TUB is the first identified member of the TULP family of four proteins with unknown function. A spontaneous mutation in murine tub causes retinal degeneration, obesity, and deafness. Mutations in another member of the TULP family, TULP1, are a cause of autosomal recessive retinitis pigmentosa (RP). These findings prompted us to investigate TUB as a candidate gene for RP and Leber congenital amaurosis (LCA). A mutation screen of the entire coding region of the TUB gene in 159 unrelated patients with autosomal recessive RP, 114 unrelated patients with simplex RP, and 21 unrelated patients with L
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Several high-throughput studies have described gene expression in the central nervous system (CNS), and recently there has been increasing interest in analyzing how gene expression compares in different regions of the CNS. As the retina is often used as a model system to study CNS development and function, we compared retina and brain gene expression using microarray analyses.
METHODS: Mouse retina, brain and liver RNA was hybridized to a custom cDNA microarray containing 5,376 genes and ESTs, and the data from the quantified scanned images were analyzed using Bioconductor and SAM. P
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lafora's disease is a progressive myoclonus epilepsy with pathognomonic inclusions (polyglucosan bodies) caused by mutations in the EPM2A gene. EPM2A codes for laforin, a protein with unknown function. Mutations have been reported in the last three of the gene's exons. To date, the first exon has not been determined conclusively. It has been predicted based on genomic DNA sequence analysis including comparison with the mouse homologue.
OBJECTIVES: 1) To detect new mutations in exon 1 and establish the role of this exon in Lafora's disease. 2) To generate hypotheses about the biolo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plasminogen activator inhibitor 1 (PAI-1) is sensitive to oxidative inactivation, and it has been suggested that specific oxidation of a methionine residue, Met347, situated in the P1' position of the reactive center may be the cause of the inactivation. To test this hypothesis we have purified and biochemically characterized mutant proteins of PAI-1 in which Met347 and either of two other methionines, Met266 or Met354, has been replaced with oxidation-resistant valine residues. The mutant proteins were found to be equally sensitive to oxidation as wild-type PAI-1, suggesting that a specific o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we report on two different GJA8 variants related to congenital eye anomalies in two unrelated families, respectively. GJA8 (or Cx50) encoding a transmembrane protein to form lens connexons has been known as a common causative gene in congenital cataracts and its variants have recently been reported related to a wide phenotypic spectrum of eye defects. We identified two GJA8 variants, c.134G>T (p.Try45Leu, W45L) detected in a cataract family by Sanger sequencing and c.281G>A (p.Gly94Glu, G94E) found in a family with severe eye malformations including microphthalmia by whole-exome
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We isolated and sequenced cDNA clones corresponding to two storage proteins (HcSP-1 and HcSP-2) from fall webworm, Hyphantria cunea. The cDNAs for HcSP-1 (2,337 bp) and HcSP-2 (2,572 bp) code for 753 and 747 residue proteins with predicted molecular masses of 88.3 and 88.5 kDa, respectively. The calculated isoelectric points are pI = 8.4 (HcSP-1) and 7.6 (HcSP-2). Multiple alignment analysis of the amino acid sequence revealed that HcSP-1 is most similar to SL-1 from S. litura (73.8% identity) and other methionine-rich hexamers, whereas HcSP-2 is most similar to the SL-2 alpha subunit from S.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloidosis are a group of diseases in which soluble proteins aggregate and deposit in fibrillar conformation extracellularly in tissues. The effectiveness of therapeutic strategies depends on the specific protein involved, being crucial to accurately determine its nature. Moreover, following the diagnosis, the search for the mutation within relatives allows the clinical advice. Here we report the precise diagnosis and explored the possible reasons of the structural pathogenicity for a renal amyloidosis related to a fibrinogen Aα-chain variant. Whole-exome sequencing and GATK calling pipeline
СтатьяКлинический случайПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plasmodium falciparum causes malaria, which is an infectious and fatal disease. In early days, malaria-infected cells were diagnosed using a microscope. owing to a huge number of instances for analysis and intricacy of time, it may lead to false detection. Automated parasite detection technologies are in high demand due to increased time consumption and erroneous detection. To create effective cures and treatments, it is critical to use an accurate approach for predicting malaria parasite. Here, numerous protein sequences formulation techniques namely: discrete methods, Biochemical, physiochem
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In recent years, the emergence of avian orthoreovirus (ARV) has caused significant losses to the poultry industry worldwide. In this study, a novel ARV isolate, designated as AHZJ19, was isolated and identified from domestic chicken with viral arthritis syndrome in China. AHZJ19 can cause typical syncytial cytopathic effect in the chicken hepatocellular carcinoma cell line, LMH. High-throughput sequencing using Illumina technology revealed that the genome size of AHZJ19 is about 23,230 bp, which codes 12 major proteins. Phylogenetic tree analysis found that AHZJ19 was possibly originated from
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mammalian cell expresses thousands of long noncoding RNAs (lncRNAs) that are longer than 200 nucleotides but do not encode any protein. lncRNAs can change the expression of protein-coding genes through both cis and trans mechanisms, including imprinting and other types of transcriptional regulation, and posttranscriptional regulation including serving as molecular sponges. Deep sequencing, coupled with analysis of sequence characteristics, is the primary method used to identify lncRNAs. Physiological roles of specific lncRNAs can be examined using genetic targeting or knockdown with modifi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite the major role of Gag in establishing resistance of HIV-1 to protease inhibitors (PIs), very limited data are available on the total contribution of Gag residues to resistance to PIs. To identify in detail Gag residues and structural interfaces associated with the development of HIV-1 resistance to PIs, we traced viral evolution under the pressure of PIs using Gag-protease single genome sequencing and coevolution analysis of protein sequences in 4 patients treated with PIs over a 9-year period. We identified a total of 38 Gag residues correlated with the protease, 32 of which were outs
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A case of anaphylaxis following a bite from a Siberian hamster (SH; Phodopus sungorus) is described. Skin prick tests with hair, urine and salivary gland extracts from SH were positive, while the tests were negative for hair extracts from other rodents. IgE immunoblotting with the patient serum revealed 3 IgE-binding bands of about 18, 21 and 23 kDa. When the patient's serum was preincubated with rabbit, mouse and gerbil hair extracts, no inhibition of the 3 SH IgE-binding bands was demonstrated. Proteins extracted from the 3 bands were analyzed by N-terminal sequencing and matrix-assisted las
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gustatory receptor (Gr) protein family contains most of the diversity in the insect chemoreceptor superfamily, including within it not only taste receptors but select olfactory receptors as well. Manual annotation of the Gr family in the genome sequence of the yellow-fever mosquito, Aedes aegypti, yielded a total of 114 potential proteins encoded by 79 genes. In the sequenced genome, 23 of these genes and protein isoforms are pseudogenic, leaving 91 putatively functional Grs. Comparison with our previously published set of 76 Grs encoded by 52 genes in the distantly related Anopheles gambi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Photobacterium damselae subsp. piscicida is the causative agent of fish pasteurellosis, a severe disease affecting cultured marine fish worldwide. In this study, suppression subtractive hybridization was used to identify DNA fragments present in the virulent strain PC554.2, but absent in the avirulent strain EPOY 8803-II. Twenty-one genomic regions of this type (that included twenty-six distinct putative ORFs) were analysed by DNA sequencing. Twenty ORFs encoded proteins with homology to proteins in other bacteria, including four homologues involved in siderophore biosynthesis, and four homolo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleotide excision repair (NER) is the most flexible of all known DNA-repair mechanisms, and XPG is a 3'-endonuclease that participates in NER. Mutations in this gene (ERCC5) may result in the human syndrome xeroderma pigmentosum (XP) and, in some cases, in the complex phenotype of Cockayne syndrome (CS). Two Brazilian XP siblings, who were mildly affected, were investigated and classified into the XP-G group. The cells from these patients were highly ultraviolet (UV) sensitive but not sensitive to photosensitized methylene blue, an agent that causes oxidative stress. This phenotype is in con
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The study intended to define the underlying genetic defects for 21 index patients affected with different forms of anterior segment dysgenesis. Sequence analysis for the PAX6, PITX2, FOXC1, and CYP1B1 genes has been implemented for this purpose.
METHODS: Ten patients affected with Peters anomaly, 8 with Rieger anomaly, and 3 with aniridia were included in this study. All patients underwent a complete eye examination, including anterior segment evaluation, with slit-lamp microsocopy, fundoscopy, tonography, and gonioscopy. Twenty-one intronic primer pairs were used to amplify the codi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The relationship between amino acid sequences of the β-hairpin structures and amyloidogenic β-arcade-forming motifs are of special interest because, similar to amyloid fibrils, most of the β-hairpin repeat (BHR) structures have the so-called cross-β arrangement. Moreover, β-hairpin is considered as a probable intermediate structure in amyloidogenesis. In this work, a bioinformatics sequence analysis of the known BHR structures is performed in search of amylodogenic motifs able to form β-arcade fibrils. The analysis shows that the occurrence of the predicted β-arcade motifs in the BHR regions i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Experiments involving mass spectrometry (MS)-based proteomics are widely used for analyses of connective tissues. Common examples include the use of relative quantification to identify differentially expressed peptides and proteins in cartilage and tendon. We are working on characterising so-called 'neopeptides', i.e. peptides formed due to native cleavage of proteins, for example under pathological conditions. Unlike peptides typically quantified in MS workflows due to the in vitro use of an enzyme such as trypsin, a neopeptide has at least one terminus that was not due to the use of trypsin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования