Ferroptosis is a non-apoptotic cell death mechanism characterized by the generation of lipid peroxides. While many effectors in the ferroptosis pathway have been mapped, its epitranscriptional regulation is not yet fully understood. Ferroptosis can be induced via system xCT inhibition (Class I) or GPX4 inhibition (Class II). Previous works have revealed important differences in cellular response to different ferroptosis inducers. Importantly, blocking mRNA transcription or translation appears to protect cells against Class I ferroptosis inducing agents but not Class II. In this work, we examin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hyperconserved genomic sequences have great promise for understanding core biological processes. It has been recently proposed that scores of hyperconserved 5' untranslated regions (UTRs), also known as transcript leaders (hTLs), encode internal ribosome entry sites (IRESes) that drive cap-independent translation, in part, via interactions with ribosome expansion segments. However, the direct functional significance of such interactions has not yet been definitively demonstrated. We provide evidence that the putative IRESes previously reported in Hox gene hTLs are rarely included in transcript
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Considerable evidence from mouse models and human postmortem brain suggests loss of Muscleblind-like protein 2 (MBNL2) function in brain is a major driver of CNS symptoms in Myotonic dystrophy type 1 (DM1). Increased hypersomnia, fatigue, and surgical complications associated with general anesthesia suggest possible sensitivity to GABAergic inhibition in DM1. To test the hypothesis that MBNL2 depletion leads to behavioral sensitivity to GABAA receptor (GABAA-R) modulation, Mbnl2 knock-out (KO) and wild-type (WT) littermates were treated with the anesthetic sevoflurane, the benzodiazepine diaze
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIB1Δ4 is an N-terminally truncated isoform of the oncogene amplified in breast cancer 1 (AIB1) with increased expression in high-grade human ductal carcinoma in situ (DCIS). However, the role of AIB1Δ4 in DCIS malignant progression has not been defined. Here we CRISPR-engineered RNA splice junctions to produce normal and early-stage DCIS breast epithelial cells that expressed only AIB1Δ4. These cells showed enhanced motility and invasion in 3D cell culture. In zebrafish, AIB1Δ4-expressing cells enabled invasion of parental cells when present in a mixed population. In mouse xenografts, a subpo
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Uveal melanoma (UM) is the most common primary intraocular malignancy in adults, and its metastases are known to be fatal. It is critical to identify molecular markers to be used in potential prognostic evaluation for early diagnosis, treatment, and metastasis or to investigate all aspects of known genetic anomalies. Therefore, this study aimed to analyze the eight genes (GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, SRSF2, EIF1AX, PLCB4, and CYSLTR2) that are associated with the most common genetic anomalies in UM from a molecular perspective. The genome sequences and expression profiles of 108 UM patients were
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathogenic variants in SLC26A4 have been associated with autosomal recessive hearing loss (arHL) and a unilateral or bilateral enlarged vestibular aqueduct (EVA). SLC26A4 is the second most frequently mutated gene in arHL. Despite the strong genotype-phenotype correlation, a significant part of cases remains genetically unresolved. In this study, we investigated a cohort of 28 Dutch index cases diagnosed with HL in combination with an EVA but without (M0) or with a single (M1) pathogenic variant in SLC26A4. To explore the missing heritability, we first determined the presence of the previously
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Introduction. Cervical cancer is caused by human papillomavirus (HPV), but some cases may test HPV-negative. We previously tested 2850 Swedish cases and found that 394/2850 (13.8 %) cases tested HPV DNA-negative by PCR. Sequencing is the most thorough method to assess HPV status.Aim. We wished to assess whether deep sequencing might detect HPV sequences among these HPV-negative cervical cancer specimens, and to increase the likelihood of detecting transcriptionally active infections.Methodology. Out of the 2850 cancer cases, we sequenced a random sample of 92 HPV PCR-negative cervical cancers
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long non-coding RNAs (lncRNAs) play critical roles in various biological functions and disease processes including cancer. The metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1 (MALAT1) was initially identified as a lncRNA with elevated expression in primary human non-small cell lung tumors with high propensity to metastasize, and subsequently shown to be highly expressed in numerous other human cancers including breast, ovarian, prostate, cervical, endometrial, gastric, pancreatic, sarcoma, colorectal, bladder, brain, multiple myeloma, and lymphoma. MALAT1 is deeply involved in several p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Current SARS-CoV-2 pandemy mortality created the hypothesis that some populations may be more susceptible to SARS-CoV-2. TMPRSS2 encodes a transmembrane serine protease which plays a crucial role in SARS-CoV-2 cell entry. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in TMPRSS2 might influence SARS-CoV2 entry into the cell. This study aimed to investigate the impact of SNPs on TMPRSS2 function and structure. In silico tools such as Ensembl, Gtex, ExPASY 2, GEPIA, CCLE, KEGG and GO were engaged to characterize TMPRSS2 and its expression profile. The functional effects of SNPs were analyzed by PolyPhen
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protective immunity against Mycobacterium tuberculosis is poorly understood. The role of interleukin (IL)-4, the archetypal T-helper type 2 (Th2) cytokine, in the immunopathogenesis of human tuberculosis remains unclear.Blood and/or bronchoalveolar lavage fluid (BAL) were obtained from participants with pulmonary tuberculosis (TB) (n=23) and presumed latent TB infection (LTBI) (n=22). Messenger RNA expression levels of interferon (IFN)-γ, IL-4 and its splice variant IL-4δ2 were determined by real-time PCR. The effect of human recombinant (hr)IL-4 on mycobacterial survival/containment (CFU·mL-1
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human general transcription factor TFIID is composed of the TATA-binding protein (TBP) and 13 TBP-associated factors (TAFs). In eukaryotic cells, TFIID is thought to nucleate RNA polymerase II (Pol II) preinitiation complex formation on all protein coding gene promoters and thus, be crucial for Pol II transcription. In a child with intellectual disability, mild microcephaly, corpus callosum agenesis and poor growth, we identified a homozygous splice-site mutation in TAF8 (NM_138572.2: c.781-1G > A). Our data indicate that the patient's mutation generates a frame shift and an unstable TAF8
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DIS3 (defective in sister chromatid joining) is the catalytic subunit of the exosome, a protein complex involved in the 3'-5' degradation of RNAs. DIS3 is a highly conserved exoribonuclease, also known as Rrp44. Global sequencing studies have identified DIS3 as being mutated in a range of cancers, with a considerable incidence in multiple myeloma. In this work, we have identified two protein-coding isoforms of DIS3. Both isoforms are functionally relevant and result from alternative splicing. They differ from each other in the size of their N-terminal PIN (PilT N-terminal) domain, which has be
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epilepsy is a common neurological disease, manifested in unprovoked recurrent seizures. Epileptogenesis may develop due to genetic or pharmacological origins or following injury, but it remains unclear how the unaffected brain escapes this susceptibility to seizures. Here, we report that dynamic changes in forebrain microRNA (miR)-211 in the mouse brain shift the threshold for spontaneous and pharmacologically induced seizures alongside changes in the cholinergic pathway genes, implicating this miR in the avoidance of seizures. We identified miR-211 as a putative attenuator of cholinergic-medi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bromodomain-containing protein 7 (BRD7) is a tumour suppressor that is known to regulate many pathological processes including cell growth, apoptosis and cell cycle. Endoplasmic reticulum (ER) stress-induced apoptosis plays a key role in diabetic cardiomyopathy (DCM). However, the molecular mechanism of hyperglycaemia-induced myocardial apoptosis is still unclear. We intended to determine the role of BRD7 in high glucose (HG)-induced apoptosis of cardiomyocytes. In vivo, we established a type 1 diabetic rat model by injecting a high-dose streptozotocin (STZ), and lentivirus-mediated short hair
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the case of a 10-year-old Spanish girl with mutations in NADK2 Prenatal central nervous system abnormalities showed ventriculomegaly, colpocephaly, and hypoplasia of the corpus callosum. At birth, axial hypotonia, uncoordinated movements, microcephaly, and generalized cerebellar atrophy were detected. Metabolic investigations revealed high lysine, lactate, and pipecolic acid levels in blood and cerebrospinal fluid. Pyruvate carboxylase and pyruvate dehydrogenase activity in fibroblasts were normal. Beginning at birth she received biotin, thiamine, and carnitine supplementation. A lys
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Mutations in the DUOX2 gene have been associated with transient or permanent congenital hypothyroidism due to a dyshormonogenic defect.
OBJECTIVE: This study aimed to verify the prevalence of DUOX2 mutations and the associated clinical features in children selected by criteria supporting a partial iodide organification defect (PIOD).
PATIENTS AND METHODS: Thirty children with PIOD-like criteria were enrolled and genotyped. A detailed clinical characterization was undertaken together with the functional analysis of the DUOX2 variations and the revision of the clinical and molecular d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hereditary spastic paraplegia (HSP) is often caused by mutations in the SPAST gene. The frequency of SPAST mutations causing HSP in Australian patients is currently unknown.
AIM: We aimed to determine the frequency of SPAST gene mutations in our cohort of HSP patients.
METHODS: We recruited 30 unrelated patients with HSP for clinical and genetic assessment. DNA or RNA was extracted from patients' samples to perform direct DNA sequencing of the SPAST gene, multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) and/or cDNA analysis.
RESULTS: We identified 13 heterozygous SPAST mu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To study the effects of oxygen fluctuations on rat vascular endothelial growth factor (VEGF), VEGF receptor 1(VEGFR1), and VEGFR2 in a model of retinopathy of prematurity (ROP).
METHODS: Retinas at several postnatal days (p) were analyzed for VEGF splice variants, VEGFR1 and VEGFR2 messenger RNAs (mRNAs) using real-time polymerase chain reaction or for VEGF protein using enzyme-linked immunosorbent assay.
RESULTS: Older developmental age was associated with VEGFR1 (P < .001), VEGF(120) (P < .001), and VEGF(188) (P = .03) mRNA overexpression. Expression of VEGFR2 and VEGF(164) mRNA
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cystinuria is an autosomal recessive disorder caused by defective transport of cystine and the dibasic amino acids ornithine, lysine and arginine across cell membranes. Poor solubility of cystine in urine leads to kidney stones and associated symptoms and complications. Mutations of genes SLC3A1 and SLC7A9 encoding for amino acid transport systems are responsible for different types of cystinuria. In this study we describe a new LC-MS/MS assay for these amino acids in urine. Moreover, we report a novel splice-acceptor site mutation in the SLC7A9 gene that we believe is the cause of the phenoty
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The tight junctions of the endothelial and epithelial regions of the blood-brain barrier are regulated by interactions with the neighboring tissue. We examined how the neural retina regulates the assembly of tight junctions in the retinal pigment epithelium (RPE). The proteins JAM-A, AF-6, PAR-3 and PAR-6 have been implicated in the assembly of other epithelial tight junctions. Using chick embryos and primary cell culture, we examined gene expression of these proteins during embryonic development, and whether retinal secretions regulate their expression. Three highly conserved RNA splice sites
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.