The clinical diagnosis of a malignant pleural effusion (MPE) is still based on the detection of tumor cells in the pleural effusion. The question of how to improve the efficiency and accuracy of detecting an MPE still remains. This study explores the use of microfluidic technology to concentrate cells in an MPE and achieved the detection of the cell marker TPN in the microarray capture area. TPN is a mitochondria-specific bio-probe that can identify tumor cells on the basis of differences in the mitochondrial potential. First, we designed a microfluidic chip to analyze its performance. The res
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
YARS is responsible for catalysing the binding of tyrosine to its cognate tRNA and plays a crucial role in basic biosynthesis. However, its biological functions in bladder cancer remains to be proven. We analysed variations in YARS1 expression and survival in bladder cancer using multiple data sets, including TCGA-BLCA, GSE13507 and bladder cancer-specific tissue microarrays. Furthermore, we explored the biological functions of YARS1 using transcriptome data. Our findings revealed a noteworthy correlation between YARS1 and immune infiltration in bladder cancer, as determined using the XCELL al
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nasopharyngeal carcinoma (NPC) is a type of cancers that develops in the nasopharynx, the very upper part of the throat behind the nose. NPC is typically diagnosed in later stages of the disease and has a high rate of recurrence due to the location of the tumor growth site. In this study, we compared the gene expression profiles of NPC tissues from patients with and without recurrence to identify potential molecular biomarkers of NPC recurrence.
METHODS: Microarrays were used to analyze the expression of genes in 15 NPC tissues taken at the time of diagnosis and at the site of rec
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The purpose of this study is to investigate the expression of the epithelial membrane proteins (EMP) 1, 2, and 3 in adrenal gland neoplasm and to explore the broader implications of this. Tissue microarrays were constructed for 132 cases of adrenal cortical neoplasms (ACN) (adrenal cortical adenoma (115 cases), and carcinoma (17 cases)) and 189 cases of pheochromocytoma. Immunohistochemical staining was performed to identify EMP 1, 2, and 3, and was compared with clinicopathological parameters. The H-score of EMP 3 (p < 0.001) was higher in pheochromocytoma when compared to that of ACN, and th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The goal of this work was to determine the factors affecting the emergence of azithromycin-resistant Neisseria gonorrhoeae isolates in Russia, where azithromycin was never recommended for the treatment of gonococcal infections. Clinical N. gonorrhoeae isolates collected in 2018-2021 (428 isolates) were analyzed. No azithromycin-resistant isolates were found in 2018-2019, but in 2020-2021, a significant increase in the ratio of azithromycin-resistant isolates was observed: 16.8% and 9.3%, respectively. A hydrogel DNA microarray was developed for the analysis of resistance determinants: mutation
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The application of extracellular vesicles (EVs) derived from mesenchymal stem cells (MSCs) requires customized materials to target disease or cell damage. We hypothesized that EVs exert different inflammatory effects on one recipient cell, although stem cells of different origins in humans have similar payloads.
RESULTS: Here, the payload of EVs released by crosstalk between MSCs and human middle ear epithelial cells (HMEECs) extracted from adipose tissue, bone marrow and tonsils significantly increased the level of anti-inflammatory factors. EVs derived from the co-culture medium
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE OF REVIEW: In allergy, personalized medicine passes through the assessment of molecular allergens sensitization profiles. Such technique may help to better diagnose and treat patients suffering from allergic respiratory diseases.
RECENT FINDINGS: Different laboratory tests are available today to assess sensitization to molecular allergens, from singleplex assays, to unspecific, screening multiplex assays, mainly performed through microarrays or macroarrays. It is important to collect both results from specific IgE toward allergen extracts and toward molecular allergens, to collect the
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiplexed imaging platforms to simultaneously detect multiple epitopes in the same tissue section emerged in the last years as very powerful tools to study tumor immune contexture. These revolutionary technologies are providing a deep methodology for tumor evaluation in formalin-fixed and paraffin-embedded (FFPE) to improve the understanding of tumor microenvironment, new targets for treatment, prognostic and predictive biomarkers, and translational studies. Multiplexed imaging platforms allow for the identification of several antigens simultaneously from a single tissue section, core needle
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Circulating miRNAs are favored for biomarker candidates as they can reflect tissue specific miRNA dysregulation in disease contexts. Moreover, they have the additional advantage that they can be monitored in a minimally invasive manner. Blood-borne miRNAs are therefore currently characterized to identify, describe, and validate their potential suitability as biomarkers; however, sampling and as well miRNA detection methods limit these studies in terms of sensitivity but also practicability in clinical, at-home, or low-resource sampling of high-quality circulating RNA samples. We describe here
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Gac/Rsm network regulates, at the transcriptional level, many beneficial traits in biocontrol-active pseudomonads. In this study, we used Phenotype MicroArrays, followed by specific growth studies and mutational analysis, to understand how catabolism is regulated by this sensor kinase system in the biocontrol isolate Pseudomonas chlororaphis O6. The growth of a gacS mutant was decreased significantly relative to that of the wild-type on ornithine and arginine, and on the precursor of these amino acids, N-acetyl-l-glutamic acid. The gacS mutant also showed reduced production of polyamines.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biliary atresia (BA) is a pediatric cholangiopathy with unknown etiology occurring in isolated and syndromic forms. Laterality defects affec … situs inversus, polysplenia, panhypopituitarism, and mildly dysmorphic facial features. Chromosomal microarray analysis demonstrated a 277 kb heterozygous deletion on chromosome 20, which included a single gene, FOXA2, in the proband and her father. This deletion was confirmed to be de novo in the father. The proband and her father share a common diagnosis of heterot …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Emergence of resistance to pentavalent antimonials has become a severe obstacle in the treatment of visceral leishmaniasis (VL) on the Indian subcontinent. The mechanisms operating in laboratory-generated strains are somewhat known, but the determinants of clinical antimony resistance are not well understood. By utilizing a DNA microarray expression profiling approach, we identified a gene encoding mitogen-activated protein kinase 1 (MAPK1) for the kinetoplast protozoan Leishmania donovani (LdMAPK1) that was consistently downregulated in antimony-resistant field isolates. The expression level
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A global collection of plasmids of the IncHI1 incompatibility group from Salmonella enterica serovar Typhi were analyzed by using a combination of DNA sequencing, DNA sequence analysis, PCR, and microarrays. The IncHI1 resistance plasmids of serovar Typhi display a backbone of conserved gene content and arrangement, within which are embedded preferred acquisition sites for horizontal DNA transfer events. The variable regions appear to be preferred acquisition sites for DNA, most likely through composite transposition, which is presumably driven by the acquisition of resistance genes. Plasmid m
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: It is well known that the normalization step of microarray data makes a difference in the downstream analysis. All normalization methods rely on certain assumptions, so differences in results can be traced to different sensitivities to violation of the assumptions. Illustrating the lack of robustness, in a striking spike-in experiment all existing normalization methods fail because of an imbalance between up- and down-regulated genes. This means it is still important to develop a normalization method that is robust against violation of the standard assumptions
RESULTS: We develop
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ALL-1 gene is directly involved in 5-10% of acute lymphoblastic leukemias (ALLs) and acute myeloid leukemias (AMLs) by fusion to other genes or through internal rearrangements. DNA microarrays were used to determine expression profiles of ALLs and AMLs with ALL-1 rearrangements. These profiles distinguish those tumors from other ALLs and AMLs. The expression patterns of ALL-1-associated tumors, in particular ALLs, involve oncogenes, tumor suppressors, antiapoptotic genes, drug-resistance genes, etc., and correlate with the aggressive nature of the tumors. The genes whose expression differe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The T-ALL cell lines CCRF-CEM and Jurkat were studied for their sensitivity toward apoptosis induced by tetrocarcin-A (TC-A), an antibacterial and antitumor agent isolated from the actinomycete Micromonospora. This substance promoted cell death via a mitochondrial signaling pathway, that is, by activation of Bid and Bax, loss of the mitochondrial transmembrane potential, release of cytochrome c, and activation of effector caspases, even under conditions of Bcl-2 overexpression. Furthermore, sensitivity to TC-A was not dependent on expression of wild-type caspase-8. In contrast, this apoptotic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Endometrial carcinoma (EC) is an aggressive gynecological malignancy with high recurrence rates and limited treatment options. Patients with EC exhibit elevated serum levels of lyso-platelet-activating factor (lyso-PAF), a biologically inactive product generated during the hydrolysis of PAF by PAF-acetylhydrolase (II) (PAF-AH2). Nevertheless, the biological function of PAF in EC progression and the relationship between abnormal lyso-PAF levels and EC progression remain unclear. RESULTS: In this study, we identified the bioactive phospholipid mediator–PAF, which effectively suppress
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Dengue virus (DENV) infection causes viral haemorrhagic fever that is characterized by extensive activation of the immune system. The aim of this study is to investigate the kinetics of the transcriptome signature changes during the course of disease and the association of genes in these signatures with clinical parameters.
METHODOLOGY/PRINCIPLE FINDINGS: Sequential whole blood samples from DENV infected patients in Jakarta were profiled using affymetrix microarrays, which were analysed using principal component analysis, limma, gene set analysis, and weighted gene co-expression n
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Distinct gene expression profiles can be detected in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) in patients with schizophrenia; however, little is known about the effects of antipsychotic medication. This study compared gene expression profiles in PMBCs from treatment-naive patients with schizophrenia before and after antipsychotic drug treatment. PBMCs were obtained from 10 treatment-naive schizophrenia patients before and 6 wk after initiating antipsychotic drug treatment and compared to PMBCs collected from 11 healthy community volunteers. Genome-wide expression profiling was conducted usin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Encystation is an essential differentiation process for the completion of the life cycle of a group of intestinal protozoa including Entamoeba histolytica, the causative agent of intestinal and extraintestinal amebiasis. However, regulation of gene expression during encystation is poorly understood. To comprehensively understand the process at the molecular level, the transcriptomic profiles of E. invadens, which is a related reptilian species that causes an invasive disease similar to that of E. histolytica, was investigated during encystation. Using a custom-generated Affymetrix platform mic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования