In the future, zoonotic spillover events are expected to occur more frequently. Consequences of such events have clearly been demonstrated by recent outbreaks of monkeypox, Ebola virus, and the well-known severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Virus discovery has proven to be an important tool in the preparation against viral outbreaks, generating data concerning the diversity, quantity, and ecology of the vertebrate virome. Orthoparamyxoviruses, a subfamily within the Paramyxoviridae, are important biosurveillance targets, since they include several known animal, human,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the determination of the whole genome sequence of varicella-zoster virus (VZV) virus, the successful breakthrough of infectious cloning technology of VZV, and the emergence of effective preventive vaccines, which have been proven to be effective and safe, varicella has become a disease preventable by specific immunity. This article will review the genomic structure, epidemiological characteristics, and research application progress of varicella vaccine and herpes zoster vaccine of varicella zoster virus to provide reference for primary prevention of the disease.
ОбзорАннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rift Valley fever (RVF) is a mosquito-borne zoonotic disease causing acute hemorrhagic fever. Accurate identification of mutations and phylo … , we anticipate that the RVFV universal primer pairs and the developed method will aid in RVFV phylogenomics and mutation detection.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In recent years, the occurrence of fowl adenovirus 2 (FAdV-2) has been on the rise in China, posing a significant threat to the poultry industry. This study aimed to investigate the epidemiology, phylogenetic relationship, genomic characteristics, and pathogenicity of FAdV-2. The epidemiological analysis revealed the detection of multiple FAdV serotypes, including FAdV-1, FAdV-2, FAdV-3, FAdV-4, FAdV-8a, FAdV-8b, and FAdV-11 serotypes. Among them, FAdV-2 exhibited the highest proportion, accounting for 21.05% (8/38). The complete genomes of these 8 FAdV-2 strains were sequenced. Genetic evolut
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydia psittaci, a strictly intracellular bacterium, is an underestimated etiologic agent leading to infections in a broad range of animals and mild illness or pneumonia in humans. In this study, the metagenomes of bronchoalveolar lavage fluids from the patients with pneumonia were sequenced and highly abundant C. psittaci was found. The target-enriched metagenomic reads were recruited to reconstruct draft genomes with more than 99% completeness. Two C. psittaci strains from novel sequence types were detected and these were closely related to the animal-borne isolates derived from the linea
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Borrelia burgdorferi, a causative agent of Lyme disease, contains the most segmented bacterial genome known to date, with one linear chromosome and over twenty plasmids. How this unusually complex genome is organized, and whether and how the different replicons interact are unclear. We recently demonstrated that B. burgdorferi is polyploid and that the copies of the chromosome and plasmids are regularly spaced in each cell, which is critical for faithful segregation of the genome to daughter cells. Regular spacing of the chromosome is controlled by two separate partitioning systems that involv
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we investigated Bartonella infection and its genetic diversity in rodents in Beitun, Xinjiang Uygur Autonomous Region, China. Small mammals were captured using snap traps at four sampling sites in 2018. Spleen and liver tissues were collected and cultured to isolate Bartonella strains. Whole-genome sequencing was performed on the strains identified as Bartonella by gltA gene PCR, and the average nucleotide identity (ANI) of the genomes was calculated by using FastANI v1.33. Phylogenetic trees were constructed for the samples positive for Bartonella spp. by the gltA PCR assay bas
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Leprosy is caused by Mycobacterium leprae and Mycobacterium lepromatosis. Both organisms cannot be cultured in vitro. M. lepromatosis was found to be associated mainly with diffuse lepromatous leprosy and with Lucio's phenomena initially. Later, M. lepromatosis was observed in borderline leprosy cases (BL), lepromatous leprosy cases (LL) and leprosy reactional cases (T1R and ENL). Although many cases are being reported with similar clinical features like Lucio phenomenon in India but M. lepromatosis was not isolated from these cases. The aim of this study was to screen MB patients
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extinct lineages of Yersinia pestis, the causative agent of the plague, have been identified in several individuals from Eurasia between 5000 and 2500 years before present (BP). One of these, termed the 'LNBA lineage' (Late Neolithic and Bronze Age), has been suggested to have spread into Europe with human groups expanding from the Eurasian steppe. Here, we show that the LNBA plague was spread to Europe's northwestern periphery by sequencing three Yersinia pestis genomes from Britain, all dating to ~4000 cal BP. Two individuals were from an unusual mass burial context in Charterhouse Warren, S
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gut microbiota comprises the collective genomes of microbial symbionts and is composed of bacteria, fungi, viruses, and protists within the gastrointestinal tract of a host. Although the literature associated with gut microbiota is increasing, studies on eukaryotes in the human gut are just beginning to surface. Blastocystis is one of the most common intestinal parasites of humans and animals and is estimated to colonise more than 1 billion people on a global scale. However, the understanding of the genetic characteristics of Blastocystis subtype (ST) at the genome level and its relationsh
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Africa's Lake Tanganyika basin is a cholera hotspot. During 2001-2020, Vibrio cholerae O1 isolates obtained from the Democratic Republic of the Congo side of the lake belonged to 2 of the 5 clades of the AFR10 sublineage. One clade became predominant after acquiring a parC mutation that decreased susceptibility to ciprofloxacin.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Interstitial deletion in the long arm of chromosome 9 [del(9q)] is a fairly common cytogenetic finding associated with acute myeloid leukemia (AML), seen in approximately 2-5% of AML patients. However, the genomic features of the deletion remain largely unknown. Using chromosome analysis, single nucleotide polymorphism microarray, and next-generation sequencing, we characterized del(9q)s and other genomic alterations in 9 AML patients. We found several distinct features of the del(9q)s. The proximal breakpoints of the deletions are clustered within a 2.5-Mb region (chr9: 68,513,625-70,984,372;
НовостьПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deciphering genomic architecture is key to identifying novel disease drivers and understanding the mechanisms underlying myeloma initiation and progression. In this work, using the CoMMpass dataset, we show that structural variants (SV) occur in a nonrandom fashion throughout the genome with an increased frequency in the t(4;14), RB1, or TP53 mutated cases and reduced frequency in t(11;14) cases. By mapping sites of chromosomal rearrangements to topologically associated domains and identifying significantly upregulated genes by RNAseq we identify both predicted and novel putative driver genes.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alniaria alnifolia (Siebold and Zucc.) Rushforth, 2018 (alternative name: Sorbus alnifolia) belongs to the genus Alniaria of the family Rosaceae and is widely distributed in northern China, Korea, and Japan. It is an essential resource used in the construction, pharmaceuticals, and food industries. It is also used to treat various diseases, such as fever, hyperglycemia, rash, asthma, bronchitis, constipation, leprosy, anemia, and other skin ailments. In this study, we sequenced a sample of A. alnifolia and determined its complete chloroplast genome. The chloroplast genome of A. alnifolia has a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Malignant mesothelioma (MMe) is a rare malignancy originating from the linings of the pleural, peritoneal and pericardial cavities. The best-defined risk factor is exposure to carcinogenic mineral fibers (e.g., asbestos). Genomic studies have revealed that the most frequent genetic lesions in human MMe are mutations in tumor suppressor genes. Several genetically engineered mouse models have been generated by introducing the same genetic lesions found in human MMe. However, most of these models require specialized breeding facilities and long-term exposure of mice to asbestos for MMe developmen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/OBJECTIVES: The diagnostic distinction between atypical Spitz tumor (AST) and malignant melanoma (MM) in pediatric tumors is challenging. Molecular tests are increasingly used to characterize these neoplasms; however, limited studies are available in pediatric patients. This study aimed to provide a genomic comparison of pediatric MM and AST in the context of comprehensive clinical annotation.
METHODS: Pediatric patients diagnosed with MM (n=11) and AST (n=12) were compared to a cohort of 693 adult melanoma patients. DNA next-generation sequencing assessed kinase gene fusions, tumo
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The peritoneum is a common site of metastasis in advanced gastric cancer (GC). Diagnostic laparoscopy is now routinely performed as part of disease staging, leading to an earlier diagnosis of synchronous peritoneal metastasis (PM). The biology of GCPM is unique and aggressive, leading to a dismal prognosis. These tumors tend to be resistant to traditional systemic therapy, and yet, this remains the current standard-of-care recommended by most international clinical guidelines. As this is an area of unmet clinical need, several translational studies and clinical trials have focused on addressin
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Blood lipids are heritable modifiable causal factors for coronary artery disease. Despite well-described monogenic and polygenic bases of dyslipidemia, limitations remain in discovery of lipid-associated alleles using whole genome sequencing (WGS), partly due to limited sample sizes, ancestral diversity, and interpretation of clinical significance. Among 66,329 ancestrally diverse (56% non-European) participants, we associate 428M variants from deep-coverage WGS with lipid levels; ~400M variants were not assessed in prior lipids genetic analyses. We find multiple lipid-related genes strongly a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Haemophilus influenzae serotype a (Hia) can cause severe invasive disease, especially in young children. In 2018, 4 invasive Hia … ed in 1 subclade, within a larger clade containing 3 nonoutbreak invasive Hia isolates. Comparative genomics did not reveal any genetic mutations that distinguished carriage from invasive isolates. Three (20%) community isolates were rifampin resistant and had a previously unreported mutation in the rpoB gene.
CONCLUSIONS: In the outbreak community, Hia i …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This report describes the MalariaGEN Pv4 dataset, a new release of curated genome variation data on 1,895 samples of Plasmodium vivax collected at 88 worldwide locations between 2001 and 2017. It includes 1,370 new samples contributed by MalariaGEN and VivaxGEN partner studies in addition to previously published samples from these and other sources. We provide genotype calls at over 4.5 million variable positions including over 3 million single nucleotide polymorphisms (SNPs), as well as short indels and tandem duplications. This enlarged dataset highlights major compartments of parasite popul
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования