Imatinib (IMA) and nilotinib are the first and second generations of BCR-ABL tyrosine kinase inhibitors, which widely applied in chronic myeloid leukemia (CML) treatment. Here we aimed to provide new targets for CML treatment by transcriptome analysis. Microarray data GSE19567 was downloaded and analyzed from Gene Expression Omnibus (GEO) to identify common genes, which are downregulated or upregulated in K562-imatinib and K562-nilotinib treated cells. The differentially expressed genes (DEGs) were assessed, and STRING and Cytoscape were used to create the protein-protein interaction (PPI) net
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Skeletal muscle atrophy is the major hallmark of cancer cachexia. The mechanisms underlying muscle wasting remain elusive in cachectic patients. Our research seeks to identify differentially expressed genes (DEGs) between non-cachectic and cachectic cancer patients and elucidate their functions.
METHODS: We screened the DEGs of skeletal muscle between patients with and without cachexia from microarray data. Biological function of DEGs is analyzed through gene enrichment analysis, while an interaction network is constructed to visualize how genes are related. A Spearman's correlati
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recent studies have indicated that some members of the tripartite motif (TRIM) proteins function as important regulators for non-small cell lung cancer (NSCLC), However, the regulatory mechanism underpinning aberrant expression of TRIM in NSCLC remains unclear. Here we report that TRIM15 plays important roles in NSCLC progression through modulating Keap1-Nrf2 signaling pathway.
METHODS: TRIM15 expression was evaluated by western blot analysis, tissue microarray-based immunohistochemistry analysis. The interactions between TRIM15 and Keap1 were analyzed by co-immunoprecipitation (C
СтатьяVideo-Audio MediaПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Most chromosomal aberrations revealed by chromosomal microarray testing (CMA) are simple; however, very complex chromosomal structural rearrangements can also be found. Although the mechanism of structural rearrangements has been gradually revealed, not all mechanisms have been elucidated. We analyzed the breakpoint-junctions (BJs) of two or more clustered copy number variations (CNVs) in the same chromosome arms to understand their conformation and the mechanism of complex structural rearrangements. Combining CMA with long-read whole-genome sequencing (WGS) analysis, we successfully determine
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Congenital stationary night blindness (CSNB) is a heterogeneous group of Mendelian retinal disorders that present in childhood. Biallelic variants altering the protein-coding region of the TRPM1 gene are one of the commonest causes of CSNB. Here, we report the clinical and genetic findings in 10 unrelated individuals with TRPM1-retinopathy.
METHODS: Study subjects were recruited through a tertiary clinical ophthalmic genetic service at Manchester, UK. All participants underwent visual electrodiagnostic testing and panel-based genetic analysis.
RESULTS: Study subjects had a median ag
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
METHODS: Differential expression of five selected miRNAs (hsa-mir-1225-3p, hsa-mir-1238, hsa-miR-3162-3P, hsa-miR-4721, and hsa-miR-H7) was … ions with hepatic fibrotic level (p < 0.05), and the upregulation trends were consistent with miRNA microarray analysis previously. The multivariate logistic regression analysis identified that a model of five miRNAs (miR-5) had a high diagnostic accuracy in discrimination of different stages of liver fibrosis. The ROC showed that the miR-5 has excellent value in dia …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Atrazine (ATZ) is an extensively used herbicide and ubiquitous environmental contaminant. ATZ and its metabolite, diaminochlorotriazine (DAC … ilization competence of annexin-positive (AV+) and annexin-negative (AV-) spermatozoa was examined. Microarray analysis was performed for 7-day blastocysts. Intracytoplasmic sperm injection was performed with control (AV+, AV-) and DACT (AV+, AV-) spermatozoa. Cleavage rates did not differ between groups and blastocyst formation tended to be higher for AV- vs. AV+ in …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sevoflurane, one of the most commonly used pediatric anesthetics, was found to cause developmental neurotoxicity. To understand specific risk groups and develop countermeasures, a better understanding of its mechanisms is needed. We hypothesize that, as in many other brain degeneration pathways, long non-coding RNAs (lncRNAs) are involved in the sevoflurane-induced neurotoxicity. Postnatal day 7 (PD7) mice were exposed to 3% sevoflurane for 6 h. To quantify neurotoxicity in these mice, we (1) detected neural apoptosis through analysis of caspase 3 expression level and activity and (2) assessed
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A large proportion of liver cancer cases is caused by hepatitis B virus (HBV) infection. In recent years, an increasing number of reports have indicated that circular RNAs (circRNAs) exert regulatory effects in cancer development, whereas the role of circRNAs in HBV-positive liver cancer requires further investigation. In the present study, abnormally expressed circRNAs were identified in HBV-positive liver cancer cells through microarray analysis. A total of 1,493 differentially expressed circRNAs [absolute fold-change (FC) ≥2] in HBV-positive liver cancer cells were detected, of which 171 we…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RESEARCH QUESTION: What is the difference in endometrial transcriptomics between women with normal and with low mid-luteal progesterone during the implantation window?
DESIGN: An endometrial biopsy and serum progesterone concentration were taken from participants during the mid-luteal phase (LH+7 to LH+9). A total of 12 participants were recruited and categorized into two groups based on their progesterone concentrations: normal progesterone (>15 ng/ml, n = 6) and low progesterone (<15 ng/ml, n = 6). Global endometrial gene expression between the two groups was compared by microarray techniqu
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiomyocyte hypertrophy is a response to stress or hormone stimulation and is characterized by an increase of cardiomyocyte size. Abnormal … pertrophic cardiomyocytes were induced by angiotensin II (0.1 μmol/L) for 48 hours. High-throughput microarray analysis combined with quantitative real-time PCR assay were then performed to screen the differentially expressed lncRNAs and mRNAs. A total of 1577 lncRNAs and 496 mRNAs transcripts were identified differentially expressed in hypertrophic cardiomyocytes. A …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Idiopathic pulmonary arterial hypertension (IPAH) is a severe cardiopulmonary disease with a relatively low survival rate. Moreover, the pathogenesis of IPAH has not been fully recognized. Thus, comprehensive analyses of miRNA-mRNA network and potential drugs in IPAH are urgent requirements.
METHODS: Microarray datasets of mRNA and microRNA (miRNA) in IPAH were searched and downloaded from Gene Expression Omnibus (GEO). Differentially expressed genes (DEGs) and differentially expressed miRNAs (DEMIs) were identified. Then, the DEMI-DEG network was conducted with associated compr
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Microarray technologies have identified imbalances in the expression of specific genes and biological pathways in Alzheimer's disease (AD) brains. However, there is a lack of reproducibility across individual AD studies, and many related neurodegenerative and mental health disorders exhibit similar perturbations.
OBJECTIVE: Meta-analyze publicly available transcriptomic data from multiple brain-related disorders to identify robust transcriptomic changes specific to AD brains.
METHODS: Twenty-two AD, eight schizophrenia, five bipolar disorder, four Huntington's disease, two major
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The molecular mechanisms of abnormal palatogenesis were investigated in this study. A key regulator, miR-106a-5p, and its target pathway were analyzed.
OBJECTIVES: This research is trying to clarify the underlying mechanism of the modulation of miRNA transcription during the formation of cleft palate by 7T and 9.4T NMR metabolomic platforms.
METHOD: Differentially expressed miRNAs and mRNAs were analyzed by microarray analysis and verified by qRT-PCR. The protein expression in TGFβ signaling pathways were analyzed by Western Blotting. The relationship between miR-106a-5p and TGFβ…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to gain a better understanding of the molecular circuitry of Schmid-type metaphyseal chondrodysplasia (SMCD), and to identify more potential genes associated with the pathogenesis of SMCD. Microarray data from GSE72261 were downloaded from the NCBI GEO database, including collagen X p.Asn617Lys knock-in mutation (ColXN617K), ablated XBP1 activity (Xbp1CartΔEx2), compound mutant (C/X), and wild-type (WT) specimens. Differentially expressed genes (DEGs) were screened in Xbp1 vs. WT, Col vs. WT and CX vs. WT, respectively. Pathway enrichment analysis of these DEGs was performed.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To study the genetic cause of Mayer-Rokitansky-Kuster-Hauser syndrome (MRKH). Although a few candidate genes and genomic domains … mbers.
INTERVENTIONS(S): DNA sequencing of WNT4, HNF1B, and LHX1 in 100 MRKH patients, chromosomal microarray analysis in 31 North American MRKH patients, and characterization and sample collection of 147 North American and Turkish MRKH probands and their families.
MAIN OUTCOME MEASURE(S): DNA sequence variants and CNVs; pedigree structural analysis.
RESULT(S): We …
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Only a few genetic causes for childhood obesity have been identified to date. Copy number variants (CNVs) are known to contribute t … 1989 genes, including all known obesity loci. The expression of candidate genes was assessed using microarray analysis of messenger RNA from subcutaneous adipose tissue.
RESULTS: We identified rare CNVs in 17 subjects (19%) with obesity and 2 controls (3%). In three cases (3%), the identified variant involved a known syndromic lesion (22q11.21 duplication, 1q21.1 d …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: One in eight women will develop breast cancer, 15-20% of whom will have triple-negative breast cancer (TNBC), an aggressive breast … lysis. Apoptosis was observed morphologically and by measuring cleaved PARP/caspase three products. Microarray analysis was performed using MDA-MB-231 cells to examine cell cycle genes regulated by riluzole and any enhanced effects on paclitaxel-mediated cell cycle arrest, determined by FACS analysis. These results were confirmed in vivo using a MDA-MB-231 xenograft …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fc receptor-like (FCRL) 5 is a novel IgG binding protein expressed on B cells, with the capacity to regulate Ag receptor signaling. We asses … the FCRL5(+) subset had more switched isotype expression and more extensive proliferative history. Microarray analysis and quantitative RT-PCR demonstrated that the two TLM subsets possess distinct gene expression profiles, characterized by markedly different CD11c, SOX5, T-bet, and RTN4R expression, as well as differences in expression of inhibitory receptors. Func …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic changes, such as alteration of DNA methylation patterns, have been proposed as a molecular mechanism underlying the effect of alcohol on the maintenance of adult stem cells. We have performed genome-wide gene expression microarray and DNA methylome analysis to identify molecular alterations via DNA methylation changes associated with exposure of human dental pulp stem cells (DPSCs) to ethanol (EtOH). By combined analysis of the gene expression and DNA methylation, we have found a significant number of genes that are potentially regulated by EtOH-induced DNA methylation. As a focused
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования