UNLABELLED: Treponema pallidum ssp. pallidum , the causative agent of syphilis, has a small proteome and encompasses numerous strains. Knowledge gaps remain in understanding the molecular mechanisms of pathogenesis of this bacterium, as well as the structure and function of the full complement of proteins encoded by T. pallidum . Here, an AI-based structure-to-function modeling workflow was used to investigate the complement of proteins encoded by T. pallidum . High-confidence structure models were generated for 976 T. pallidum proteins, covering 99% of the proteome. Analysis of the generated
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Omsk hemorrhagic fever virus (OHFV) is a member of the tick-borne encephalitis serocomplex of flaviviruses, and causes hemorrhagic disease in humans. In this study, an infectious cDNA of OHFV was constructed to investigate the molecular mechanisms involved in OHFV pathogenesis for the first time. Our cDNA clone was capable of producing infectious virus which is genetically identical to the parental Guriev strain, and the recombinant virus showed similar biological properties to the parental virus including growth kinetics and virulence characteristics. While characterizing the cDNAs, fortuitou
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Gastric cancer is a harmful disease, the comorbidity mechanism and causality relationship between this disease and other diseases are worth studying.
METHODS: Using a two-sample Mendelian Randomization method, this study revealed the potential causal effect of atrial fibrillation (AF) on gastric cancer (GC) risk by constructing a genetic instrument containing 136 AF associated SNPs. Subsequently, analysis identifies 62 AF-GC co-associated genes and constructs a protein-protein interaction network of key genes. High-throughput sequencing data were further used to analyze the associa
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii are basidiomycetous yeasts that cause cryptococcosis in immunocompromised and immunocompetent individuals, respectively. In this study, Representational Difference Analysis (RDA) was applied to isolate sequences representing genomic differences between C. neoformans var. grubii and C. gattii. RDA is a PCR based subtractive enrichment procedure for isolating the differences between two nearly identical genomes. We have approximately 200 clones sequenced leading to the identification of 19 different sequences with significant similarities (E(value)
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deep sequencing and de novo assembly of small RNAs (sRNA analysis) provide a powerful approach to detect plant RNA and DNA viruses. Here, using sRNA analysis of Gentiana triflora (gentian) plants affected with kobu-sho disease, a serious disease of gentian, we found caulimovirus-like sequences, provisionally designated as gentian caulimovirus-like sequence (GCVS). Analysis of the complete nucleotide sequence indicated that GCVS is a novel virus with a genomic structure and organization typical of members of genus Caulimovirus (family Caulimoviridae). Based on Southern blot hybridization and ro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rubella virus is the causative agent of rubella, a mild rash illness, and a potent teratogenic agent when contracted by a pregnant woman. Global rubella control programs target the reduction and elimination of congenital rubella syndrome. Phylogenetic analysis of partial sequences of rubella viruses has contributed to virus surveillance efforts and played an important role in demonstrating that indigenous rubella viruses have been eliminated in the United States. Sixteen wild-type rubella viruses were chosen for whole genome sequencing. All 16 viruses were collected in the United States from 1
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
About 10 % of gastric carcinoma worldwide is associated with EBV, which is defined as EBV-associated gastric carcinoma (EBVaGC). To date, EBV sequence data from EBVaGC in Guangdong, China, an endemic area of nasopharyngeal carcinoma (NPC), are not available. In the present study, two EBV genomes from EBVaGC specimens from Guangdong (designated as GDGC1 and GDGC2) were determined by next-generation sequencing, de novo assembly and joining of contigs by Sanger sequencing. In addition, we sequenced EBV from two Korean EBVaGC cell lines, YCCEL1 and SNU-719. Genomic diversity, including single nucl
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Expressed sequence tags (ESTs) are an effective approach for discovery of novel genes. In the current study, approximately 250 ESTs of the cattle parasitic nematode Setaria digitata were examined and a cDNA clone identified whose coding sequence could not be functionally annotated by searching over publicly available genome, protein, EST and STS databases. Here, we report the extensive characterization of this ORF (UP) and its homologues using a bioinformatic approach. Uncharacterized protein (SDUP) of S. digitata consists of 204 amino acids with a predicted molecular weight and isoelectric po
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The hypoxia-inducible factor 1 (HIF-1), a heterodimer composed of alpha and beta subunits, plays an important role in the cellular response to O(2) deprivation. In this paper, Drosophila HIF-1beta (dHIF-1beta) homolog is cloned and characterized. Further, Northern analyses showed that dHIF-1alpha and dHIF-1beta expressed their highest level at an embryonic stage. From the pupal stage on, their expression was sharply reduced and maintained at a steady level. Anoxia treatment up-regulated the expression of the both alpha and beta subunits. Over-expression of dHIF-1alpha in transgenic embryos res
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Introduction: Despite the availability of an effective vaccine and treatment to reduce the viral load and progressive hepatocellular injury, approximately 240 million people worldwide are chronically infected with the hepatitis B virus (HBV). In Colombia, the circulation of different viral genotypes has been confirmed. Mutations in the genome have been associated to antiviral therapy resistance, viral escape to neutralizing antibodies, occult infection and progression to hepatocellular carcinoma. Objective: To identify the genotypes and the presence of mutations in the coding region of the sur
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Germline copy-number variants (CNVs) involving quadruplications are rare and the mechanisms generating them are largely unknown. Previously, we reported a 20-week gestation fetus with split-hand malformation; clinical microarray detected two maternally inherited triplications separated by a copy-number neutral region at 17p13.3, involving BHLHA9 and part of YWHAE. Here, we describe an 18-month-old male sibling of the previously described fetus with split-hand malformation. Custom high-density microarray and digital droplet PCR revealed the copy-number gains were actually quadruplications in th
Клинический случайСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An outbreak of nine cases of mumps was reported from a total of 97 vaccinated nursing students at two medical colleges in Thailand in 2010, 16-26 days after administration of MMR vaccine containing the L-Zagreb mumps strain. Symptoms ranged in severity from fever and parotid swelling to orchitis. Clinical samples were obtained from seven patients and three were suitable for further study. Sequencing confirmed that the SH gene of the mumps virus in the unpassaged clinical specimens was identical to the L-Zagreb SH gene in the vaccine. Further analysis of the viral genome identified nucleotide p
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tityus discrepans is a Venezuelan scorpion known to cause severe human envenomations. It contains toxins that impair proper ion channels function, affect coagulation pathways and interfere with the immunological system, leading to a widespread inflammatory syndrome. This communication reports the results of genes cloned from a cDNA expression library of venomous glands from T. discrepans. A full-length cDNA phagemid library was prepared from which 127 genes were cloned and grouped in 22 clusters showing more than one EST (expressed sequence tag) (74%), and 29 singlets (26%). The identified put
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Our previous study revealed that Vav3 oncogene is overexpressed in human prostate cancer, activates androgen receptor (AR), and stimulates growth in prostate cancer cells. The purpose of this study is to further determine the potential role of Vav3 in prostate cancer development in genetically engineered mouse model. We generated Vav3 transgenic mice by targeted overexpression of a constitutive active Vav3 in the prostatic epithelium. We found that overexpression of Vav3 led to development of mouse prostatic intraepithelial neoplasia and prostate cancer at the age of as early as 3 months. The
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Legionella pneumophila is a facultative intracellular pathogen responsible for severe lung disease in humans, known as legionellosis or Legionnaires' disease. Previously, we reported on the approximately 60-kDa glucosyltransferase (Lgt1) from Legionella pneumophila, which modified eukaryotic elongation factor 1A. In the present study, using L. pneumophila Philadelphia-1, Lens, Paris, and Corby genome databases, we identified several genes coding for proteins with considerable sequence homology to Lgt1. These new enzymes form three subfamilies, termed Lgt1 to -3, glucosylate mammalian elongatio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Injection of crude venom from the scorpion Orthochirus scrobiculosus into larvae of Heliothis virescens (Lepidoptera: Noctuidae) caused trembling and uncoordinated movement before development of a progressive and prolonged flaccid paralysis. The isolation of the toxin (OsI-1) responsible for this effect of O. scrobiclosus venom is described. The molecular mass of OsI-1 toxin was 6994 Da, as determined by desorption mass spectroscopy. The complete primary structure of OsI-1 was deduced from the sequence of cDNA clones obtained by rapid amplification of cDNA ends (RACE) PCR. Comparison of the de
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cDNA coding for mouse aldehyde oxidase (AO), a molybdoflavoprotein, has been isolated and characterized. The cDNA is 4347 nt long and consists of an open reading frame predicting a polypeptide of 1333 amino acid residues, with 5' and 3' untranslated regions of 13 and 335 nt respectively. The apparent molecular mass of the translation product in vitro derived from the corresponding cRNA is consistent with that of the monomeric subunit of the AO holoenzyme. The cDNA codes for a catalytically active form of AO, as demonstrated by transient transfection experiments conducted in the HC11 mouse
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Wastewater treatment plants (WWTPs) are recognized as hotspots for horizontal gene transfer (HGT) of antibiotic resistance genes (ARGs). Despite our understanding of the composition and distribution of ARGs in WWTPs, the genetic location, host, and fate of ARGs remain largely unknown.
RESULTS: In this study, we combined Oxford Nanopore and Illumina metagenomics sequencing to comprehensively uncover the resistome context of influent, activated sludge, and effluent of three WWTPs and simultaneously track the hosts of the ARGs. The results showed that most of the ARGs detected in all
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hyaluronidases (HYALs) are enzymes ubiquitously found in venoms from diverse animals and seem to be related to venom spreading. HYAL activity might be important to Tityus spp. envenoming, since anti-Tityus serrulatus HYAL (TsHYAL) rabbit antibodies neutralize T. serrulatus venom (TsV) lethality. The present work aimed to verify and compare HYAL activity of venoms from other Brazilian Tityus spp. (Tityus bahiensis, Tityus stigmurus and Tityus obscurus) and to test whether anti-TsHYAL antibodies and Brazilian horse therapeutic scorpion antivenom (produced by Fundação Ezequiel Dias (FUNED), Butan
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Toxoplasma gondii is one of the most important apicomplexan parasites and infects one-third of the human population worldwide. Transformation between the tachyzoite and bradyzoite stages in the intermediate host is central to chronic infection and life-long risk. There have been some transcriptome studies on T. gondii; however, we are still early in our understanding of the kinds and levels of gene expression that occur during the conversion between stages.
RESULTS: We used high-throughput RNA-sequencing data to assemble transcripts using genome-based and de novo strategies. The e
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования