Mendelian disorders of cholesterol biosynthesis typically result in multi-system clinical phenotypes, underlining the importance of choleste … rofile in plasma and urine suggested that their defect was at the level of squalene synthase. Whole-exome sequencing was used to identify recessive disease-causing variants in FDFT1. Functional characterization of one variant demonstrated a partial splicing defect and altered promoter and/or enhancer activity, reflecting essential mechanisms for regulat …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adrenocortical cancer (ACC) is a rare cancer with poor prognosis and high mortality due to metastatic disease. All reported genetic alterations have been in primary ACC, and it is unknown if there is molecular heterogeneity in ACC. Here, we report the genetic changes associated with metastatic ACC compared to primary ACCs and tumor heterogeneity. We performed whole-exome sequencing of 33 metastatic tumors. The overall mutation rate (per megabase) in metastatic tumors was 2.8-fold higher than primary ACC tumor samples. We found tumor heterogeneity among different metastatic sites in ACC and dis…
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The phenotypic spectrum associated with heterozygous mutations in cartilage oligomeric matrix protein gene (COMP) range from a mild form of multiple epiphyseal dysplasia (MED) to pseudoachondroplasia (PSACH). However, the phenotypic effect from biallelic COMP variants is unclear. We investigated a large consanguineous Pakistani family with a severe form of PSACH in 2 individuals. Another 14 family members presented with a mild PSACH phenotype similar to MED. Using exome sequencing and subsequent segregation analysis, we identified homozygosity for a COMP missense variant [c.1423G>A; p.(D475N)]…
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report compound heterozygous variants in HTT, the gene encoding huntingtin, in association with an autosomal recessive neurodevelopmental disorder. Three siblings presented with severe global developmental delay since birth, central hypotonia progressing to spastic quadraparesis, feeding difficulties, dystonia (2/3 sibs), prominent midline stereotypies (2/3), bruxism (1/3), high myopia (2/3), and epilepsy (1/3). Whole exome sequencing identified compound heterozygous variants in HTT that co-segregated in the three affected sibs and were absent in an unaffected sib. There were no additional …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spondylocarpotarsal synostosis syndrome (SCT) is a rare Mendelian disorder (OMIM #272460) characterized by prenatal vertebral fusion, scoliosis, short stature and carpal and tarsal synostosis. SCT is typically known as an autosomal recessive disease caused by variants in the FLNB gene. The genetic basis of the rarer cases of vertical transmissions remains unknown. In two independent families with symptoms related to autosomal dominant SCT, we identified - by exome sequencing - two protein-altering variants in the embryonic myosin heavy chain 3 (MYH3) gene. As MYH3 variants are also associated …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Congenital heart disease (CHD) patients have an increased prevalence of extracardiac congenital anomalies (CAs) and risk of neurodevelopmental disabilities (NDDs). Exome sequencing of 1213 CHD parent-offspring trios identified an excess of protein-damaging de novo mutations, especially in genes highly expressed in the developing heart and brain. These mutations accounted for 20% of patients with CHD, NDD, and CA but only 2% of patients with isolated CHD. Mutations altered genes involved in morphogenesis, chromatin modification, and transcriptional regulation, including multiple mutations in RB…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
FUS/TLS (denoting fused in sarcoma/translocated in liposarcoma [MIM 137070]) codifies an RNA binding protein. Mutations in this gene cause amyotrophic lateral sclerosis (ALS; MIM 608030). Essential tremor (ET [MIM 190300]) is the most frequent movement disorder. Despite its strong familiar aggregation, recently a whole exome sequencing study has identified FUS mutations as a cause of familial ET. To determine whether mutations in FUS are also common in other populations, we sequenced FUS gene in 178 unrelated Spanish subjects with ET. We detected only an intronic single-pair nucleotide deletio…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIMS: Calcium homeostasis requires regulated cellular and interstitial systems interacting to modulate the activity and movement of this ion. Disruption of these systems in the kidney results in nephrocalcinosis and nephrolithiasis, important medical problems whose pathogenesis is incompletely understood.
METHODS: We investigated 25 patients from 16 families with unexplained nephrocalcinosis and characteristic dental defects (amelogenesis imperfecta, gingival hyperplasia, impaired tooth eruption). To identify the causative gene, we performed genome-wide linkage analysis, exome capt…
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intellectual disability (ID) is frequent in the general population, with 1 in 50 individuals directly affected worldwide. The multiple etiologies include X-linked ID (XLID). Among syndromic XLID, few syndromes present severe ID associated with postnatal microcephaly and midline stereotypic hand movements. We report on three male patients with ID, midline stereotypic hand movements, hypotonia, hyperkinesia, strabismus, as well as seizures (2/3), and non-inherited and postnatal onset microcephaly (2/3). Using array CGH and exome sequencing we characterised two truncating mutations in IQSEC2, nam…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Meckel-Gruber syndrome (MKS) is a genetically heterogeneous severe ciliopathy characterised by early lethality, occipital encephalocele, polydactyly, and polycystic kidney disease.
PURPOSE: To report genetic analysis results in two families in which all known MKS diseases genes have been excluded.
METHODS: In two consanguineous families with classical MKS in which autozygome-guided sequencing of previously reported MKS genes was negative, we performed exome sequencing followed by autozygome filtration.
RESULTS: We identified one novel splicing mutation in TMEM231, which led to c…
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spondyloepimetaphyseal dysplasia with joint laxity, leptodactylic type (lepto-SEMDJL, aka SEMDJL, Hall type), is an autosomal dominant skeletal disorder that, in spite of being relatively common among skeletal dysplasias, has eluded molecular elucidation so far. We used whole-exome sequencing of five unrelated individuals with lepto-SEMDJL to identify mutations in KIF22 as the cause of this skeletal condition. Missense mutations affecting one of two adjacent amino acids in the motor domain of KIF22 were present in 20 familial cases from eight families and in 12 other sporadic cases. The skelet…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Seborrheic keratosis is a common benign skin tumor that affects most individuals, particularly later in life. Despite its high prevalence, the underlying biology of seborrheic keratosis remains poorly understood. In this study, we performed whole-exome sequencing and spatial transcriptomics on a cohort of seborrheic keratosis and solar lentigo lesions to gain insight into their molecular landscape. Our results reveal a high mutational burden driven by solar UV damage, with recurrent somatic variants observed in genes such as FGFR3, NOTCH1, and TP53. Spatial transcriptomic analysis uncovered a …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mandibulofacial dysostosis with microcephaly (MFDM) is caused by haploinsufficiency of EFTUD2 gene. This syndrome is characterized by microc … variants in the EFTUD2 gene that had not been previously reported prenatally. In the first patient, exome sequencing identified a c.2698_2701del p.(Val865Serfs*34), while in the second a novel large deletion involving multiple genes, including the entire EFTUD2 gene, was detected by microarray analysis. Prenatal diagnosis of MFDM requires precise ultras …
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Classical Ehlers-Danlos syndrome (cEDS), caused by pathogenic variants in COL5A2, is characterized by skin hyperextensibility, joint hypermobility and atrophic scarring. This study aimed to identify and validate the pathogenicity of an unreported COL5A2 intronic variant in a Chinese family with cEDS.
METHODS: Trio-based whole exome sequencing (Trio-WES) was performed to screen for pathogenic variants, and the candidate variant was confirmed by Sanger sequencing. Minigene assays were then conducted to evaluate the functional consequences of key variants.
RESULTS: A de novo COL5A2 …
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Xeroderma pigmentosum is a rare autosomal recessive genetic disorder characterized by hypersensitivity to ultraviolet radiation and increased risk of skin cancer. Impaired DNA repair mechanisms are considered to be involved in the occurrence and development of this distinct disorder. We present the case of a 48-year-old Chinese woman with facial and chest tumors; these lesions had been rapidly growing over the past 6 months. Pathological biopsy and immunohistology indicated malignant melanoma in facial and chest tumors and squamous cell carcinoma in chest tumors. Using whole-exome sequencing, …
СтатьяКлинический случайОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple chronic ulcers of the small intestine are primarily attributed to Crohn's disease. Other differential diagnoses include rare monogenic disorders caused by mutations in PLA2G4A and SLCO2A1, the latter responsible for chronic enteropathy associated with SLCO2A1 (CEAS), a condition mainly reported in Asian patients. We present the case of a 10-year-old girl from India with a 5-year history of abdominal pain, altered bowel habits and failure to gain weight. Despite multiple admissions and treatment with steroids, immunomodulators and biologics, her symptoms persisted. Exome sequencing con…
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hearing loss is one of the conditions characterized by a high degree of genetic heterogeneity, and whole exome sequencing (WES) serves as a key method for identifying pathogenic variants. To date, 155 genes have been reported to be associated with nonsyndromic hearing loss. Recently, a study by Velde et al. found that the IKZF2 (OMIM#606234) gene is associated with nonsyndromic hearing loss. In our cohort of nearly 300 patients with undiagnosed hearing loss who underwent WES, we discovered a case harboring a variant in the IKZF2 gene, specifically c.485A > C (NM_001387220.1). By investigating …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The single pass transmembrane protein CD33 is enriched in phagocytic and hematopoietic cell types, such as monocytes. CD33 is thought to be … D33 due to germline loss of function variants. Through PheWAS-based approaches using existing whole exome biobanks and bespoke phenotyping using recall-by-genotype (RBG) studies, we show that CD33 loss of function alters circulating white blood cell counts and distributions, albeit mildly and with no overt clinical pathology. These findings indicate tha …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 4-month-old male child was admitted with failure to thrive, persistent osmotic diarrhea, and presence of multiple metabolic abnormalities, which included hypertriglyceridemia, hypercholesterolemia, hypercalcemia, and medullary nephrocalcinosis. He was diagnosed with congenital glucose-galactose malabsorption (CGGM). The exome analysis showed presence of pathogenic mutation in exon 8 of the SLC5A1 gene (c875G>A, p.Cys292Tyr). This gene codes for a sodium-glucose cotransporter called SGLT1. To date, no clinical case reports have reported hypertriglyceridemia and hypercholesterolemia with CGGM.…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA-binding proteins play a key role in post-transcriptional events, such as mRNA splicing, transport, stability, translation and decay. Dysregulation of RNA life can have dramatic consequences. CELF RNA-binding proteins appear to be essential during embryo development. In this study, we identified 15 patients with heterozygous missense or loss-of-function variants in the CELF4 gene by exome or genome sequencing. All variants affecting the N-terminus of the protein are essential and sufficient for the RNA-binding and splicing activity or RRM domains. Most patients presented with neurodevelopme…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования