BACKGROUND: The Escherichia coli protein GlgS is up-regulated in response to starvation stress and its overexpression was shown to stimulate glycogen synthesis.
RESULTS: We solved the structure of GlgS from E. coli, a member of an enterobacterial protein family. The protein structure represents a bundle of three alpha-helices with a short hydrophobic helix sandwiched between two long amphipathic helices.
CONCLUSION: GlgS shows structural homology to Huntingtin, elongation factor 3, protein phosphatase 2A, TOR1 motif domains and tetratricopeptide repeats, suggesting a possible role in protein
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human cytomegalovirus (HCMV) is an opportunistic pathogen that infects a majority of the world population. It may cause severe disease in immunocompromised people and lead to pregnancy loss or grave disabilities of the fetus upon congenital infection. For effective replication and lifelong persistence in its host, HCMV relies on diverse functions of its tegument protein UL82, also known as pp71. Up to now, little is known about the molecular mechanisms underlying the multiple functions of this crucial viral protein. Here, we describe the X-ray structure of full-length UL82 to a resolution of 2
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The primary structure of the crusta gene encoding alpha-latrocrustoxin (alpha-LCT), a high molecular mass neurotoxin specific to crustaceans, was determined in the black widow spider Latrodectus mactans tredicimguttatus genome. The total length of the sequenced DNA was 4693 bp. The structural part of the black widow spider chromosome gene encoding alpha-LCT does not contain introns. The sequenced DNA contains a single extended open reading frame (4185 bp) and encodes a protein precursor of alpha-LCT, comprising 1395 aa. We assume the Met residue at position -10 relative to the N-terminal resid
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein CM-2 from Bitis arietans venom was purified by chromatographic procedures involving Sephadex G-50 and CM-cellulose. The purified protein comprises 82 amino acids including 14 half-cystine residues and its primary structure has been elucidated. Protein CM-2 is not toxic. Although the protein clears a suspension of egg yolk, structural features and the inability to hydrolyse L-alpha-lecithin reveal that it cannot be a phospholipase A2. In spite of its sequence showing some homology with that of porcine colipase, protein CM-2 is not a colipase.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rat Nap57 and its yeast homologue Cbf5p are pseudouridine synthases involved in rRNA biogenesis, localized in the nucleolus. These proteins, together with H/ACA class of snoRNAs compose snoRNP particles, in which snoRNA guides the synthase to direct site-specific pseudouridylation of rRNA. In this paper we present an Arabidopsis thaliana protein that is highly homologous to Cbf5p (72% identity and 85% homology) and NAP57 (67% identity and 81% homology). Moreover, the plant protein has conserved structural motifs that are characteristic features of pseudouridine synthases of the TruB class. We
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytokinesis is an essential process in bacterial cell division, and it involves more than 25 essential/non-essential cell division proteins that form a protein complex known as a divisome. Central to the divisome are the proteins FtsB and FtsL binding to FtsQ to form a complex FtsQBL, which helps link the early proteins with late proteins. The FtsQBL complex is highly conserved as a component across bacteria. Pathogens like Vibrio cholerae, Mycobacterium ulcerans, Mycobacterium leprae, and Chlamydia trachomatis are the causative agents of the bacterial Neglected Tropical Diseases Cholera, Buru
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transducer of Cdc42-dependent actin assembly protein 1 (TOCA1) is an effector of the Rho family small G protein Cdc42. It contains a membrane-deforming F-BAR domain as well as a Src homology 3 (SH3) domain and a G protein-binding homology region 1 (HR1) domain. TOCA1 binding to Cdc42 leads to actin rearrangements, which are thought to be involved in processes such as endocytosis, filopodia formation, and cell migration. We have solved the structure of the HR1 domain of TOCA1, providing the first structural data for this protein. We have found that the TOCA1 HR1, like the closely related CIP4 H
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Homologous recombination (HR) is a pathway to faithfully repair DNA double-strand breaks (DSBs). At the core of this pathway is a DNA recombinase, which, as a nucleoprotein filament on ssDNA, pairs with homologous DNA as a template to repair the damaged site. In eukaryotes Rad51 is the recombinase capable of carrying out essential steps including strand invasion, homology search on the sister chromatid and strand exchange. Importantly, a tightly regulated process involving many protein factors has evolved to ensure proper localisation of this DNA repair machinery and its correct timing within
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genome of the virus that causes salivary gland hypertrophy in Musca domestica (MdSGHV) was sequenced. This non-classified, enveloped, double stranded, circular DNA virus had a 124,279bp genome. The G + C content was 43.5% with 108 putative methionine-initiated open reading frames (ORFs). Thirty ORFs had homology to database proteins: eleven to proteins coded by both baculoviruses and nudiviruses (p74, pif-1, pif-2, pif-3, odv-e66, rr1, rr2, iap, dUTPase, MMP, and Ac81-like), seven to nudiviruses (mcp, dhfr, ts, tk and three unknown proteins), one to baculovirus (Ac150-like), one to herpesv
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The association of only certain M protein serotypes of group A streptococci with acute glomerulonephritis is very well recognized. Structural information on the M protein, a dimeric alpha-helical coiled-coil molecule, has come so far from three rheumatogenic serotypes, 5, 6, and 24. However, M proteins from the nephritogenic serotypes have not been well characterized. In the present study, we have isolated a biologically active 20,000 Mr pepsin fragment of type 49 M protein (PepM49), a nephritogenic serotype, and purified it to homogeneity using DEAE-Sephadex and gel filtration. The amino acid
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transglutaminases (TGase; protein-glutamine: amine gamma-glutamyl-transferase) are a family of calcium-dependent acyl-transfer enzymes ubiquitously expressed in mammalian cells and responsible for catalyzing covalent cross-links between proteins or peptides. A series of recent crystal structures have revealed the overall architecture of TGase enzymes, and provided a deep look at their active site, calcium and magnesium ions, and the manner by which guanine nucleotides interact with this enzyme. These structures, backed with extensive biochemical studies, are providing new insights as to how ac
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathogenic bacteria Neisseria meningitidis cause serious infection i.e. meningitis (infection of the brain) worldwide. Among five pathogenic serogroups, serogroup B causes life threatening illness as there is no effective vaccine available due to its poor immunogenicity. A total of 73 genes in N. meningitidis genome have identified that were proved to be essential for meningococcal disease and were considered as crucial drug targets. We targeted five of those proteins, which are known to involve in amino acid biosynthesis, for homology-based three dimensional structure determinations by MODELL
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alkaline phosphatases (ALPs) [orthophosphoric-monoester phosphohydrolase (alkaline optimum), EC 3.1.3.1] isolated from human liver, bone, and kidney (L/B/K) exhibit very similar biochemical and immunologic properties that differentiate them from other human ALPs, such as those characteristically found in placenta and intestine. Despite their similarities, the L/B/K ALPs produced in different tissues show slight physical differences. To examine structural and evolutionary relationships between the various ALPs, a cDNA corresponding to L/B/K ALP mRNA has been isolated. A lambda 11 cDNA expressio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PKD1 is the major locus of the common genetic disorder autosomal dominant polycystic kidney disease (ADPKD). Analysis of the predicted protein sequence of the human PKD1 gene, polycystin, shows a large molecule with a unique arrangement of extracellular domains and multiple putative transmembrane regions. The precise function of polycystin remains unclear with a paucity of mutations to define key structural and functional domains. To refine the structure of this protein we have cloned the genomic region encoding the Fugu PKD1 gene. Fugu PKD1 spans 36 kb of genomic DNA and has greater complexit
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A robust tool for fold recognition was applied to the systematic analysis of the sequences below 200 residues encoded by the genome of Mycoplasma pneumoniae. The goal was to determine the additional information gain achievable in genome analysis by fold recognition, beyond the intrinsic limits of homology studies. A list of 124 sequences encoding for soluble proteins or domains not homologous to each other, or to proteins with known three-dimensional structure, was analyzed, resulting in significant Z scores for the energy of the structural models in 12 of these cases. This result indicates th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Protein three-dimensional structures are very much important in terms of functional and evolutionary context. In the present work we evaluated the snake venom constituent cytotoxin, short neurotoxin and related non-toxin proteins of other chordates with reference to structure prediction, validation of the models, distribution of secondary structural elements, hydrophobicity molecular surface analysis, functional annotation and functionally critical binding site identification with the assistance of different bioinformatical tools.
METHODS: Homology models have been generated with
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The phosphatidylinositol 3-kinase-related protein kinases are key regulators controlling a wide range of cellular events. The yeast Tel1 and Mec1·Ddc2 complex (ATM and ATR-ATRIP in humans) play pivotal roles in DNA replication, DNA damage signaling, and repair. Here, we present the first structural insight for dimers of Mec1·Ddc2 and Tel1 using single-particle electron microscopy. Both kinases reveal a head to head dimer with one major dimeric interface through the N-terminal HEAT (named after Huntingtin, elongation factor 3, protein phosphatase 2A, and yeast kinase TOR1) repeat. Their dimeric
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A new approach to the molecular modelling of homologous serine proteases is adopted, by including a set of 21 buried waters known to be preserved in enzymes sharing the primary specificity of trypsin, in the homology modelling of rat submaxillary gland kallikrein. Buried waters--water molecules sequestered from bulk solvent within a protein matrix--appear to be integral conserved components of all serine proteases of known structure and should be incorporated into serine protease models built on the basis of sequence/structural homology to this family. The absence of such waters might induce e
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Conotoxins are short, cysteine-rich peptides of great interest as novel therapeutic leads and of great concern as lethal biological agents due to their high affinity and specificity for various receptors involved in neuromuscular transmission. Currently, of the approximately 6000 known conotoxin sequences, only about 3% have associated structural characterization, which leads to a bottleneck in rapid high-throughput screening (HTS) for identification of potential leads or threats. In this work, we combine a graph-based approach with homology modeling to expand the library of conotoxin structur
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Some samples of latrotoxin purified from the black widow spider venom contain two components: alpha-latrotoxin (M(r) approximately 130,000) and a low mol. wt protein with M(r) about 8000. Clones carrying the cDNA sequence for the low mol. wt protein copurified with alpha-latrotoxin were isolated from spider venom glands. Nucleotide sequence analysis of the cloned cDNA revealed the primary structure of the polypeptide to be 18 amino acids signal peptide and 70 amino acids protein chain with mol. wt of 7947 and pI of approximately 4.0. The protein exhibits certain structural homology with erabut
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования