Endometriosis is a multifaceted disease, causing debilitating pelvic pain in some patients, while being completely asymptomatic in others. The pathophysiology of endometriosis pain is not well understood and poorly correlated to stage. We hypothesized that this clinical heterogeneity may be explained by examining differences in gene expression. We performed RNA sequencing of 27 formalin-fixed, paraffin-embedded peritoneal biopsies from 9 symptomatic (Sx) and 10 asymptomatic (ASx) subjects. 890 genes were differentially expressed between Sx and ASx samples. Of these, the most significant includ…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Harmful algal blooms (HABs) caused by Microcystis aeruginosa (MC) pose serious threats to freshwater ecosystems, public health, and water tr … (PG), whose release can be modulated by coating the halloysite nanotubes (HNT) with a thin layer of paraffin wax. Pulse amplitude modulation fluorometry (PAM) measurements confirm that PG disrupts the photosynthesis efficiency of MC in doses as low as 25 mg/L. Importantly, the extensive extracellular polymeric substance (EPS) produced by MC forms a hydrate …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salivary gland tumors (SGTs) are rare and biologically heterogeneous neoplasms for which conventional histopathological and single-platform … ors (85.9%), particularly adenoid cystic carcinoma (38.5%), and frequently relied on formalin-fixed paraffin-embedded samples (55.7%). Genomic and transcriptomic integration was the most commonly used strategy (74.4%), typically supported by immunohistochemistry (61.5%) and in situ hybridization (38.5%) for biological validation. Overall, multi-omics studi …
СтатьяСистематический обзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiac transthyretin amyloidosis (ATTR-CA) is caused by myocardial deposition of misfolded transthyretin, leading to progressive heart failure. Disease pathology, however, extends beyond passive amyloid deposition and also involves active processes such as extracellular matrix (ECM) remodeling and immune activation. Mass spectrometry (MS) is the gold standard for amyloid typing in diagnostics. Here, we applied quantitative MS-driven proteomics on formalin-fixed paraffin-embedded whole cardiac tissue sections from six ATTR-CA cases, ten unaffected controls and four AL-CA controls to investigat…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The placenta's complex cellular diversity challenges traditional transcriptomic analyses. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) offers breakthrough capabilities by enabling transcriptome profiling at the single-cell level. However, traditional scRNA-seq relies on fresh or frozen samples, which present practical storage and quality challenges. Applying scRNA-seq to Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded (FFPE) placentas could harness archived samples for clinical insights.
METHODS: We used 10x Genomics Flex technology to analyze 8 non-pathological placentas ranging from 21 + 6 weeks …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To evaluate the expression of hypoxia-inducible factor 1 alpha (HIF-1α), NOTCH-1, ADAM-12, and heparin-binding epidermal growth factor (HB-EGF) in adenoid cystic carcinoma (ACC), mucoepidermoid carcinoma (MEC), and normal salivary glands (SG), exploring hypoxia-related stromal and parenchymal adaptations with potential implications for tumor stratification and therapeutic targeting.
STUDY DESIGN: Forty-six formalin-fixed, paraffin-embedded samples were analyzed: 17 ACC, 19 MEC, and 10 SG controls. Immunohistochemistry was performed for all markers. Protein expression was quantified…
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: This study aimed to retrospectively analyze the prevalence and clinical characteristics of TUGSE and explore the potential role of viral agents in these lesions.
METHODS: Fifty-seven TUGSE and 50 non-specific ulcer patients were included. Patient demographic and clinical data were collected. Formalin-fixed paraffin-embedded tissues were screened by PCR for Epstein-Barr virus (EBV), cytomegalovirus (hCMV), human papillomavirus (HPV), herpes simplex virus (HSV), and Helicobacter pylori (H. pylori).
RESULTS: The majority of TUGSE patients were in their sixth (29.8%) and seventh (24.…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The purpose of this study was to determine optic nerve head (ONH) laminar collagen and retrolaminar myelin expression change in non-human-primate (NHP) experimental glaucoma (EG) using immunohistochemistry (IHC) and spatial transcriptomics.
METHODS: Unilateral EG NHPs (n = 3) were perfusion fixed, ONHs were trephined, embedded in paraffin, and serial sectioned for IHC and spatial transcriptomics. EG versus control eye retinal nerve fiber layer thickness (RNFLT) and axon loss within each region of study were estimated.
RESULTS: CNPase levels decrease in the retrolaminar region of the…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Helicobacter pylori is the principal infectious driver of chronic gastritis, a precursor to several gastric lesions. Data on tis … istopathology laboratories in Uganda.
METHODS: A cross-sectional study analyzed 150 formalin-fixed paraffin-embedded tissue blocks of patients diagnosed with chronic gastritis between September 2018 to August 2021. The histopathology analysis was done using H&E and modified Giemsa stains. Data was analyzed with STATA version 17, determining prevalence thr …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Digestive and liver disease : official journal of the Italian Society of Gastroenterology and the Italian Association for the Study of the Liver2026eng
BACKGROUND: Intestinal transglutaminase 2 (TGM2)-IgA deposits represent an early marker of celiac disease (CeD).
OBJECTIVE: This multicentre retrospective study aimed to assess the usefulness of a double immunohistochemistry technique for detecting TGM2-IgA deposits in formalin-fixed, paraffin-embedded duodenal biopsies from patients with CeD.
METHODS: Duodenal biopsy sections were classified into: i) CeD, characterized by villous atrophy and serum TGM2 antibodies of IgA class (TGA-IgA) levels categorized as <5 × ULN (low), 5-10 × ULN (moderate), or >10 × ULN (high); ii) Potential CeD (pCeD)…
СтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prion diseases are rare neurodegenerative disorders that share misfolding of the normal cellular prion protein into disease-causing isoforms … uced sensitivity for some uncommon prion disease molecular subtypes. We developed a formalin-fixed, paraffin-embedded tissue-based prion seeding assay to serve as a complementary diagnostic tool for prion diseases. Fixed brain tissue was prepared through an optimized process involving careful defacing of tissue blocks prior to sampling and then stepwise de …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Extranodal marginal zone lymphoma of mucosa-associated lymphoid tissue (MALT) arises in various extranodal sites and has been linked to chronic inflammation, often triggered by infectious agents. Ocular adnexal (OA) MALT lymphoma has been associated with Chlamydophila psittaci (C. psittaci) in some regions. This study aimed to investigate the involvement of pathogenic microorganisms, including C. psittaci, in OA-MALT lymphoma.
METHODS: DNA was extracted from 17 formalin-fixed, paraffin-embedded OA-MALT lymphoma samples. Next-generation sequencing was performed, and reads were anal…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The incidence of human papillomavirus (HPV)-positive oropharyngeal cancer (OPC) is increasing in Australia, yet very little is known about the dynamics of the HPV types in OPC over time. Here we used a database to identify oropharyngeal cancer patients diagnosed in Queensland in 2009-2011 and 2019-2021. We retrieved and extracted DNA from 526 formalin-fixed paraffin-embedded tumour tissues, which were tested for DNA quality and 14 high-risk (HR)-HPV types. The HPV prevalence in OPC tumour tissue increased from 45% in 2009-2011 to 68% in 2019-2021. HPV-16 was the most common HPV type, found in …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Subclinical acute rejection (SCAR) in kidney transplantation, defined by histologic lesions without clinical dysfunction, remains a major cause of allograft injury and is currently detectable only by invasive protocol biopsies. We conducted a multicenter study in which transcriptomic profiling of Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded biopsies from SCAR and control patients revealed a distinct signature with upregulation of NFKBIZ, TNFSF14, SLAMF8, and CD247, validated by qRT-PCR and immunohistochemistry but not detectable in urine. Focusing on secreted cytokines, CXCL10 and FasL emerged as candida…
СтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Basal cell carcinomas (BCCs) are thought to reside within an immunosuppressed tumor microenvironment, but a detailed characterization of BCC-associated immune cells was lacking.
METHODS: Utilizing multiplex immunohistochemistry (IHC) (Vectra Polaris, Akoya Biosciences), we designed two staining panels, targeting either T cells (CD3, CD4, CD8, FoxP3, PD1) or myeloid cells (neutrophil elastase, CD68, CD163, HLADR, CD1c). Formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) BCC tumor specimens (n = 30) were analyzed using the panels. The majority of immune cells reside at the peritumoral margin; …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aims to examine the role of exosomes derived from human urine-derived stem cells (hUSCs-Exo) in the in vitro construction of a co … were examined under a fluorescence inverted microscope on days 1, 3, and 7. On day 7, samples were paraffin-embedded for histological analysis of cell integration. hUSCs with mesenchymal stem cell (MSC) properties were successfully isolated, and exosomes extracted via centrifugation. hUSCs-exosome (Exo) enhanced cell migration but did not significantly af …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We previously generated a global bulk-level proteogenomic atlas of metastatic colorectal cancer (CRC) in a Chinese cohort (CCRC). Using formalin-fixed paraffin-embedded tissues from this cohort, we identified 2095 ectopic lymphoid-like structures (ELSs) across 132 primary tumors. Both lymphoid aggregates (Aggs) and tertiary lymphoid structures (TLSs) were significantly associated with metastasis and clinical outcomes in CRC, in which the spatial and compositional heterogeneity of ELSs and their clinical relevance remain unknown. Here, we upgraded our LCM-MTA platform to version 2.0 for deep sp…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Colorectal carcinoma is among the most prevalent malignancies worldwide. PD-L1 is an immune-checkpoint ligand that can contribute to tumor immune evasion whereas BCL2 is an anti-apoptotic protein involved in cell-survival pathways, with its mutation frequently observed in various human cancers. This study aimed to evaluate the prognostic significance of immunohistochemically identified PD-L1 and BCL2 proteins in colorectal carcinoma.
MATERIALS: Sixty paraffin-embedded colorectal carcinoma tissue specimens were subjected to immunohistochemistry (IHC) staining for PD-L1 and BCL2 exp…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurate quantification of immune cell subpopulations is essential for understanding immune responses in research and clinical settings. Flo … on for FC-based characterization of CD45+, CD3+, CD4+, and CD8+ T cells and another formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE), and analyzed with hematoxylin and eosin (H&E) for eosinophils and immunohistochemistry (IHC) for CD4 and CD8. A pilot analysis of 10 samples shows high concordance of the results taken from the two methods, allowing for cross-valida …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The incidence of upper tract urothelial carcinoma (UTUC) continues to rise in Southwestern Taiwan, despite a reduction in known environmental carcinogens. This study aimed to characterize the mutational and molecular profiles of UTUC in this high-incidence region and evaluate potential therapeutic targets. We performed next-generation sequencing using the TruSight Oncology 500 panel on 19 formalin-fixed, paraffin-embedded UTUC samples. We analyzed single nucleotide variants (SNVs), insertions/deletions (INDELs), copy number variants (CNVs), microsatellite instability (MSI), and tumor mutationa…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования