A genomic locus was discovered within Brucella abortus that contains a novel transposon-like element designated Tn2020. Tn2020 is bounded by … Da transposase and its 22 kDa internal translation product shared significant similarity to several transposases from diverse bacterial hosts. Immediately 5' of Tn2020 are genes encoding ribosomal proteins RplU and RpmA. This region also contains a 90 bp sequence that shares significant homology to a repetitive element with inverted repeats from the Sinorhizob …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptomycetes are common soil inhabitants, yet few described species are plant pathogens. While the pathogenicity mechanisms remain unclear, previous work identified a gene, nec1, which encodes a putative pathogenicity or virulence factor. nec1 and a neighboring transposase pseudogene, ORFtnp, are conserved among unrelated plant pathogens and absent from nonpathogens. The atypical GC content of nec1 suggests that it was acquired through horizontal transfer events. Our investigation of the genetic organization of regions adjacent to the 3' end of nec1 in Streptomyces scabies 84.34 identified a
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Laribacter hongkongensis is associated with community-acquired gastroenteritis and traveler's diarrhea. In this study, we perfor … rug efflux (n = 54). It also contained eight prophages, 17 other phage-related CDSs and 26 CDSs for transposases.
CONCLUSIONS: The L. hongkongensis genome possessed genes for acid and bile resistance, intestinal mucosa colonization, evasion of host defense and cytotoxicity and invasion. A broad variety of antibiotic resistance or multidrug resistance genes, a …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We cloned a 9.4-kb DNA fragment from Streptomyces scabies ATCC 41973 that allows the nonpathogen Streptomyces lividans 66 TK24 to necrotize and colonize potato tuber slices and produce scab-like symptoms on potato minitubers. Deletion analysis demonstrated that activity was conferred by a 1.6-kb DNA region. Sequence analysis of a 2.4-kb DNA fragment spanning the DNA region necessary for activity revealed three open reading frames (ORFs). The deduced amino acid sequence of ORF1, designated ORFtnp, showed high levels of identity with the first 233 amino acids of the putative transposases of the …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) represents a significant global health threat, responsible for infections in … onally, these genomes also exhibited an extensive decay of prophages and the accumulation of pseudo-transposases.
CONCLUSIONS: The recurring patterns of the eukaryotic-associated loci strongly suggested genome data contamination across the genomes of the MRSA strains WH3018 and WH9628. These MRSA genomes likely underwent extensive prophage decay and an increa …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Rhabdochlamydiaceae family is one of the most widely distributed within the phylum Chlamydiae, but most of its members remain uncultivab … han other Chlamydia-related bacteria. Comparative analyses with other chlamydial genomes identified transposases of the PD-(D/E)XK nuclease family that are unique to this new genome. These transposases show evidence of interphylum horizontal gene transfers between multiple arthropod endosymbionts, including Cardinium spp. (Bacteroidetes) and diverse proteobact …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The RAG proteins required for V(D)J recombination of immunoglobulin and T-cell receptor genes in the acquired immune response contain a magnesium ion-binding site termed a DDE site, composed of D (aspartic acid) and E (glutamic acid) amino acids. A similar DDE-like magnesium binding site also is present in transposases, retroviral integrases, and the innate antiviral response enzymes RNAse H and RNA-induced silencing complex (RISC).
OBJECTIVE: To help clinicians understand immunodeficiency that results from deficiencies of RAG protein functions, such as severe combined immunodefic…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neisseria gonorrhoeae (the gonococcus) is an obligate human pathogen and the causative agent of the disease gonorrhea. The gonococcal pilus … e gonococcus with significant identity to the pilin inversion gene (piv) from Moraxella species and transposases of the IS110 family of insertion elements. These genes were candidates for a recombinase system involved in pilin antigenic variation. We have named these genes irg for invertase-related gene family. In this work, we characterize these genes and dem …
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three new strains of dissimilatory perchlorate-reducing bacteria (DPRB), QD19-16, QD1-5, and P3-1, were isolated from an active sludge. Phyl … 16, Acidovorax sp. QD1-5, and Citrobacter sp. P3-1 through horizontal gene transfer, facilitated by transposases. These results provided a direct evidence of horizontal gene transfer of PRI that could jump across phylogenetically unrelated bacteria through transposase. KEY POINTS: • Three new DPRB strains can effectively remove high concentration of perchlorat …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Klebsiella pneumoniae is a major global nosocomial pathogen, and strains acquiring extended-spectrum β-lactamase (ESBL) or carbap … et(A)v and blaNDM-1 genes were detected within the conjugative plasmid of the strain.
CONCLUSIONS: Transposases play a crucial role in the formation of complex multidrug-resistant K. pneumoniae strains. The findings of this study provide a novel perspective and critical evidence for elucidating the antimicrobial resistance mechanisms and dissemination pathway …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The development of robust nonviral vectors could facilitate clinical gene therapy applications and may overcome some of the immune complications of viral vectors. Nevertheless, most nonviral gene deliver approaches typically yield only transient and/or low gene expression. To address these caveats, we have explored piggyBac transposons to correct hemophilia B by liver-directed factor IX (FIX) gene therapy in hemophilic mice. To achieve this, we combined the use of: (i) a hyperactive codon-optimized piggyBac transposase, (ii) a computationally enhanced liver-specific promoter, (iii) a hyperfunc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer initiation and progression are intricately linked with abnormal epigenetic modifications. The detection of these epigenetic alterations throughout tumorigenesis is essential for early cancer diagnosis and effective treatment. Cleavage Under Targets and Tagmentation (CUT&Tag) is a relatively new method for profiling diverse chromatin components. Here, we describe the genome-wide profiling of histone modifications by CUT&Tag in cancer tissues. Lightly cross-linked nuclei are immobilized on beads and incubated with a specific primary antibody against histone modifications. Then a secondary
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A member of the Tc1 family of transposable elements has been identified in the Central and South American mosquito Anopheles albimanus. The full-length Quetzal element is 1680 base pairs (bp) in length, possesses 236 bp inverted terminal repeats (ITRs), and has a single open reading frame (ORF) with the potential of encoding a 341-amino-acid (aa) protein that is similar to the transposases of other members of the Tc1 family, particularly elements described from three different Drosophila species. The approximately 10-12 copies per genome of Quetzal are found in the euchromatin of all three chr…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transposons derived from Sleeping Beauty (SB), piggyBac (PB), or Tol2 typically require cotransfection of transposon DNA with a transposase … fficacy has gradually increased by codon optimization of the transposase, generation of hyperactive transposases, and/or introduction of specific mutations in the transposon terminal repeats. Their versatility enabled the stable genetic engineering in many different primary cell types, including stem/progenitor cells and differentiated cell types. This prompte …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding the minimal gene set required for cellular viability is a central goal in microbiology. A transposon mutagenesis protocol has been developed for use in Chlamydia to enable gene function analysis and reveal the essential genome. This method utilizes a self-replicating Himar-1 transposon delivery system, with a hyperactive transposase gene under inducible transcriptional and translational control, coupled with long-read nanopore sequencing to identify transposon insertion sites. In a step-by-step protocol, we describe how to prepare the transposon library by infecting cells with a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transposons, DNA sequences capable of relocating within the genome, make up a significant portion of eukaryotic genomes and are often found … existing ones, we observed gradual unfolding through loop extensions from a folded core. Including transposases as explicit particles, our model shows that adjacent transposon insertion occurs when densely packed chromatin excludes transposases or when insertion rates exceed the thermal equilibration rate of polymer configurations. We conclude that 1) dense c …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carbapenem-resistant Escherichia coli (CREC) poses a growing threat to public health, particularly when emerging from animal reservoirs such … enes associated with replication, repair, stress response, and mobile genetic elements (integrases, transposases, CRISPR-Cas) were also detected, indicating high genomic adaptability. Phenotypic testing revealed alarming resistance to key antimicrobials, including ampicillin (56.15%), amikacin (55.38%), ceftazidime (53.08%), and colistin (79.23%, including int …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Environmental surveillance of antibiotic resistance can contribute towards better understanding and management of human and envi … hromosome within two separate multidrug-resistance determining regions (MDRs), each flanked by IS26 transposases. MDR-1 carries blaTEM-1, tmrB, aac(3)-IId, aadA5, mph(A), mrx, sul1, qacEΔ1 and dfrA17; while MDR-2 harbors aph(3″)-Ib, aph(6)-Id, blaTEM-1, catA1, tet(D) and sul2. Four identical chromosomal copies of blaCTX-M-14 are located outside these regions, …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We evaluated real-time PCR assays for the detection of C. burnetii which targets sequences that are present either in one (icd) or in several copies (transposase of IS1111a) on the chromosome. The assays are highly sensitive, with reproducible detection limits of approximately 10 copies per reaction, at least 100 times more sensitive than capture ELISA, when performed on infected placenta material and specific for C. burnetii. The numbers of IS1111 elements in the genomes of 75 C. burnetii isolates were quantified by real-time PCR and proved to be highly variable.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An Escherichia coli strain isolated from the feces of swine at a pork slaughterhouse in Henan province China was found to possess two colist … ariable and stable regions were similar across different plasmids, multiple insertion sequences and transposases.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования