Despite effective antiretroviral therapy, HIV persists in the central nervous system (CNS) and may contribute to neuroinflammation and cognitive impairment. How viral persistence, immune responses, and regional CNS T-cell architecture relate to cognitive functioning remains unclear. We performed a cross-sectional, multi-compartmental immune-genomic study in 12 people with HIV on long-term viral suppression enrolled in the Last Gift rapid autopsy program. Quantitative HIV reservoir measures (total-episomal DNA, unspliced-multiply spliced RNA) and paired αβ T-cell receptor repertoire (TCRR) sequ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: We have previously demonstrated that double homeobox 4 centromeric (DUX4C) encoded for a functional DUX4c protein upregulated in dystrophic skeletal muscles. Based on gain- and loss-of-function studies we have proposed DUX4c involvement in muscle regeneration. Here, we provide further evidence for such a role in skeletal muscles from patients affected with facioscapulohumeral muscular dystrophy (FSHD).
METHODS: DUX4c was studied at RNA and protein levels in FSHD muscle cell cultures and biopsies. Its protein partners were co-purified and identified by mass spectrometry. Endogenous
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular and electrical remodeling of ion channels determining action potential duration has been proposed as a major mechanism in chronic atrial fibrillation. We investigated the mRNA expression of the cardiac L-type Ca2+-channel subunits alpha1c, alpha2/delta1, beta1a, and beta1b/c in atrial tissue of patients with chronic atrial fibrillation compared to patients in sinus rhythm. In addition, the mRNA expression of the 5-hydroxytryptamine type 4-, beta1-, and beta2-adrenergic receptors, which are known to stimulate the L-type Ca2+-current in human atrium, was analyzed and the effect of chro
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Emerging discoveries of dynamic and reversible N6-methyladenosine (m6A) modification on RNA in mammals have revealed the key roles of the modification in human tumorigenesis. As known m6A readers, insulin-like growth factor 2 mRNA-binding proteins (IGF2BPs) are upregulated in most cancers and mediates the enhancement of m6A-modified mRNAs stability. However, the mechanisms of IGF2BPs in renal cell cancer (RCC) still remain unclear. Bioinformatic analysis and RT-qPCR were performed to evaluate the expression of IGF2BPs and m6A writer Wilms tumor 1-associating protein (WTAP) in RCC samples and i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Alternative splicing represents an important nuclear mechanism in the posttranscriptional regulation of gene expression, which is frequently altered during tumorigenesis. Previously, we described marked changes in alternative splicing of the CD44 gene in ovarian and breast cancer as well as specific induction of distinct splicing factors during tumor development. The present study was focused on the expression profiles of different splicing factors, including classical serine-arginine (SR) proteins including ASF/SF2, hTra2β1, hTra2α, and Y-box-binding protein (YB-1) in physiological
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alternative splicing of Wt1 results in the insertion or omission of the three amino acids KTS between zinc fingers 3 and 4. In vitro experiments suggest distinct molecular functions for + and -KTS isoforms. We have generated mouse strains in which specific isoforms have been removed. Heterozygous mice with a reduction of +KTS levels develop glomerulosclerosis and represent a model for Frasier syndrome. Homozygous mutants of both strains die after birth due to kidney defects. Strikingly, mice lacking +KTS isoforms show a complete XY sex reversal due to a dramatic reduction of Sry expression lev
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Obesity and periodontitis are chronic diseases that share inflammatory and metabolic pathways. The RBFOX1 gene was selected as an exploratory candidate gene because it encodes an RNA-binding splicing regulator, has been implicated in obesity-related phenotypes, and has been reported in candidate-gene analyses of periodontitis/metabolic traits. This study investigated the association between obesity, periodontal disease severity, and RBFOX1 rs6500744 polymorphism. This case-control study enrolled 106 adults: 53 with obesity (BMI ≥ 30 kg/m2) and 53 normoweight controls. Clinical and radiographic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUD: Osteogenesis imperfecta (OI) is a phenotypically and genetically heterogeneous group of inherited connective tissue disorder. This investigation aims to elucidate the molecular etiology underlying a four-generation Chinese family affected by OI.
METHODS: Whole-exome sequencing was employed to identify pathogenic variants in the proband, with subsequent Sanger sequencing performed for familial co-segregation analysis. A minigene assay was conducted to investigate the effect of variant on splicing patterns. The pathogenic potential of variant was evaluated through protein structural
Клинический случайСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGRUOUND: Phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) regulates cellular development and energy homeostasis. However, the roles of its subunits in organ development remain largely unknown.
METHODS: We explored the roles of PI3K catalytic subunits in steroidogenic factor 1 (SF1)-expressing cells through knockout (KO) of the p110α and p110β subunits.
RESULTS: We examined mice with a double KO of p110α and p110β in SF1-expressing cells (p110αβ KOSF1). Although these animals exhibited no significant changes in the development of the ventromedial hypothalamus, we noted pronounced hypotrophy in the ad
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Predicting effects of genomic variants has become a real challenge in the diagnosis of rare human diseases. Holt-Oram syndrome is an autosomal condition characterized by the association of radial and heart defects, due to variants in TBX5. Most variants are predicted to be truncating and result in haploinsufficiency. The pathogenicity of missense or splice variants is harder to demonstrate.
METHODS: Fourteen TBX5 variants of uncertain significance (5 missense, 9 splice) and 6 likely pathogenic missense variants were selected for functional testing, depending on the variant-type (immu
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mutations in genes encoding spliceosome components result in craniofacial structural defects in humans, referred to as spliceosomopathies. The SF3b complex is a crucial unit of the spliceosome, but model organisms generated through genetic modification of the complex do not perfectly mimic the phenotype of spliceosomopathies. Since the phenotypes are suggested to be determined by the extent of spliceosome dysfunction, an alternative experimental system that can seamlessly control SF3b function is needed.
METHODS: To establish another experimental system for model organisms elucida
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal muscular atrophy (SMA), which results from the deletion or/and mutation in the SMN1 gene, is an autosomal recessive neuromuscular disorder that leads to weakness and muscle atrophy. SMN2 is a paralogous gene of SMN1. SMN2 copy number affects the severity of SMA, but its role in patients treated with disease modifying therapies is unclear. The most appropriate individualized treatment for SMA has not yet been determined. Here, we reported a case of SMA type I with normal breathing and swallowing function. We genetically confirmed that this patient had a compound heterozygous variant: one
СтатьяКлинический случайПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Malignant melanoma of the female genital tract is relatively uncommon and accounts for 3-7% of all melanoma localizations. This study aimed to identify driver genes in melanoma of the female genital tract with the purpose of enhancing understanding of disease pathogenesis and identifying potential new therapeutic targets to develop effective therapies.
METHODS: KIT (CD117) and BRAF expression were detected immunohistochemically. Polymerase Chain Reaction (PCR) and Sanger sequencing techniques were performed to identify the mutational status of BRAF, NRAS, KRAS, NF1, KIT, PDGFRA an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mutations in CLN3 cause Batten disease, however non-syndromic CLN3 disease, characterized by retinal-specific degeneration, has been also described. Here, we characterized an induced pluripotent stem cell (iPSC)-derived disease model derived from a patient with non-syndromic CLN3-associated retinopathy.
METHODS: Patient-iPSC, carrying the 1 kb-deletion and c.175G>A variants in CLN3, coisogenic iPSC, in which the c.175G>A variant was corrected, and control iPSC were differentiated into neural retinal organoids (NRO) and cardiomyocytes. CLN3 transcripts were analyzed by Sanger seque
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cystic fibrosis (CF) is an autosomal recessive disorder caused by mutations in the CF transmembrane conductance regulator (CFTR) gene, encoding an anion channel that conducts chloride and bicarbonate across epithelial membranes. Mutations that disrupt pre-mRNA splicing occur in >15% of CF cases. One common CFTR splicing mutation is CFTR c.3718-2477C>T (3849+10 kb C>T), which creates a new 5' splice site, resulting in splicing to a cryptic exon with a premature termination codon. Splice-switching antisense oligonucleotides (ASOs) have emerged as an effective therapeutic strategy to block aberra…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Retinitis pigmentosa (RP) is one of the most common form of inherited retinal dystrophies. Identification of disease-causing mutations is a prerequisite for applying targeted therapeutic approaches. The present study aimed to identify disease-associated mutations in a large Serbian family, in which two brothers have suffered from RP starting in the first decade of their lives.
METHODS: The index patient and 12 additional members of a four-generation family were analyzed. All participants underwent detailed ophthalmic examinations. Genomic DNA was isolated from family members to pe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The epithelial cell adhesion molecule gene (EPCAM, previously known as TACSTD1 or TROP1) encodes a membrane-bound protein that is localized to the basolateral membrane of epithelial cells and is overexpressed in some tumors. Biallelic mutations in EPCAM cause congenital tufting enteropathy (CTE), which is a rare chronic diarrheal disorder presenting in infancy. Monoallelic deletions of the 3' end of EPCAM that silence the downstream gene, MSH2, cause a form of Lynch syndrome, which is a cancer predisposition syndrome associated with loss of DNA mismatch repair. Here, we report 13 novel EPCAM m
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
STUDY QUESTION: Can subphenotype analysis of genome-wide association study (GWAS) data from subjects with testicular germ cell tumor (TGCT) provide insight into cryptorchidism (undescended testis, UDT) susceptibility?
SUMMARY ANSWER: Suggestive intragenic GWAS signals common to UDT, TGCT case-case and TGCT case-control analyses occur in genes encoding RBFOX RNA-binding proteins (RBPs) and their neurodevelopmental targets.
WHAT IS KNOWN ALREADY: UDT is a strong risk factor for TGCT, but while genetic risk factors for TGCT are well-known, genetic susceptibility to UDT is poorly understood and
СтатьяМетаанализПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liver myofibroblasts are specialized effector cells that drive hepatic fibrosis, a hallmark process of chronic liver diseases, leading to progressive scar formation and organ failure. Liver myofibroblasts are increasingly recognized as heterogeneous with regards to their origin, phenotype, and functions. For instance, liver myofibroblasts express cell markers that are universally represented such as, ItgαV and Pdgfrβ, or restricted to a given subpopulation such as, Lrat exclusively expressed in hepatic stellate cells, and Gpm6a in mesothelial cells. To study liver myofibroblasts in vitro, we h
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oxidatively modified forms of proteins accumulate during aging. Oxidized protein conformers might act as intermediates in the formation of amyloids in age-related disorders. However, it is not known whether this amyloidogenic conversion requires an extensive protein oxidative damage or it can be promoted just by a discrete, localized post-translational modification of certain residues. Here, we demonstrate that the irreversible oxidation of a single free Cys suffices to severely perturb the folding energy landscape of a stable globular protein, compromise its kinetic stability, and lead to the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.