The human spastizin (spastic paraplegia 15, SPG15) and spatacsin (spastic paraplegia 11, SPG11) complex is involved in the formation of lysosomes, and mutations in these two proteins are linked with hereditary autosomal-recessive spastic paraplegia. SPG11-SPG15 can cooperate with the fifth adaptor protein complex (AP5) involved in membrane sorting of late endosomes. We employed cryogenic-electron microscopy and in silico predictions to investigate the structural assemblies of the SPG11-SPG15 and AP5-SPG11-SPG15 complexes. The W-shaped SPG11-SPG15 intertwined in a head-to-head fashion, and the
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycobacteriophage Bxb1 is a well-characterized virus of Mycobacterium smegmatis with double-stranded DNA and a long, flexible tail. Mycobacteriophages show considerable potential as therapies for Mycobacterium infections, but little is known about the structural details of these phages or how they bind to and traverse the complex Mycobacterium cell wall. Here, we report the complete structure and atomic model of phage Bxb1, including the arrangement of immunodominant domains of both the capsid and tail tube subunits, as well as the assembly of the protein subunits in the tail-tip complex. The
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This is a brief review on modeling genetic codes with the aid of 2-adic dynamical systems. In this model amino acids are encoded by the attractors of such dynamical systems. Each genetic code is coupled to the special class of 2-adic dynamics. We consider the discrete dynamical systems, These are the iterations of a function F:Z2→Z2, where Z2 is the ring of 2-adic numbers (2-adic tree). A genetic code is characterized by the set of attractors of a function belonging to the code generating functional class. The main mathematical problem is to reduce degeneration of dynamic representation and se
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A new three-dimensional chemometric approach was introduced to explore the interaction of hydroxychloroquine (HCQ)-calf thymus deoxyribonucleic acid (DNA) and quantify binding constant using fluorescence excitation and emission measurements. The fluorescence excitation-emission spectra were recorded after gradual titration of HCQ with DNA. Then, the excitation and emission curves and relative concentrations of the drug and drug-DNA complex were quantitatively estimated using a three-dimensional model called Parallel Factor Analysis (PARAFAC) to a cubic fluorescence data array. The interaction
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The behavior of metal ions is commonly studied in pure solvent although, in our daily life, these metals are involved in mixtures of solvents. In the present study, we investigated structures, relative stabilities and temperature dependance of solvated ferrous ion in water-ammonia mixture solvent at 0K and at various temperatures ranging from 25K to 400K. All the calculations are performed at the MN15 level of theory associated with the aug-cc-pVDZ basis set. For deep understanding of binding patterns in solvated ferrous ion in water-ammonia mixture solvent, noncovalent interactions are presen
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The paper is focused on biological activity and theoretical study of the structure and properties of a new azo derivative of β-diketones and its complexes with some metals. The aim of our work was to study the structure and properties of the newly synthesized compound as well as to theoretically determine the possibility of complex formation with the Cu(II) or Co(II) ions. A compound with the same substituents R1=R2=CH3 was chosen for the study. A synthesized azo compound based on 4-amino antipyrine and its complexes with Cu(II), Co(II) in solution and solid phase is reported. The structures o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This paper reviews our historical developments of broken-symmetry (BS) and beyond BS methods that are applicable for theoretical investigations of metalloenzymes such as OEC in PSII. The BS hybrid DFT (HDFT) calculations starting from high-resolution (HR) XRD structure in the most stable S1 state have been performed to elucidate structure and bonding of whole possible intermediates of the CaMn4Ox cluster (1) in the Si (i = 0 ~ 4) states of the Kok cycle. The large-scale HDFT/MM computations starting from HR XRD have been performed to elucidate biomolecular system structures which are crucial f
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Interactions between mutations (epistasis) can add substantial complexity to genotype-phenotype maps, hampering our ability to predict evolution. Yet, recent studies have shown that the fitness effect of a mutation can often be predicted from the fitness of its genetic background using simple, linear relationships. This phenomenon, termed global epistasis, has been leveraged to reconstruct fitness landscapes and infer adaptive trajectories in a wide variety of contexts. However, little attention has been paid to how patterns of global epistasis may be affected by environmental variation, despi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The singlet oxygen generation by electronically excited molecules in photodynamic therapy (PDT) requires light absorption within a specific wavelength window, and a subsequent intersystem crossing transition to a triplet excited state that is, at least, 0.98 eV higher in energy than the singlet ground state. Tetrapyrrolic macrocycles, such as porphyrin and corrole, have been widely used in oxygen singlet generation for PDT. Suitable functionalization can potentialize these macrocycles as photosensitizers. In this contribution, we use Density Functional Theory (DFT) calculations to determine th
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The most prevalent sensory disease in humans is deafness. A variety of genes have been linked to hearing loss, which can either be isolated (non-syndromic) or associated with lesions in other organs (syndromic). It has been discovered that WHRN variants are responsible for non-syndromic hearing loss and Usher syndrome type II.
METHODS AND RESULTS: Exome sequencing in a consanguineous Moroccan patient with severe hearing loss identified a single homozygous mutation c.619G > T; p.Ala207Ser in WHRN, encoding a cytoskeletal scaffold protein that binds membrane protein complexes to the
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This paper demonstrates the metal ion effects on the quercetin 2,4-dioxygenase (2,4-QD)-like reactivity. For this purpose, a series of five metal(II)-acetato complexes [MII(L)(OAc)] {M = Mn (1OAc), Co (2OAc), Ni (3OAc), Cu (4OAc), Zn (5OAc); OAc = acetate} supported with a newly designed N3O-donor carboxylato ligand L- {L- = 2-((benzyl((6'-methyl-[2,2'-bipyridin]-6-yl)methyl)amino)methyl)benzoate} has been synthesised as models for the active sites of MII-substituted 2,4-QDs. The enzyme-substrate (ES) model complexes [MII(L)(fla)] {M = Mn (1fla), Co (2fla), Ni (3fla), Cu (4fla), Zn (5fla); fla
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Late-stage modification of drug molecules is a fast method to introduce diversity into the already biologically active scaffold. A notable number of analogs of mefloquine, chloroquine, and hydroxychloroquine have been synthesized, starting from the readily available active pharmaceutical ingredient (API). In the current review, all the modifications sites and reactivity types are summarized and provide insight into the chemistry of these molecules. The approaches include the introduction of simple groups and functionalities. Coupling to other drugs, polymers, or carriers afforded hybrid compou
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three compounds based on Ge-V-O clusters were hydrothermally synthesized and characterized by IR, UV-Vis, XRD, ESR, elemental analysis and X-ray crystal structural analysis. Both [Cd(phen)(en)]2[Cd2(phen)2V12O40Ge8(OH)8(H2O)]∙12.5H2O (1) and [Cd(DETA)]2[Cd(DETA)2]0.5[Cd2(phen)2V12O41Ge8(OH)7(0.5H2O)]∙7.5H2O (2) (1,10-phen = 1,10-phenanthroline, en = ethylenediamine, DETA = diethylenetriamine) are the first Ge-V-O cluster compounds containing aromatic organic ligands. Compound 1 is the first dimer of Ge-V-O clusters, which is linked by a double bridge of two [Cd(phen)(en)]2+. Compound 2 exhibit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The protease activities are tightly regulated by inhibitors and dysregulation contribute to pathological processes such as cancer and inflammatory disorders. Tissue factor pathway inhibitor 2 (TFPI-2) is a serine proteases inhibitor, that mainly inhibits plasmin. This protease activated matrix metalloproteases (MMPs) and degraded extracellular matrix. Other serine proteases are implicated in these mechanisms like kallikreins (KLKs). In this study, we identified for the first time that TFPI-2 is a potent inhibitor of KLK5 and 12. Computer modeling showed that the first Kunitz domain of TFPI-2 c
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While the pervasiveness of allostery in proteins is commonly accepted, we further show the generic nature of allosteric mechanisms by analyzing here transmembrane ion-channel viroporin 3a and RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) from SARS-CoV-2 along with metabolic enzymes isocitrate dehydrogenase 1 (IDH1) and fumarate hydratase (FH) implicated in cancers. Using the previously developed structure-based statistical mechanical model of allostery (SBSMMA), we share our experience in analyzing the allosteric signaling, predicting latent allosteric sites, inducing and tuning targeted allosteric resp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) is a progressive neurodegenerative disorder and the leading cause of dementia worldwide. The limited pharmacological approaches based on cholinesterase inhibitors only provide symptomatic relief to AD patients. Moreover, the adverse side effects such as nausea, vomiting, loss of appetite, muscle cramps, and headaches associated with these drugs and numerous clinical trial failures present substantial limitations on the use of medications and call for a detailed insight of disease heterogeneity and development of preventive and multifactorial therapeutic strategies on u
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is a growing concern for male reproductive health as studies suggest that there is a sharp increase in prostate cancer and other fertility related problems. Apart from lifestyle, pollutants are also known to negatively affect the reproductive system. In addition to many other compounds that have been shown to alter androgen signaling, several environmental pollutants are known to disrupt androgen signaling via binding to androgen receptor (AR) or indirectly affecting the androgen synthesis. We analyzed here the molecular mechanism of the interaction between the human AR Ligand Binding Do
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bis(aminoacidato)copper(II) [CuII(aa)2] coordination compounds are the physiological species of copper(II) amino acid compounds in blood plasma. Since there are no experimental data in the literature about the geometries that physiological CuII(aa)2 could form with l-cysteine (Cys), that is, for bis(l-cysteinato)copper(II) [Cu(Cys)2] and the ternary (l-histidinato)(l-cysteinato)copper(II) [Cu(His)(Cys)], this paper computationally examines the possible conformations that the two compounds could form with the Cys ligand having a protonated sulfur, as in the conventional zwitterion, which was de
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this theoretical study, quantum chemical analysis of five novel non-fullerene donor molecules designed from recently reported highly efficient (11.5%) donor molecule P2TBR, containing non-fused ring central thiophene-benzene-thiophene core, 2-D benzodithiophene donors, and end capped 3-methylrhodanine acceptors, has been performed to evaluate the photovoltaic parameters and their application in organic solar cells. These donor molecules consist of centrally introduced acrylonitrile acceptors in between thiophene-benzene-thiophene core of P2TBR, namely M1. Compounds M2-M5 were designed from
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Virus-Like Particles (VLPs) have been used as immunogenic molecules in numerous recombinant vaccines. VLPs can also serve as vaccine platform to exogenous antigens, usually peptides incorporated within the protein sequences which compose the VLPs or conjugated to them. We herein described the conjugation of a synthetic tetrasaccharide mimicking the Streptococcus pneumoniae serotype 14 capsular polysaccharide to recombinant adenoviral type 3 dodecahedron, formed by the self-assembling of twelve penton bases and investigated the induced immune response when administered subcutaneously (s.c.). Wh
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования