The antioxidant activity of molecules constitutes an important factor for the regulation of redox homeostasis and reduction of the oxidative stress. Cells affected by oxidative stress can undergo genetic alteration, causing structural changes and promoting the onset of chronic diseases, such as cancer. We have performed an in silico study to evaluate the antioxidant potential of two molecules of the zinc database: ZINC08706191 (Z91) and ZINC08992920 (Z20). Molecular docking, quantum chemical calculations (HF/6-31G**) and Pearson's correlation have been performed. Molecular docking results of Z
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Melanin is the main pigment responsible for the color of human skin, hair and eye. Its biosynthesis requires three melanogenic enzymes, tyrosinase (TYR), and the tyrosinase-related proteins TYRP1 and TYRP2. The difficulty of isolating pure and homogeneous proteins from endogenous sources has hampered their study, and resulted in many contradictory findings regarding their physiological functions. In this review, we summarize recent advances on the structure and function of TYR and TYRPs by virtue of the crystal structure of human TYRP1, which is the first available structure of a mammalian mel
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Gram-negative, rod-shaped bacterium Aeromonas hydrophila has two multifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase (MTAN) enzymes, MtaN-1 and MtaN-2, that differ from those in other bacteria. These proteins are essential for several metabolic pathways, including biological methylation, polyamine biosynthesis, methionine recycling, and bacterial quorum sensing. To gain insight into how these two proteins function, we determined four high-resolution crystal structures of MtaN-1 in its apo form and in complex with the substrates S-adenosyl-l-homocysteine, 5'-methylthi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Natowicz syndrome (mucopolysaccharidoses type 9) is a lysosomal storage disorder caused by deficient or defective human hyaluronidase 1. The disorder is not well studied at the molecular level. Therefore, a new in silico approach was proposed to study the molecular basis on which one clinically observed mutation, Glu268Lys, results in a defective enzyme. The native and mutant structures were subjected to comparative analyses using a conformational sampling approach for geometrical variables viz, RMSF, RMSD, and Ramachandran plot. In addition, the strength of a Cys207-Cys221 disulfide bond and
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cyclophilins catalyze cis ↔ trans isomerization of peptidyl-prolyl bonds, influencing protein folding along with a breadth of other biological functions such as signal transduction. Here, we have determined the microscopic rate constants defining the full enzymatic cycle for three human cyclophilins and a more distantly related thermophilic bacterial cyclophilin when catalyzing interconversion of a biologically representative peptide substrate. The cyclophilins studied here exhibit variability in on-enzyme interconversion as well as an up to 2-fold range in rates of substrate binding and relea
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Halohydrin hydrogen-halide-lyase (H-Lyase) is a bacterial enzyme that is involved in the degradation of halohydrins. This enzyme catalyzes the intramolecular nucleophilic displacement of a halogen by a vicinal hydroxyl group in halohydrins to produce the corresponding epoxides. The epoxide products are subsequently hydrolyzed by an epoxide hydrolase, yielding the corresponding 1, 2-diol. Until now, six different H-Lyases have been studied. These H-Lyases are grouped into three subtypes (A, B, and C) based on amino acid sequence similarities and exhibit different enantioselectivity. Corynebacte
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Xanthine oxidoreductase (XOR), which is widely distributed from humans to bacteria, has a key role in purine catabolism, catalyzing two steps of sequential hydroxylation from hypoxanthine to xanthine and from xanthine to urate at its molybdenum cofactor (Moco). Human XOR is considered to be a target of drugs not only for therapy of hyperuricemia and gout, but also potentially for a wide variety of other diseases. In this review, we focus on studies of XOR inhibitors and their implications for understanding the chemical nature and reaction mechanism of the Moco active site of XOR. We also discu
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multisubunit RNA polymerase, an enzyme that accomplishes transcription in all living organisms, is a potent target for antibiotics. The antibiotic streptolydigin inhibits RNA polymerase by sequestering the active center in a catalytically inactive conformation. Here, we show that binding of streptolydigin to RNA polymerase strictly depends on a noncatalytic magnesium ion which is likely chelated by the aspartate of the bridge helix of the active center. Substitutions of this aspartate may explain different sensitivities of bacterial RNA polymerases to streptolydigin. These results provide the
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Matrix metalloproteinases (MMPs) play a critical role in physiological processes and pathological conditions such tumor invasion and metastasis. In recent years, a number of MMP inhibitors have been proposed, including the chemically modified tetracyclines (CMTs), which have been evaluated in preclinical cancer models showing promising results. This work provides insights into the structure and dynamics of the MMP-2 catalytic domain complexed with seven CMT (CMT-n), based on the analysis of molecular dynamics trajectories in solution. The comparative analysis of various relevant molecular aspe…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metals are present in about one-half of the protein structures available and also have critical roles in nucleic acid biochemistry. This prologue introduces the fourth of the Thematic Minireview Series on Metals in Biology, which deals with several topics involving iron, manganese, copper, and other metals. The six minireviews discuss metal transport and intracellular homeostasis, including chaperones and siderophores, maturation of the diiron active sites in hydrogenases, the balance between manganese and iron, and copper homeostasis relevant to pathogens.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heme oxygenase (HO) cleaves hemin into biliverdin, iron, and CO. For mammalian HOs, both native hemin propionates are required for substrate binding and activity. The HO from the pathogenic bacterium Neisseria meningitidis (NmHO) possesses a crystallographically undetected C-terminal fragment that by solution (1)H nuclear magnetic resonance (NMR) is found to fold and interact with the active site. One of the substrate propionates has been proposed to form a salt bridge to the C-terminus rather than to the conventional buried cationic side chain in other HOs. Moreover, the C-terminal dipeptide
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein arginine methyltransferases (PRMTs) catalyze the transfer of methyl groups from S-adenosylmethionine (SAM) to the guanidinium group of arginine residues in a number of important cell signaling proteins. PRMT1 is the founding member of this family, and its activity appears to be dysregulated in heart disease and cancer. To begin to characterize the catalytic mechanism of this isozyme, we assessed the effects of mutating a number of highly conserved active site residues (i.e., Y39, R54, E100, E144, E153, M155, and H293), which are believed to play key roles in SAM recognition, substrate
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HNO can interact with numerous heme proteins, but atomic level structures are largely unknown. In this work, various structural models for the first stable HNO heme protein complex, MbHNO (Mb, myoglobin), were examined by quantum chemical calculations. This investigation led to the discovery of two novel structural models that can excellently reproduce numerous experimental spectroscopic properties. They are also the first atomic level structures that can account for the experimentally observed high stabilities. These two models involve two distal His conformations as reported previously for M
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryptosporidium parvum is one of several Cryptosporidium spp. that cause the parasitic infection cryptosporidiosis. Cryptosporidiosis is a diarrheal infection that is spread via the fecal-oral route and is commonly caused by contaminated drinking water. Triosephosphate isomerase is an enzyme that is ubiquitous to all organisms that perform glycolysis. Triosephosphate isomerase catalyzes the formation of glyceraldehyde 3-phosphate from dihydroxyacetone phosphate, which is a critical step to ensure the maximum ATP production per glucose molecule. In this paper, the 1.55 Å resolution crystal stru
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Treatment of latent tuberculosis infection remains an important goal of global TB eradication. To this end, targets that are essential for intracellular survival of Mycobacterium tuberculosis are particularly attractive. Arylamine N-acetyltransferase (NAT) represents such a target as it is, along with the enzymes encoded by the associated gene cluster, essential for mycobacterial survival inside macrophages and involved in cholesterol degradation. Cholesterol is likely to be the fuel for M. tuberculosis inside macrophages. Deleting the nat gene and inhibiting the NAT enzyme prevents survival o
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carbapenem-hydrolyzing class D beta-lactamases (CHDLs) are enzymes found in important Gram-negative pathogens (mainly Acinetobacter baumannii and Enterobacteriaceae) that confer resistance to beta-lactam antibiotics, and notably carbapenems. The crystal structure of the OXA-48 carbapenemase was determined at pH 7.5 and at a resolution of 1.9 A. Surprisingly, and by contrast with OXA-24, the only other CHDL of known crystal structure, the structure of OXA-48 was similar to OXA-10, an enzyme devoid of carbapenemase activity, indicating that the hydrolysis of these compounds could depend on subtl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The crystal structure of human carbonic anhydrase II (CA II) complexed with the inhibitor acetazolamide (AZM) has been determined at 1.1 A resolution and refined to an R(cryst) of 11.2% and an R(free) of 14.7%. As observed in previous CA II-inhibitor complexes, AZM binds directly to the zinc and makes several key interactions with active-site residues. The high-resolution data also showed a glycerol molecule adjacent to the AZM in the active site and two additional AZMs that are adventitiously bound on the surface of the enzyme. The co-binding of AZM and glycerol in the active site demonstrate
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acutolysin A, which is isolated from the snake venom of Agkistrodon acutus, is a member of the SVMPs subfamily of the metzincin family, and it is a snake venom zinc metalloproteinase possessing only one catalytic domain. The catalytic zinc ion, in the active site, is coordinated in a tetrahedral manner with three imidazole nitrogen atoms of histidine and one oxygen atom. It is uncertain whether this oxygen atom is a water molecule or a hydroxide ion just from the three-dimensional X-ray crystal structure. The identity of the fourth ligand of zinc is theoretically determined for the first time …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We characterized the catalytic subunit of phosphatidylinositol 3-kinase in Aedes aegypti (Aaegp110). Aaegp110 is an essential component of the insulin/ insulin growth factor I signaling (IIS) cascade, which regulates aging, reproduction, and other physiological processes in diverse organisms. The Aaegp110 gene encodes five putative domains (adapter binding, ras binding, C2, helical, and PI3-kinase) identified by sequence homology with other p110 proteins. Aaegp110 transcript was expressed during all A. aegypti life stages except late pupae, with particularly high levels in embryos. In female t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Individuals harboring germ-line DICER1 mutations are predisposed to a rare cancer syndrome, the DICER1 Syndrome or pleuropulmonary blastoma-familial tumor and dysplasia syndrome [online Mendelian inheritance in man (OMIM) #601200]. In addition, specific somatic mutations in the DICER1 RNase III catalytic domain have been identified in several DICER1-associated tumor types. Pituitary blastoma (PitB) was identified as a distinct entity in 2008, and is a very rare, potentially lethal early childhood tumor of the pituitary gland. Since the discovery by our team of an inherited mutation in DICER1 i…
Клинический случайСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования