Mammalian orthoreoviruses (reoviruses) serve as potential triggers of celiac disease and have oncolytic properties, making these viruses potential cancer therapeutics. Primary attachment of reovirus to host cells is mainly mediated by the trimeric viral protein, σ1, which engages cell-surface glycans, followed by high-affinity binding to junctional adhesion molecule-A (JAM-A). This multistep process is thought to be accompanied by major conformational changes in σ1, but direct evidence is lacking. By combining biophysical, molecular, and simulation approaches, we define how viral capsid protei
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
1-Aminocyclopropane carboxylic acid oxidase (ACCO) catalyzes the last step of ethylene biosynthesis in plants. Although some sets of structures have been described, there are remaining questions on the active conformation of ACCO and in particular, on the conformation and potential flexibility of the C-terminal part of the enzyme. Several techniques based on the introduction of a probe through chemical modification of amino acid residues have been developed for determining the conformation and dynamics of proteins. Cysteine residues are recognized as convenient targets for selective chemical m
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Expression of the two critical virulence factors of Vibrio cholerae, toxin-coregulated pilus and cholera toxin, is initiated at the tcpPH promoter by the regulators AphA and AphB. AphA is a winged helix DNA-binding protein that enhances the ability of AphB, a LysR-type transcriptional regulator, to activate tcpPH expression. We present here the 2.2 Å X-ray crystal structure of full-length AphB. As reported for other LysR-type proteins, AphB is a tetramer with two distinct subunit conformations. Unlike other family members, AphB must undergo a significant conformational change in order to bind
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polyclonal antibodies are used extensively to characterize their protein antigens in many experimental settings, including measuring protein concentration and function in vitro, ex vivo and in fixed and living tissues. Disulfide bonds constrain the polypeptide backbone of proteins and reduce the conformational variations of the structure. Several proteins are constitutively produced as multiple partially disulfide-bonded states that result in populations of protein states with a variety of conformational forms, which can influence polyclonal antibody binding to the protein. For two protein ant
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In a number of conformational diseases, intracellular accumulation of proteins bearing non-native conformations occurs. The search for compounds that are capable of hindering the formation and accumulation of toxic protein aggregates and fibrils is an urgent task. Present fluorescent methods of fibrils' detection prevent simple real-time observations. We suppose to use green fluorescent protein fused with target protein and fluorescence lifetime measurement technique for this purpose. The recombinant proteins analyzed were produced in E. coli. Mass spectrometry was used for the primary structu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-throughput quantitative analysis of protein conformational changes has a profound impact on our understanding of the pathological mechanisms of Alzheimer's disease (AD). To establish an effective workflow enabling quantitative analysis of changes in protein conformation within multiple samples simultaneously, here we report the combination of N,N-dimethyl leucine (DiLeu) isobaric tag labeling with limited proteolysis mass spectrometry (DiLeu-LiP-MS) for high-throughput structural protein quantitation in serum samples collected from AD patients and control donors. Twenty-three proteins wer…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The MSMP (MicroSeminoProtein, Prostate-associated) protein is overexpressed in several cancers, including prostate, ovarian, and breast cancers. Its overexpression is particularly prevalent in tumors resistant to hormonal therapy, as well as to antiangiogenic treatments (e.g., anti-VEGF therapies). In hypoxic tumor microenvironments, characteristic of solid tumors, MSMP expression increases and facilitates tumor growth. MSMP binds to the transmembrane receptor CCR2 (C-C chemokine receptor type 2), a GPCR present on monocytes and lymphocytes. This interaction stabilizes an active conformation o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis C virus, Nonstructural 3 helicase (NS3h) protein is a well-studied segment of Non-structural 3/4 A helicase-protease protein that is crucial for the RNA duplex unwinding and RNA translocation during the process of HCV replication. Similar to other HCV nonstructural proteins, helicase is a potential target for antiviral drugs and several antiviral molecules have been used to target the RNA-binding cleft, despite the fact that none of those helicase antivirals have advanced the clinical trials. Compound 2t9 (5-bromo-1H-indol-3-yl acetic acid) has been identified through the integrated
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Monocarboxylate transporter 8 (MCT8) facilitates cellular uptake and efflux of thyroid hormone (TH). Mutations in MCT8 result in severe intellectual and motor disability known as the Allan-Herndon-Dudley syndrome (AHDS). Previous studies have provided valuable insights into the putative mechanism of substrate binding in the inward-open conformation, required for TH efflux. The current study aims to delineate the mechanism of substrate binding in the outward-open conformation, required for TH uptake. Extensive chemical modification and site-directed mutagenesis studies were used to guide protei
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The pathogenic conversion of the cellular prion protein (PrPC) into the β-sheet-rich isoform PrPSc is the pivotal pathogenic event in prion disease, yet the molecular steps that govern this structural transition remain elusive. In this study, we introduce a new approach to monitor site-specific conformational transitions that occur during infectious prion formation. The method relies on genetically encoded substitution of a fluorescent, environmentally sensitive noncanonical amino acid, l-(7-hydroxycoumarin-4-yl)ethylglycine (7-HCAA), into recombinant PrP substrate molecules, allowing real-tim
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Structural information about the interactions between membrane proteins and their ligands provides insights into the membrane protein functions. A variety of surfactants have been used for structural analyses of membrane proteins, and in some cases, they yielded successful results. However, the use of surfactants frequently increases the conformational instability of membrane proteins and distorts their normal function. Here, we propose a new strategy of membrane protein reconstitution into lipid bilayers on affinity beads, which maintains the native conformation and function of the protein fo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Increasing numbers of inherited diseases are found to result from mutations that lead to misfolded proteins. In many cases, the changes in conformation are relatively modest and the function of the protein would not be predicted to be affected. Yet, these proteins are recognized as "misfolded" and degraded prematurely. Recently, small molecules known as chemical and pharmacological chaperones were found to stabilize such mutant proteins and facilitate their trafficking to their site of action. Here, we review the recent published evidence suggesting that pharmacological chaperones represent pr
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Direction switching in the flagellar motor of Escherichia coli is under the control of a complex on the rotor formed from the proteins FliG, FliM, and FliN. FliG lies at the top of the switch complex (i.e., nearest the membrane) and is arranged with its C-terminal domain (FliGC) resting on the middle domain (FliGM) of the neighboring subunit. This organization requires the protein to adopt an open conformation that exposes the surfaces engaging in intersubunit FliGC/FliGM contacts. In a recent study, Baker and coworkers [13] obtained evidence that FliG in the cytosol is monomeric and takes on
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prion diseases are transmissible neurodegenerative conditions that include Creutzfeldt-Jakob disease (CJD) in humans and bovine spongiform e … agent, but recent studies suggest that strain specific phenotypes can be encoded by different prion protein conformations and glycosylation patterns. It is an intriguing proposition that the post-translational modifications alone, or in combination with amino acid changes, play dominant roles in the pathogenic transformation of PrP(c) to PrP(sc). Prion diseases are un …
Аннотация на английскомСтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein tyrosine phosphatases (PTPs) play pivotal roles in myriad cellular processes by counteracting protein tyrosine kinases. Striatal-enriched protein tyrosine phosphatase (STEP, PTPN5) regulates synaptic function and neuronal plasticity in the brain and is a therapeutic target for several neurological disorders. Here, we present three new crystal structures of STEP, each with unexpected features. These include high-resolution conformational heterogeneity at multiple sites, a highly coordinated citrate molecule in the active site, a previously unseen conformational change at an allosteric s
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ApoA-I, the major protein of plasma high-density lipoprotein, removes cellular cholesterol and protects against atherosclerosis. ApoA-I muta … er amyloidosis (G26R, W50R, F71Y, and L170P) or aberrant lipid metabolism (L159R). Global and local protein conformation and dynamics in solution were assessed by circular dichroism, fluorescence, and hydrogen-deuterium exchange mass spectrometry. All mutants showed increased deuteration in residues 14-22, supporting our hypothesis that decreased protection of this ma …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Herpes simplex virus (HSV) is an important human pathogen with a high worldwide seroprevalence. HSV enters epithelial cells, the primary site of infection, by a low-pH pathway. HSV glycoprotein B (gB) undergoes low pH-induced conformational changes, which are thought to drive membrane fusion. When neutralized back to physiological pH, these changes become reversible. Here, HSV-infected cells were subjected to short pulses of radiolabeling, followed by immunoprecipitation with a panel of gB monoclonal antibodies (MAbs), demonstrating that gB folds and oligomerizes rapidly and cotranslationally
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The regulation of conformational stability in multidomain proteins (MDP) is a central challenge in protein engineering with major implications for antigen optimization, enzyme activity modulation, and signal transduction. The function of these proteins depends on the properties of their constituent domains as well as on interdomain orientation and interface rearrangement during conformational transitions. Previous studies show that conformational transition is largely governed by changes in a small number of key residue pairs. However, such dynamic inter-residue contacts are typically sparse,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
5-fluorouracil (5-FU) is an anticancer drug, which inhibits human thymidine phosphorylase (hTP) and plays a key role in maintaining the process of DNA replication and repair. It is involved in regulating pyrimidine nucleotide production, by which it inhibits the mechanism of cell proliferation and cancerous tumor growth. However, up to 80% of the administered drug is metabolized by dihydropyrimidine dehydrogenase (DPD). This work compares binding of 5-FU and its analogues to hTP and DPD, and suggests strategies to reduce drug binding to DPD to decrease the required dose of 5-FU. An important f
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prion strains in infected animals may exist as heterogeneous populations composed of a major prion conformer responsible for the dominant disease phenotype and minor conformers that are phenotypically silent or difficult to detect. However, the presence and biological significance of such minor conformers in natural prion isolates remain poorly understood. Identifying and characterizing these hidden substrains is important for understanding prion strain diversity and for assessing potential transmission risks to humans and livestock. In this study, we utilized a modified protein misfolding cyc
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования