BACKGROUND/AIMS: Our aim was to explore the molecular mechanism underlying development of IgA nephropathy and discover candidate agents for IgA nephropathy.
METHODS: The differentially expressed genes (DEGs) between patients with IgA nephropathy and normal controls were identified by the data of GSE35488 downloaded from GEO (Gene Expression Omnibus) database. The co-expressed gene pairs among DEGs were screened to construct the gene-gene interaction network. Gene Ontology (GO) enrichment analysis was performed to analyze the functions of DEGs. The biologically active small molecules capable o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although oral submucous fibrosis (OSF) is the most common precancerous lesion of the oral cavity in Southeast Asia where the habit of betel quid (BQ) chewing is popular, its molecular biological properties are largely unknown. The aim of this study was to identify the genes responsible for its pathogenesis and malignant transformation using oligonucleotide microarray. The expression profiles of 14,500 genes in human oral submucous fibrosis and normal control were analyzed using Affymetrix U133A 2.0 GeneChip arrays. The results revealed that 716 genes were upregulated and 149 genes were downreg
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypoxic-ischemic brain injury (HIBD) causes neonatal death and serious neurological disability; however, there are currently no promising therapies for it excepting cooling. Therefore, in this study, we used peptidome analysis to identify differentially expressed peptides in cerebrospinal fluid (CSF) of neonates with HIBD or controls, which may give a foundation for finding new promising drugs of neonatal HIBD. CSF samples were collected from neonates with HIBD (n = 4) or controls (n = 4). ITRAQ LC-MS/MS was used to identify differentially expressed peptides between two groups. A total of 35 d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Primary Sjögren's syndrome (pSS) is a common chronic autoimmune disease characterized by a high prevalence of autoantibodies and lymphocyte-mediated exocrine gland damage. To enhance our understanding of the mechanisms underlying the progression of the disease and to discover potential biomarkers for the early diagnosis of pSS, we applied RNA sequencing to compare the gene expression patterns in minor salivary glands between pSS patients and non-pSS. A total of 293 differentially expressed genes (DEGs) were detected in pSS vs. non-pSS (FDR < 0.05, fold changes > 2). Of these DEGs, 285 (97.26%)
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coronary heart disease (CHD), idiopathic pulmonary arterial hypertension (IPAH) and pulmonary heart disease (PHD) are circulatory system diseases that may simultaneously emerge in a patient and they are often treated together in clinical practice. However, the molecular mechanisms connecting these three diseases remain unclear. In order to determine the multidimensional characteristic correlations between these three diseases based on genomic networks to aid in medical decision-making, genes from the Online Mendelian Inheritance in Man database were obtained, and applied network construction a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quercetin (QCT) and luteolin (LTL) are anticancer herbal compounds. However, their combined effects on colon cancer metastasis remain unknown. This study explored the effects and mechanisms of QCT and LTL against colon cancer metastasis using network pharmacology and experimental validation. We systematically screened 74 QCT and LTL targets from the TCMSP, HERB, SwissTargetPrediction, TCGA, and GeneCards databases, which intersected with colon cancer metastasis. Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) enrichment analysis were performed to investigate the biologica
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This dataset focuses on N6-Methyladenosine (m6A) RNA methylation in papillary thyroid carcinoma (PTC) without autoimmune thyroid disease (AITD). Emerging evidence suggests that m6A modification was associated with the occurrence and progression of both thyroid carcinoma and AITD. Given the substantial clinical overlap between thyroid carcinoma (particularly PTC) and AITD, rigorous exclusion of autoimmune confounding factors is essential to isolate the distinct role of m6A modifications in driving thyroid carcinogenesis and progression. Here, mRNA & lncRNA Epitranscriptomic Microarray technolog
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding gene function and pathways is a key goal in genomics. Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) provide frameworks to annotate genes based on their roles, cellular locations, and functions. These classifications help researchers analyze complex systems, identify drug targets, and investigate gene-disease connections. GO and KEGG annotations are central to enrichment analysis, which tests for overrepresented pathways in gene sets, often comparing disease to healthy states. Enrichment analysis methods include overrepresentation analysis (ORA) for gene li
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Chinese longsnout catfish (Leiocassis longirostris) is a commercially valuable freshwater species in China. We elucidated molecular mechanisms underlying testicular development of L. longirostris across five stages (stages I to V) through integrated transcriptomic and proteomic analyses, which is crucial for enhancing its sperm quality and efficient reproduction. Enrichment analyses identified several key pathways as essential for testicular development, including TGF-β signaling, Wnt signaling, ECM-receptor interaction, ferroptosis, cell cycle regulation, and ubiquitin-mediated proteolysi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dilated cardiomyopathy (DCM) is a leading cause of heart failure with a high mortality rate. Cardiac fibrosis plays a critical role in the progression of DCM, yet therapeutic strategies targeting fibrosis remain limited. Therefore, it is essential to investigate the underlying mechanisms of fibrosis in DCM. Our study demonstrates through the integration of weighted gene co-expression network analysis and gene ontology annotation that 35 biological processes, including cytokine production, were significantly associated with fibrosis in DCM. Protein-protein interaction analysis identified 82 cru
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sex as a biological variable is not a common consideration in molecular mechanistic or preclinical studies of retinal diseases. Understanding the sexual dimorphism of adult RPE and retina under physiological conditions is an important first step in improving our understanding of sex-based physio-pathological mechanisms.
METHODS: Isobaric tags for relative and absolute quantitation (iTRAQ) were used for quantitative proteomics of male and female mouse retina and RPE (10 mice of each sex for each tissue type). Differentially expressed proteins were subjected to Gene Ontology (GO) an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Although numerous neuroimaging studies have depicted neural alterations in individuals with obsessive-compulsive disorder (OCD), a psychiatric disorder characterized by intrusive cognitions and repetitive behaviors, the molecular mechanisms connecting brain structural changes and gene expression remain poorly understood.
METHODS: This study combined the Allen Human Brain Atlas dataset with neuroimaging data from the Meta-Analysis (ENIGMA) consortium and independent cohorts. Later, partial least squares regression and enrichment analysis were performed to probe the correlation betw
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To determine the differential expressions of long non-coding RNA (lncRNA) and messenger RNA (mRNA) in normal and asthenospermia (AS) men and analyze their biological significance in AS.
METHODS: We isolated and extracted total RNAs from 9 normal and 9 AS sperm samples, determined the expressions of RNAs in the sperm using the DNBSEQ sequencing platform, and analyzed their relevant functions by gene ontology enrichment (GO) and Kyoto encyclopedia of genes and genomes pathway (KEGG) analyses.
RESULTS: An average of 10.64G data was generated per group, with 282 185 RNAs detected, inc
Аннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii species complexes are the etiological agents of cryptococcosis, a disease responsible for 181 000 deaths annually worldwide due to late diagnosis and limited treatment options. Studies focusing on the identification of new substances with antifungal activity, such as essential oils (EOs), are urgently needed. While the antifungal effects of EO have already been suggested, their mechanism of action at the molecular level still requires evaluation. In this work, we assessed the molecular changes induced by the exposure of Cryptococus neoformans
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spermatogenesis is a complicated course of several rigorous restrained steps that spermatogonial stem cells undergo to develop into highly specialized spermatozoa; however, specific genes and signal pathways, which regulate the amplification, differentiation and maturation of these cells, remain unclear. We performed bioinformatics analyses to investigate the dynamic changes of the gene expression patterns at three time points in the course of the first wave of rat spermatogenesis. Differently expressed genes (DEGs) were identified, and the features of DEGs were further analyzed with GO (Gene
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aflatoxin B1 (AFB1) and ochratoxin A (OTA) are typical contaminants of food and feed, which have serious implications for human and animal health, even at low concentrations. Therefore, a transcriptomic study was carried out to analyze gene expression changes triggered by low doses of AFB1 and OTA (100 nM; 7 days), individually and combined, in human lymphoblastic T cells. RNA-sequencing analysis showed that AFB1-exposure resulted in 99 differential gene expressions (DEGs), while 77 DEGs were obtained in OTA-exposure and 3236 DEGs in the combined one. Overall, 16% of human genome expression wa
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: N6-methyl adenosine (m6A) is the most common reversible mRNA modification in eukaryotes implicated in key roles in various biological processes. The purpose of our analysis was to examine the association of ankylosing spondylitis (AS) with m6A methylation.
METHOD: We obtained 72 samples from the data set GSE73754, including 52 AS patients and 20 healthy people. We divided the samples into two groups: the experimental group and the control group, and then observed the differences of 26 m6A related genes in the two groups. We also analyzed the correlation between different m6A genes
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exosomes mediate inflammation and immune responses. The aim of the study was to examine the expression profiles of plasma exosomal microRNAs (miRNAs) and analyze their target gene functions in participants with chronic rhinosinusitis with nasal polyps (CRSwNP). We measured plasma exosomal miRNAs in five patients with CRSwNP and five controls. Transcripts per million (TPM) was used to assess miRNAs expression and the Benjamini-Hochberg procedure was employed for multiple comparisons correction. Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) and Gene ontology (GO) analyses revealed biological an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gasotransmitter hydrogen sulfide (H2S) produced by the transsulfuration pathway (TSP) is an important biological mediator, involved in many physiological and pathological processes in multiple higher organisms, including humans. Cystathionine-β-synthase (CBS) and cystathionine-γ-lyase (CSE) enzymes play a central role in H2S production and metabolism. Here, we investigated the role of H2S in learning and memory processes by exploring several Drosophila melanogaster strains with single and double deletions of CBS and CSE developed by the CRISPR/Cas9 technique. We monitored the learning and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypoxia is one of the most important predisposing conditions for Peyronie's disease (PD) and the pathogenetic mechanism is yet to be completely elucidated. This study applied bioinformatic approaches to select candidate hypoxia-related genes involved in the pathogenesis of PD. The Gene Expression Omnibus (GEO) data set GSE146500 was introduced to compare the transcriptional profiling between normal and PD samples. The differential expression of hypoxia-related gene was determined with R software. On the selected candidate genes, further functional analyses were applied, including protein-prote
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования