Copper nitrite reductases catalyse the reduction of nitrite to nitric oxide in the periplasm of Gram-negative bacteria as the second step of the denitrification pathway. Although these enzymes have been extensively studied, limited data are available regarding their thermal stability. The thermal unfolding mechanism of the copper nitrite reductase from the pathogenic bacterium Neisseria gonorrhoeae and the contribution of its copper centres to thermostability were investigated using differential scanning calorimetry and spectroscopic techniques. The results show that enzyme unfolding is irreve
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In general, small proteins rapidly fold on the timescale of milliseconds or less. For proteins with a substantial volume difference between the folded and unfolded states, their thermodynamic equilibrium can be altered by varying the hydrostatic pressure. Using a pressure-sensitized mutant of ubiquitin, we demonstrate that rapidly switching the pressure within an NMR sample cell enables study of the unfolded protein under native conditions and, vice versa, study of the native protein under denaturing conditions. This approach makes it possible to record 2D and 3D NMR spectra of the unfolded pr
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hidden protein states with partially unfolded regions can have a functional relevance and may also contribute to an uncontrolled self-association of proteins leading to pathological conditions. Human ileal bile acid-binding protein (hI-BABP), a member of the family of intracellular lipid-binding proteins (iLBPs), plays a key role in the transcellular trafficking and metabolic targeting of bile salts. Disorder-order transitions and sparsely populated hidden states in hI-BABP are thought to be key elements of ligand recognition, with implications for bile salt recycling and bile salt-mediated si
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: The stability of protein interfaces influences protein dynamics and unfolding cooperativity. Although in some cases the dynamics of proteins can be deduced from their topology, much of the stability of an interface is related to the complementarity of the interacting parts. It is also important to note that proteins that display non-cooperative unfolding cannot be rationally stabilized unless the regions that unfold first are known. Being able to identify protein interfaces that are significantly less stable would contribute to our understanding of protein dynamics and be very valu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protective antigen (PA) is an 83kDa protein which, although essential for toxicity of Bacillus anthracis, is harmless and an effective vaccine component. In vivo it undergoes receptor binding, proteolysis, heptamerisation and membrane insertion. Here we probe the response of PA to denaturants, temperature and pH. We present analyses (including barycentric mean) of the unfolding and refolding behavior of PA and reveal the origin of two critical steps in the denaturant unfolding pathway in which the first step is a calcium and pH dependent rearrangement of domain 1. Thermal unfolding fits a sing
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Folded protein hydrogels are emerging as promising new materials for medicine and healthcare applications. Folded globular proteins can be modelled as colloids which exhibit site specific cross-linking for controlled network formation. However, folded proteins have inherent mechanical stability and unfolded in response to an applied force. It is not yet understood how colloidal network theory maps onto folded protein hydrogels and whether it models the impact of protein unfolding on network properties. To address this, we study a hybrid system which contains folded proteins (patchy colloids) a…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Duchenne muscular dystrophy (DMD) is a lethal muscle disease caused by the absence of the protein dystrophin. Dystrophin is hypothesized to work as a molecular shock absorber that limits myofiber membrane damage when undergoing reversible unfolding upon muscle stretching and contraction. Here, we report the mechanical characterization of single full-length dystrophin (Dys) molecules using two operational modes of atomic force microscopy; constant speed and constant force as well as Monte Carlo simulations. Furthermore, we have compared Dys with large fragments encoding the N-terminus through s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present protocol describes how to measure experimentally the slow protein dynamics that take place upon the thermal unfolding of the B subunit cholera toxin pentamers using broadband dielectric spectroscopy (BDS) in weakly hydrated and nanoconfined conditions. Transient unfolding intermediates, rarely identified otherwise, are revealed thanks to the B subunit's remarkable heat resistance up to 180°C and distinct molecular dynamics. The frequencies detected experimentally are consistent with the spatiotemporal scales of motions of molecular dynamics simulation. For complete details on the u
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Organic solvents are known to bring about dehydration of proteins, the molecular basis of which has remained uncharacterized. The dehydration effect in many cases leads to eventual unfolding of proteins through the macroscopic solvent effect. In some cases, the organic solvent molecules also bind to protein surfaces, thereby forcing local unfolding. The X-ray structure of hen egg-white lysozyme co-crystallized in the presence of alcohols with varying hydrophobicities has been studied. It was noticed that although the alcohols have very little effect on the conformation of the overall protein s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The protein transporter anthrax lethal toxin is composed of protective antigen (PA), a transmembrane translocase, and lethal factor (LF), a … ding and translocation. This structure provides insight into the mechanism of translocation-coupled protein unfolding.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lipoprotein lipase (LPL) carries out the lipolytic processing of triglyceride-rich lipoproteins (TRL) along the luminal surface of capillaries. LPL activity is regulated by the angiopoietin-like proteins (ANGPTL3, ANGPTL4, ANGPTL8), which control the delivery of TRL-derived lipid nutrients to tissues in a temporal and spatial fashion. This regulation of LPL mediates the partitioning of lipid delivery to adipose tissue and striated muscle according to nutritional status. A complex between ANGPTL3 and ANGPTL8 (ANGPTL3/8) inhibits LPL activity in oxidative tissues, but its mode of action has rema
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this present work, we report the effects of different concentrations of various cholinium-based ionic liquids (ILs) on the structural and … ding (ΔuG), enthalpy of unfolding (ΔuH), heat capacity change (ΔCp) and total entropy change during protein unfolding (ΔuS). Molecular docking studies of β-LG and various choline-based ILs are also performed to know the probable binding conformations using AutoDock Vina and AutoDock tools 1.5.6, results obtained are in correlation with spectroscopic and biothermody …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anthrax lethal toxin is used as a model system to study protein translocation. The toxin is composed of a translocase channel, called protective antigen (PA), and an enzyme, called lethal factor (LF). A proton gradient (ΔpH) can drive LF unfolding and translocation through PA channels; however, the mechanism of ΔpH-mediated force generation, substrate unfolding, and establishment of directionality are poorly understood. One recent hypothesis suggests that the ΔpH may act through changes in the protonation state of residues in the substrate. Here we report the charge requirements of LF's amino-
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vaccines against poliomyelitis and influenza contain inactivated forms of poliovirus and influenza virus. These antigens are generated on an … H 1.5-2.5, poliovirus of type I unfolds in a single unfolding event with respective Tm (midpoint of protein unfolding transition) values between 34 and 45 degrees C. At pH 2, polioviruses of type II unfold equally in a single event, but, compared with the type I virus, with a Tm value increased by 3.7 degrees C. At neutral pH, the DSC thermogram of type I polioviru …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Crowding environment has a significant impact on the folding and stability of protein in biological systems. In this work, we have used four different sizes of a molecular crowder, polyethylene glycol (PEG), to analyze the unfolding and refolding kinetics of an iLBP protein, CRABP I, using urea as chemical denaturant. In general, the stability of the native state of the protein is boosted by the presence of crowding agents in the solution. However, our findings show that not only the type of crowder but also the crowder size played a key role in the effects of excluded volume. In case of lower
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hyaluronate lyases are a class of endoglycosaminidase enzymes, which are of considerable complexity and heterogeneity. Their primary function is to degrade hyaluronan and certain other glycosaminoglycans and facilitate the spread of disease. Among hyaluronate lyases, the bacteriophage-associated enzymes are unique as they have the lowest molecular mass, very low amino acid sequence homology with bacterial hyaluronate lyases, and exhibit absolute specificity for one type of glycosaminoglycan, i.e. hyaluronan. Despite such unique characteristics significant details on structural features of thes
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein disulfide isomerase (PDI) is a redox-dependent protein with oxidoreductase and chaperone activities. It is a U-shaped protein with an abb'xa' structural organization in which the a and a' domains have CGHC active sites, the b and b' domains are involved with substrate binding, and x is a flexible linker. PDI exhibits substantial flexibility and undergoes cycles of unfolding and refolding in its interaction with cholera toxin, suggesting PDI can regain a folded, functional conformation after exposure to stress conditions. To determine whether this unfolding-refolding cycle is a substrat
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein-surfactant interactions are substantial to industrial and cosmetic compilations. In this regard, we have studied the interaction of cleavable gemini surfactant (C16-C4O2-C16) with the myoglobin (Mb), utilizing physicochemical and spectroscopic approach. The results obtained were quite intriguing. Tensiometry has shown that pure C16-C4O2-C16 bear lower surface tension (γ) and CMC values than mixed systems (C16-C4O2-C16 + Mb). Intrinsic fluorescence results showed enhancement in the fluorescence intensity upon cleavable gemini binding. UV results depict visible fluctuations in the peaks
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sporadic fatal insomnia (sFI) is a rapid progressive neurodegenerative disease characterised by gradual to perpetual insomnia, followed by dysautonomia, coma and death. 1 The cause of sFI was recently mapped to a mutation in a protein, the prion, found in the human brain. It is the unfolding of the prion that leads to the generation of toxic oligomers that destroy brain tissue and function. Recent studies have confirmed that a methionine mutation at codon 129 of the human Prion is characteristic of sFI. Current treatment slows down the progression of the disease, but no cure has be
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peroxisomal matrix proteins are nuclear encoded and synthesized in the cytosol. It is well established that folded, cofactor-containing, and even oligomeric matrix proteins can pass the peroxisomal membrane. Here, we studied whether relatively long unfolded proteins can be imported into peroxisomes using the yeast Hansenula polymorpha as a model organism. First, we designed fusion proteins containing parts of the intrinsically disordered N-terminal region of 630 residues of Saccharomyces cerevisiae nucleoporin 1 (Nsp1). These included fusion proteins containing the first N-terminal 301 or 601
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования