We present a comprehensive analysis of the submissions to the first edition of the Endoscopy Artefact Detection challenge (EAD). Using crowd-sourcing, this initiative is a step towards understanding the limitations of existing state-of-the-art computer vision methods applied to endoscopy and promoting the development of new approaches suitable for clinical translation. Endoscopy is a routine imaging technique for the detection, diagnosis and treatment of diseases in hollow-organs; the esophagus, stomach, colon, uterus and the bladder. However the nature of these organs prevent imaged tissues t
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We examined whether automated visual evaluation (AVE), a deep learning computer application for cervical cancer screening, can be used on cervix images taken by a contemporary smartphone camera. A large number of cervix images acquired by the commercial MobileODT EVA system were filtered for acceptable visual quality and then 7587 filtered images from 3221 women were annotated by a group of gynecologic oncologists (so the gold standard is an expert impression, not histopathology). We tested and analyzed on multiple random splits of the images using two deep learning, object detection networks.
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell-type specific gene expression profiles are needed for many computational methods operating on bulk RNA-Seq samples, such as deconvolution of cell-type fractions and digital cytometry. However, the gene expression profile of a cell type can vary substantially due to both technical factors and biological differences in cell state and surroundings, reducing the efficacy of such methods. Here, we investigated which factors contribute most to this variation. We evaluated different normalization methods, quantified the variance explained by different factors, evaluated the effect on deconvoluti
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Little is known about the risk for overdose after opioid prescription. We assessed associations between the type of opioid, quantity dispensed, daily dose, and risk for overdose among adolescents who were previously opioid naive.
METHODS: Retrospective analysis of 1 146 412 privately insured adolescents ages 11 to 17 years in the United States captured in the Truven MarketScan commercial claims data set from January 2007 to September 2015. Opioid overdose was defined as any emergency department visit, inpatient hospitalization, or outpatient health care visit during which opioid o
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The development of chromosomal conformation capture techniques, particularly, the Hi-C technique, has made the analysis and study of the spatial conformation of a genome an important topic in bioinformatics and computational biology. Aided by high-throughput next generation sequencing techniques, the Hi-C technique can generate genome-wide, large-scale intra- and inter-chromosomal interaction data capable of describing in details the spatial interactions within a genome. These data can be used to reconstruct 3D structures of chromosomes that can be used to study DNA replication, ge
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Progression from anorectal abscess to fistula is poorly described and it remains unclear which patients develop a fistula following an abscess. The aim was to assess the burden of anorectal abscess and to identify risk factors for subsequent fistula formation.
METHODS: The Hospital Episode Statistics database was used to identify all patients presenting with new anorectal abscesses. Cox regression analysis was undertaken to identify factors predictive of fistula formation.
RESULTS: A total of 165 536 patients were identified in the database as having attended a hospital in Englan
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Soft tissue artefact (STA) represents one of the main obstacles for obtaining accurate and reliable skeletal kinematics from motion capture. Many studies have addressed this issue, yet there is no consensus on the best available bone pose estimator and the expected errors associated with relevant results. Furthermore, results obtained by different authors are difficult to compare due to the high variability and specificity of the phenomenon and the different metrics used to represent these data. Therefore, the aim of this study was twofold: firstly, to propose standards for description of STA;
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A cell line representative of human high-grade serous ovarian cancer (HGSOC) should not only resemble its tumour of origin at the molecular level, but also demonstrate functional utility in pre-clinical investigations. Here, we report the integrated proteomic analysis of 26 ovarian cancer cell lines, HGSOC tumours, immortalized ovarian surface epithelial cells and fallopian tube epithelial cells via a single-run mass spectrometric workflow. The in-depth quantification of >10,000 proteins results in three distinct cell line categories: epithelial (group I), clear cell (group II) and mesenchymal
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Keratoconus is a progressive corneal disease with thinning and scarring of the cornea. Diagnostic and treatment options are usually evaluated in large prospective or retrospective trials. Big data and smart data provide the possibility to analyze routine data for clinical research. In this article we report the generation of a monocentric keratoconus registry by means of computerized data analysis of routine data. This demonstrates the potential of clinical research by means of routine data.
METHODS: A "clinical data warehouse" was created from all available routine electronic dat
DatasetСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background and aims In many jurisdictions, where gambling services are provided, regulatory codes require gambling operators to apply a duty of care toward patrons. A common feature of these provisions is some expectation that venue staff identify and assist patrons who might be experiencing problems with their gambling. The effectiveness of such measures is, however, predicated on the assumption that there are reliable and observable indicators that might be used to allow problem gamblers to be distinguished from other gamblers. Methods In this study, we consolidate the findings from two larg
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ability of drugs to induce phospholipidosis (PLD) is linked directly to their molecular substructures: hydrophobic, cyclic moieties with hydrophilic, peripheral amine groups. These structural properties can be captured and coded into SMILES arbitrary target specification (SMARTS) patterns. Such structural alerts, which are capable of identifying potential PLD inducers, should ideally be developed on a relatively large but reliable data set. We had previously developed a model based on SMARTS patterns consisting of 32 structural fragments using information from 450 chemicals. In the present
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We studied the effects in rats of a 6-day intracerebroventricular (i.c.v) infusion of four different end-capped phosphorothioate-modified antisense oligonucleotides (AOs), specifically targeting different regions of the 5-hydroxytryptamine2A (5-HT2A) receptor mRNA, on central 5-HT2A receptor expression and 5-HT2A receptor-mediated behaviours. Only one of the AOs (sequence 4), directed against the 5'-untranslated region (from + 557 to + 577), specifically affected central 5-HT2A receptor expression and receptor-mediated behaviour. This AO (sequence 4) reduced binding of the 5-HT2A agonist 1-(2,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Emerging evidence has suggested that the tumor microenvironment, including immune infiltration, plays a crucially important role in tumor progression. Nevertheless, limited studies have been conducted on this topic in adrenocortical carcinoma. The present study aimed to explore the immune-related biomarkers in adrenocortical carcinoma. CIBERSORT was used to estimate the abundances of 22 kinds of immune cells, and univariable Cox analysis was performed to find survival-related immune cells with both Overall Survival (OS) and Progression-Free Interval (PFI). DESeq2 was applied to find differenti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: This article aims to analyze the scientific literature on hearing loss (HL) in the field of Otorhinolaryngology published from the past to the present.
METHODS: A comprehensive dataset comprising 8013 articles on HL, spanning from 1980 to 2023, was retrieved from the Web of Science database and analyzed using various statistical and bibliometric methods.
RESULTS: The leading countries in productivity were the United States, Japan, and Germany. The top productive journals included the International Journal of Pediatric Otorhinolaryngology (n = 652), Otology & Neurotology (579), an
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Sustainability is a prominent topic in modern-day society, with a trend toward reducing environmental impact. The growing amount of plastics and the release of greenhouse gases during waste management raise concerns. This study compares the environmental burden of clear aligners- and self-ligating metal brackets (fixed appliances) to identify the production phase where improvements could best reduce impact.
METHODS: A simplified fast-track life cycle impact assessment (LCIA) was performed for four illustrative patient cases (two aligner, two fixed appliances). Data were derived fro
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The role of particulate matter (PM) on genetic susceptibility to inflammatory bowel disease (IBD) is a controversial topic. The study aims to evaluate the causal effect of PM on IBD using Mendelian randomization (MR). PM and IBD datasets were screened for common single nucleotide polymorphisms (SNPs) based on the MR basic assumptions. Subsequently, the effect of these SNPs on genetic susceptibility to IBD was analyzed using inverse variance weighted. Finally, the heterogeneity and robustness of the results were assessed using Cochran's Q and leave-one-out sensitivity analysis, respectively. MR
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding the behavior of populations of drug consumers has been and remains a topic of keen interest. Using a unique dataset on 25 districts from Bengal, India, from 1911 to 1925, we analyze whether populations of consumers treat alcohol, cannabis, and opium as economic substitutes or complements in a legal regime. Additionally, we examine responsiveness to prices and income. Our analysis has three main findings. First, we find evidence of substitution between alcohol and cannabis bud. Second, cannabis leaf is a complement for alcohol but a substitute for cannabis bud. Third, we find nega
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This chapter presents a practical guide for conducting sentiment analysis using Natural Language Processing (NLP) techniques in the domain of tick-borne disease text. The aim is to demonstrate the process of how the presence of bias in the discourse surrounding chronic manifestations of the disease can be evaluated. The goal is to use a dataset of 5643 abstracts collected from scientific journals on the topic of chronic Lyme disease to demonstrate using Python, the steps for conducting sentiment analysis using pretrained language models and the process of validating the preliminary results usi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hypertension is one of the major risk factors for cardiovascular diseases. Research on the patient classification of hypertension has become an important topic because Traditional Chinese Medicine lies primarily in "treatment based on syndromes differentiation of the patients".
METHODS: Clinical data of hypertension was collected with 12 syndromes and 129 symptoms including inspection, tongue, inquiry, and palpation symptoms. Syndromes differentiation was modeled as a patient classification problem in the field of data mining, and a new multi-label learning model BrSmoteSvm was bu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.