BACKGROUND: Bacillus anthracis (B. anthracis), a Gram-positive bacterium, poses significant threats to both livestock and humans, with known potential use in bioterrorism. Despite its zoonotic importance, the pathogen’s evolutionary dynamics and metabolic genes remain poorly understood, limiting insights into its virulence mechanisms. This study aimed to: (i) evaluate the distribution of toxin genes across B. anthracis isolates, (ii) employ a machine learning algorithm to identify genetic differences among toxin- and capsule synthesis gene-carrying B. anthracis isolates, and (iii) identify sha
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Salmonella 4,[5],12:i:-, a globally emerging pathogen with multidrug resistance (MDR), is spreading in China. Nationwide data on the antimicrobial resistance (AMR) and genomic characteristics of Salmonella 4,[5],12:i:- from human sources in China are scarce. This study aimed to characterize the prevalence, genetic diversity, and AMR profiles of Salmonella 4,[5],12:i:- in China.
METHODS: All information, including geographical data, antimicrobial susceptibility test results, and whole-genome sequences, was extracted from the Chinese Pathogen Identification Network database from 2
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2), the causative agent of COVID -19, is constantly evolving, requiring continuous genomic surveillance. In this study, we used whole-genome sequencing to investigate the genetic epidemiology of SARS-CoV-2 in Bangladesh, with particular emphasis on identifying dominant variants and associated mutations. We used high-throughput next-generation sequencing (NGS) to obtain DNA sequences from COVID-19 patient samples and compared these sequences to the Wuhan SARS-CoV-2 reference genome using the Global Initiative for Sharing All Influenza Da
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The serovars of Salmonella enterica display dramatic differences in pathogenesis and host preferences. We developed a process (patent pending) for grouping Salmonella isolates and serovars by their public health risk. We collated a curated set of 12,337 S. enterica isolate genomes from human, beef, and bovine sources in the US. After annotating a virulence gene catalog for each isolate, we used unsupervised random forest methods to estimate the proximity (similarity) between isolates based upon the genomic presentation of putative virulence traits We then grouped isolates (virulence clusters)
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During a surveillance study conducted to assess the occurrence and genomic landscape of critical priority pathogens circulating at the human-animal-environment interface in Brazil, as part of the Grand Challenges Explorations-New Approaches to Characterize the Global Burden of Antimicrobial Resistance program, two multidrug-resistant (MDR) Citrobacter portucalensis carrying blaCTX-M-15 extended-spectrum β-lactamase (ESBL) genes, isolated from green sea turtles, were characterized. Genomic and phylogeographical analysis of C. portucalensis genomes available in public databases revealed the inte
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus agalactiae evasion from the human defense mechanisms has been linked to the production of DNases. These were proposed to contribute to the hypervirulence of S. agalactiae ST17/capsular-type III strains, mostly associated with neonatal meningitis. We performed a comparative genomic analysis between ST17 and ST19 human strains with different cell tropism and distinct DNase production phenotypes. All S. agalactiae ST17 strains, with the exception of 2211-04, were found to display DNase activity, while the opposite scenario was observed for ST19, where 1203-05 was the only DNase(+) s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: All retroviruses, including human immunodeficiency virus (HIV), must integrate a DNA copy of their genomes into the genome of the infected host cell to replicate. Although integrated retroviral DNA, known as a provirus, can be found at many sites in the host genome, integration is not random. The adaption of linker-mediated PCR (LM-PCR) protocols for high-throughput integration site mapping, using randomly-sheared genomic DNA and Illumina paired-end sequencing, has dramatically increased the number of mapped integration sites. Analysis of samples from human donors has shown that th
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infections with influenza A viruses (IAV) are highly prevalent in swine populations, and stable cocirculation of at least three lineages has been well documented in European swine - till 2009. However, since the emergence of the human pandemic pdmH1N1 virus in 2009, which has been (re)introduced into individual swine herds worldwide, the situation has been changing. These variations in the respective IAV pools within pig populations are of major interest, and the zoonotic potential of putative emerging viruses needs to be evaluated. As data on recent IAV in swine from southern Germany were rel
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human leukocyte antigen (HLA) class I and class II loci are the most polymorphic genes in the human genome; distinguishing the thousands of HLA alleles is challenging. Next generation sequencing of exonic amplicons with the 454 genome sequence (GS) FLX System and Conexio Assign ATF 454 software provides high resolution, high throughput HLA genotyping for eight class I and class II loci. HLA typing of potential donors for unrelated bone marrow donor registries typically uses a subset of these loci at high sample throughput and low cost per sample. The Fluidigm Access Array System enables th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In 2005, a human adenovirus strain (formerly known as HAdV-D22/H8 but renamed here HAdV-D53) was isolated from an outbreak of epidemic keratoconjunctititis (EKC), a disease that is usually caused by HAdV-D8, -D19, or -D37, not HAdV-D22. To date, a complete change of tropism compared to the prototype has never been observed, although apparent recombinant strains of other viruses from species Human adenovirus D (HAdV-D) have been described. The complete genome of HAdV-D53 was sequenced to elucidate recombination events that lead to the emergence of a viable and highly virulent virus with a modif
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Next-generation sequencing (NGS) technology has shown promise for the detection of human pathogens from clinical samples. However, one of the major obstacles to the use of NGS in diagnostic microbiology is the low ratio of pathogen DNA to human DNA in most clinical specimens. In this study, we aimed to develop a specimen-processing protocol to remove human DNA and enrich specimens for bacterial and viral DNA for shotgun metagenomic sequencing. Cerebrospinal fluid (CSF) and nasopharyngeal aspirate (NPA) specimens, spiked with control bacterial and viral pathogens, were processed using either a
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human metapneumovirus (HMPV) is a significant cause of respiratory infection, yet no licensed vaccine exists. Variability across viral subgroups, particularly in the attachment (G) protein, can complicate universal design. We assessed the immunogenetic regions in the fusion (F) and G proteins to identify stable vaccine targets.
METHODS: We analyzed N = 324 Pittsburgh and N = 655 global HMPV genomes (2017-2022) for genome diversity per viral subgroup. Previously identified epitope sequences were obtained from the Immune Epitope DataBase (IEDB) for F and G proteins and sequence simi
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cattle now occupy two epidemiologically distinct influenza interfaces. This Mini Review comparatively synthesizes epidemiological, pathological, experimental-transmission, genomic, and surveillance evidence for highly pathogenic avian influenza A(H5N1) and influenza D virus (IDV), asking how source ecology, tissue tropism, shedding, transmission, persistence, and zoonotic evidence differ between the two viruses. Genetically distinct H5N1 viruses have spilled over repeatedly from wild birds into United States dairy cattle. In lactating cows, infection is prominent in mammary alveolar epithelium
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amino acid composition within a proteome is conventionally viewed as a property of individual protein function. However, specific nutrient scarcity has been shown to reshape which amino acids are encoded in the genome of microbes. Mosquitoes have fed on blood for 200 million years, relying on blood amino acids for reproduction. We wondered whether this ancient dependency has left an imprint on the mosquito proteome. Here we show a proteome-wide shift to lower isoleucine usage in blood-feeding mosquitoes, mirroring the known isoleucine deficiency of adult human hemoglobin. In comparing amino ac
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brucellosis represents a significant global health concern that is endemic in many regions of the world, especially in Maghreb (Tunisia, Morocco and Algeria). In Tunisia the diagnosis of human brucellosis is primarily based on serological tests and cultivation of the causative pathogen, without the knowledge of the underlying Brucella species or biovar. In addition, the scarcity of laboratories with adequate biosecurity measures to handle suspected specimens constitutes a significant challenge. Furthermore, the absence of full genome data limits our understanding of the genetic diversity of Br
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As one of the three mammalian gasotransmitters, hydrogen sulfide (H2S) plays a major role in maintaining physiological homeostasis. Endogenously produced H2S plays numerous beneficial roles including mediating vasodilation and conferring neuroprotection. Due to its high membrane permeability, exogenously produced H2S originating from the gut microbiota can also influence human physiology and is implicated in reducing intestinal mucosal integrity and potentiating genotoxicity and is therefore a potential target for therapeutic interventions. Gut microbial H2S production is often attributed to d
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Our increasingly aging society leads to a growing incidence of neurodegenerative diseases. So far, the pathological mechanisms are inadequately understood, thus impeding the establishment of defined treatments. Cell-based additive gene therapies for the increased expression of a protective factor are considered as a promising option to medicate neurodegenerative diseases, such as age-related macular degeneration (AMD). We have developed a method for the stable expression of the gene encoding pigment epithelium-derived factor (PEDF), which is characterized as a neuroprotective and anti-angiogen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАVideo-Audio MediaПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is a large demand of a human relevant in vitro test system suitable for assessing the cardiotoxic potential of cosmetic ingredients and other chemicals. Using human-induced pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes (hiPSC-CMs), we have already established an in vitro cardiotoxicity assay and identified genomic biomarkers of anthracycline-induced cardiotoxicity in our previous work. Here, five cosmetic ingredients were studied by the new hiPSC-CMs test; kojic acid (KJA), triclosan (TS), triclocarban (TCC), 2,7-naphthalenediol (NPT), and basic red 51 (BR51) based on cytotoxicity as well
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three beta-hydroxysteroid dehydrogenase/delta 5-delta 4-isomerase (3 beta-HSD) catalyze the oxidative conversion of delta 5-3 beta-hydroxysteroids to the delta 4-3-keto configuration and is therefore essential for the biosynthesis of all classes of hormonal steroids, namely progesterone, glucocorticoids, mineralocorticoids, androgens, and estrogens. Using human 3 beta-HSD cDNA as probe, a human 3 beta-HSD gene was isolated from a lambda-EMBL3 library of leucocyte genomic DNA. A fragment of 3 beta-HSD genomic DNA was also obtained by amplification of genomic DNA using the polymerase chain react
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Anorexia nervosa (AN) is a polygenic, severe metabopsychiatric disorder with poorly understood aetiology. Eight significant loci have been identified by genome-wide association studies (GWAS) and single nucleotide polymorphism (SNP)-based heritability was estimated to be ~ 11-17, yet causal variants remain elusive. It is therefore important to define the full spectrum of genetic variants in the wider regions surrounding these significantly associated loci. The hypothesis we evaluate here is that unrecognised or relatively unexplored variants in these regions exist and are promising
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования