The evolutionary features of clear-cell renal cell carcinoma (ccRCC) have not been systematically studied to date. We analyzed 1,206 primary tumor regions from 101 patients recruited into the multi-center prospective study, TRACERx Renal. We observe up to 30 driver events per tumor and show that subclonal diversification is associated with known prognostic parameters. By resolving the patterns of driver event ordering, co-occurrence, and mutual exclusivity at clone level, we show the deterministic nature of clonal evolution. ccRCC can be grouped into seven evolutionary subtypes, ranging from t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Trauma is a universal phenomenon. Violence is a type of trauma and war is one of the ways in which violence is expressed. The "Neuroevolutionary Time-depth Principle" of innate fears, based on prevalence data, suggests that high rates of posttraumatic stress disorder (PTSD) after combat exposure can be due to the fact that this fear-stress response appeared as a reaction to inter-group male-to-male and intra-group killings after the rising of population densities in the Neolithic period.
MATERIAL AND METHODS: Studies of PTSD prevalence available in MEDLINE, Institute for Scienti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The facile synthesis of metal-organic framework (MOF)-derived catalysts with precisely controlled compositions and structures for oxygen evolution reaction (OER) remains a formidable challenge. Herein, we propose a host-guest encapsulation strategy to modulate the phase evolution by leveraging the structural dimensions of the host Ni-MOF. Specifically, two iron-based guests with varying molecular sizes (e.g., ferrocene (FcFe) and iron phthalocyanine (PcFe)) are selected to enter a large-pore Ni-MOF-274. A significant host-guest compatibility effect was identified, whereby the compact FcFe mole
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterovirus G (EV-G) comprises 20 genotypes (G1-G20) associated with various disease conditions in pig populations. Recombination among homologous EV-G drives virus evolution; however, recombination with a virus from a heterologous family is a rare event. Currently, two types of recombinant EV-G strains containing torovirus papain-like cysteine protease (PLCP) at the 2C-3A junction (Type I) and in place of structural proteins (Type II) are reported. The present study was conducted to reveal the RNA virome in diarrheic piglet feces, retrieving the genome coding for a complete polyprotein of EV-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mumps is a highly contagious viral disease caused by the mumps virus (MuV), a member of the genus Orthorubulavirus in the family Paramyxoviridae. Although effective vaccines exist, mumps vaccination is not yet part of Uganda's routine immunization program. In 2022 and 2023, Uganda experienced a notable outbreak of mumps, underscoring the need for molecular characterization of the circulating virus strains. This study aimed to identify and genetically characterize the mumps virus strains responsible for the outbreak. Buccal or oropharyngeal swabs were collected from clinically confirmed cases f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mammalian sex-determining gene SRY is highly conserved across species, with only a few exceptions. The Japanese rodent genus Tokudaia is known for its unique sex chromosome evolution. The Okinawa spiny rat T. muenninki (TMU) acquired neo-sex chromosomes with multiple Sry copies by sex chromosome-autosome fusions. All SRY copies in TMU have a substitution from alanine to serine at position 21 in the high-mobility group (HMG) box, a critical DNA-binding domain, suggesting that they are nonfunctional. However, the sex determination system in TMU remains unclear, in part because the species is
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE OF REVIEW: Primary and secondary liver cancers are frequently unresectable at the time of diagnosis. Historically, these patients were treated with palliative therapy and no hope for curative resection. While liver transplant has been the standard of care for unresectable hepatocellular carcinoma (HCC), its indications have expanded to other oncologic indications based on promising data from select centers. This review focuses on the utilization of liver transplant for HCC, cholangiocarcinoma, and colorectal liver metastasis.
RECENT FINDINGS: In the realm of HCC, immunotherapy is an e
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reconstructing evolutionary histories and estimating the rate of evolution from molecular sequence data is of central importance in evolutionary biology and infectious disease research. We introduce a flexible Bayesian phylogenetic inference framework that accommodates changing evolutionary rates over time by modeling sequence character substitution processes as inhomogeneous continuous-time Markov chains (ICTMCs) acting along the unknown phylogeny, where the rate remains as an unknown, positive and integrable function of time. The integral of the rate function appears in the finite-time trans
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Evolution of a complete nitrogen (N) cycle relies on the onset of ammonia oxidation, which aerobically converts ammonia to nitrogen oxides. However, accurate estimation of the antiquity of ammonia-oxidizing bacteria (AOB) remains challenging because AOB-specific fossils are absent and bacterial fossils amenable to calibrate molecular clocks are rare. Leveraging the ancient endosymbiosis of mitochondria and plastid, as well as using state-of-the-art Bayesian sequential dating approach, we obtained a timeline of AOB evolution calibrated largely by eukaryotic fossils. We show that the first AOB e
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lung adenocarcinoma (LUAD) is a common type of lung cancer with a high risk of metastasis, but the exact molecular mechanisms of metastasis are not yet understood.
METHODS: This study acquired single-cell transcriptomics profiling of 11 distal normal lung tissues, 11 primary LUAD tissues, and 4 metastatic LUAD tissues from the GSE131907 dataset. The lung multicellular ecosystems were characterized at a single-cell resolution, and the potential mechanisms underlying angiogenesis and metastasis of LUAD were explored.
RESULTS: We constructed a global single-cell landscape of 93,610
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CFTR chloride channel mutations cause the lethal and incurable disease cystic fibrosis (CF). CFTR is activated by phosphorylation, and phosphorylated channels exhibit "bursting" behavior-"bursts" of openings separated by short "flickery" closures and flanked by long "interburst" closures-driven by ATP binding/hydrolysis at two nucleotide-binding domains. The human channel (hCFTR) and the distant zebrafish ortholog (zCFTR) display differences both in their gating properties and structures. In phosphorylated ATP-bound hCFTR, the hR117 side chain, conserved across evolution, forms an H-bond that
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic infection with hepatitis C virus (HCV) is an important contributor to the global incidence of liver diseases, including liver cirrhosis and hepatocellular carcinoma. Although common for single-stranded RNA viruses, HCV displays a remarkable high level of genetic diversity, produced primarily by the error-prone viral polymerase and host immune pressure. The high genetic heterogeneity of HCV has led to the evolution of several distinct genotypes and subtypes, with important consequences for pathogenesis, and clinical outcomes. Genetic variability constitutes an evasion mechanism against
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aquatic bacterium Vibrio cholerae is the etiological agent of the diarrheal disease cholera, which has plagued the world for centuries. This pathogen has been the subject of studies in a vast array of fields, from molecular biology to animal models for virulence activity to epidemiological disease transmission modeling. V. cholerae genetics and the activity of virulence genes determine the pathogenic potential of different strains, as well as provide a model for genomic evolution in the natural environment. While animal models for V. cholerae infection have been used for decades, recent ad
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Fishes of the Syngnathidae family are rare in having male pregnancy: males receive eggs from females and egg development occurs in the male brood pouch that diverged during evolution. The family is divided into two subfamilies: Nerophinae and Syngnathinae.
METHODS: We compared histologically five types of the brood pouch in Syngnathinae: an open pouch without skinfolds (alligator pipefish); an open pouch with skinfolds (messmate pipefish); a closed pouch with skinfolds (seaweed pipefish); and closed pouches with a sac-like pouch on the tail (pot-bellied seahorse) or within a bod
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
130 years ago, in 1892, our great compatriot Dmitry Iosifovich Ivanovsky (18641920) discovered a new type of pathogen viruses. Viruses have existed since the birth of life on Earth and for more than three billion years, as the biosphere evolved, they are included in interpopulation interactions with representatives of all kingdoms of life: archaea, bacteria, protozoa, algae, fungi, plants, invertebrates, and vertebrates, including the Homo sapiens (Hominidae, Homininae). Discovery of D.I. Ivanovsky laid the foundation for a new science virology. The rapid development of virology in the 20th ce
Аннотация на английскомРедакционная статьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) is one of the recently identified zoonotic coronaviruses. The one-hump camels are believed to play important roles in the evolution and transmission of the virus. The animal-to-animal, as well as the animal-to-human transmission in the context of MERS-CoV infection, were reported. The camels shed the virus in some of their secretions, especially the nasal tract. However, there are many aspects of the transmission cycle of the virus from animals to humans that are still not fully understood. Rodents played important roles in the transmissi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arterial stiffness is a complex process affecting the aortic tree that significantly contributes to cardiovascular diseases (systolic hypertension, coronary artery disease, heart failure or stroke). This process involves a large extracellular matrix remodeling mainly associated with elastin content decrease and collagen content increase. Additionally, various chemical modifications that accumulate with ageing have been shown to affect long-lived assemblies, such as elastic fibers, that could affect their elasticity. To precisely characterize the fiber changes and the evolution of its elasticit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Classical BCR-ABL-negative myeloproliferative neoplasms (MPN) are a heterogeneous group of hematologic malignancies, including essential thrombocythemia (ET), polycythemia vera (PV), and primary myelofibrosis (PMF), as well as post-PV-MF and post-ET-MF. Progression to more symptomatic disease, such as overt MF or acute leukemia, represents one of the major causes of morbidity and mortality. There are clinically evident but also subclinical types of MPN progression. Clinically evident progression includes evolution from ET to PV, ET to post-ET-MF, PV to post-PV-MF, or pre-PMF to overt PMF, and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There are data to suggest that some ductal carcinoma in situ (DCIS) may evolve through an evolutionary bottleneck, where minor clones susceptible to the imposed selective pressure drive disease progression. Here, we tested the hypothesis that an impact of the inflammatory environment on DCIS evolution is HER2-dependent, conferring proliferative dominance of HER2-negative cells. In tissue samples, density of tumour-infiltrating immune cells (TIICs) was associated only with high tumour nuclear grade, but in 9% of predominantly HER2-negative cases, the presence of tumoral foci ('hot-spots') of ba
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Research into the evolution and pathogenesis of Vibrio cholerae has benefited greatly from the generation of high-throughput sequencing data to drive molecular analyses. The steady accumulation of these data sets now provides a unique opportunity for in silico hypothesis generation via coexpression analysis. Here, we leverage all published V. cholerae RNA sequencing data, in combination with select data from other platforms, to generate a gene coexpression network that validates known gene interactions and identifies novel genetic partners across the entire V. cholerae genome. This network pro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.