Epigenomic abnormalities caused by genetic mutation in epigenetic regulators can result in neurodevelopmental disorders, deficiency in neural plasticity and mental retardation. As a histone demethylase, plant homeodomain finger protein 8 (Phf8) is a candidate gene for syndromal and non-specific forms of X-chromosome-linked intellectual disability (XLID). Here we report that Phf8 knockout mice displayed impaired learning and memory, and impaired hippocampal long-term potentiation (LTP) without gross morphological defects. We also show that mTOR signaling pathway is hyperactive in hippocampus in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kdm3b is a JmjC domain-containing histone H3 (H3) demethylase and its physiological functions are largely unknown. In this study, we found that Kdm3b protein is highly expressed in multiple cell types in the mouse testes, including Leydig cells, Sertoli cells, spermatogonia and spermatocytes at different differentiation stages. We also observed Kdm3b protein in the epithelial cells of the caput epididymis, prostate and seminal vesicle. Breeding tests revealed that the number of pups produced by the breeding pairs with Kdm3b knockout (Kdm3bKO) males and wild type (WT) females was reduced 68% be
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
X-linked mental retardation (XLMR) is a complex human disease that causes intellectual disability. Causal mutations have been found in approximately 90 X-linked genes; however, molecular and biological functions of many of these genetically defined XLMR genes remain unknown. PHF8 (PHD (plant homeo domain) finger protein 8) is a JmjC domain-containing protein and its mutations have been found in patients with XLMR and craniofacial deformities. Here we provide multiple lines of evidence establishing PHF8 as the first mono-methyl histone H4 lysine 20 (H4K20me1) demethylase, with additional activi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer is a multifaceted disease driven by genetic mutations and epigenetic dysregulation. Among epigenetic modifiers, histone demethylases like KDM4C (lysine demethylase 4C) play a pivotal role in tumor progression by removing repressive methylation mark at Histone H3K9/H3K36 and altering chromatin structure and gene expression. Overexpression of KDM4C has been implicated in various malignancies, including breast, prostate, colorectal, and hepatocellular carcinomas, hence it is promising drug target. This study employs a structure-based drug discovery strategy to identify natural polyphenolic…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Histone demethylases have been extensively characterized in plants, yet how their enzymatic activities are regulated remains largely unknown. Here, we identify that MBD8, a protein harboring a putative methyl-CpG-binding domain (MBD), forms a protein complex with the histone demethylase LDL2 in Arabidopsis thaliana. In this complex, MBD8 functions as a cofactor that is required for efficient LDL2-mediated removal of mono- and di-methylation at histone H3 (H3K4me1 and H3K4me2) across the genome. In the Arabidopsis C24 ecotype, loss-of-function mutations in MBD8 and LDL2 result in indistinguisha…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glioblastoma (GBM) is the most aggressive and deadliest type of primary brain tumor, treated with temozolomide (TMZ) as first-line chemotherapy. However, temozolomide resistance remains a critical therapeutic hurdle in GBM, often resulting in treatment failure and tumor recurrence. Here, we aimed to identify an epigenetic target to overcome TMZ resistance in GBM. We established TMZ-resistant GBM cell lines, which exhibited increased expression of resistance markers such as E2F6, ABCG2, and phosphorylated STAT3, and decreased Bax expression. Through KDM inhibitor screening with these cells, we
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Epigenetic changes that lead to long-term neuroadaptations following opioid exposure are not well understood. We examined how histone demethylase JMJD3 in the nucleus accumbens (NAc) influences heroin seeking after abstinence from self-administration.
METHODS: Male Sprague Dawley rats were trained to self-administer heroin. Western blotting and quantitative polymerase chain reaction were performed to quantify JMJD3 and bone morphogenetic protein (BMP) pathway expression in the NAc (n = 7-11/group). Pharmacological inhibitors or viral expression vectors were microinfused into the N
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Periodontal ligament (PDL) cells are critical for the bone remodeling process in periapical lesions since they can differentiate into osteoblasts and secrete osteoclastogenesis-promoting cytokines. Post-translational histone modifications including alterations of the methylation status of H3K27 are involved in cell differentiation and inflammatory reaction. The histone demethylase Jumonji domain-containing 3 (Jmjd3) specifically removes methylation of H3K27. We investigated whether Jmjd3 is involved in the osteogenic differentiation and secretion of PDL cells' inflammatory factors. Jmjd3 expre
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenome alteration in chondrocytes correlates with osteoarthritis (OA) development. H3K27me3 demethylase UTX regulates tissue homeostasis and deterioration, while its role was not yet studied in articulating joint tissue in situ. We now uncovered that increased UTX and H3K27me3 expression in articular chondrocytes positively correlated with human knee OA. Forced UTX expression upregulated the H3K27me3 enrichment at transcription factor Sox9 promoter, inhibiting key extracellular matrix molecules collagen II, aggrecan, and glycosaminoglycan in articular chondrocytes. Utx overexpression in kne
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The pathogenesis of allergic contact dermatitis (ACD) requires the activation of Ag-specific T cells, including effector and regulatory T cells. The differentiation and function of these T cells is epigenetically regulated through DNA methylation and histone modifications. However, the roles of altered histone H3K27 methylation in T cells in the development of ACD remain unknown. Two types of histone H3K27 demethylases, Utx and Jmjd3, have been reported in mammals. To determine the role of the histone H3K27 demethylase expression of T cells in the development of ACD, we generated T cell-specif
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Malignant pleural mesothelioma (MPM) is a highly aggressive cancer with a dismal prognosis. There is increasing interest in targeting chromatin regulatory pathways in difficult-to-treat cancers. In preliminary studies, we found that KDM4A (lysine-specific histone demethylase 4) was overexpressed in MPM.
METHODS: KDM4A protein expression was determined by immunohistochemistry or immunoblotting. Functional inhibition of KDM4A by targeted knockdown and small molecule drugs was correlated to cell growth using cell lines and a xenograft mouse model. Gene expression profiling was perfor
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A machine learning approach has been applied to virtual screening for lysine specific demethylase 1 (LSD1) inhibitors. LSD1 is an important anti-cancer target. Machine learning models to predict activity were constructed using Morgan molecular fingerprints. The dataset, consisting of 931 molecules with LSD1 inhibition activity, was obtained from the ChEMBL database. An evaluation of several candidate algorithms on the main dataset revealed that the support vector regressor gave the best model, with a coefficient of determination (R2) of 0.703. Virtual screening, using this model, identified fi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inactivation of the retinoblastoma gene (RB1) product, pRB, is common in many human cancers. Targeting downstream effectors of pRB that are central to tumorigenesis is a promising strategy to block the growth of tumors harboring loss-of-function RB1 mutations. One such effector is retinoblastoma-binding protein 2 (RBP2, also called JARID1A or KDM5A), which encodes an H3K4 demethylase. Binding of pRB to RBP2 has been linked to the ability of pRB to promote senescence and differentiation. Importantly, genetic ablation of RBP2 is sufficient to phenocopy pRB's ability to induce these cellular chan
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАVideo-Audio MediaПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The role of lysine demethylase 7A (KDM7A) in the mammalian brain remains largely unexplored. Here, we demonstrate that KDM7A occupies thousands of genomic loci in hippocampal chromatin and that both its expression and chromatin binding are dynamically regulated by neuronal activity in culture and in vivo. To define its functional relevance, we generated mouse models with either complete loss of KDM7A or disrupted enzymatic activity and assessed neurological phenotypes. Integrating cellular and molecular analyses with transcriptomic and chromatin-occupancy profiling and behavioral assessments,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The efficacy of the host antiviral response against Influenza A virus (IAV), a leading cause of global pandemics, hinges upon the rapid recognition of the pathogen and the prompt activation of immune mechanisms. Nevertheless, the epigenetic landscape that orchestrates this antiviral response remains largely elusive. Here, we identify histone demethylase JMJD2D as a critical regulator in defense against IAV infection. A significant upregulation of JMJD2D expression was observed clinically in response to IAV infection, indicating that JMJD2D may play a role in regulating IAV infection. Indeed, J
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epstein-Barr virus (EBV) infects >95% of adults and contributes to several human cancers. EBV can remain latent where viral lytic genes are silenced, precluding the use of antiviral agents such as ganciclovir. Little is known about the host factors involved in EBV latency. Here we performed a human genome-wide CRISPR-Cas9 screen in Burkitt lymphoma B cells, which identified lysine-specific histone demethylase 1 (LSD1) and its corepressors REST corepressor 1 (CoREST) and zinc finger protein 217 (ZNF217) as critical for EBV latency. Gene knockout or LSD1 inhibition triggered EBV reactivation, an
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) is the most prevalent chronic liver disease without specific Food and Drug Administration-approved … tion in primary brown adipocytes. We here investigated the role of KDM1A, one of the most important histone demethylases, in NAFLD. In this study, we observed a significant upregulation of KDM1A in NAFLD mice, monkeys, and humans compared to the control group. Based on these results, we further found that the KDM1A can exacerbate lipid accumulation and inflammation in …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Chronic apical periodontitis is a typical inflammatory disease of the oral cavity, the pathology is characterized by an inflammatory reaction with bone defects in the periapical area. Chinese medicine is our traditional medicine, Carbon Dots (CDs) are a new type of nanomaterials. The purpose of this study was to prepare Yam Carbon Dots (YAM-CDs) to investigate the mechanism of action of YAM-CDs on bone differentiation in vivo and in vitro.
METHODS: We characterized YAM-CDs using transmission electron microscopy (TEM), Fourier Transform Infrared Spectrometer (FTIR), X-Ray Diffrac
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acetaminophen (APAP) overdose is a major cause of acute liver failure, while the underlying mechanisms of APAP hepatotoxicity are not fully understood. Recently, emerging evidence suggests that epigenetic enzymes play roles in APAP-induced liver injury. Here, we found that Utx (ubiquitously transcribed tetratricopeptide repeat, X chromosome, also known as KDM6A), a X-linked histone demethylase which removes the di- and tri-methyl groups from histone H3K27, was markedly induced in the liver of APAP-overdosed female mice. Hepatic deletion of Utx suppressed APAP overdose-induced hepatotoxicity in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The proliferation and multi-directional differentiation potential of mesenchymal stem cells (MSCs) enabled its wide use in the development of new therapies for bone and cartilage repair. Although preliminary work has been done to verify the gene expression profile of MSCs osteogenic and chondrogenic differentiation, it is still unclear what key factors initiate the differentiation of MSCs, resulting in its limited application in bone and cartilage tissue engineering. The epigenetic mechanism mediated by histone demethylases (lysine [K]-specific histone demethylases, KDMs) is the key link in re…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования