Genetic diversity of surface exposed and stage specific Plasmodium falciparum immunogenic proteins pose a major roadblock to developing an effective malaria vaccine with broad and long-lasting immunity. We conducted a prospective genetic analysis of candidate antigens (msp1, ama1, rh5, eba175, glurp, celtos, csp, lsa3, Pfsea, trap, conserved chrom3, hyp9, hyp10, phistb, surfin8.2, and surfin14.1) for malaria vaccine development on 2375 P. falciparum sequences from 16 African countries. We described signatures of balancing selection inferred from positive values of Tajima's D for all antigens a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Scrub typhus is an acute infectious disease caused by the bacterium Orientia tsutsugamushi, which is widely distributed in northern, southern, and eastern Asia. Early diagnosis is essential because the average case fatality rate is usually >10% but can be as high as 45% if antimicrobial treatment is delayed. Although an O. tsutsugamushi 56-kDa type-specific antigen (TSA) is commonly used for serological diagnosis of scrub typhus, the 56-kDa TSA shows variations among O. tsutsugamushi strains, which may lead to poor diagnostic results. Therefore, the discovery of new antigenic proteins may impr
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The search for epitopes that will effectively trigger an immune response remains the "El Dorado" for immunologists. The development of promising immunotherapeutic approaches requires the appropriate targets to elicit a proper immune response. Considering the high degree of HLA/TCR diversity, as well as the heterogeneity of viral and tumor proteins, this number will invariably be higher than ideal to test. It is known that the recognition of a peptide-MHC (pMHC) by the T-cell receptor is performed entirely in a structural fashion, where the atomic interactions of both structures, pMHC and TCR,
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The B cell receptor (BCR) repertoire captures an individual's immunological history and antigen-driven evolution within a vast, high-dimensional sequence space. Although bulk and single-cell adaptive immune receptor repertoire sequencing (AIRR-seq) now enables deep profiling of BCR diversity, interpreting these datasets remains challenging due to strong inter-individual heterogeneity, nonlinear sequence-structure-function relationships, dynamic clonal evolution, and the rarity of functionally relevant clones. Artificial intelligence (AI) provides a conceptual and computational framework for ad
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autoimmune diseases (AIDs) affect 5-10% of the global population, yet effective diagnosis and treatment remain challenging due to their complexity and heterogeneity. Autoantibodies serve as crucial biomarkers for disease classification and prognosis, making comprehensive autoantigen profiling essential for advancing our understanding of autoimmune pathogenesis. Phage ImmunoPrecipitation sequencing (PhIP-Seq) has emerged as a transformative high-throughput technology that combines phage display with next-generation sequencing to comprehensively profile antibody-antigen interactions. This review
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The vast diversity of the virosphere underscores the need for rapid, adaptable vaccine development infrastructures. Arthropod-borne zoonotic alphaviruses, in particular, continue to pose substantial threats to human and animal health. We present a fast, multitarget vaccine design pipeline integrating machine learning-based epitope prediction, protein modeling, and docking to prioritize viral peptides by immunogenicity, allele coverage, solubility, and stability. T cell epitopes were validated using peptide microarrays and molecular dynamics simulations, confirming receptor binding accuracy. Fl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The unwanted immune response to Biologic Therapies can result in anti-drug antibodies that complicate clinical development and may adversely affect patient outcomes. At present, prediction of the impact of this immunogenicity before starting clinical trials is impossible, due to the complexity of the immune system and the multiple factors that contribute to the risk of immunogenicity. Advances in computational methods and power will enable improvements in prediction of immunogenicity. A workshop at EMBL-EBI brought together industry experts and academics to reflect on the contributions of arti
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Malaria remains a major global health threat, with Plasmodium species, especially P. falciparum, increasingly resistant to drugs and vaccines. Novel strategies are needed to address antigenic diversity and the parasite's intracellular immune evasion. This study aimed to identify conserved and immunogenic B-cell epitopes in P. falciparum and human erythrocytes to design a bispecific antibody model, COMED hook, capable of blocking erythrocyte invasion. Surface and secretory proteins of P. falciparum and erythrocytes were retrieved from public databases. B-cell epitopes were predicted and filtere
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
For successful clinical translation of therapeutic human papillomavirus (HPV) vaccines, optimizing antigen selection is key to enhancing efficacy. Traditional E6/E7 targets are limited by heterogeneous tumor expression. This review advocates expanding the antigen repertoire to include tumor-specific neoantigens in next-generation vaccines. We systematically evaluate established HPV therapeutic antigens and vaccine platforms, and comprehensively explore the frontier of novel antigens, advanced screening technologies, and recent vaccine innovations. Central is a bioinformatics-guided antigen sel
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Subclade K is a newly emergent influenza A/H3N2 strain that became the dominant strain circulating globally; more than 90% of influenza A vi … T cell epitopes and that this loss may have contributed to the emergence of subclade K. Using a new immunoinformatics tool, EpiCC, we assessed T cell epitope cross-conservation between subclade K, other circulating H3N2 strains, and the most recent seasonal vaccine strains. Evaluation of 706 H3N2 HA sequences demonstrated a 10% reduction in cross-conserved T cell e …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In silico techniques have become essential in contemporary parasitology, offering swift, cost-effective, and scalable methods for exploring parasite biology, host-parasite interactions, drug resistance, the discovery of diagnostic markers, vaccine development, and the prioritization of therapeutic targets. Computational frameworks that encompass genomics, pangenomics, phylogenetics, transcriptomics, proteomics, structural biology, molecular docking, molecular dynamics simulations, artificial intelligence (AI), and immunoinformatics have collectively revolutionized parasite research. They enabl…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Q fever is a zoonotic disease caused by the obligate intracellular bacterium Coxiella burnetii that presents significant challenges for glob … esigns. Particular attention is given to innovative technologies, including reverse vaccinology and immunoinformatics, that have enabled the identification of novel antigenic targets. Recent clinical data demonstrating the safety and immunogenicity of next-generation vaccine candidates are presented, alongside manufacturing and implementation considerations. While …
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Trichomonas vaginalis is the etiological agent of trichomoniasis, the most common non-viral sexually transmitted infection (STI) worldwide. The increasing resistance to metronidazole, currently the only FDA-approved treatment, necessitates the development of a novel vaccine to prevent and control this infection.
METHODS: In this study, an in silico immunoinformatics pipeline was employed to identify antigenic peptides and construct a multi-epitope vaccine candidate targeting T. vaginalis. Surface and secretory proteins were retrieved and analyzed for antigenicity, allergenicity, a…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human cytomegalovirus (HCMV) is accountable for high morbidity in neonates and immunosuppressed individuals. Due to the high genetic variabi … highly immunogenic and antigenic epitopes with high global population coverage were finalized using immunoinformatics tools and algorithms. Further, the epitopes that were overlapping among the finalized B-cell and T-cell epitopes were linked with suitable linkers to form various combinations of multi-epitopic vaccine constructs. Among 16 vaccine constructs, Vc12 w …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sphingomyelin is a major constituent of eukaryotic cell membranes, and if degraded by bacteria sphingomyelinases may contribute to the pathogenesis of infection. Among Leptospira spp., there are five sphingomyelinases exclusively expressed by pathogenic leptospires, in which Sph2 is expressed during natural infections, cytotoxic, and implicated in the leptospirosis hemorrhagic complications. Considering this and the lack of information about associations between Sph2 and leptospirosis severity, we use a combination of immunoinformatics approaches to identify its B-cell epitopes, evaluate their…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tuberculosis (TB) is an infectious disease caused by Mycobacterium tuberculosis. As a result of the coronavirus disease 2019 (COVID-19) pand … and adaptive immunity and triggering adaptive immunity. Furthermore, innovations in bioinformatics, immunoinformatics, synthetic technologies, new materials, and transgenic animal models have put wings on the research of peptide-based vaccines for TB. Hence, this review seeks to give an overview of current tools that can be used to design a peptide-based vaccine, t …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Salmonella is responsible for causing enteric fever, septicemia, and gastroenteritis in humans. Due to high disease burden and emergence of multi- and extensively drug-resistant Salmonella strains, it is becoming difficult to treat the infection with existing battery of antibiotics as we are not able to discover newer antibiotics at the same pace at which the pathogens are acquiring resistance. Though vaccines against Salmonella are available commercially, they have limited efficacy. Advancements in genome sequencing technologies and immunoinformatics approaches have solved the p…
ОбзорСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lymphatic filariasis (LF) is a debilitating parasitic disease caused by filarial parasites and it is prevalent across the underprivileged po … oinflammatory cytokines as compared to the infected but untreated group. Furthermore, our in silico immunoinformatics data revealed eight B-cell epitopes and several T-cell epitopes in FSAg and these epitopes were linked to form a refined antigen in silico. The immune simulation suggested IgM and IgG1 as the predominant immunoglobulins induced in response to FSAg. …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toxoplasmosis caused by an obligatory intracellular protozoan parasite of Toxoplasma gondii threats a wide spectrum of human and animal host … ults disclosed that the designing of effective multiepitopes of T. gondii by in silico modeling and immunoinformatics tools can strengthen our knowledge about triggering of epitope-based vaccine/diagnosis strategies in future perspectives.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zika virus (ZIKV) is an arbovirus belonging to the Flaviviridae family and the genus Flavivirus. Infection with ZIKV causes a mild, self-limiting febrile illness called Zika fever. However, ZIKV infection has been recently associated with microcephaly and Guillain-Barré syndrome. Vaccines for the disease are a high priority of World Health Organization. Several studies are currently being conducted to develop a vaccine against ZIKV, but until now there is no licensed ZIKV vaccine. This study used a novel immunoinformatics approach to identify potential T-cell immunogenic epitopes present in th…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.