Fungal infections are becoming more prevalent globally, particularly affecting immunocompromised populations, such as people living with HIV, organ transplant recipients and those on immunomodulatory therapy. Globally, approximately 6.55 million people are affected by invasive fungal infections annually, leading to serious health consequences and death. Mitochondria are membrane-bound organelles found in almost all eukaryotic cells and play an important role in cellular metabolism and energy production, including pathogenic fungi. These organelles possess their own genome, the mitochondrial ge
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study explored virulence genes, antibiotic resistance genes, and mobile genetic elements in 14 Listeria monocytogenes strains from milk and dairy products collected from different regions of Ethiopia. The strains were classified into two Multilocus Sequence Typing sequence types (ST2 and ST45) and further grouped into clonal complexes (CC2) and different cgMLST types. Twenty-nine virulence genes were identified across all 14 strains, with lplA1 detected at higher levels in all strains except SAMN28661660. All L. monocytogenes strains also carried four antibiotic resistance genes (fosX, li
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Yersinia enterocolitica is a significant foodborne pathogen causing gastrointestinal illnesses worldwide. This study investigates the prevalence and genomic characteristics of Y. enterocolitica to assess potential health risks in southeastern China, a region lacking mandatory yersiniosis monitoring. From 2939 samples collected between 2008 and 2022, 105 isolates were recovered. The highest prevalence was found in rodents (8.1%), followed by retail meats (7.1%), other foods (3.7%), and human clinical cases (0.8%). In addition to meats and rodents, ready-to-eat salads, seafood, and frozen food p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Oyo State, Nigeria, reported its first coronavirus disease 2019 (COVID-19) case on 21 March 2020 and subsequently recorded the fifth highest number of cases in Nigeria, most in the capital city Ibadan. We aimed to identify severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) variants that were circulating in Ibadan between August 2021 and August 2022 and to assess the utility of healthcare worker (HCW)-associated infections for endemic COVID-19 surveillance.
METHODS: Following ethical approval, SARS-CoV-2 real-time quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR)-confirmed
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica serovar Goldcoast is recognized as a pathogen implicated in human epidemics; nonetheless, its antimicrobial resistance and epidemiological attributes remain largely unexplored. Here, we analyzed the complete genome sequence of a blaNDM-1-carrying ST2529 S. Goldcoast strain T67, isolated from a patient with a clinical diagnosis of acute enteritis in China, along with its genetic relatedness to 57 other S. Goldcoast strains of the same sequence type in the NCBI GenBank database. The whole genome of T67 consists of one chromosome and four plasmids, characterized by the presenc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Acinetobacter calcoaceticus-baumannii complex is a significant cause of nosocomial infections. While A. baumannii is the most common and clinically significant member globally, recent studies suggest that A. pittii is an emerging pathogen within the complex. Clinical A. pittii isolates have not been well characterized. In this study, we investigated the genomic and phenotypic characteristics of six clinical A. pittii isolates from five healthcare facilities. All isolates were resistant to ceftazidime and ertapenem, and one was resistant to imipenem and meropenem. Using whole genome sequenc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVE: Genomic medicine offers an unprecedented opportunity to improve cancer outcomes through prevention, early detection and precision therapy. Health policy makers worldwide are developing strategies to embed genomic medicine in routine cancer care. Successful translation of genomic medicine, however, remains slow. This systematic review aims to identify and synthesise published evidence on the cost effectiveness of genomic medicine in cancer control. The insights could support efforts to accelerate access to cost-effective applications of human genomics.
METHODS: The st…
СтатьяСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Candidozyma auris (formerly known as Candida auris) (C auris) is a multidrug-resistant fungal pathogen that has emerged as a significant threat to global health. Shifts in climatic conditions may be driving its adaptation and pathogenicity. Its increased ability to tolerate higher temperatures has been suggested as the first adaptation led by anthropogenic climate change in a pathogenic organism. In this study, we analyzed 801 whole-genome sequences isolated in clinical settings from the New York-New Jersey region from 2016 to 2024. Using Bayesian hierarchical logistic regression models, we id
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Certain strains of Bifidobacterium adolescentis inhabiting the gastrointestinal tract have been shown to possess properties that are purported to improve host health. However, given the genetic and phenotypic diversity that has been reported among B. adolescentis strains, it is unclear if and to what extent these traits are conserved across the species. Accordingly, we examined potentially beneficial properties using a combination of genomic and in vitro approaches. Phylogeny inferred from core genomes of 148 B. adolescentis isolates revealed five major lineages. At the functional genomic leve
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Eimeria are obligate protozoan parasites, and more than 1,500 species have been reported. However, Eimeria genomes lag behind many other eukaryotes since obtaining many oocysts is difficult due to a lack of sustainable in vitro culture, highly repetitive sequences, and mixed species infections. To address this challenge, we used whole-genome amplification of a single oocyst followed by long-read sequencing and obtained a chromosome-level genome of Eimeria tenella.
RESULTS: The assembled genome was 52.13 Mb long, encompassing 15 chromosomes and 46.94% repeat sequences. In total, 7,
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Studies in laboratory models and postmortem human brain tissue from patients with Alzheimer's disease have revealed disruption of basic cellular processes such as DNA repair and epigenetic control as drivers of neurodegeneration. While genomic alterations in regions of the genome that are rich in repetitive sequences, often termed "dark regions," are difficult to resolve using traditional sequencing approaches, long-read technologies offer promising new avenues to explore previously inaccessible regions of the genome. In the current study, we leverage nanopore-based long-read whole-genome sequ
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Staphylococcus epidermidis recently emerged as a major cause of medical device-associated infections. However, the role of the nosocomial environment in its evolution remains poorly understood. To investigate the genomic changes underlying S. epidermidis evolutionary history, we compared genomes of 1960s isolates, before its recognition as a human pathogen, to those from the 1990s, when it became prevalent in hospital-acquired infections. We found that S. epidermidis from the 1960s and 1990s shared similar population structures, with the A/C cluster predominating in both periods. Recombination
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Squamous cell carcinoma (SCC) of unknown primary (SCCUP) refers to any SCC for which the primary tumor origin cannot be identified despite guideline-directed evaluation. Although strategies employing comprehensive genomic profiling (CGP) to identify targets for non-SCC carcinomas of unknown primary (CUPs) have shown benefit, the genomic landscape in SCCUP remains poorly defined. Here we describe results of CGP in patients with SCCUP to identify potential therapy targets and characteristic biomarkers.
PATIENTS AND METHODS: Cases of advanced SCCUP were identified in the FoundationCO
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Whole genome sequencing (WGS) is the gold standard for identifying emerging variants during epidemics but is resource intensive. Traditionally, a low RT-qPCR cycle threshold (Ct) is used to select samples with presumed high viral loads but whether better alternatives exist is unclear. This study introduces and evaluates a Ct-independent method, SCQC-Plus (SCQC+) approach, combining enhanced library preparation and agarose gel-based quality control for selecting samples for sequencing. From June 2022 through December 2024 at the state public health laboratory, over 1,800 SARS-CoV-2 positive cli
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: As Bacillus cereus species can negatively affect the safety and quality of both food and non-food products, it would be useful to describe among the selected strains traits supporting survival in specific matrices. We recently characterized the genome of 3 A ES, a B. cereus isolated from eye shadow, revealing multiple genes predicted to support the adaptation of this strain to harsh environmental conditions. Here, we compared the genotypic and phenotypic relative sensitivity/ resistance of B. cereus 3 A ES with two additional B. cereus cosmetic isolates: an eye shadow isolate, 7 C
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Klebsiella pneumoniae (Kp) is a leading cause of hospital-acquired infections representing a growing threat driven by emerging multidrug resistance (MDR) and hypervirulence. In this study, we aim to characterise the genomic and epidemiological landscape of Kp in a Portuguese regional hospital (Braga) lacking prior genomic data. We performed whole-genome sequencing of 115 Kp isolates collected from colonisation and infection cases. Phylogenetic, resistance, and virulence profiles were integrated with clinical and epidemiological data. Genomic analysis revealed high diversity, with 83.5% of isol
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The DnaJ heat shock protein family (HSP40) is the biggest chaperone family in mammalian cells, mainly functioning as cochaperone of HSP70 to maintain proteostasis and cellular homeostasis under both normal and stressful conditions. Although the functions of HSP70s have been extensively studied in diverse biological pathways and senesces including genome maintenance, HSP40s' biological functions at basal state or in response to exogenous insults remain largely under-investigated. Emerging evidence shows that HSP40 proteins participate in genome maintenance pathways and modulate cancer therapy e
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eukaryotic transposon-encoded Fanzor proteins hold great promise for genome-engineering applications as a result of their compact size and mechanistic resemblance to TnpB. However, the unmodified Fanzor systems show extremely low activity in mammalian cells. Guided by the predicted structure of a Fanzor2 complex using AlphaFold3, we engineered the NlovFz2 nuclease and its cognate ωRNA to create an evolved enNlovFz2 system, with an expanded target-adjacent motif (TAM) recognition scope (5'-NMYG) and a substantially improved genome-editing efficiency, achieving an 11.1-fold increase over the wil
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acute respiratory distress syndrome (ARDS) is a severe inflammatory process of the lung, often due to sepsis, and poses significant mortality burden in intensive care units. Here we conducted a genome-wide association study (GWAS) of ARDS to identify genetic risk loci that can help guide the development of new therapeutic options.
METHODS: We performed a case-control GWAS in 716 cases with ARDS, mainly associated with severe infections, and 4399 at-risk controls from three independent studies. Results were meta-analysed across the three studies, with significance set at p < 5 × 10
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Feline infectious peritonitis (FIP), caused by feline coronavirus (FCoV), is a highly lethal disease characterized by systemic organ infection in cats. Current challenges of FIP include the absence of definitive diagnostic criteria, effective vaccines, and targeted therapies. Developing a robust genome editing toolkit is therefore critical to unraveling FCoV replication and pathogenesis mechanisms, elucidating viral protein functions, and identifying promising diagnostic and therapeutic targets.
METHODS: In this study, we developed a yeast-based CRISPR genome editing system comp
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования