Single-cell ATAC-sequencing enables high-resolution mapping of cell states and their putative regulatory elements. The enrichment of genome-wide association study (GWAS) signals within context-specific regulatory regions can reveal disease-relevant cell populations. We present Single-Cell ATAC-seq Disease Score (SCADS), a computational framework that integrates GWAS summary statistics with scATAC-seq data to prioritize disease-relevant cells. SCADS produces calibrated, cell-level scores that are comparable across datasets and traits by: (i) identifying chromatin co-regulatory regions via topic
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cataracts are the leading cause of vision loss worldwide. Despite surgery being the only effective treatment, its economic burden highlights the necessity of exploring the pathogenesis of cataracts. In this study, we analyzed 4 large-scale GWAS (genome-wide association study) datasets for cataracts and performed SMR analysis along with heterogeneity in dependent instruments (HEIDI) testing to explore the effects of methylation, expression, and protein QTLs on cataracts. We further validated shared genetic variants through COLOC analysis. Additionally, we searched datasets related to cataracts
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell dynamics and biological function are governed by intricate networks of molecular interactions. Inferring these interactions from data is a notoriously difficult inverse problem. Most existing network inference methods construct population-averaged representations of gene interaction networks, and they do not naturally allow us to infer differences in interaction activity across heterogeneous cell populations. We introduce locaTE, an information theoretic approach that leverages single-cell, dynamical information, together with geometry of the cell-state manifold, to infer cell-specific, c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Accurate classification of meningioma brain tumors is crucial for determining the appropriate treatment plan and improving patient outcomes. However, this task is challenging due to the slow-growing nature of these tumors and the potential for misdiagnosis. Additionally, deep learning models for tumor classification often require large amounts of labeled data, which can be costly and time-consuming to obtain, especially in the medical domain.
OBJECTIVE: Our main aim is to enhance Meningioma Tumor Classification Accuracy.
METHOD: This study proposes a multi-task learning (MTL) app
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background and Objectives: The growing academic interest within the biomedical sciences regarding the diagnostic capabilities of multimodal language models, such as ChatGPT-4o, is clear. However, their ability to interpret oral clinical images remains insufficiently explored. This exploratory pilot study aimed to provide preliminary observations about the diagnostic validity of ChatGPT-4o in identifying oral squamous cell carcinoma (OSCC), oral leukoplakia (OL), and oral lichen planus (OLP) using only clinical photographs, without the inclusion of additional clinical data. Materials and Method
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
California data demonstrate failures in latent tuberculosis screening to prevent progression to tuberculosis disease. Therefore, we developed a clinical risk prediction model for tuberculosis disease using electronic health records. This study included Kaiser Permanente Southern California and Northern California members ≥18 years during 2008-2019. Models used Cox proportional hazards regression, Harrell's C-statistic, and a simulated TB disease outcome accounting for cases prevented by current screening which includes both observed and simulated cases. We compared sensitivity and number-neede
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Chronic pain is defined as pain that persists or recurs for more than 3 months. This study focuses on neuropathic pain (NP) and fibromyalgia (FM) which are chronic pain states, and aims to identify lifestyle habits associated with their prevalence. Other neurological disorders are also analyzed as references.
METHODS: Association between the variable referring to disease prevalence (number of claims for reimbursement of marker drugs) and the variable for lifestyle habits/health examination results (collected from insured individuals aged 40-74 years) was determined by analyzing Ja
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objectives. To determine the effect of heat waves on emergency department (ED) visits for individuals experiencing homelessness and explore vulnerability factors. Methods. We used a unique highly detailed data set on sociodemographics of ED visits in San Diego, California, 2012 to 2019. We applied a time-stratified case-crossover design to study the association between various heat wave definitions and ED visits. We compared associations with a similar population not experiencing homelessness using coarsened exact matching. Results. Of the 24 688 individuals identified as experiencing homeless
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The hippocampus with varying degrees of atrophy was a crucial neuroimaging feature resulting in the declining memory and cognitive function in Alzheimer's disease (AD). However, the abnormal dynamic functional connectivity (DFC) in both white matter (WM) and gray matter (GM) from the left and right hippocampus remains unclear.
OBJECTIVE: To explore the abnormal DFC within WM and GM from the left and right hippocampus across the different stages of AD.
METHODS: Current study employed the OASIS-3 dataset including 43 mild cognitive impairment (MCI), 71 pre-mild cognitive impairment
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Skin cutaneous melanoma (SKCM) is a prevalent skin cancer whose metastatic form is dangerous due to its high morbidity and mortality. Previous studies have systematically established the vital role of oxidative stress (OS) in melanoma progression. This study aimed to identify prognostic OS genes closely associated with SKCM and illustrate their potential mechanisms. Transcriptome data and corresponding clinical traits of patients with SKCM were retrieved from The Cancer Genome Atlas and Gene Expression Omnibus databases. A weighted gene co-expression network analysis was conducted to identify
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neurofeedback (NF) aptitude, which refers to an individual's ability to change brain activity through NF training, has been reported to vary significantly from person to person. The prediction of individual NF aptitudes is critical in clinical applications to screen patients suitable for NF treatment. In the present study, we extracted the resting-state functional brain connectivity (FC) markers of NF aptitude, independent of NF-targeting brain regions. We combined the data from fMRI-NF studies targeting four different brain regions at two independent sites (obtained from 59 healthy adults and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Working memory is a basic human cognitive function. However, the genetic signatures and their biological pathway remain poorly understood. In the present study, we tried to clarify this issue by exploring the potential associations and pathways among genetic variants, brain morphometry and working memory performance. We first carried out association analyses between 2-back accuracy and 212 image-derived phenotypes from 1141 Human Connectome Project (HCP) subjects using a linear mixed model (LMM). We found a significantly positive correlation between the left cuneus volume and 2-back accuracy (
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Somatic mutations arise randomly or are induced by environmental factors, which may increase the risk of Alzheimer's disease (AD). Identifying somatic mutations in sporadic AD (SAD) may provide new insight of the disease. To evaluate the potential contribution of somatic single nucleotide variations (SNVs), particularly that of well-known AD-candidate genes, we investigated sequencing data sets from four platforms: whole-genome sequencing (WGS), deep whole-exome sequencing (WES) on paired brain and liver samples, RNA sequencing (RNA-seq), and single-cell whole-genome sequencing (scWGS) of brai
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cerebrovascular reactivity (CVR), defined here as the Blood Oxygenation Level Dependent (BOLD) response to a CO2 pressure change, is a useful metric of cerebrovascular function. Both the amplitude and the timing (hemodynamic lag) of the CVR response can bring insight into the nature of a cerebrovascular pathology and aid in understanding noise confounds when using functional Magnetic Resonance Imaging (fMRI) to study neural activity. This research assessed a practical modification to a typical resting-state fMRI protocol, to improve the characterization of cerebrovascular function. In 9 health
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Developmental stuttering is a speech disorder characterized by disruption in the forward movement of speech. This disruption includes part-word and single-syllable repetitions, prolongations, and involuntary tension that blocks syllables and words, and the disorder has a life-time prevalence of 6-12%. Within Vanderbilt's electronic health record (EHR)-linked biorepository (BioVU), only 142 individuals out of 92,762 participants (0.15%) are identified with diagnostic ICD9/10 codes, suggesting a large portion of people who stutter do not have a record of diagnosis within the EHR. To identify ind
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Seasonal affective disorder (SAD) famously follows annual cycles, with incidence elevation in the fall and spring. Should some version of cyclic annual pattern be expected from other psychiatric disorders? Would annual cycles be similar for distinct psychiatric conditions? This study probes these questions using 2 very large datasets describing the health histories of 150 million unique U.S. citizens and the entire Swedish population. We performed 2 types of analysis, using "uncorrected" and "corrected" observations. The former analysis focused on counts of daily patient visits associated with
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Intrauterine inflammation affects short- and long-term neonatal outcomes. Histological chorioamnionitis and funisitis are acute inflammatory responses in the fetal membranes and umbilical cord, respectively. Although labor dystocia includes a potential risk of intrauterine inflammation, the risk of histological chorioamnionitis and funisitis of labor dystocia has not been evaluated yet. This study aimed to examine the association between labor dystocia and risk of histological chorioamnionitis and funisitis.
METHODS: In this retrospective cohort study, the cases who underwent hist
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A mesoscale network model is proposed for the development of spike and wave discharges (SWDs) in the cortico-thalamo-cortical (C-T-C) circuit. It is based on experimental findings in two genetic models of childhood absence epilepsy-rats of WAG/Rij and GAERS strains. The model is organized hierarchically into two levels (brain structures and individual neurons) and composed of compartments for representation of somatosensory cortex, reticular and ventroposteriomedial thalamic nuclei. The cortex and the two thalamic compartments contain excitatory and inhibitory connections between four populati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A unique feature of thymomas is their unrivaled frequency of associated myasthenia gravis (MG). Previous studies reported that MG+ thymomas contain a larger number of mature "pre-emigrant" CD4+ T cells than MG- thymomas and that most thymomas do not contain AIRE expressing cells irrespective of MG status. These findings suggest that CD4+ T cells that mature inside the abnormal microenvironment of thymomas and egress to the blood are critical to the development of thymoma-associated MG (TAMG) irrespective of thymoma histotype. However, underlying mechanisms have remained enigmatic. To get hints
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To evaluate the effect of providing a greater percentage of therapy as contextualized treatment on acute traumatic brain injury (TBI) rehabilitation outcomes.
DESIGN: Propensity score methods are applied to the TBI Practice-Based Evidence (TBI-PBE) database, a database consisting of multi-site, prospective, longitudinal observational data.
SETTING: Acute inpatient rehabilitation.
PARTICIPANTS: Patients enrolled in the TBI-PBE study (N=1843), aged 14 years or older, who sustained a severe, moderate, or complicated mild TBI, received their first inpatient rehabilitation facility ad
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования