Contamination of tissue samples with blood is hardly avoidable. The possibilities for replicate sampling and tissue washing are limited when working with resected specimens of human origin. However, its impact on metabolic profiling has rarely been addressed. In this study, we performed elemental analysis and metabolic profiling focusing on 108 hydrophilic target metabolites in 61 meningioma tissue samples obtained from a non-stratified cohort of 36 patients during neurosurgery. We used iron as an easily accessible proxy for blood. The samples were frequently and non-homogenously contaminated
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microgravity is a condition that may affect gastrointestinal function and metabolism during spaceflight. Despite attempts to keep normal dietary habits at the ISS, the food selection and meal timing may also be perturbed during the confinement. To understand the impact of spaceflight on human metabolism, we characterized the plasma metabolome of astronauts (n = 52) before, during, and after missions on board the International Space Station (ISS) using liquid chromatography coupled with mass spectrometry. Here we show that spaceflight affected around 40 circulating compounds. In this longitudin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Artificial insemination in the pig industry requires frozen semen of better freezability and post-thaw quality. Several recent metabolomics studies were carried out to discover sperm freezability-related biomarkers. However, only a limited number of pig breeds were examined and results remain obscure. Here, boar semen samples were collected and quality evaluated for 3 Western breeds (Duroc, Landrace and Yorkshire), originating from a nucleus farm and a boar station. Post-thaw sperm from the nucleus farm exhibited significantly higher motility and vitality rates (p < 0.01), and also better acro…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Massive untargeted metabolomics datasets are rapidly accumulating, but cross-study and cross-platform reuse remain limited by poor comparability. This limitation is exacerbated by the low rate of confident structural annotation, which restricts structure-based alignment to only a small fraction of detected metabolic features. Here, X-Align is presented, which is an annotation-independent framework for cross-platform alignment of untargeted metabolomics features. Its core component, Align-ID, is a residual attention-based deep regression model that learns reference chromatographic behavior dire…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human gut microbiome is a complex and constantly evolving community of trillions of microorganisms that are crucial to various aspects o … ch as 16S rRNA sequencing, shotgun metagenomics, and the integration of multi-omics approaches like metabolomics, proteomics, and transcriptomics. It also discusses innovative tools including single-cell genomics, spatial transcriptomics, and microbiome-on-a-chip platforms, which hold promise for revealing host-microbe interactions at unprecedented levels of d …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present study investigated the distinct metabolic profiles of two primary traditional Chinese medicine (TCM) syndromes in patients with cholelithiasis-liver Qi stagnation (LQS) and liver-gallbladder damp-heat (LGDH). By integrating untargeted and targeted metabolomics, we aimed to identify objective serum and urine biomarkers for syndrome differentiation and to elucidate their underlying biological basis. In total, 91 participants, comprising 33 healthy controls (HCs), 30 cholelithiasis patients with LQS syndrome, and 28 cholelithiasis patients with LGDH syndrome, were enrolled. Untargeted…
СтатьяDatasetПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Organic anion transporting polypeptide (OATP) 1B1 is an influx transporter mediating the hepatic uptake of many compounds through the cell membrane. OATP1B1 activity fluctuates due to various factors; hence, evaluating OATP1B1 activity is important for pharmacokinetic studies and precision dosing of substrate drugs. This study aimed to discover novel biomarker candidates using nontargeted metabolomics. Blood samples of 432 individuals selected from the Japanese general population and 264 patients were analyzed. The samples were pretreated by more vigorous extraction methods than those conventi…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Sepsis remains a leading cause of mortality worldwide, with cardiac dysfunction contributing substantially to sepsis-related deaths. Due to the unique biology of myocardial tissue, the mechanisms underlying sepsis-induced cardiac injury are incompletely understood. This exploratory study aimed to apply integrated proteomic and metabolomic profiling to characterize molecular alterations in cardiac tissue from a cecal ligation and puncture mouse model of sepsis. RESULTS: Comparative analysis identified 118 significantly altered proteins (75 upregulated and 43 downregulated) and 190 si
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Efficient metabolite extraction is a key determinant of metabolome coverage and data quality in metabolomics. In this study, we systematically compare two widely used metabolite extraction strategies in untargeted metabolomics, including methanol-based single- and methyl tertiary-butyl ether (MTBE) based dual-phase solvent systems, and evaluate their performance across common urine and plasma, in liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS)-based metabolomics. Through a rational experimental design, we disentangled the multifactorial differences between single- and dual-phase extractions in…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Edible fungi fermentation is an effective strategy for enhancing the functional value of traditional foods, while postbiotics offer multiple … abolite profiles of fermented and control samples were comprehensively analyzed by UPLC-MS/MS-based metabolomics. A total of 1,433 metabolites were identified. The addition of daylily, glucose, and trace elements significantly altered the metabolic profile, particularly facilitating the diverse production of organic acids while maintaining a stable total acid …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Public metabolomics databases offer a large number of datasets. Combined analysis of these data sets may better capture complex molecular mechanisms in diseases. However, most datasets include measurements for only a very small fraction of the known metabolites. Hence, simply putting together these studies leads to very sparse datasets, which do not lend themselves well to training machine learning models. In this paper, we propose two novel approaches for dataset merging and imputation model training: (i) Iterative similarity-based merging generates an optimal merge set for each dataset and m…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Seronegative rheumatoid arthritis (negRA) is difficult to diagnose due to the absence of rheumatoid factor and anticitrullinated peptide ant … redox regulation and nucleotide/cofactor metabolism. These findings support the potential of urine metabolomics as a non-invasive tool for biomarker discovery in negRA and warrant validation in larger cohorts.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drug-induced liver injury (DILI) is one of the most common adverse reactions in clinical settings, and drug hepatotoxicity is also a primary factor contributing to the suspension and withdrawal of drug development. Currently, there are no specific biomarkers available for the early diagnosis and monitoring of DILI in clinical practice. In recent years, metabolomics has emerged as a powerful tool for identifying small molecule biomarkers in DILI, owing to its unique advantages. In this article, we comprehensively reviewed the metabolomics studies related to DILI to investigate the pathophysiolo…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: During pregnancy, the maternal and fetal metabolomes are linked and can influence one another through factors such as maternal … od at the time of the delivery and utilized high-resolution mass spectrometry to perform untargeted metabolomics on maternal (n = 65) and neonate (n = 65) samples. We performed principal component analysis of the detected features to assess differences between mothers and neonates. We then performed a metabolome-wide association study to identify significant f …
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tuberculous meningitis (TBM) remains the most devastating form of extra-pulmonary tuberculosis (TB) and is associated with high mortality and neurological deficits, often due to delayed diagnosis. Disease outcome in TBM depends critically on early diagnosis and timely initiation of treatment. However, the non-specific clinical presentation of TBM poses a major diagnostic challenge, as no single test can reliably establish a definitive diagnosis. The recommended diagnostic approach, GeneXpert MTB/RIF ultra, combined with mycobacterial culture of cerebrospinal fluid (CSF), remains limited by sub
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In multiple system atrophy (MSA), the fatal movement disorder, cell populations of the striatum and other subcortical brain regions degenerate, leading to a rapidly progressive, atypical Parkinsonian syndrome. The pathophysiology of neurons and glial cells shows misfolding, aggregation, and increased release of the protein α-synuclein. In addition, neuronal hypoexcitability, a reduction in the activity of the mitochondrial respiratory chain, and a dysregulation of the enzymes involved in the biosynthesis of coenzyme Q10 were observed in human stem-cell models. In this study, untargeted and tar
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hyperuricemia is the second most prevalent metabolic disorder globally and exhibits pronounced heterogeneity in clinical practice. Only abou … ric acid nephrolithiasis (UAN), respectively. Using an advanced SCIEX ZenoTOF 7600-based untargeted metabolomics platform, 925 metabolites were identified in both positive and negative ionization modes. The assessment of quality control (QC) samples showed high precision in instrumental measurement with RSD values of the ion features less than 30% achieving 91 …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tobacco (Nicotiana tabacum L.) is a major economic crop and a model for plant-pathogen interactions, yet the spatiotemporal dynamics of defense metabolism during infection remain poorly characterized. Here, we used MALDI-MSI-based spatial metabolomics to systematically profile tobacco leaves during Pseudomonas syringae infection. Multidimensional analysis of 1,399 annotated metabolites revealed distinct spatiotemporal regulation patterns. Temporally, early infection (12 h postinfection (hpi)) was characterized by increased organic acids and terpenoids, followed by a mid-stage shift toward phen…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neisseria gonorrhoeae remains a high-priority pathogen according to the World Health Organisation Bacterial Priority Pathogens List. In South Africa, increasing antimicrobial resistance to tetracycline, ciprofloxacin, and penicillin is limiting available treatment options for N. gonorrhoeae infections. This challenge necessitates the exploration of alternative therapeutics, with natural products representing a promising source of novel scaffolds. This study employed a metabolomics-guided approach to tentatively identify antigonorrhoeal compounds from South African medicinal plants. Sixteen cru…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Urothelial carcinoma （UC） is a globally prevalent malignancy lacking robust non-invasive biomarkers. Metabolic reprogramming is a recognized cancer hallmark. Untargeted metabolomics enables high-throughput and unbiased analysis of bodily fluids， offering a promising approach for discovering novel biomarkers in UC. This investigation employs untargeted metabolomic profiling to detect novel urinary biomarkers in UC cohorts. The analytical strategy prioritizes tumor-associated metabolic perturbations through pathway-centric characterization of dysregulated biochemical networks. This study systema…
Аннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования