The unfolded protein response (UPR) is a conserved stress-signaling pathway activated after accumulation of unfolded proteins within the endoplasmic reticulum (ER). Active UPR signaling leads to unconventional, enzymatic splicing of XBP1 mRNA enabling expression of the transcription factor XBP1s to control ER homeostasis. While IRE1 has been identified as the endoribonuclease required for cleavage of this mRNA, the corresponding ligase in mammalian cells has remained elusive. Here, we report that RTCB, the catalytic subunit of the tRNA ligase complex, and its co-factor archease mediate XBP1 mR
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TGF-β regulates pleiotropic cellular responses including cell growth, differentiation, migration, apoptosis, extracellular matrix production, and many other biological processes. Although non-Smad signaling pathways are being increasingly reported to play many roles in TGF-β-mediated biological processes, Smads, especially receptor-regulated Smads (R-Smads), still play a central mediatory role in TGF-β signaling for epithelial-mesenchymal transition. Thus, the biological activities of R-Smads are tightly regulated at multiple points. Inhibitory Smad (I-Smad also called Smad7) acts as a critica
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The four R-spondin (Rspo) proteins are secreted agonists of Wnt signalling in vertebrates, functioning in embryogenesis and adult stem cell biology. Through ubiquitination and degradation of Wnt receptors, the transmembrane E3 ubiquitin ligase ZNRF3 and related RNF43 antagonize Wnt signalling. Rspo ligands have been reported to inhibit the ligase activity through direct interaction with ZNRF3 and RNF43. Here we report multiple crystal structures of the ZNRF3 ectodomain (ZNRF3(ecto)), a signalling-competent Furin1-Furin2 (Fu1-Fu2) fragment of Rspo2 (Rspo2(Fu1-Fu2)), and Rspo2(Fu1-Fu2) in comple
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ubiquitin-proteolytic system controls the stability of proteins in space and time. In this study, using a temperature-sensitive mutant allele of the cul-2 gene, we show that CRL2(LRR-1) (CUL-2 RING E3 ubiquitin-ligase and the Leucine Rich Repeat 1 substrate recognition subunit) acts at multiple levels to control germline development. CRL2(LRR-1) promotes germ cell proliferation by counteracting the DNA replication ATL-1 checkpoint pathway. CRL2(LRR-1) also participates in the mitotic proliferation/meiotic entry decision, presumably controlling the stability of meiotic promoting factors in
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: p53 is a transcription factor that plays an important role in preventing cancer development. p53 participates in relevant aspects of cell biology, including apoptosis and cell cycle control and must be strictly regulated to maintain normal tissue homeostasis. p53 E3 ubiquitin protein ligase homolog (Mdm2) is an important negative regulator of p53. The purpose of this study was to determine if Mdm2 regulates p53 in vivo in the adult lens.
METHODS: We analyzed mice expressing human p53 transgene (Tgp53) selectively in the lens in the presence or absence of Mdm2. Mice with the required
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The components in plant signal transduction pathways are intertwined and affect each other to coordinate plant growth, development, and defenses to stresses. The role of ubiquitination in connecting these pathways, particularly plant innate immunity and flowering, is largely unknown. Here, we report the dual roles for the Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) Plant U-box protein13 (PUB13) in defense and flowering time control. In vitro ubiquitination assays indicated that PUB13 is an active E3 ubiquitin ligase and that the intact U-box domain is required for the E3 ligase activity. Disruption of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Receptor-like tyrosine kinase (RYK) functions as a transmembrane receptor for the Wnt family of secreted protein ligands. Although RYK undergoes endocytosis in response to Wnt, the mechanisms that regulate its internalization and concomitant activation of Wnt signaling are unknown. We discovered that RYK both physically and functionally interacts with the E3 ubiquitin ligase Mindbomb 1 (MIB1). Overexpression of MIB1 promotes the ubiquitination of RYK and reduces its steady-state levels at the plasma membrane. Moreover, we show that MIB1 is sufficient to activate Wnt/β-catenin (CTNNB1) signalin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Maintaining genomic integrity is critical to avoid life-threatening disorders, such as premature aging, neurodegeneration and cancer. A multiprotein cascade operates at sites of DNA double-strand breaks (DSBs) to recognize, signal and repair damage. RNF168 (ring-finger nuclear factor) contributes to this emerging pathway of several E3 ubiquitin ligases that perform sequential ubiquitylations on damaged chromosomes, chromatin modifications essential for aggregation of repair complexes at the DSB sites. Here, we report the clinical and cellular phenotypes associated with a newly identified homoz…
Клинический случайСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Approximately 90% of cases of Lafora disease, a fatal teenage-onset progressive myoclonus epilepsy, are caused by mutations in either the EPM2A or the EPM2B genes that encode, respectively, a glycogen phosphatase called laforin and an E3 ubiquitin ligase called malin. Lafora disease is characterized by the formation of Lafora bodies, insoluble deposits containing poorly branched glycogen or polyglucosan, in many tissues including skeletal muscle, liver, and brain. Disruption of the Epm2b gene in mice resulted in viable animals that, by 3 months of age, accumulated Lafora bodies in the brain an
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multi drug resistance capacity for Mycobacterium tuberculosis (MDR-Mtb) demands the profound need for developing new anti-tuberculosis drugs. The present work is on Mtb-MurC ligase, which is an enzyme involved in biosynthesis of peptidoglycan, a component of Mtb cell wall. In this paper the 3-D structure of Mtb-MurC has been constructed using the templates 1GQQ and 1P31. Structural refinement and energy minimization of the predicted Mtb-MurC ligase model has been carried out by molecular dynamics. The streochemical check failures in the energy minimized model have been evaluated through Proche
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
D-Alanine-D-alanine ligase (DDl) is an essential enzyme in bacterial cell wall biosynthesis and an important target for developing new antibiotics. Here, we describe a new approach to identify new inhibitor scaffolds for DDl based on similarity in the ATP binding region of different kinases and DDl. After an initial screening of several protein kinase inhibitors, we found that the Brutons's tyrosine kinase inhibitor LFM-A13, an analog of the Leflunomide metabolite A771726, inhibits DDl with a K(i) of 185 microM. A series of malononitrilamide and salicylamide derivatives of LFM-A13 has been syn
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ubiquitination affects various immune processes and E3 ubiquitin ligases (E3) play an important role in determining substrate specificity. We identified 11 human E3 ligase genes of potential importance in pathogenesis of autoimmune diseases by search of public databases and screened them for candidacy of biological investigation with case-control linkage disequilibrium tests on multiple SNPs in the genes using rheumatoid arthritis (RA) as a model of autoimmune diseases. Significant association with RA was observed in an SNP in intron 3 of Cullin 1 (CUL1) that affected transcriptional efficienc…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reduced levels of p27(Kip1) are frequent in human cancers and have been associated with poor prognosis. Skp2, a component of the Skp1-Cul1-F-box protein (SCF) ubiquitin ligase complex, has been implicated in p27(Kip1) degradation. Increased Skp2 levels are seen in some solid tumors and are associated with reduced p27(Kip1). We examined the expression of these proteins using single and double immunolabeling in a large series of lymphomas to determine if alterations in their relative levels are associated with changes in cell proliferation and lymphoma subgroups. We studied the expression of Skp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In 264 genitourinary medicine clinic attenders reporting recent fellatio, the prevalence of pharyngeal Chlamydia trachomatis determined by an expanded standard including cell culture and two in-house PCR tests was 1.5% in 194 women and zero in 70 men. The ligase chain reaction (Abbott LCx) had a specificity of 99.2% and a positive predictive value of 60%.
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increased sensitivities of nucleic acid amplification tests such as ligase chain reaction (LCR) have the potential to simplify specimen collection for gonorrhea diagnosis. In this study patients took their own vaginal swab specimens for gonorrhea culture and LCR testing. Immediately following specimen collection by patients, a trained clinician obtained endocervical swab specimens for the same tests. By using LCR to diagnose gonorrhea, 54 (17.5%) of 309 patients had positive tests. Forty-five patients with positive cervical LCR tests also had positive vaginal LCR tests; for one patient, on
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To understand the possible role of phytanoyl-CoA ligase, present in the membrane, in the oxidation of phytanic acid in the matrix of peroxisomes (Pahan, K. and I. Singh. 1993. FEBS Lett. 333: 154-158) we examined the transport of phytanic acid/phytanoyl-CoA into peroxisomes and the topology of the active site of phytanoyl-CoA ligase in the peroxisomal membrane. The increase in lignoceroyl-CoA ligase as compared to no change in the activities of palmitoyl-CoA and phytanoyl-CoA ligases when peroxisomes were disrupted with detergent or sonication and inhibition of the activities of both palmitoyl…
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intercellular communication via gap junctions is often lost during cancer development, which may contribute to increased tumor growth and affect how cancer cells respond to radio- and chemotherapy. Gap junction channels comprise transmembrane proteins belonging to the connexin family, of which connexin43 (Cx43) is the most ubiquitously expressed in humans. SMAD ubiquitination regulatory factor 2 (SMURF2), a member of the neural precursor cell expressed developmentally down-regulated protein 4 (NEDD4) family of E3 ubiquitin ligases, often accumulates in the cytoplasm in cancer cells, where it m…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Iron is an essential micronutrient for living organisms, but its solubility is extremely low under alkaline conditions. Plants often suffer … provement of iron deficiency tolerance and grain iron accumulation by knocking-down OsHRZ ubiquitin ligases, which negatively regulate iron deficiency response and iron accumulation in rice. In the present report, we aimed to further improve the iron deficiency tolerance and grain iron accumulation of OsHRZ knockdown rice by the simultaneous introduction …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ubiquitination is a crucial post-translational modification, whose functional diversity is largely determined by the structures of ubiquitin (Ub) chains. The specific interaction between E3 ubiquitin ligases and substrates (ESIs) precisely regulates Ub chain assembly, directing substrates toward different fates like degradation or signaling. In 2022, we released UbiBrowser 2.0, containing known/predicted ESIs and deubiquitinase-substrate interactions from 39 species. To address the urgent need for in-depth analysis of Ub chain functions, we updated UbiBrowser to v3.0 (http://ubibrowser.ncpsb.o…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The innate immune response serves as the first line of host defense against pathogenic infections, and its precise regulation is critical for maintaining immune homeostasis. Fanconi Anemia complementation group L (Fancl) is an E3 ubiquitin ligase that plays an essential role in zebrafish ovarian differentiation, but whether it is involved in innate immunity remains elusive. Here, we investigate the function of fancl in antiviral innate immunity using zebrafish model. We found that fancl was induced upon spring viremia of carp virus (SVCV) infection. Overexpression of fancl in cells suppressed
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования