In celiac disease (CeD), gluten activates adaptive immune cells that cause damage to the small intestinal mucosa. Histological evaluation of … ents, proteome analysis of total tissue or isolated epithelial cell compartment from formalin-fixed paraffin embedded biopsies collected before and after 14-day gluten challenge demonstrates that patients with strong mucosal response to challenge have signs of ongoing tissue inflammation already before challenge. This low-level tissue inflammation at basel …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The hepatopulmonary syndrome (HPS) is defined by the presence of pulmonary gas exchange abnormalities due to intrapulmonary vascular dilatations in patients with chronic liver disease. Changes in DNA methylation reflect the genomic variation. Since liver transplant (LT) reverts HPS we hypothesized that it may be associated with specific liver epigenetic changes. Thus, the aim of this study was to investigate the role of the liver epigenome in patients with HPS. We extracted DNA from paraffin embedded liver tissue samples from 10 patients with HPS and 10 age-, sex- and MELD (Model for End-stage…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Capillary deposition of C4d is an important marker of antibody-mediated rejection (AMR) following heart transplantation (HT). There are two immunopathologic assay methods for detecting C4d: frozen-tissue immunofluorescence (IF) and paraffin immunohistochemistry (IHC). The clinical significance of discrepancy between the results of IF and IHC has not been understood.
METHODS AND RESULTS: We reviewed 2187 biopsies from 142 HT recipients who had biopsies with assessment of both IF and IHC staining. Among them, 103 (73%) patients had negative IF and IHC C4d staining (Negative Group) a…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Filaggrin is a protein integral to the structure and function of the epidermis. Filaggrin (FLG) loss-of-function (LOF) mutations are common and increase the risk of developing atopic dermatitis (AD) and ichthyosis vulgaris (IV). Epidemiologic data suggest a link between skin cancer and AD. We examined if FLG staining pattern can be used to characterize cutaneous squamous cell carcinomas (SCC), basal cell carcinomas (BCC), and reactive squamous epithelium.
METHODS: Tissue microarrays (TMAs) were created from 196 cases of formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) SCC and 144 BCC cases…
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Human papillomavirus (HPV) gained momentum as a potential etiological factor for many types of cancers. Therefore, the aim of this study was to assess the prevalence of HPV-16 infection among Sudanese patients diagnosed with Squamous Cell Carcinoma (SCC) and Salivary Gland Carcinoma. A descriptive, hospital-based study was conducted. 150 formalin-fixed paraffin-embedded blocks were collected.
RESULTS: The study population included a total of 150 patients aged between 18 to 87 years with a mean age of 48.8 ± 11.9 years. Based on gender, females constituted 46.7% while males constitu…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytomegalovirus (CMV) reactivation in the colon is common in patients with severe ulcerative colitis (UC). Ganciclovir (GCV) resistance conferring CMV UL97 gene mutations have been reported in recent years. However, the prevalence of UL97 gene mutations in GCV-naive CMV infection in the colon remains unknown. We investigated the prevalence of CMV UL97 gene mutations in patients with colonic CMV infection associated with or without UC. Twenty-two GCV-naive patients with colonic CMV infection, 15 with UC and 7 with other diseases, were enrolled. Frozen biopsy samples or formalin-fixed paraffin-e…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Oestrogen receptor (ER) expression is a prognostic biomarker in endometrial cancer (EC). However, expression does not provide in … RNA levels from Affymetrix microarray data (public datasets), or measured by qPCR on formalin-fixed paraffin-embedded samples (clinical cohort) and related to ER expression and outcome.
RESULTS: ER pathway activity scores differed significantly throughout the menstrual cycle supporting the validity of the pathway test. The highest ER pathway scores were f …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: We conducted this study to assess the effect of VDR and CRBP-1 immunohistochemical expression on the endometrium and to explore their role in endometrial cancer carcinogenesis.
METHODS: This study comprised two hundred paraffin-embedded endometrial tissue samples diagnosed as 42 and 63 proliferative and secretory endometrium respectively, 45 endometrial hyperplasias with atypia and 50 endometrial carcinomas (25 low-grade and 25 high-grade endometrial carcinomas). The immunohistochemical method was done to determine the expression of VDR and CRBP-1.
RESULTS: VDR was strongly expre…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, feed naturally containing Fusarium mycotoxins was fed to gilts during the perinatal period, and the effects on the thymus wer … o medulla ratio of the thymus was morphometrically analysed using NIS Elements BR (Nikon) software. Paraffin-embedded thymus sections were stained to quantify apoptosis (with terminal deoxynucleotidyl transferase-mediated dUTP nick-end labelling - TUNEL method), cellular proliferation (Ki-67) and macrophages (MAC 387). The results showed that the thymus co …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Tumor-associated macrophages (TAM) are pivotal in remodeling of the tumor immune microenvironment and clinical outcome. Herein, we aim to evaluate the impact of immunohistochemical (IHC) expression of CD68 and CD163 in TAM on clinico-pathological features, patients' response to therapy and the overall survival (OS).
RESULTS: This retrospective study was performed on paraffin-embedded tissue blocks of 100 classic Hodgkin Lymphoma (cHL) cases diagnosed and treated at our Institution. Immunohistochemical scores of CD68 and CD163 were statistically related to bulky disease (p value = …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Current staging systems for cutaneous squamous cell carcinoma (cSCC) have limited positive predictive value for identifying patients who will experience metastasis.
OBJECTIVE: To develop and validate a gene expression profile (GEP) test for predicting risk for metastasis in localized, high-risk cSCC with the goal of improving risk-directed patient management.
METHODS: Archival formalin-fixed paraffin-embedded primary cSCC tissue and clinicopathologic data (n = 586) were collected from 23 independent centers in a prospectively designed study. A GEP signature was developed using a …
СтатьяМногоцентровое исследованиеВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the present study, we aimed to address the use of ethyl pyruvate (EP) against the harmful effects of cyclophosphamide (CP) treatment. Thirty-nine adult male mice were divided into three groups including control group received normal saline [0.20 mL per day; intraperitoneally (IP)], CP group received CP (15.00 mg kg-1 per week, IP) and CP+EP group received EP (40.00 mg kg-1 per day, IP) along with CP and treated for 35 days. After preparation of paraffin sections and Hematoxylin and Eosin staining, the histomorphometric studies were performed on the testicular tissue. Additionally, the serum…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human Echinococcosisis a cyclo-zoonotic infection caused by tapeworms of the Echinococcus granulosus sensu stricto complex. The detection of mitochondrial genome data of genus Echinococcus can reflect the taxonomic status, genetic diversity, and population structure genetics.
METHODS: Totally, 52 formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue samples from patients with histologically confirmed CE were collected from Mazandaran province, Iran in the period of Mar 1995 to May 2018. All extracted DNAs from (FFPE) tissue samples were subjected to amplify by polymerase chain reactions …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer (CRC) tumors can be partitioned into four biologically distinct consensus molecular subtypes (CMS1-4) using gene expressio … s also implemented with targeted RNA-sequencing (Illumina AmpliSeq). In a series of formalin-fixed, paraffin-embedded CRC samples (n = 49), ColoType by targeted RNA-sequencing agreed with subtypes predicted by two independent methods with accuracies 0.92, 0.82, respectively. With further validation, ColoType by targeted RNA-sequencing, may enable clinical …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gold nanoparticles (AuNPs) are commonly used in biosensors of various kinds. However, its application to extract DNA from cancer tissues has not been extensively studied. The purification of DNA from cancer tissues is an important step in diagnostic and therapeutic development. Almost, all cervical cancer cases are associated with high-risk human papillomavirus (HR-HPV) infection. Accurate viral diagnosis has so far relied on the extraction of adequate amounts of DNA from formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissue samples. Till now, no specific and sensitive DNA purification method has be…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The practical application of genome-scale technologies to precision oncology research requires flexible tissue processing strategies that can be used to differentially select both tumour and normal cell populations from formalin-fixed, paraffin-embedded tissues. As tumour sequencing scales towards clinical implementation, practical difficulties in scheduling and obtaining fresh tissue biopsies at scale, including blood samples as surrogates for matched 'normal' DNA, have focused attention on the use of formalin-preserved clinical samples collected routinely for diagnostic purposes. In practice…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stage pT1 bladder cancer (BC) shows highly diverse outcomes. Predictive markers are required to stratify patients for personalized treatment. The present study aimed to validate immune response quantification as a prognostic marker. Patients with pT1 BC (n = 167) treated by transurethral resection of the bladder (TURB) were enrolled. Formaldehyde-fixed paraffin-embedded material was stained for CD3 and CD8. Corresponding T cells were counted in three regions with the highest immune response. Numbers of tertiary lymphoid structures (TLS) and lymphocyte aggregates (LA) were quantified. High CD3+…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Epidermolytic acanthoma (EA) is a rare acquired lesion demonstrating a characteristic histopathological pattern of epidermal deg … o identify the contributions of keratin mutations to EA.
METHODS: Using genomic DNA extracted from paraffin-embedded samples from departmental archives, we evaluated a discovery cohort using whole-exome sequencing (WES) and assessed remaining samples using Sanger sequencing screening and restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis.
RESULTS: …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Journal of oral pathology & medicine : official publication of the International Association of Oral Pathologists and the American Academy of Oral Pathology2020eng
BACKGROUND: Odontogenic keratocyst (OKC) is a unique developmental odontogenic cyst that has the potential to behave aggressively and is ass … thogenesis of sporadic OKC, syndromic OKC and OOC by immunohistochemistry.
METHODS: Formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue blocks of 15 diagnosed cases each of sporadic OKC, syndromic OKC and OOC were retrieved from the archives of Department of Oral Pathology and subjected to immunohistochemical staining for the detection of BRAFV600E mutation us …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Matrix-assisted laser desorption/ionisation mass spectrometry imaging (MALDI-MSI) has been successfully used to elucidate the relative abundance and spatial mapping of analytes in situ. Currently, sample preparation workflows for soft formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues, such as brain, liver, kidney, and heart, have been successfully developed. However, hard tissues, such as cartilage-bone, tooth, and whole mouse body, have resulted in the loss of morphology or tissue during the heat-induced epitope retrieval (HIER) step on commercially available conductive indium tin oxide (ITO) s…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования