The CCT [CONSTANS (CO), CO-like, and TIMING OF CAB EXPRESSION1 (TOC1)] gene family is involved in photoperiodic flowering and adaptation to different environments. In this study, 39 CCT family genes from the poplar genome were identified and characterized, including 18 COL, 7 PRR, and 14 CMF TFs. Phylogenetics analysis showed that the PtrCCT gene family could be classified into five classes (Classes I-V) that have close relationships with Arabidopsis thaliana. Eight pairs of PtrCCTs had collinear relationships through interchromosomal synteny analysis in poplar, suggesting segmental duplicatio…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A prerequisite to understanding the evolution of the human X chromosome is the analysis of synteny of X-linked genes in different species. We have focused on the spermine synthase gene in human Xp22. 1. We show that whereas the human gene spans a genomic region of 54 kb, the Fugu rubripes gene is encompassed in a 4.7-kb region. However, we could not find conserved synteny between this region of human Xp22 and the equivalent F. rubripes region. A cosmid clone containing the F. rubripes gene does not contain other X-linked genes. Instead we identified homologs of human genes that are autosomally…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dactylaplasia, or Dac, was recently mapped to the distal portion of mouse chromosome 19 and shown to be inherited as an autosomal semi-dominant trait characterized by missing central digital rays. The most common locus for human split hand split foot malformation, also typically characterized by missing central digital rays, is 10q25, a region of synteny to the Dac locus. The Dac mouse appears to be an ideal genotypic and phenotypic model for this human malformation syndrome. Several genes lie in this region of synteny, however, only Fibroblast Growth Factor 8, or Fgf-8, has been implicated to…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Since its discovery in birds, gonadotropin-inhibitory hormone (GnIH) has triggered investigation in the other groups of vertebrates. In the present study, we have identified a single gnih gene in the European eel (Anguilla anguilla), a representative species of a basal group of teleosts (Elopomorphs). We have also retrieved a single gnih gene in Osteoglossomorphs, as well as in more recently emerged teleosts, Clupeocephala. Phylogeny and synteny analyses allowed us to infer that one of the two gnih paralogs emerged from the teleost-specific whole genome duplication (TWGD or 3R), would have bee…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinach is a common vegetable, and dioecy is maintained by a pair of XY sex chromosomes. Due to limited genomic resources and its highly rep … th the rest genome, which matches extremely low gene density featured by only nine annotated genes. Synteny analysis between Y contigs and Superscaffold_66 revealed a 340-Kb accumulative Y contig (non-continuous) and a 500-Kb X counterpart along with SVs and wide-spread tandem duplications. Among the nine genes, one ABC transporter gene revealed noticeabl …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Convergent evolution, a process by which organisms evolved independently to have similar traits, provides opportunities to understand adaptation. The bacterial genus Mycoplasma contains multiple species that evolved independently to become ruminant pathogens, which represents an interesting study system for investigating the process. In this work, we determined the genome sequences of 11 Entomoplasma/Mesoplasma species. This new data set, together with the other available Mollicutes genomes, provided comprehensive taxon sampling for inferring the gene content evolution that led to the emergenc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The availability of a large number of whole-genome sequences allows comparative genomic analysis to reveal and understand evolution of regul … ed homologous and homeologous segments of ca. 100 kb, with or without MIR319, performed comparative synteny analysis and genome fractionation studies. We detected variable rates of gene retention across members of Brassicaceae when genomic blocks of MIR319a, MIR319b, and MIR319c were compared either between themselves or against Arabidopsis thaliana genom …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several studies point to the possibility that malignant hyperthermia (MH) in pigs is caused by a defect in the calcium release channel (CRC) of skeletal muscle sarcoplasmic reticulum. The locus for MH is closely linked to the glucosephosphate isomerase (GPI) locus, near the centromere of chromosome 6. We demonstrate synteny of the genes for CRC and GPI using somatic cell hybrid lines, and assign the CRC gene to chromosome 6p11----q21 by in situ hybridization.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schistosoma japonicum is a flatworm that causes schistosomiasis, a neglected tropical disease. S. japonicum RNA-Seq analyses has been previo … ual maturation. We identified 12,291 S. japonicum expressed lncRNAs. Sequence similarity search and synteny conservation indicated that some 14% of S. japonicum intergenic lncRNAs have synteny conservation with S. mansoni intergenic lncRNAs. Co-expression analyses showed that lncRNAs and protein-coding genes in S. japonicum males and females have a dynami …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to investigate the biological characteristics of Corynebacterium hindlerae, a pathogen discovered in bovine hosts, analyze … tion of Average Nucleotide Identity (ANI), and comparative genomic analysis covering gene families, synteny, SNPs, InDels, and structural variations (SVs). The isolate exhibited optimal growth at 37 °C, pH 5.5, and 1-2% NaCl concentration, demonstrated strong biofilm-forming ability, but showed weak or no motility. Phylogenetic analysis divided the five C …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The yellow fever mosquito (Aedes aegypti) is an organism of high medical importance because it is the primary vector for diseases such as ye … it high contiguity and gene completeness, comparable to AaegL5. While Aaf exhibits a high degree of synteny to AaegL5, it also exhibits several large inversions. We also conducted comparative genomic analyses using our genomes and other publicly available culicid reference genomes to find extensive chromosomal rearrangements between major lineages. The ex …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The veiled chameleon (Chamaeleo calyptratus) is a typical member of the family Chamaeleonidae and a promising object for comparative cytogen … arker indicates that chromosome 5 may be the sex chromosome pair. One of the chromosome 5 conserved synteny blocks shares homology with the ancestral pleurodont X chromosome, assuming parallelism in the evolution of sex chromosomes from two basal Iguania clades (pleurodonts and acrodonts). The comparative chromosome map produced here can serve as the foun …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs (miRNAs) are short RNAs involved in gene regulation through translational inhibition and transcript cleavage. After processing from imperfect fold-back structures, miRNAs are incorporated into RNA-induced silencing complexes (RISCs) before targeting transcripts with varying degrees of complementarity. Some miRNAs are evolutionarily deep-rooted, and sequence complementarity with their targets is maintained through purifying selection. Both Arabidopsis and Capsella belong to the tribe Camelineae in the Brassicaceae, with Capsella rubella serving as an outgroup to the genus Arabidopsis.
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ability to form botulinum neurotoxin is restricted to six phylogenetically and physiologically distinct bacteria (Clostridium botulinum … up I) and non-proteolytic C. botulinum (C. botulinum Group II) are highly diverged and show neither synteny nor homology. It has also emerged that the botulinum neurotoxin-forming clostridia are not overtly pathogenic (unlike C. difficile), but saprophytic bacteria that use the neurotoxin to kill a host and create a source of nutrients. One important feat …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The conventional prolactin (PRL), also known as PRL1, is an adenohypophysial hormone that critically regulates various physiological events … p of cmPRL1 to known vertebrate PRL1s was confirmed by the analyses of molecular phylogeny and gene synteny. The cmPRL1 gene was similar to teleost PRL1 genes in gene synteny, but was distinct from amniote PRL1 genes, which most likely arose in an early amphibian by duplication of the ancestral PRL1 gene. The mRNA of cmPRL1 was predominantly expressed in …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genus Elaphe Fitzinger, a large species clade within Colubridae, comprises 18 non-venomous snake species. Among them, Elaphe taeniura se … s. Comparative analysis between the assembled genome and three other colubrid species revealed high synteny. In addition, several chromosomal fusion and fission events were observed. This reference genome provides a valuable resource for studying the taxonomy, conservation, and evolutionary history of the widely distributed Elaphe species.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Rickettsia genus comprises obligate intracellular bacteria transmitted by arthropods and responsible for clinically relevant zoonoses, r … ude genes related to genetic mobility, indicating possible acquisition through horizontal transfer. Synteny analysis demonstrated high gene conservation in R. typhi and extensive structural reorganization in R. rhipicephali. Statistical correlation reinforced the stability of the core genome regardless of pangenome expansion and revealed an inverse relati …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Endolichenic fungi represent an emerging source of bioactive secondary metabolites; however, the genomic basis of their chemical … s. Comparative genomics involved heatmap-based distribution analysis across the Cladosporium genus, synteny profiling using Clinker to assess gene order conservation, and Maximum Likelihood phylogenetic analysis of the polyketide synthase (T1PKS) domain. Results: We identified 26 putative BGCs, revealing a largely untapped metabolic repertoire. Comparativ …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The WFDC1 gene is frequently down-regulated or lost in prostate cancer, and the encoded protein, ps20, has been implicated in epithelial cel … stomes. The rate of evolutionary change within the coding regions of vertebrate WFDC1 genes and the synteny conservation in mammals differed from that of other vertebrate clades, indicating a possible functional diversity of ps20 homologues. A gene set enrichment analysis of the genes around WFDC1 (conserved synteny) showed functional relationships betwee …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The complete genome sequences available for eight species of Rickettsia and information for other near relatives in the Rickettsiales includ … Thailand patient isolate of Orientia tsutsugamushi. The Rickettsia genomes exhibit a high degree of synteny punctuated by distinctive chromosome inversions and consistent phylogenetic relationships regardless of whether protein coding sequences or RNA genes, concatenated open reading frames or gene regions, or whole genomes are used to construct phylogene …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования