UNLABELLED: Spatial transcriptomics approaches provide crucial insights into gene expression distribution within intact tissue architecture, but they encounter limitations in detecting morphologically complex cell types, assessing their spatial associations with pathology, and accurately annotating cell types using RNA data alone. Therefore, we developed a robust post-processing workflow integrating Xenium spatial technology with iterative indirect immunofluorescence imaging (4i) on formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) human brain tissue. The post-Xenium 4i protocol presented here allows mu…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background and objective Nasal and paranasal lesions are one of the most common otorhinolaryngological presentations encountered in clinical … ion. After adequate fixation, the biopsy specimen was submitted for routine processing, followed by paraffin embedding, and stained with hematoxylin and eosin (H&E). Special stains like periodic acid-Schiff (PAS) and Ziehl-Neelsen (ZN) stains for acid-fast bacilli (AFB) were used as required. IHC was performed in the required samples. IHC markers were perf …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The selectin family is a group of early-reactive adhesion molecules that plays a role in the rolling phase of leukocytes in cellula … in the iris- ciliary body and the retina were studied by immunohistochemistry using wholemounts and paraffin-embedded sections and by monitoring the level of E-selectin mRNA expression. A monoclonal antibody to E-selectin and a control antibody were each injected intravenously to evaluate the effects of E-selectin inhibition on ocular inflammation at the t …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cholangiocarcinoma (CCA) exhibits diverse responses to chemotherapy, underscoring the need for drug sensitivity biomarkers. This proof-of-concept study utilized Fourier transform infrared (FTIR) spectral features to identify ex vivo gemcitabine sensitivity and resistance, as determined by the histoculture drug response assay (HDRA). We analyzed ten formalin-fixed paraffin-embedded tumor samples and 21 serum samples (including seven matched pairs) using synchrotron radiation-based FTIR microspectroscopy and attenuated total reflectance FTIR spectroscopy, respectively. Tissue and serum spectra w…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Terminal glial cells (TGCs) of cutaneous end-organ complexes have traditionally been regarded as structural and trophic elements, although they may also participate in mechanosensory processing. We performed an exploratory immunohistochemical and immunofluorescence study of mechanosensitivity-associated ion channel proteins in human Meissner and Pacinian corpuscles using archival formalin-fixed, paraffin-embedded glabrous skin from 64 donors and several anatomical sites. Immunoreactivity was assessed separately in mechanoreceptor axons and TGCs. In Meissner corpuscles, TGC-associated immunorea…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Microvascular inflammation (MVI), donor-specific antibodies (DSAs)-negative and C4d-negative, was recently defined as a distinct phenotype by Banff 2022 and has been associated with adverse clinical outcomes. We have developed a model for rejection-related molecular classification of renal allograft biopsies using gene expression profiling of formalin-fixed paraffin-embedded renal biopsy tissue and evaluated its performance in patients with MVI.
METHODS: Using this updated gene expression profiling-based multiclass model, we evaluated 138 biopsy specimens obtained from a large US …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Conventional histopathology faces methodological limitations when assessing complex three-dimensional tissue architectures. In p … with immunohistochemical marker profiles.
MATERIALS AND METHODS: Tissue cores from formalin-fixed, paraffin-embedded human pancreatic samples were volumetrically assessed using SRµCT. The investigated material was further processed as microarrays. Serial sections and immunohistochemical stains were correlated with the 3D datasets.
RESULTS: SRµCT enabled …
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reconstitution of synthetic cells holds potential to advance synthetic biology, biomanufacturing, and therapeutics. Microfluidic generation of cell-sized liposomes via double emulsion templating offers precise control over composition and formation process, yet the principles underlying solvent-mediated dewetting remain poorly understood. Using a solvent combination of hexanol and paraffin oil, we demonstrate that solvent-mediated dewetting liposome generation entails both solvent removal and the application of mechanical stimuli. Solvent removal suffices to induce the morphological transition…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The carcinogenesis of metastatic prostate cancer results from complex interactions between genetic and environmental factors. The g … n and underscore the challenges associated with performing comprehensive analyses on formalin-fixed paraffin-embedded samples.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Membrane-based separations constitute energy-lean alternatives to olefin/paraffin purification, however, it remains challenging to translate sub-ångström discrimination into defect-free, large-area membranes via manufacturing-compatible routes. In this work, we realize a multiscale engineering design that strategically integrates engineered metal-organic frameworks (MOFs) with renewable, low-cost biomass-derived polymers via continuous-flow processing, followed by semi-batch carbonization into mixed-matrix carbon hollow fiber membranes. Controlled molecular entanglement imparts robust colloida…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Visualizing three-dimensional (3D) microstructures of complex biological tissues is crucial for understanding disease progression and enviro … hat samples prepared by critical-point-dried (CPD) markedly enhanced intrinsic contrast relative to paraffin-embedded specimens, enabling delineation of tissue microarchitecture and the reliability of digital segmentation. Additionally, we developed a scalable data orchestration workflow (Tiffy McSliceface, TMSF) that enabled segmentation of full-resolutio …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Classical histology remains the gold standard for liver fibrosis assessment but is limited by destructive sectioning, 2D information, and sa … hydration, snap-freezing, and lyophilization. After imaging, tissues are rehydrated, re-embedded in paraffin, and processed for routine histology, immunohistochemistry, RNA extraction with qPCR, and targeted NGS (800-gene panel). The protocol yields high-contrast, artifact-free micro-CT images with clear visualization of nuclei, sinusoidal networks, portal …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Patients with biliary tract cancer (BTC) often have actionable mutations, and comprehensive genomic profiling (CGP) plays an important role. However, the feasibility of CGP using transpapillary biopsy (TPB) samples remains unclear.
METHODS: Thirty patients with suspected BTC based on radiographic imaging were enrolled. Pre-analytical criteria for CGP suitability were based on the OncoGuide NCC Oncopanel System (NCCOP) and FoundationOne CDx (F1CDx). Each patient underwent six biopsies using an endoscopic introducer: five biopsy samples were preserved as formalin-fixed paraffin-embe…
Clinical StudyСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lubrication additives that combine high efficiency at low concentrations with broad universality are urgently needed for breaking through th … achieves surprising universality across a wide range of base fluids (PEG, water, ester oil, liquid paraffin). This work offers a new paradigm for designing high-performance, universal lubricant additives toward the sustainable lubrication technology.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Electrochromic and thermochromic smart windows are mature technologies that offer complementary strategies for regulating solar transmittance. To enhance their overall performance and mitigate key limitations associated with each approach, we present hybrid electro-thermochromic (ETC) smart windows. By integrating a black electrochromic layer composed of three complementarily-colored, redox-matched viologen molecules with a paraffin-particle-based thermochromic film, these hybrid devices deliver multiple synergistic functionalities: voltage-controlled, multimodal operation enabling both passiv…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: Autofluorescence is a common challenge in fluorescence microscopy of inflamed tissue, particularly where red blood cell (RBC) au … bles discriminating between RBC autofluorescence and true proximity ligation assay (PLA) signals in paraffin-embedded inflamed lung tissue. Our approach combines antigen retrieval, selective fluorophore excitation, spectral unmixing, and post-processing to minimize autofluorescence while maintaining tissue integrity. We demonstrate the workflow's efficacy …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quantifying the spatial distribution of microRNAs (miRNAs) within plant tissue is critical for deciphering cell-specific gene-regulatory pat … ed that multispectral RCA enhances detection and quantifies low-abundance targets in ethanol-fixed, paraffin-embedded Arabidopsis thaliana leaf sections. Integrating multispectral RCA with our nanoliter well array enhances multiplexing by 5-fold per post and expands the utility of the technique for miRNA spatial profiling in plant tissue.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastric cancer exhibits substantial intratumoral heterogeneity; however, genetic differences between spatially separated differentiated and undifferentiated components within the same tumor, particularly in deficient mismatch repair (dMMR) cases, remain poorly defined. We compared somatic mutation and copy number variation (CNV) profiles between these two histologic types within the same gastric tumor, including dMMR cases. Formalin-fixed, paraffin-embedded specimens from five gastric cancers were macrodissected to separate differentiated and undifferentiated components and analyzed using a 22…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Collecting duct carcinoma (CDC) is a rare and aggressive renal malignancy with limited therapeutic options and no established bi … hologists. Immunohistochemical analyses for Nectin-4 and Trop-2 were carried out on formalin-fixed, paraffin-embedded tissue. Tumors were considered positive when >10% of cells showed membranous and/or cytoplasmic staining.
RESULTS: Nectin-4 expression was detected in 41% of cases, with variable staining intensity, while Trop-2 expression was observed in …
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Nandrolone, a synthetic anabolic steroid, is frequently used for muscle enhancement but is known to compromise male fertility, pa … re euthanized, and testicular tissues were harvested for morphological and histological evaluation. Paraffin-embedded sections were stained with hematoxylin and eosin, and seminiferous tubule diameters were quantitatively assessed.
RESULTS: Nandrolone administration increased testicular weight and the gonadosomatic index relative to controls. Royal jelly …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования