BACKGROUND: Non-invasive prenatal testing (NIPT) by massively parallel sequencing is a useful clinical test for the detection of common fetal aneuploidies. While the accuracy of aneuploidy detection can approach 100%, results discordant with the fetus are occasionally reported. In this study we investigated the basis of a discordant T21 positive and T18 negative NIPT result associated with a T18 fetus confirmed by karyotyping.
METHODS: Massively parallel sequencing was used to detect fetal DNA in maternal circulating plasma. The parental origin and nature of the fetal and placental aneuploidi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Androgenetic-biparental mosaicism (ABM) denotes an embryo in which a subset of cells contains a diploid chromosomal complement derived entirely from the father. Such embryos have a high incidence of placental mesenchymal dysplasia (PMD) and paternal imprinting disorders because the androgenetic cells have pangenomic paternal uniparental disomy. Uniparental disomy also poses a theoretical risk for paternally transmitted autosomal recessive disorders, if both chromosomes of each autosomal pair are identical (isodisomy). We present the 1st example of a recessive disorder, renal-hepatic-pancreatic
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Congenital adrenal hyperplasia (CAH) due to 21-hydroxylase deficiency is an autosomal recessive disorder and is the most common cause of ambiguous genitalia in the newborn. The genes encoding 21-hydroxylase, CYP21A2, and tenascin-X (TNX), TNXB, are located within the HLA complex, in a region of high gene density termed the RCCX module. The module has multiple pseudogenes as well as tandem repeat sequences that promote misalignment during meiosis leading to complex gene rearrangements, deletions and gene conversion events. CYP21A2 mutations cause CAH, and TNX deficiency has been identified as a…
Клинический случайСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Species identification of cell lines and detection of cross-contamination are crucial for scientific research accuracy and reproducibility. Whereas short tandem repeat profiling offers a solution for a limited number of species, primarily human and mouse, the standard method for species identification of cell lines is enzyme polymorphism. Isoezymology, however, has its own drawbacks; it is cumbersome and the data interpretation is often difficult. Furthermore, the detection sensitivity for cross-contamination is low; it requires large amounts of the contaminant present and cross-contamination
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To analyze fibrillin-1 (FBN(1)) gene mutation in Chinese patients with Marfan syndrome(MFS) and to make a gene diagnosis by haplotype analysis for MFS.
METHODS: Nine MFS families were analysed with single strand conformation polymorphism(SSCP) and DNA sequencing. With the use of four primers designed in the flanking sequences of each short-sequence tandem-repeat region in FBN(1) gene, the haplotype-segregation analysis for MFS(B) was performed.
RESULTS: In MFS(A)II(1), PCR-SSCP detected SSCP band alterations in exon 25 of FBN(1) gene; direct sequencing showed a small 13bp deletion
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Despite decades of research, the agent responsible for transmitting spongiform encephalopathies (TSEs) has not been identified. The Prion hypothesis, which dominates the field, supposes that modified host PrP protein, termed PrPSc, acts as the transmissible agent. This model fits the observation that TSE diseases elicit almost no immune reaction. Prion transmission has not been verified, however, as it has not been possible to produce pure PrPSc aggregates. One long-standing objection to the Prion model is the observation that TSE disease agents show classical genetic behaviours, s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prader-Willi syndrome (PWS) is a complex neurogenetic disorder. The phenotype is likely to be a contiguous gene syndrome involving genes which are paternally expressed only, located in the human 15q11-q13 region. Four mouse models of PWS have been reported but these do not definitively allow the delineation of the critical region and the associated genes involved in the aetiology of PWS. Moreover, targeted mutagenesis of mouse homologues of the human candidate PWS genes does not appear to result in any of the features of PWS. Therefore, the isolation of new genes in this region remains crucial
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rhododendron simsii var. putuoense is a coastal-endemic plant with significant ecological and genetic resource value. Although its chloroplast genome (cpDNA) was recently characterized, its mitochondrial genome (mtDNA) remains unexplored. Here, we report the first complete assembly and annotation of the R. simsii var. putuoense mtDNA using PacBio HiFi long-read sequencing. The genome sequence is 658,161 bp in length, organized as two subgenomic linear molecules (a major one of 633,105 bp and a minor one of 25,056 bp), and encodes 33 protein-coding genes (PCGs), 26 tRNAs, three rRNAs and 323 OR
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus pyogenes is a strict human pathogen responsible for more than 700 million infections annually worldwide. Strains of serotype M28 S. pyogenes are typically among the five more abundant types causing invasive infections and pharyngitis in adults and children. Type M28 strains also have an unusual propensity to cause puerperal sepsis and neonatal disease. We recently discovered that a one-nucleotide indel in an intergenic homopolymeric tract located between genes Spy1336/R28 and Spy1337 altered virulence in a mouse model of infection. In the present study, we analyzed size variation
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Mucopolysaccharidosis II (MPS II, OMIM 309900) is a lysosomal disorder recommended for newborn screening (NBS) in the United States. This study evaluated outcomes of high-throughput NBS for MPS II and use of 2 reflex testing methods to improve sensitivity and specificity.
METHODS: We implemented a first-tier liquid chromatography tandem mass spectrometry laboratory-developed test measuring iduronate-2-sulfatase (I2S) enzyme activity in dried blood spots. Newborns with activity ≤10% of the daily median underwent reflex testing for endogenous nonreducing end (NRE) glycosaminoglycan (GA
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have recently isolated a 2.2-kb cDNA clone (1C5) from a human spinal cord cDNA library with partial identity to the 14-3-3 protein mRNA encoding the theta protein (YWHAQ). 14-3-3 protein transcripts are highly expressed in large projection neurones of the hippocampus, cerebellum, and spinal cord and have been found to be significantly up-regulated in rat motor neurones following hypoglossal nerve axotomy. In this study we investigated whether the 1C5 transcript (YWHAQ) isolated from spinal cord was involved in amyotrophic lateral sclerosis (ALS). We found a significant up-regulation of 1C5
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
KEY POINTS: MUC1 is associated with autosomal dominant tubulointerstitial kidney disease, a genetic disorder progressing to kidney failure. Variations in this gene are not easily diagnosed by conventional methods due to the MUC1 architecture, which contains a variable number of tandem repeats. Using dedicated bioinformatics tools, we systematically detected the presence of 27dupC most common MUC1 pathogenic variant from exome sequencing data.
BACKGROUND: The MUC1 gene is associated with autosomal dominant tubulointerstitial kidney disease (ADTKD), leading to CKD. Current methods of sequencing
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Idiopathic short stature (ISS) refers to non-syndromic growth failure without chronic disorders. The molecular basis of ISS remains largely unknown. Although a variable number of tandem repeats (VNTR) of 57 nucleotides in ACAN is known to correlate with the height of people in the general population, the role of this genetic variant in the etiology of ISS has not been studied.
METHODS: We studied 128 Japanese patients with ISS, including 63 patients with prenatal and postnatal growth failure (small-for-gestational age-SS [SGA-SS]), and 100 control individuals. To examine the rep
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations identified in the hypoxanthine phosphoribosyltransferase (HPRT) gene of patients with Lesch-Nyhan (LN) syndrome are dominated by simple base substitutions. Few hotspot positions have been identified, and only three large genomic rearrangements have been characterized at the molecular level. We have identified one novel mutation, two tentative hot spot mutations, and two deletions by direct sequencing of HPRT cDNA or genomic DNA from fibroblasts or T-lymphocytes from LN patients in five unrelated families. One is a missense mutation caused by a 610C-->T transition of the first base of
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Global medical associations (ACOG, ISUOG, ACMG) recommend diagnostic prenatal testing for the detection and prevention of genetic disorders. Historically, cytogenetic methods such as karyotype analysis, fluorescent in situ hybridization (FISH) and chromosomal microarray (CMA) are utilized worldwide to diagnose common syndromes. However, the limitations of each of these methods, either performed in tandem or simultaneously, demonstrates the need of a revolutionary technology that can alleviate the need for multiple technologies. Optical genome mapping (OGM) is a novel method that fills this voi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer-associated defects in mucin-type O-glycosylation expose truncated glycans on cell-surface glycoproteins and create tumor-associated glycopeptide epitopes. However, the structural principles by which antibodies recognize specific MUC1 glycopeptide sequences remain incompletely defined. Here, we report the molecular basis of MUC1 recognition by 16A, a high-affinity antibody isolated against hypoglycosylated MUC1. Co-crystal structures of 16A Fab bound to site-selectively glycosylated MUC1 peptides revealed that 16A recognizes an STAPPAHG-centered epitope within the MUC1 variable number ta
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Somatic structural variations (somatic SVs) are hallmarks of tumors, but their comprehensive detection remains technically challenging. Long-read sequencing (LRS) technology, which generates reads spanning large-scale SVs and their flanking sequences, enables a wide range of prospects for somatic SV detection. However, existing LRS-based somatic SV detection algorithms and pipelines exhibit variable performance that has not been systematically characterized. In this study, we conducted a rigorous evaluation of 51 LRS-based somatic SV detection strategies, integrating 3 reference genomes, 2 ali
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Opium poppy, a member of the Papaveraceae family, is an ancient herbaceous plant and well-known medical resource in the pharmaceutical industry. However, opium poppies are grown worldwide for producing illicit drugs, significantly increasing the incidence of narcotic drug abuse. Since the narcotic poppy has not yet been genetically investigated, we characterized a novel variable number tandem repeat (VNTR) marker of forensically important poppy species based on the genetic analysis of 164 samples collected from two locations spanning the Jeolla province and Jeju island of South Korea. Comparin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: An internal tandem duplication in the gene encoding Fms-like tyrosine kinase 3 (FLT3-ITD) is associated with high relapse risk and poor prognosis in acute myeloid leukemia (AML) and plays a crucial role in treatment decisions. Measurable residual disease (MRD) analysis of FLT3-ITD during and after treatment has shown prognostic value in adults, but its clinical value in children remains unexplored.
PROCEDURE: This study evaluated the potential of MRD analysis with deep sequencing (ultrahigh-sensitivity next-generation sequencing; UHS-NGS) of FLT3-ITD to assess treatment response a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Abnormally O-glycosylated MUC1 tandem repeat glycopeptide epitopes expressed by multiple types of cancer have long been attractive targets for therapy in the race against genetic mutations of tumor cells. Glycopeptide signature-guided therapy might be a more promising avenue than mutation signature-guided therapy. Three O-glycosylated peptide motifs, PDTR, GSTA, and GVTS, exist in a tandem repeat HGVTSAPDTRPAPGSTAPPA, containing five O-glycosylation sites. The exact peptide and sugar residues involved in antibody binding are poorly defined. Co-crystal structures of glycopeptides and respective
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования