INTRODUCTION: Human adenovirus infections are typically associated with acute respiratory infection, keratoconjunctivitis, acute cystitis, hepatitis, and gastroenteritis, while central nervous system (CNS) related infections are rarely reported.
METHODS: In this study, a novel human adenovirus was identified in the cerebrospinal fluid from an encephalitis patient with X-linked agammaglobulinemia via metagenomic next-generation sequencing (mNGS). Probe capture enrichment sequencing and PCR validation further confirmed the presence of this adenovirus in the patient's cerebrospinal fluid.
RESUL
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TT-virus (TTV, patient initials: T.T.), a novel DNA virus, was first isolated in Japan in 1997 from serum of a patient with post-transfusion hepatitis of unknown aetiology. To date, the contribution of TTV to liver disease remains doubtful. The potential for transmission via blood and blood products makes it essential to establish the prevalence of TTV viraemia in the blood donor population. 413 blood donor serum samples were chosen randomly, the DNA was extracted and TTV-specific DNA amplified by nested polymerase chain reaction (PCR). TTV infection was present in 13 out of 413 (3.15%) blood
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The capripoxviruses comprise three species: goatpox virus (GTPV), sheeppox virus (SPPV) and lumpy skin disease virus (LSDV). They are large double-stranded DNA viruses with highly conserved core genomes and variable terminal regions. Previous studies have described variation in Capripoxvirus gene content, their broader population structure and the contribution of non-coding and structural variation remains opaque. This study investigated the genomic diversity and evolutionary history of GTPV and SPPV using phylogenetics, pangenome variation graphs (PVGs), and gene-specific analyses. We found c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Goose astrovirus genotype 1 (GAstV-1) has emerged in goose farms in some provinces of China in recent years and is considered to be one of the pathogens of gout in goslings in China. However, few studies have been conducted on the dynamic distribution, tissue tropism, and pathogenesis of GAstV-1 in goslings. In 2022, an epidemiological investigation of goose astrovirus (GAstV) in goslings was conducted in seven provinces of China. During the investigation, a GAstV-1 designated as GAstV-JSXZ was identified in the kidney of an 8-day-old gosling and was successfully isolated from a goose embryo.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: SARS-CoV-2 is a recently emerged respiratory pathogen that has significantly impacted global human health. We wanted to rapidly characterise the transcriptomic, proteomic and phosphoproteomic landscape of this novel coronavirus to provide a fundamental description of the virus's genomic and proteomic potential.
METHODS: We used direct RNA sequencing to determine the transcriptome of SARS-CoV-2 grown in Vero E6 cells which is widely used to propagate the novel coronavirus. The viral transcriptome was analysed using a recently developed ORF-centric pipeline. Allied to this, we used
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human herpesvirus 8 (HHV-8) can be classified into distinct subtypes on the basis of sequence polymorphisms in several open reading frames (ORFs). We analyzed the subtypes of HHV-8 in 59 human immunodeficiency virus-infected Japanese patients by using polymorphisms in ORF26 and found that over two-thirds of the HHV-8 isolates fell into major subtype A. We also found that single nucleotide polymorphisms (SNPs) at nucleotide positions 1032 (C-to-A substitution) and 1055 (G-to-T substitution) in HHV-8 ORF26 were correlated with increased susceptibility to Kaposi's sarcoma, compared to the results
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tomato yellow leaf curl virus (Family Geminiviridae, Genus Begomovirus) is a serious menace in the cultivation of tomato causing Tomato leaf curl disease (ToLCD). Recently, we presented the TYLCV isolates having additional genomic features (nucleotides insertions) characterized from the tomato fields of Kuwait adding up to the genetic diversity repertoire of these viruses. The widespread prevalence of disease in tropics across the continents, emergence of genetic variants and ever increasing complete genome sequences of virus isolates in public database warrant a global analysis to infer the g
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Japanese encephalitis virus (JEV) is one of the major causative agents of viral encephalitis in East Asia, Southeast Asia and Australia. However, no clinical JEV strain has yet been isolated from JE patients in Chongqing, China. In this study, we report the genomic analysis of a new JEV strain, CQ11-66, isolated from a pediatric patient in Chongqing, China.
FINDINGS: Virus isolation was carried out in BHK-21 cells. Nested PCR was used to detect and isolate the JEV strain, and computer analysis of phylogenetic relationships, nucleic acid homology studies and deduction of the amino
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Insertion of fluorescent reporter genes into viral genomes is a powerful tool for monitoring infection. In coronaviruses, this is commonly achieved by replacing accessory ORFs, thereby deleting endogenous gene functions. An alternative strategy is to manipulate viral RNA synthesis by inserting copies of the viral transcription regulatory sequence (TRS), which drives the transcription of viral subgenomic RNAs. However, coronavirus transcription is tightly regulated, and these modifications frequently disrupt native subgenomic RNA synthesis and attenuate viral growth. Here, we describe a reporte
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Duck plague virus (DPV) is a high-morbidity fowl alphaherpesvirus that causes septicemic lesions in various organs. Most DPV genes are conserved among herpesviruses, while a few are specific to fowl herpesviruses, including the LORF3 gene, for which there is currently no literature describing its biological properties and functions. This study first addressed whether the LORF3 protein is expressed by making specific polyclonal antibodies. We could demonstrate that DPV LORF3 is an early gene and encodes a protein involved in virion assembly, mainly localized in the nucleus of DPV-infected DEF c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Duck plague caused by duck plague virus (DPV) is one of the main diseases that seriously endangers the production of waterfowl. DPV possesses a large genome consisting of 78 open reading frames (ORFs), and understanding the function and mechanism of each encoded protein in viral replication and pathogenesis is the key to controlling duck plague outbreaks. US1 is one of the two genes located in the repeat regions of the DPV genome, but the function of its encoded protein in DPV replication and pathogenesis remains unclear. Previous studies found that the US1 gene or its homologs exist in almost
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Oryctes rhinoceros nudivirus (OrNV) is a dsDNA virus with enveloped, rod-shaped virions. Its genome is 127,615 bp in size and contains 139 predicted protein-coding open reading frames (ORFs). In-depth genome sequence comparisons revealed a varying number of shared gene homologues, not only with other nudiviruses (NVs) and baculoviruses, but also with other arthropod-specific large dsDNA viruses, including the so-called Monodon baculovirus (MBV), the salivary gland hypertrophy viruses (SGHVs) and white spot syndrome virus (WSSV). Nudivirus genomes contain 20 baculovirus core gene homologues
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The PA-X protein of influenza A virus has roles in host cell shutoff and viral pathogenesis. While most strains are predicted to encode PA-X, strain-dependent variations in activity have been noted. We found that PA-X protein from the A/PR/8/34 (PR8) strain had significantly lower repressive activity against cellular gene expression than PA-X proteins from the avian strains A/turkey/England/50-92/91 (H5N1) (T/E) and A/chicken/Rostock/34 (H7N1). Loss of normal PA-X expression, either by mutation of the frameshift site or by truncating the X open reading frame (ORF), had little effect on the inf
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Influenza A viruses (IAVs) lacking the nonstructural protein 1 (NS1) gene (IAV-ΔNS1) are attenuated both in vitro and in vivo, yet retain replicative capacity in interferon signaling-deficient systems. To date, several efforts have been pursued to expand its functionality by incorporating transgenes in lieu of the NS1 gene. However, such vectors require complex segment designs, retain residual NS1 peptide stretches, or display suboptimal cytokine secretion, largely due to the constraints related to the partial nuclear export protein (NEP) open reading frame (ORF) upstream of the tr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Codon pair bias (CPB), which has been observed in all organisms, is a neglected genomic phenomenon that affects gene expression. CPB results from synonymous codons that are paired more or less frequently in ORFeomes regardless of codon bias. The effect of an individual codon pair change is usually small, but when it is amplified by large-scale genome recoding, strikingly altered biological phenotypes are observed. The utility of codon pair bias in the development of live attenuated vaccines was recently demonstrated by recodings of poliovirus (a positive-strand RNA virus) and influ
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During the summer of 2003, leaf curl symptoms were observed in tomato (Lycopersicon esculentum) plantings in the Iganga District of Uganda. Begomoviral infection was suspected. Twelve symptomatic samples were collected. Begomoviral DNA was extracted and amplified using polymerase chain reaction (PCR) with the begomovirus-specific degenerate primer pair PAL1v1978/PAR1c715 (4). The expected 1.4-kb PCR products were obtained from 11 of 12 samples. The 1.4-kb PCR product of one of the samples was cloned and sequenced. Based on the sequence of the 1.4-kb DNA product, specific primers were designed
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human herpesvirus 6 (HHV-6) and cytomegalovirus (CMV) are population-prevalent betaherpesviruses with intermittent lytic replication that can be pathogenic in immunocompromised hosts. Elucidation of the adaptive immune response is valuable for understanding pathogenesis and designing novel treatments. Knowledge of T-cell antigens has reached the genome-wide level for CMV and other human herpesviruses, but study of HHV-6 is at an earlier stage. Using rare-cell enrichment combined with an HLA-agnostic, proteome-wide approach, we queried HHV-6B-specific CD4 T cells from 18 healthy donors with eac
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bovine parvovirus 2 (BoPV-2), officially classified as Ungulate copiparvovirus 1 by the ICTV, and Bopivirus A, a recently recognized picornavirus, are poorly characterized viruses sporadically reported in cattle worldwide. Here, we describe the first detection of BoPV-2 and Bopivirus A in Iran-and potentially the Middle East-through RNA-seq analysis of a diarrheic neonatal calf. Four BoPV-2 contigs (82-85% nucleotide identity; 91-100% amino acid identity) were identified, clustering within the Ungulate copiparvovirus 1 clade, while the Bopivirus sequence grouped with Chinese strains BoP8 and B
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In recent months, several SARS-CoV-2 variants have emerged that enhance transmissibility and escape host humoral immunity. Hence, the tracking of viral evolutionary trajectories is clearly of great importance. Little is known about SARS-CoV-2 evolution in nonhuman primate models used to test vaccines and therapies and to model human disease. Viral RNA was sequenced from rectal swabs from Chlorocebus aethiops (African green monkeys) after experimental respiratory SARS-CoV-2 infection. Two distinct patterns of viral evolution were identified that were shared between all collected samples. First,
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cowpox virus infection of humans is an uncommon, potentially fatal, skin disease. It is largely confined to Europe, but is not found in Eire, or in the USA, Australasia, or the Middle or Far East. Patients having contact with infected cows, cats, or small rodents sporadically contract the disease from these animals. We report here clinical aspects of 8 patients from the Munich area who had purchased infected pet rats from a local supplier. Pet rats are a novel potential source of local outbreaks. The morphologically distinctive skin lesions are mostly restricted to the patients' necks, reflect
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования