Rhodococcus equi is an important veterinary and zoonotic pathogen that survives inside macrophage phagolysosomes. Nitrate reductase NarGHI is a known virulence factor for this pathogen. This enzyme complex serves as the terminal electron acceptor in anaerobic respiration in other pathogens, such as the phylogenetically related Mycobacterium tuberculosis. A recent study demonstrated that R. equi survives under anaerobic conditions. In this work, we endeavored to uncover the electron transport chain complexes of R. equi. By in silico comparison to known complexes in the Transporter Classificatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lung cancer remains a leading cause of cancer-related mortality, primarily because of the lack of effective diagnostic and therapeutic biomarkers. To address the issue of fragmented biomarker data across numerous publications, we have developed the Lung Cancer Biomarker Database (LCBD, http://lcbd.biomarkerdb.com ).
METHODS: We comprehensively reviewed biomarker-related studies up to June 30, 2023, and extracted relevant biomarker information. The identified biomarkers were systematically annotated, including genes, proteins, GO terms, KEGG pathways, biomarker types, molecular typ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: UBA1 and UBA6 are classic ubiquitin-activating E1 enzymes, which participate in the ubiquitination degradation of intracellular proteins and are closely related to the occurrence and development of various diseases and tumors. However, at present, comprehensive analysis has not been used to study the role of UBA family in cancers.
METHODS: We extracted the relevant data of cancer patients from the TCGA database and studied the relationship between the expression patterns of UBA family and the survival rate, and stage of patients in pan-cancer, especially breast cancer (BRCA), colo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study integrates metabolites from Forsythia suspensa (FS) and gut microbiota GM to assess combined therapeutic efficacy against drug-induced liver injury (DILI) using network pharmacology and molecular docking. Metabolites of FS and GM were retrieved from the NPASS and gutMGene databases, respectively. Relevant targets for metabolites and DILI-related targets were identified through public databases. The PPI network and KEGG pathway analysis were employed to identify hub targets and key signalling pathways. Furthermore, we performed a molecular docking assay on the active metabolites and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Artificial intelligence (AI) has brought tremendous progress to drug discovery, yet identifying hit and lead compounds with optimal physicochemical and pharmacological properties remains a significant challenge. Structure-based drug design (SBDD) has emerged as a promising paradigm, but the inherent data biases and ignorance of synthetic accessibility render SBDD models disconnected from practical drug discovery. In this work, we explore two methodologies, Rag2Mol-G and Rag2Mol-R, both based on retrieval-augmented generation to design small molecules to fit a 3D pocket. These two methods invol
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Focal adhesion kinase 1 (FAK1) is a non-receptor tyrosine kinase involved in cancer metastasis and tumor progression. Due to its role in regulating cell migration and survival, FAK1 is considered a promising target for cancer therapy. While large chemical databases such as ZINC offer a wide variety of molecules, many of them have not yet been explored as potential FAK1 inhibitors.In this study, we applied several computational methods to identify new inhibitors of the FAK1 kinase domain. Pharmacophore models were built based on the FAK1-P4N complex (PDB ID: 6YOJ), and the most statistically re
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To investigate the mechanism and potential targets of Yiqi Ziyin (YQZY) for treating immune thrombocytopenia (ITP). Prednisone and YQZY were orally administered to ITP mice. Post-treatment, blood samples were taken to evaluate the blood picture. The spleen was obtained to observe histomorphological changes and calculate the spleen index. The active components and predicted related targets of YQZY were obtained based on the TCMSP database. The ITP-related targets were screened by GeneCards and DisGeNET databases. Then, functional enrichment analyses were conducted to examine the potential regul
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The current study explored the potential toxic mechanisms and targets of PM2.5-induced different types of cystitis by using Mendelian randomization (MR) analysis and network toxicology. We first found a significant causal association between PM2.5 and cystitis by MR analysis. Subsequently, we obtained a total of 18,763 PM2.5-regulated genes through the CTD database, and the enrichment analysis suggested that PM2.5 is mainly closely related to biological functions such as oxidative stress, apoptosis, cytokine production, and inflammation. Next, we obtained disease targets for total cystitis and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To perform a systematic review with meta-analysis to assess recent scientific evidence on the association between periodontitis and systemic parameters/conditions in individuals with chronic kidney disease (CKD).
MATERIALS AND METHODS: The search for studies was performed in MedLine/PubMed, Scopus, Web of Science, and BIREME databases. Reference lists of selected articles were also searched. Studies with different epidemiological designs evaluating the influence of exposure to periodontitis on serum markers and mortality in individuals with CKD were eligible for inclusion. Three in
Систематический обзорСтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The diagnostic biomarkers associated with ischemic stroke (IS) that may have clinical utility remain elucidated. Thus, the potential functional lncRNAs in IS were explored. The Gene Expression Omnibus database provided the transcriptome profile of IS for download. WGCNA analysis and integrated bioinformatics were used to find genes that were differentially expressed (DEGs). The Starbase database created the lncRNA-based ceRNA network. In order to investigate the molecular mechanism and involved pathways of DEGs in IS, functional enrichment analysis was carried out. Using qRT-PCR, lncRNAs ident
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myocardial ischemia-reperfusion injury (MIRI) is a significant risk factor for acute myocardial infarction and is closely associated with ferroptosis. This study aimed to identify key ferroptosis-related genes as potential diagnostic markers for MIRI and to explore their roles in immune infiltration and therapeutic targeting in myocardial tissue. We obtained single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and RNA-seq data on MIRI from the GEO database, applied Seurat and UMAP for data processing and clustering, and analyzed ligand-receptor interactions using CellPhoneDB. By scoring ferroptosis in cardi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Orthosiphon stamineus Benth a traditional medicine used in the treatment of diabetes and kidney diseases. Sodium-glucose co-transporter (SGLT1 and SGLT2) inhibitors are the novel group of drugs used to treat patients with type 2 diabetes mellitus. In this study 20 phytochemical compounds from Orthosiphon stamineus Benth were obtained from 3 databases viz Dr.Duke's phytochemical, Ethno botanical database and IMPPAT. They were subjected to physiochemical, drug likeliness, and ADMET and toxicity predictions. Homology modeling and molecular docking against SGLT1 and SGLT2 were performed and the st
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Interstitial lung disease (ILD) is a progressive fibrotic disease associated with rheumatoid arthritis (RA); real-world data for evaluating RA-associated ILD (RA-ILD) are limited. We evaluated prevalence, time to onset, clinical characteristics and prognostic factors in patients diagnosed with RA (n = 8963) in the Discus Analytics JointMan database (2009-2019) with and without ILD. ILD prevalence was 4.1% (95% confidence interval 3.7-4.5); > 90% had an ILD diagnosis after RA diagnosis (mean time to onset 3.3 years). At baseline, a higher proportion of patients with RA-ILD were older (> 65 year
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteogenesis Imperfecta (OI) is a complex disease caused by genetic alterations in production of collagen type I, and collagen-related proteins. Bone fragility is the most common patient issue, but extraskeletal complications also present an adverse factor in the quality of life and prognosis of patients with OI. However, still little is known about the morbidity and mortality of these patients. The objective of this paper is to determine and describe to what extent OI impacts patients' life in terms of hospitalization and complications describing the incidence and prevalence of the Dutch coho
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The survival rates for breast cancer (BC) have improved in recent years, but resistance, metastasis, and recurrence still remain major therapeutic challenges for BC. The acidic tumor microenvironment (TME) has attracted attention because of its association with tumorigenesis, metastasis, drug resistance, and immune surveillance. In this study, we evaluated natural compounds from traditional herbal medicine used to treat cancer that selectively target genes regulated by extracellular acidosis. We integrated four transcriptomic data including BC prognostic data from The Cancer Genome Atlas datab
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
International Conference on Field-programmable Logic and Applications : [proceedings]. International Conference on Field-Programmable Logic and Applications2021eng
Database algorithms play a crucial part in systems biology studies by identifying proteins from mass spectrometry data. Many of these database search algorithms incur huge computational costs by computing similarity scores for each pair of sparse experimental spectrum and candidate theoretical spectrum vectors. Modern MS instrumentation techniques which are capable of generating high-resolution spectrometry data require comparison against an enormous search space, further emphasizing the need of efficient accelerators. Recent research has shown that the overall cost of scoring, and deducing pe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The HIV-1 integrase viral protein is responsible for incorporating the viral DNA into the genomic DNA. The inhibition of viral integration into host cell DNA is part of recent therapeutic procedures. Combination therapy with protease and reverse transcriptase inhibitors has demonstrated good synergistic results in reducing viral replication. The purpose of this study is to assess the occurrence of integrase drug resistance mutations from the period comprising 2013 through 2018 in Puerto Rico (PR). We analyzed 131 nucleotide sequences available in our HIV genotyping database, and we performed d
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Flaps are common technical choices in aesthetic and reconstructive surgeries. However, the poor flap survival rate remains to be a difficult issue that troubles plastic surgeon. Recent research evidence supports that the use of Botulinum toxin type A (BTXA) can increase the flap survival rate. For verification, the present study was carried out to evaluate the effect of BTXA on flap surgery. Eight databases (PubMed, Cochrane Library, Ovid, Web of Science, Embase, Scopus, CBM, CNKI and WANFANG database) were searched for related published literature up to September 2020. A meta-analysis was the
СтатьяМетаанализСистематический обзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: The morbidity and mortality of gastric cancer (GC) is high, but there are lack of the biomarkers for early diagnosis and progression of GC. We aimed to identify a novel biomarker for the growth and progression of GC.Methods: The Cancer Genome Atlas (TCGA) database including 352 eligible patients was used to screen candidate genes related to the prognosis of GC. A proteomics analysis of Chinese Human Proteome Sketches (CHPS) including 84 eligible sample tissues was conducted to further identify candidate biomarkers. A series of in vitro assays were performed to investigate the functi
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Purpose: To characterize the role of fibrous sheath interacting protein 2 (FSIP2) in the survival outcomes and prognosis of clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) patients, which is currently not well understood. Methods: The Oncomine and CCLE databases were used to investigate the differential expression of FSIP2 in ccRCC versus other cancer types. Levels of FSIP2 in 85 ccRCC patients were assessed by immunohistochemical analysis; clinicopathological features related to FSIP2 expression were examined in these patients finally, disease-free survival and overall survival were estimated by surv
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования