OBJECTIVES: Methyl-CpG binding protein 2 (MeCP2) is a ubiquitous epigenetic factor that represses gene expression by modifying chromatin. Mutations in the MeCP2 gene cause Rett syndrome, a progressive neurodevelopmental disorder. Recent studies also have shown that MeCP2 plays a role in carcinogenesis. Specifically, functional ablation of MeCP2 suppresses cell growth and leads to the proliferation of cancer cells. However, MeCP2's function in adult tissues remains poorly understood. We utilized a weight matrix-based comparison software to identify transcription factor binding site (TFBS) of Me
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recent studies exploring the roles of invasion-metastasis associated miRNAs in gallbladder cancer (GBC) are limited. In the study, we aimed to identify the invasion-metastasis associated miRNAs in GBC by bioinformatics and experimental validation.
METHODS: MiRNAs of different expression were identified by comparing GBC tumor samples with different survival from Gene Expression Omnibus database. MiRTarBase was used for identifying the potential target genes of miRNAs. Then, we performed Gene Ontology (GO) analysis and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway enrichmen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral transcriptional regulators (vTRs) reprogram host gene regulatory networks to promote replication, persistence, and immune evasion. Despite the identification of hundreds of vTRs in human viruses, how they rewire host pathways remains unclear. Here, we systematically profiled 95 vTRs from diverse human viruses across multiple functional assays. vTRs perturb immune, cell proliferation/death, and signaling pathways through various mechanisms; some bind DNA directly, others cooperate or antagonize human transcription factors (hTFs), and some remodel chromatin. vTRs can act as activators or r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcription factor Mrr1, best known for its regulation of Candida azole resistance genes such as MDR1, regulates other genes that are poorly characterized. Among the other Mrr1-regulated genes are putative methylglyoxal reductases. Methylglyoxal (MG) is a toxic metabolite that is elevated in diabetes, uremia, and sepsis, which are diseases that increase the risk for candidiasis, and MG serves as a regulatory signal in diverse organisms. Our studies in Clavispora lusitaniae, also known as Candida lusitaniae, showed that Mrr1 regulates expression of two paralogous MG reductases, MGD1 and MGD2,
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the cloning and sequence analysis of a gamma-butyrolactone autoregulator regulatory island that includes an sscR gene encoding the gamma-butyrolactone autoregulator receptor from Streptomyces scabies NBRC 12914, a plant pathogenic strain. gamma-Butyrolactone autoregulators trigger secondary metabolism, and sometimes morphological differentiation in the Gram-positive genus Streptomyces through binding to a specific autoregulator receptor. This gene cluster showed close similarity to other regulatory islands of Streptomyces origin that are responsible for the control of secondary metab
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel beta-lactamase gene was cloned from the whole-cell DNA of an enterobacterial Citrobacter gillenii reference strain that displayed a weak narrow-spectrum beta-lactam-resistant phenotype and was expressed in Escherichia coli. It encoded a clavulanic acid-inhibited Ambler class A beta-lactamase, GIL-1, with a pI value of 7.5 and a molecular mass of ca. 29 kDa. GIL-1 had the highest percent amino acid sequence identity with TEM-1 and SHV-1, 77%, and 67%, respectively, and only 46%, 31%, and 32% amino acid sequence identity with CKO-1 (C. koseri), CdiA1 (C. diversus), and SED-1 (C. sedlaki)
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Benzylisoquinoline alkaloids constitute a group of about 2,500 structures and are mainly produced by plants of the order Ranunculales. But only the opium poppy, Papaver somniferum, and Papaver setigerum are able to produce morphine. In this study, we started to investigate by gene expression analysis the molecular basis for this exceptional biosynthetic ability. A sequencing project from P. somniferum seedlings was initiated using a method based on the amplified fragment length polymorphism technique that resulted in 849 UniGenes. These cDNAs were analysed on macroarrays for differential expre
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this issue of Cancer Cell, Gidekel et al. demonstrate that Oct-4, a member of the POU class of homeobox genes, is a critical player in the genesis of testicular germ cell tumors. This study provides further evidence that deregulated expression of homeobox genes, which occurs in many solid tumors, is functionally relevant for carcinogenesis and highlights unique features that distinguish homeobox genes from other cancer-promoting genes.
КомментарийСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A naturally occurring AmpC beta-lactamase (cephalosporinase) gene was cloned from the Hafnia alvei 1 clinical isolate and expressed in Escherichia coli. The deduced AmpC beta-lactamase (ACC-2) had a pI of 8 and a relative molecular mass of 37 kDa and showed 50 and 47% amino acid identity with the chromosome-encoded AmpCs from Serratia marcescens and Providentia stuartii, respectively. It had 94% amino acid identity with the recently described plasmid-borne cephalosporinase ACC-1 from Klebsiella pneumoniae, suggesting the chromosomal origin of ACC-1. The hydrolysis constants (k(cat) and K(m)) s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Expression of the auxiliary human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) protein Vpr causes arrest of primate host cells in G2. Expression of this protein in budding yeast has been previously reported to cause growth arrest and a large-cell phenotype. Investigation of the effect of Vpr expression in budding yeast, reported here, showed that it causes disruption of the actin cytoskeleton. Expression of HSP42, the gene for a small heat shock protein (sHSP), from a high-copy-number plasmid reversed this effect. The sHSPs are induced by exposure of cells to thermal, osmotic, and oxidative stresses
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gonadotropin-releasing hormone (GnRH) is a neuropeptide that plays a pivotal role in reproductive processes. In recent years, it has become clear that it is also an anti-proliferative agent. GnRH analogs are now used clinically in the treatment of prostate cancer as well as endometriosis and precocious puberty. The target cells of GnRH include the gonadotropes of the anterior pituitary gland and the cells of various hormone-dependent tumors. Only a few target genes have been identified in these cells, however, and little is known concerning their regulation by GnRH. Therefore, we used a quanti
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recently, non-negative matrix factorization (NMF) has been shown to perform well in the analysis of omics data. NMF assumes that the expression level of one gene is a linear additive composition of metagenes. The elements in metagene matrix represent the regulation effects and are restricted to non-negativity. However, according to the real biological meaning, there are two kinds of regulation effects, i.e., up-regulation and down-regulation. Few methods based on NMF have considered this biological meaning. Therefore, we designed a flexible non-negative matrix factorization (FNMF) algorithm by
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mounting evidence indicates that circular RNAs (circRNAs) participate in the occurrence and development of various diseases, including osteoarthritis (OA). However, the effects and molecular mechanism of circ_0128846 in OA have not been reported.
METHODS: The expression levels of circ_0128846, microRNA-127-5p (miR-127-5p), and nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT) were determined by quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR) or western blot assay. Cell viability was determined by Cell Counting Kit-8 (CCK-8) assay. Cell apoptosis was examined by flow cytome
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this study was to investigate the changes in expression pattern of the most important genes connected with apoptosis in proliferative apoptotic lesions (hyperplasia, adenoma), applying cDNA microarray technique, in order to promote the possible diagnostic or therapeutic utilisation of any difference in gene expression compared to the healthy (normal) parathyroid gland. Samples were taken from surgically removed 2 hyperplasias, 2 adenomas and 2 normal parathyroid glands. The Apoptosis Gene Array (Superarray) was used. This contains 112 genes, in tetraspot arrangement. The probes meas
Сравнительное исследованиеАннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vibrio parahaemolyticus is a common foodborne pathogen in seafood and represents a major threat to human health worldwide. In this study, we identified that PhoR, a histidine kinase, is involved in the regulation of swarming and flagella assembly. RNA sequencing analysis showed that 1122 genes were differentially expressed in PhoR mutant, including 394 upregulated and 728 downregulated genes. KEGG enrichment and heatmap analysis demonstrated that the bacterial secretion system, flagella assembly and chemotaxis pathways were significantly downregulated in PhoR mutant, while the microbial metabo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Atherosclerosis is a complex disease with hundreds of genes influencing its progression. In addition, the phenotype of the disease varies significantly depending on the arterial bed.
METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: We characterized the genes generally involved in human advanced atherosclerotic (AHA type V-VI) plaques in carotid and femoral arteries as well as aortas from 24 subjects of Tampere Vascular study and compared the results to non-atherosclerotic internal thoracic arteries (n=6) using genome-wide expression array and QRT-PCR. In addition we determined genes that were typi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pond smelt (Hypomesus nipponensis) is a cold-freshwater fish species and a winter economic aquaculture resource in South Korea. Because of its high susceptibility to abnormal water temperature from global warming, a large number of smelt die in hot summers. Here, we present the first draft genome of H. nipponensis and transcriptomic changes in molecular mechanisms or intracellular responses under heat stress. We combined Illumina and PacBio sequencing technologies to generate the draft genome of H. nipponensis. Based on the reference genome, we conducted transcriptome analysis of liver and mus
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kidney fibrosis is a hallmark of chronic kidney disease (CKD) and a major contributor to progression toward end-stage renal disease. Here, we identify 8-oxoguanine DNA glycosylase 1 (Ogg1), a DNA repair enzyme, as a regulator of kidney fibrosis. Ogg1 expression is upregulated in experimental fibrosis models in male mice, including unilateral ureteral obstruction (UUO) and aristolochic acid (AA) nephropathy, as well as in kidney tissues from CKD patients. Genetic deletion of Ogg1 reduces fibrosis, tubular atrophy and fibrotic marker expression, and improves renal function in AA nephropathy. Mec
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stem cell-mediated regeneration is essential for tissue integrity. In skeletal muscle, tissue repair largely depends on muscle stem cells (MuSCs), which undergo dynamic cell-state transitions through making precise fate decisions during regeneration. However, the molecular regulators of cell-state conversion in MuSCs remain unclear. Here, we identify a previously unrecognized, noncanonical role for TRF2 in MuSC biology. TRF2 is dynamically regulated upon injury and required to preserve stem cell identity, support reparative myogenesis, and sustain self-renewal. MuSC-specific TRF2 disruption ex
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer cachexia involves severe skeletal muscle and adipose tissue loss. The role of Apolipoprotein E (ApoE) in adipose remodeling remains unclear. This study investigated ApoE's function in cancer cachexia. We found cachectic patients had decreased plasma ApoE but elevated expression in subcutaneous adipose. In vitro, ApoE knockdown in adipocytes downregulated both lipogenesis and lipolysis genes. In vivo, ApoE-/- mice were protected against adipose wasting in a cachexia model. Single-cell RNA sequencing revealed ApoE deficiency altered immune cell dynamics, increasing total macrophages and e
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования