This study aims to explore biomarkers linked to the progression from non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD) to hepatocellular carcinoma (HCC) and their therapeutic potential. Using bioinformatics, we identified key differentially expressed genes from various databases, focusing on genes related to NAFLD, non-alcoholic steatohepatitis, liver cirrhosis, and HCC. Among the upregulated genes, baculoviral IAP repeat containing 5 (BIRC5), cyclin B1 (CCNB1), cyclin-dependent kinase 1 (CDK1), and DNA topoisomerase II alpha (TOP2A) were found to be significant. In vivo and in vitro models of NAFLD a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinocerebellar ataxias (SCAs) are progressive neurodegenerative disorders caused by abnormal CAG repeat expansions in genes such as ATXN1, ATXN2, and ATXN3, with no effective therapeutic options currently available. To identify key molecular drivers of disease pathology, transcriptomic datasets GSE75249 and GSE151276 were analyzed. Differentially expressed genes were determined, and overlapping upregulated genes from both datasets were extracted for downstream analysis. Functional enrichment revealed significant biological processes and pathways related to protein homeostasis, cellular stress
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The oil palm is a prominent tropical oil crop with holds considerable economic value. MYB transcription factors are key regulators in growth and plant stress adaptation mechanisms in plants. However, the roles and operational mechanisms of MYB genes in oil palm are not yet well understood. In this study, EgMYB111 was cloned from oil palm, and its behavior under cold stress was examined in genetically engineered tobacco and oil palm embryoids. Physiological and biochemical analysis demonstrated that genetically engineered lines exhibited substantially greater cold tolerance than control plants.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Thalamic hemorrhage (TH) is a severe neurological condition, the molecular mechanisms of which are poorly understood, particularly in clinical settings. N-acetyltransferase 10 (NAT10), a regulator of RNA N4-acetylcytidine (ac4C) modification, has been implicated in cell cycle regulation and identified as a potential therapeutic target. This study explored the effects of NAT10 inhibition on TH pathology using a multi-omics approach.
METHODS: A mouse model of TH was established via collagenase IV injection. NAT10 activity was detected by dot blot and inhibited using Remodelin. Compr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SRSF2 plays a dual role, functioning both as a transcriptional regulator and a key player in alternative splicing. The absence of Srsf2 in MyoD + progenitors resulted in perinatal mortality in mice, accompanied by severe skeletal muscle defects. SRSF2 deficiency disrupts the directional migration of MyoD progenitors, causing them to disperse into both muscle and non-muscle regions. Single-cell RNA-sequencing analysis revealed significant alterations in Srsf2-deficient myoblasts, including a reduction in extracellular matrix components, diminished expression of genes involved in ameboid-type ce
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neuroblastoma is an embryonic cancer that contributes disproportionately to death in young children. Sequencing data have uncovered few recurrently mutated genes in this cancer, although epigenetic pathways have been implicated in disease pathogenesis. We used an expression-based computational screen that examined the impact of deubiquitinating enzymes on patient survival to identify potential new targets. We identified the histone H2B deubiquitinating enzyme USP44 as the enzyme with the greatest impact on survival in patients with neuroblastoma. High levels of USP44 significantly correlate wi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Previous studies have demonstrated the important role of fatty acid desaturase 2 (FADS2) in governing tumorigenesis and tumor metastasis. Although FADS2 is an essential regulator of fatty acid metabolism, its prognostic and immunotherapeutic value remains uncertain.
METHODS: The role of FADS2 was investigated across different types of tumors. Besides, the relationship between FADS2 and survival prognosis, clinicopathologic features, tumor-infiltrating immune cells, immunoregulatory genes, chemokines, chemokines receptor, tumor mutational burden (TMB), and microsatellite instabilit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rheumatoid arthritis or joint rheumatism is the most common systemic inflammatory disease of the joints and is considered one of the chronic autoimmune diseases. T cells and other immune cells are called to the synovial tissue and cause this disease to progress. Autophagy is a process that is associated with the breakdown of intracellular organelles. As a regulator of cell homeostasis, it can affect the activation of immune cells and participate in the pathogenesis of rheumatoid arthritis. This study aimed to evaluate the gene expression level of autophagy genes in two groups of rheumatoid art
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcriptomes are known to organize themselves into gene co-expression clusters or modules where groups of genes display distinct patterns of coordinated or synchronous expression across independent biological samples. The functional significance of these co-expression clusters is suggested by the fact that highly coexpressed groups of genes tend to be enriched in genes involved in common functions and biological processes. While gene co-expression is widely assumed to reflect close regulatory proximity, the validity of this assumption remains unclear. Here we use a simple synthetic gene regu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Limb-girdle muscular dystrophy recessive 1 calpain3-related (LGMDR1), previously known as LGMD2A, is a disease caused by mutations in the CAPN3 gene. It is characterized by progressive weakness and muscle degeneration. Frizzled related protein (FRZB), upregulated in LGMDR1, was identified as a key regulator of the crosstalk between Wnt and integrin signalling pathways. FRZB gene silencing showed a recovery in the expression of some of the costamere protein levels in myotubes.
RESULTS: Here, we performed a comprehensive characterization of Frzb-/- mice muscles to study the absence
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Excitatory neurons of the mammalian cerebral cortex are organized into six functional layers characterized by unique patterns of connectivity, as well as distinctive physiological and morphological properties. Cortical layers appear after a highly regulated migration process in which cells move from the deeper, proliferative zone toward the superficial layers. Importantly, defects in this radial migration process have been implicated in neurodevelopmental and psychiatric diseases. Here we report that during the final stages of migration, transcription factor Neurogenic Differentiation 2 (Neuro
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polycystic ovary syndrome (PCOS) is a common gynaecological disorder, with a prevalence of up to 12% of women of reproductive age, and is in part characterised by elevated circulating androgens and aberrant expression of androgen receptor (AR) in the endometrium. A high percentage of PCOS patients suffer from infertility, a condition that appears to be linked to mistimed and incomplete decidualisation critically affecting events surrounding embryo implantation. The aim of this study was to examine the involvement of MAGEA11, and the genome-wide role of AR in PCOS. We determined that elevated a
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rhesus theta defensin-1 (RTD-1), a macrocyclic immunomodulatory host defense peptide from Old World monkeys, is therapeutic in pristane-induced arthritis (PIA) in rats, a model of rheumatoid arthritis (RA). RNA-sequence (RNA-Seq) analysis was used to interrogate the changes in gene expression in PIA rats, which identified 617 differentially expressed genes (DEGs) in PIA synovial tissue of diseased rats. Upstream regulator analysis showed upregulation of gene expression pathways regulated by TNF, IL1B, IL6, proinflammatory cytokines, and matrix metalloproteases (MMPs) involved in RA. In contras
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterococcus faecalis are a major cause of nosocomial infection worldwide, and the spread of vancomycin resistant strains (VRE) limits treatment options. Tigecycline-resistant VRE began to be isolated from inpatients at a Brazilian hospital within months following the addition of tigecycline to the hospital formulary. This was found to be the result of a spread of an ST103 E. faecalis clone. Our objective was to identify the basis for tigecycline resistance in this lineage. The genomes of two closely related tigecycline-susceptible (MIC = 0.06 mg/L), and three representative tigecycline-resist
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ClpX functions as either an independent chaperone or a component of the ClpXP protease, a conserved intracellular protease that acts as a global regulator in the bacterial cell by degrading regulatory proteins, stress response proteins and rate-limiting enzymes. Previously, we found that loss of clpX in Bacillus anthracis Sterne leads to increased susceptibility to antimicrobial agents that target the cell envelope. The aim of this study was to identify genes within the regulatory network of clpX that contribute to antimicrobial resistance. Using microarray analysis, we found 119 genes that ar
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudomyxoma peritonei (PMP) is a subtype of mucinous adenocarcinoma mainly restricted to the peritoneal cavity and most commonly originating from the appendix. The genetic background of PMP is poorly understood and no targeted treatments are currently available for this fatal disease. While RAS signaling pathway is affected in most if not all PMP cases and over half of them also have a mutation in the GNAS gene, other genetic alterations and affected pathways are, to a large degree, poorly known. In this study, we sequenced whole coding genome of nine PMP tumors and paired normal tissues in o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The epithelium lining the epididymis in the male reproductive tract maintains a luminal environment that promotes sperm cell maturation. This process is dependent on the coordinated expression of many genes that encode proteins with a role in epithelial transport. We previously generated genome-wide maps of open chromatin in primary human epididymis epithelial (HEE) cells to identify potential regulatory elements controlling coordinated gene expression in the epididymis epithelium. Subsequent in silico analysis identified transcription factor-binding sites (TFBS) that were over-represented in
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Malignant carcinomas that recur following therapy are typically de-differentiated and multidrug resistant (MDR). De-differentiated cancer cells acquire MDR by up-regulating reactive oxygen species (ROS)-scavenging enzymes and drug efflux pumps, but how these genes are up-regulated in response to de-differentiation is not known. Here, we examine this question by using global transcriptional profiling to identify ROS-induced genes that are already up-regulated in de-differentiated cells, even in the absence of oxidative damage. Using this approach, we found that the Nrf2 transcription factor, wh
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Borrelia burgdorferi, the agent of Lyme disease, is a vector-borne pathogen that transits between Ixodes ticks and vertebrate hosts. During the natural infectious cycle, spirochetes must globally adjust their transcriptome to survive in these dissimilar environments. One way B. burgdorferi accomplishes this is through the use of alternative sigma factors to direct transcription of specific genes. RpoS, one of only three sigma factors in B. burgdorferi, controls expression of genes required during tick-transmission and infection of the mammalian host. How spirochetes switch between different si
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although triple negative breast cancers (TNBC) are the most aggressive subtype of breast cancer, they currently lack targeted therapies. Because this classification still includes a heterogeneous collection of tumors, new tools to classify TNBCs are urgently required in order to improve our prognostic capability for high risk patients and predict response to therapy. We previously defined a gene expression signature, RKIP Pathway Metastasis Signature (RPMS), based upon a metastasis-suppressive signaling pathway initiated by Raf Kinase Inhibitory Protein (RKIP). We have now generated a new BACH
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования