contrast agent and/or cyanine5 (cy5). We verified the performance of our new contrast agent with an AD mouse model using in vivo and ex vivo fluorescent ima
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Burkholderia pseudomallei causes a fatal and infectious disease, melioidosis or Whitmore's disease in humans and animals. Melioidosis is present in different parts of the world and is endemic in Southeast Asia and Northern Australia. Accurate diagnosis of melioidosis is difficult due to its common flu-like symptoms, potentially long incubation period and erroneous identification as culture contaminant. Early diagnosis of the disease is essentially required for administration of suitable antibiotics and disease containment. The present study reports a rapid, specific and sensitive recombinase p
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The novel zinc(II) µ-oxo-bridged-dimeric complex [Zn2(µ-O)2(BMIP)2] (BMIP = 1,3-bis(5-methoxy-1-methyl-1H-indol-3-yl)propane-1,3-dione), 1, was synthetized and fully characterized. The spectral data indicate a zincoxane molecular structure, with the BMIP ligand coordinating in its neutral form via its oxygen atoms. Structural changes in 1 in dimethylsulfoxide (DMSO) were evidenced by means of spectroscopic techniques including infrared absorption and nuclear magnetic resonance, showing DMSO entrance in the coordination sphere of the metal ion. The resulting complex [Zn2(µ-O)2(BMIP)2(DMSO)], 2,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Seeing the global emergence and the lack of a definitive cure for COVID-19, it is essential to find the most sensitive and specific detection method to identify infected patients in a timely manner. Our paper aims to compare the clinical sensitivity of different commercial RT-qPCR (Genesig, 1copy, DNA-Techonolgy and Charité primer-probe sets), isothermal PCR (Ustar Isothermal Amplification-Real Time Fluorescent Assay) and immunochromatographic antigen detection (BIOCREDIT COVID-19 Ag) assays developed to use in laboratory diagnosis of COVID-19. A total of 119 nasopharyngeal swab specimens were
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Epigenetic alterations may play a role in the development and behavior of pituitary neuroendocrine tumors (PitNETs).
OBJECTIVE: To evaluate the effect of methylation of tumor suppressor genes (TSGs) on their gene expression and on the behavior of PitNETs.
MATERIAL AND METHODS: We used methylation-specific multiplex ligation-dependent probe amplification and quantitative real-time PCR techniques to analyze the DNA-promoter hypermethylation and gene expression of 35 TSGs in 105 PitNETs. We defined functionality, size, and invasiveness of tumors according to their clinical manifestatio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To evaluate if non-diabetic subjects with periodontitis respond better than subjects with type 2 diabetes to the treatment protocol of scaling and root planing (SRP), metronidazole (MTZ) and amoxicillin (AMX).
MATERIAL AND METHODS: Diabetic and nondiabetic subjects with severe periodontitis received SRP + MTZ (400 mg/thrice a day [TID]) + AMX (500 mg/TID) for 14 days. Subgingival biofilm samples were analyzed by checkerboard DNA-DNA hybridization for 40 bacterial species. Subjects were monitored at baseline, 3, 6 and 12 months post-therapy.
RESULTS: Twenty-nine type 2 diabetics and 29 n
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Currently, a large number of anti-tumor drug delivery systems have been widely used in cancer therapy. However, due to the molecular complexity and multidrug resistance of tumors, monotherapies remain suboptimal. Thus, this study aimed to develop a multifunctional theranostic nanoplatform for effective cancer therapy. Methods: Folic acid-modified silver sulfide@mesoporous silica core-shell nanoparticle was first modified with desthiobiotin (db) on the surface, then doxorubicin (DOX) was loaded into pore. Avidin was employed as "gatekeeper" to prevent leakage of DOX via desthiobiotin-avidin int
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clinical otolaryngology : official journal of ENT-UK ; official journal of Netherlands Society for Oto-Rhino-Laryngology & Cervico-Facial Surgery2018eng
OBJECTIVE: In the Netherlands, the majority of hereditary head and neck paragangliomas (HNPGL) are caused by germline variants in the succinate dehydrogenase genes (SDHD, SDHB, SDHAF2). Here, we evaluate a four-generation family linked to a novel SDHB gene variant with the manifestation of a HNPGL.
DESIGN: A family-based study.
SETTING: The VU University Medical Center (VUmc) Amsterdam, a tertiary clinic for Otolaryngology and Head and Neck Surgery.
PARTICIPANTS AND MAIN OUTCOME MEASURES: The index patients presented with an embryonic rhabdomyosarcoma and a non-Hodgkin lymphoma. Array-based
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The main purpose of this study was to determine the prevalence of pathogenic BRCA1 and BRCA2 mutations in a consecutively ascertained clinic-based cohort of patients with pancreatic ductal adenocarcinoma and describe the clinical and family history characteristics.
PATIENTS AND METHODS: Unselected, consecutive, incident patients with pancreatic ductal adenocarcinoma were recruited at a single cancer center over a 2-year period. Participants provided blood for DNA analysis and cancer family history, and cancer treatment records were reviewed. DNA from all patients was analyzed by Sang
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Germline inactivation of the E-cadherin gene (CDH1) is associated with hereditary diffuse gastric cancer (HDGC), a rare autosomal dominant syndrome predisposing to both diffuse gastric cancer (DGC) and lobular breast cancer (LBC). We searched for CDH1 germline defects in 32 HDGC Italian probands selected according to international consensus criteria and in 5 selected relatives. We used a series of molecular methods, including: DNA sequencing, multiplex ligation-dependent probe amplification, single-nucleotide primer extension, bisulfite sequencing, reverse-transcription PCR, and bioinformatics
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The aim of the present study is to evaluate the clinical and microbiologic effects of the adjunctive use of metronidazole (MTZ) and amoxicillin (AMX) in the treatment of smokers and non-smokers with generalized chronic periodontitis (CP).
METHODS: Thirty-two smokers and 32 non-smokers were selected and received scaling and root planing (SRP) combined with MTZ (400 mg three times daily) and AMX (500 mg three times daily) for 14 days. Clinical and microbiologic examinations were performed at baseline and 3 months after SRP. Nine subgingival plaque samples per patient were analyzed u
Клиническое исследованиеСравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования