Airway smooth muscle (ASM) is a key determinant of airway caliber and a major contributor to structural remodeling in obstructive lung diseases, including asthma and COPD. ASM proliferation is regulated by transcriptional and post-transcriptional mechanisms, including ubiquitin-dependent protein turnover mediated by E3 ubiquitin ligases. Here, we investigated the role of the RING-type E3 ligase RNF145 in mitogenic signaling and ASM cell proliferation. Human ASM cells were transfected with RNF145 shRNA or treated with the E3 ligase inhibitor SMER3, followed by stimulation with fetal bovine seru…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lung cancer remains one of the most lethal and prevalent malignancies worldwide. Although E3 ubiquitin ligase SYVN1 is frequently amplified in lung cancer, its functional role has not been fully elucidated. This study investigates the mechanistic involvement of SYVN1 in regulating the GATA3/NRP1 axis in A549 cells to provide novel insights into potential therapeutic strategies for lung cancer. Expression levels of SYVN1 were assessed in BEAS-2B, A549, NCI-H647, NCI-H2170, and NCI-H520, NCI-H69 cells. Functional assays were conducted after overexpressing or silencing SYVN1, GATA3, and/or NRP1 i
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The binding of PROTACs to their partner ubiquitin E3 ligase (E3) and a protein of interest (POI) is critical for PROTAC development and validation. Characterization of PROTAC complexes by cryo-electron microscopy and X-ray crystallography is not always feasible, especially where species may be transient and protein structures may not resolve due to flexible domains or intrinsically disordered regions or where the air-water interface poses risks such as dissociation. More routine biophysical methods with broader applicability to varied samples are essential to support the rapidly expanding targ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stress-associated proteins (SAPs), a class of zinc-finger proteins, play crucial roles in plant responses to abiotic stresses, including high temperature; however, their underlying mechanism is largely unknown. Here, we report that a heat-induced E3 ubiquitin ligase OsSAP3 negatively regulates thermotolerance in rice (Oryza sativa) by specifically interacting with the small heat shock protein OsHSP16. Knockout of OsSAP3 improves seedling survival and maintains grain-setting rates under heat stress. OsSAP3 ubiquitinates the lysine residues K128 and K145 in OsHSP16 to regulate its stability. Unl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Electrostatic interactions between arginines and phosphates are central to numerous biological processes. Here, using an integrated approach combining mutagenesis, activity measurements, molecular dynamics (MD) simulations, and NMR, we demonstrate that arginines present in the C-terminal domain of Biotin protein ligase (BPL) are critical for biotinyl-5'-AMP formation. Using NMR-based assays and a group I BPL from Leishmania major (LmBPL), we selectively monitored the first biotinylation step, i.e., formation of biotinyl-5'-AMP from biotin and ATP. The distinct chemical shifts of ATP and AMP en
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The carboxyl terminus of Hsp70-interacting protein (CHIP, encoded by STUB1) combines co-chaperone and E3 ubiquitin ligase activities to regulate protein quality control. Heterozygous mutations in STUB1 cause spinocerebellar ataxia type 48 (SCA48), a progressive cerebellar ataxia with variable extrapyramidal and cognitive features. To understand the molecular basis of this variability, we systematically analyzed 13 SCA48-associated variants spanning the TPR and U-box domains through recombinant protein biochemistry and cellular models. TPR variants retained intrinsic ligase activity but showed
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Seizure is one of the common comorbidities in Alzheimer's disease (AD). Seizures in AD have been shown to occur more often with early-onset disease, particularly when there is a familial presenilin I (PS1) mutation or abnormal expression of amyloid precursor protein (APP). AD patients with seizures have been associated with a faster decline in cognitive functions. However, it remains unclear how seizures exacerbate neurodegeneration in AD. Here, we showed that, using a kainic acid-induced acute seizure model, mitochondrial function is enhanced and the reactive oxygen species (ROS) are reduced
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cellular responses to amino acid fluctuations often hinge on ubiquitin-mediated control of metabolic enzymes, yet the underlying E3 ligase pathways remain poorly defined. Using quantitative proteomics and active cullin-RING ligase (CRL) profiling, we identify LRRC58 as a cysteine-responsive substrate receptor whose stability increases sharply under cysteine starvation. Proteomics reveals an inverse relationship between LRRC58 and the metabolic enzyme cysteine dioxygenase 1 (CDO1), suggesting a cysteine-linked regulatory axis. Biochemical reconstitution and cryo-EM structures show that LRRC58 f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The RING-type E3 ubiquitin ligase plays a significant role in plant responses and adaptations to abiotic stresses such as drought. However, few studies have explored the role of E3 ubiquitin ligases in potato drought stress, especially DRIP1. In this study, 172 StHCa genes were identified across the potato genome. These genes were unevenly distributed on twelve chromosomes and divided into six subclades (group I-VI). The molecular weight of potato HCa proteins ranges from 5445.38 to 143,293.69 Da. More than half of them are acidic proteins and most are unstable. There are 161 hydrophilic prote…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Regulator of Cullins 1 (ROC1) or RING box protein-1 (RBX1) is an essential component of the largest multiunit Cullin-RING ubiquitin ligase (CRL). Previous studies demonstrated that ROC1 is frequently overexpressed in multiple malignancies, which predicts advanced cancer stages and poor prognosis. However, the molecular mechanisms driving ROC1 overexpression in cancers remain largely unknown. Herein, we reveal that HSP90 binds to ROC1 with its N-Terminus, thus promoting ROC1 stabilization. HSP90 inhibition with the N-Terminal, but not the C-Terminal inhibitors accelerate ROC1 destabilizatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The carboxyl-terminus of Hsp70-interacting protein (CHIP) plays crucial roles in tumorigenesis and immunity, with previous studies suggesting a double-edged sword in thyroid cancer. However, its precise functions and underlying molecular mechanisms in thyroid cancer remained unclear. Here, we demonstrate through immunohistochemistry (IHC) that CHIP expression progressively increases from normal thyroid tissue to primary papillary thyroid carcinoma (PTC) and lymph node metastases, with CHIP levels positively correlating with lymph node metastasis (P = 0.006). Moreover, CHIP overexpression enhan
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To explore potential biomarkers in the progression of intrahepatic cholangiocarcinoma (ICC), the gene expression profiles in ICC and paired normal tissues were analyzed using mRNA sequencing. E3 ubiquitin ligase tripartite motif containing 47 (TRIM47) was found highly expressed in ICC tissues (log2 fold change = 2.473, p < 0.001), which was also observed in seven ICC samples compared with paired normal tissues. Patients with higher TRIM47 expression exhibited shorter disease-free survival period. Functional studies indicated that TRIM47 knockdown in ICC cells suppressed cell growth in vitro an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The pathogen Staphylococcus aureus threatens clinical and public health. Vancomycin, a former last-resort treatment, has waning efficacy against resistant strains (VISA) that alter their cell envelope using enzymes like VraA. However, the specific functional mechanism of VraA in VISA is still not understood. Here, we successfully obtained monomeric VraA and found that oleate is the optimal substrate for VraA. VraA was characterized as a peripheral membrane protein with a hydrodynamic radius of 5.7 ± 0.3 nm. Disruption of VraA significantly increased S. aureus susceptibility to vancomycin, as d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To colonize and survive in the host, bacterial pathogens like Acinetobacter baumannii must acquire zinc (Zn). To maintain Zn homeostasis, A. baumannii synthesizes proteins of the COG0523 family which are predicted to chaperone Zn to metalloproteins. Bioinformatic tools identified A. baumannii A1S_0934 as a COG0523 protein, and yeast two-hybrid screening revealed that MurD, an essential muramyl ligase, interacts with A1S_0934. As such, we have named A1S_0934 MurD interacting GTPase COG0523 (MigC). Here we show that MigC is a GTPase whose activity is stimulated upon Zn coordination to a characte
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple myeloma (MM) is a blood cancer characterized by the clonal evolution of plasma cells. In 2022, there were an estimated 118 000 MM cases and 121 000 deaths worldwide. The treatment landscape of MM has undergone a dramatic transformation in recent decades, shifting from conventional chemotherapy to more targeted approaches. In order to overcome intrinsic and acquired resistance mechanisms that frequently restrict the efficacy of single-agent therapies, drug combination strategies have been developed to simultaneously target multiple pathogenetic pathways. Building on the success of immu
Полный текст найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dysregulated tissue-resident macrophages (TRMs) contribute to the pathogenesis of inflammatory bowel disease (IBD) and multiple sclerosis (MS). Uncovering molecular regulators of the divergent role of TRMs in inflammation can advance therapeutic strategies for autoimmune disorders. Here, a significant downregulation of SMAD-specific E3 ubiquitin protein ligase 2 (SMURF2) is reported in TRMs within inflamed intestinal tissues from both IBD patients and mouse models. Notably, TRM-specific deficiency of Smurf2 significantly exacerbates TRM proliferation in dextran sulfate sodium (DSS)-induced col
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MAGEA4 is a cancer-testis antigen primarily expressed in the testes but aberrantly overexpressed in several cancers. MAGEA4 interacts with the RING ubiquitin ligase RAD18 and activates trans-lesion DNA synthesis (TLS), potentially favouring tumour evolution. Here, we employed NMR and AlphaFold2 (AF) to elucidate the interaction mode between RAD18 and MAGEA4, and reveal that the RAD6-binding domain (R6BD) of RAD18 occupies a groove in the C-terminal winged-helix subdomain of MAGEA4. We found that MAGEA4 partially displaces RAD6 from the RAD18 R6BD and inhibits degradative RAD18 autoubiquitinati
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pyroptosis has been regarded as caspase-1-mediated monocyte death that induces inflammation, showing a critical and detrimental role in the development of cerebral ischemia-reperfusion injury (IRI). MARCH1 is an E3 ubiquitin ligase that exerts potential anti-inflammatory functions. Therefore, the study probed into the significance of MARCH1 in inflammation and pyroptosis elicited by cerebral IRI. Middle cerebral artery occlusion/reperfusion (MCAO/R)-treated mice and oxygen glucose deprivation/reoxygenation (OGD/R)-treated hippocampal neurons were established to simulate cerebral IRI in vivo an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования