BACKGROUND: Streptococcus suis meningoencephalitis is a zoonotic disease that mostly infects slaughterhouse workers. Rapid diagnosis of Streptococcus suis meningoencephalitis is critical for effective clinical management of this condition. However, the current diagnostic techniques are not effective for early diagnosis of this condition. To the best of our knowledge, the use of cerebrospinal fluid metagenomic next generation sequencing in the diagnosis of Streptococcus suis meningoencephalitis has been rarely reported.
CASE PRESENTATION: Here, we report a case of Streptococcus suis meningoenc
Клинический случайСтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human cervical microbiome is complex, and its role in health and disease has just begun to be elucidated. In this study, 57 cervical swab samples from 19 HIV/HPV co-infected women were analyzed for both virome and bacteriome composition. Virome analysis focused on circular DNA viruses through rolling circle amplification followed by next-generation sequencing (NGS). Data were assigned to virus families and genera, and HPV types were identified. NGS data of bacterial 16S from a subset of 24 samples were assigned to operational taxonomic units and classified according to vaginal microbiome c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: PTEN/AKT pathway deregulations have been reported to be associated with treatment response in acute leukemia. This study examined pediatric T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) samples for PTEN and AKT1 gene variations and evaluated the clinical findings.
MATERIALS AND METHODS: Fifty diagnostic bone marrow samples of childhood T-ALL cases were investigated for the hotspot regions of the PTEN and AKT1 genes by targeted next-generation sequencing.
RESULTS: A total of five PTEN variations were found in three of the 50 T-ALL cases (6%). Three of the PTEN variations were first r
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Short stature homeobox (SHOX) haploinsufficiency is a frequent cause of short stature. Despite advances in sequencing technologies, the identification of SHOX mutations continues to be performed using standard methods, including multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) followed by Sanger sequencing. We designed a targeted panel of genes associated with growth impairment, including SHOX genomic and enhancer regions, to improve the resolution of next-generation sequencing for SHOX analysis. We used two software packages, CONTRA and Nexus Copy Number, in addition to visual analysis
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION AND OBJECTIVES: Dilated cardiomyopathy (DCM) is a myocardial disease that can progress to a terminal stage, requiring heart transplantation. In this work we aim to contribute to knowledge of genetic variants in adult patients undergoing heart transplantation due to end-stage DCM, reporting the results obtained in our single-center tertiary hospital series using target next-generation sequencing (NGS).
METHODS AND RESULTS: Genetic variants were screened in 15 genes, preselected based on variants previously identified in DCM patients. Thirteen unrelated patients were included, nine
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To detect potential variation in an ethnic Han Chinese family affected with late-onset lipid storage myopathy.
METHODS: Next generation sequencing (NGS) was used to screen disease-related genes in the proband. Suspected mutation was validated with PCR and Sanger sequencing in two patients, their father, and 100 healthy controls.
RESULTS: Heterozygous c.770A>G (p.Tyr257Cys) and c.1395dupT (p.Gly466Tryfs) mutation were detected in the two patients. Their father was found to be heterozygous for the c.770A>G (p.Tyr257Cys) mutation, while the c.1395dupT (p.Gly466Tryfs) variation was no
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To determine how the load of rilpivirine-resistant variants (mutational load) influences the virological response (VR) of HIV-1-infected patients to a rilpivirine-based first-line regimen.
PATIENTS AND METHODS: Four hundred and eighty-nine patients infected with HIV-1 whose reverse transcriptase gene had been successfully resistance genotyped using next-generation sequencing were given a first-line regimen containing rilpivirine. Variables associated with the VR at 12 months were identified using a logistic model. The results were used to build a multivariate model for each mutati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although Ethiopia has an overall lower prevalence of Plasmodium falciparum among countries in Africa, the emergence of drug resistance could seriously hinder elimination efforts. Using samples collected from five therapeutic efficacy studies conducted in 2007-11, we evaluated the prevalence of putative drug resistance mutations in the pfcrt, pfmdr1, and kelch13 genes at the time of those studies, as well as the ama1 gene for genetic relatedness using a pooled amplicon deep sequencing approach. Among all sites, the kelch13 gene showed no mutations, whereas the pfcrt CVIET genotype was fixed in
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Monogenic autoinflammatory disorders (AID) and primary immunodeficiencies can present early in life with features that may be mistaken for Behçet's disease (BD). We aimed to retrospectively describe the clinical and laboratory features of 11 paediatric cases referred for suspected BD who turned out to have an alternative, monogenic disease mimicking BD.
METHODS: Retrospective, paediatric BD specialist multicentre case series. Next generation sequencing (NGS) or conventional candidate gene screening approaches were utilized, facilitated in some cases by functional assays.
RESULTS:
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Approximately 35% of patients with colorectal cancer (CRC) have a family history of the disease attributed to genetic factors, common exposures, or both. Some families with a history of CRC carry genetic variants that cause CRC with high or moderate penetrance, but these account for only 5% to 10% of CRC cases. Most families with a history of CRC and/or adenomas do not carry genetic variants associated with cancer syndromes; this is called common familial CRC. Our understanding of familial predisposition to CRC and cancer syndromes has increased rapidly due to advances in next-generation seque
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bardet-Biedl syndrome (BBS) is a rare inherited multisystemic disorder with autosomal recessive or complex digenic triallelic inheritance. There is currently no treatment for BBS, but some morbidities can be managed. Accurate molecular diagnosis is often crucial for the definition of appropriate patient management and for the development of a potential personalized therapy.
METHODS: We developed a next-generation-sequencing (NGS) protocol for the screening of the 18 most frequently mutated genes to define the genotype and clarify the mutation spectrum of a cohort of 20 BBS Italian
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: MET amplification or MET exon 14 skipping site mutation can be treated with crizotinib in non-small cell lung cancer patients. Y1003 is a binding site for E3 ubiquitin ligase, which is critical for MET degradation. Here we show an adenocarcinoma patient with Y1003S mutation and she got tumor remission after crizotinib treatment.
MATERIALS AND METHODS: A 61-year-old never-smoking female was admitted to our hospital due to increased carcino-embryonicantigen. Positron emission tomography (PET)-CT showed enlargement of bilateral cervical, left supraclavicular and multiple mediastinal
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: To avoid hemolytic disease of the fetus and newborn resulting from maternal alloantibodies against fetal Rh antigens, anti-D immunoglobulin is routinely administered to RhD-negative pregnant women in Japan. Fetal RHD genotyping using cell-free DNA may prevent unnecessary antibody administration; however, current PCR-based methods, which detect RHD deletion, do not address the higher rates of RHD-positive D antigen-negative alleles in nonwhite populations without additional inspections.
METHODS: We developed an amplicon-sequencing method that could estimate the type of paternally i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Osteogenesis imperfecta (OI) is a clinically heterogeneous disease characterized by extreme skeletal fragility. It is caused by mutations in genes frequently affecting collagen biosynthesis. Mutations in CREB3L1 encoding the ER stress transducer OASIS are very rare and are only reported in pediatric patients. We report a large family with a novel CREB3L1 mutation, with severe adult clinical presentation.
METHODS: Clinical examination was performed on the family members. Next generation sequencing was performed for the causative genes for OI. The mutation was confirmed in other fam
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intraductal papillary neoplasm of the bile duct (IPNB) is a mass-forming neoplasm in the bile duct considered to be the biliary counterpart of pancreatic intraductal papillary mucinous neoplasm (IPMN). By its cell lineage, IPNB can be classified into gastric, intestinal, pancreatobiliary, and oncocytic types. Recently, a group of Japanese and Korean pathologists proposed that IPNB be classified into two types, with type 1, being the histological counterpart of IPMN and type 2, having a more complex histological architecture. We used targeted next-generation sequencing to study the molecular ch
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human cytomegalovirus (HCMV)-encoded microRNAs (miRNAs) are involved in posttranscriptional regulation of gene expression. Extracellular vesicles (EVs) can incorporate miRNAs. Relationship between HCMV infection and miRNAs in EVs remains unknown. EVs were isolated from supernatants of human embryonic lung fibroblasts (HELF) cells. Profiles of miRNAs in EVs were analyzed by deep sequencing. Dynamics of candidate viral miRNAs transportation via EVs was investigated using TaqMan PCR. Levels of candidate viral miRNAs in serum EVs from infants with HCMV active infection were detected and analyzed w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Mixed hepatitis C virus (HCV) genotype (GT) infections are clinically important as different genotypes have varied sensitivities to direct-acting antivirals (DAAs). A high prevalence of mixed GT infections was observed in individuals who inject drugs and had multiple HCV exposures. The prevalence of mixed HCV GT infections in men who have sex with men (MSM) and high-risk behaviors was investigated by ultra-deep sequencing (UDS).
METHODS: NS5B fragment was sequenced from viruses of patients with recent HCV infection: there were 50 HIV-positive and 18 HIV-negative patients, includ
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RATIONALE: Angiostrongylus cantonensis-induced eosinophilic meningoencephalitis (AEM) in infants is a very rare but fatal disease. Utilization of genetic assay to detect the cerebral parasite plays an important role for the treatment of the infection.
PATIENT CONCERNS: Two infants (<2 years) presented with cough, intermittent fever, mental fatigue, and poor diet.
DIAGNOSIS: The patients were under clinical examination and laboratory test including cardiac ultrasound, chest X-ray, blood or cerebrospinal fluid (CSF) cell counting, serum enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), head magnetic
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We employed high throughput sequencing to survey the microbiomes of Ixodes scapularis collected in New York and Connecticut. We examined 197 individual I. scapularis adults and pools from 132 adults and 197 nymphs. We detected Borrelia burgdorferi sensu stricto in 56.3% of individual ticks, Anaplasma phagocytophilum in 10.6%, Borrelia miyamotoi in 5%, Babesia microti in 7.6%, and Powassan virus in 3.6%. We did not detect Borrelia mayonii, Ehrlichia muris eauclairensis, Bartonella spp. or pathogenic Babesia species other than B. microti. The most abundant bacterium (65%), and only rickettsial s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this study was to investigate the associations between cervical microbiota and different human papillomavirus (HPV) infection statuses in cytologically normal women. The cervical microbiota of HPV-positive or -negative women with a normal cytologic diagnosis was characterized and compared using 16S rDNA-based high-throughput sequencing, and the differences in cervical microbiota associated with new acquisition, persistence, and clearances of HPV genotypes were analyzed via one-year follow-up. The results showed that the cervical microbial richness of HPV-positive women was lower tha
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования