BACKGROUND: Invasive aspergillosis (IA) is the most common life-threatening opportunistic invasive mould infection in immunocompromised peop … ed for research into both new diagnostic tools and drug treatment strategies. Newer methods such as polymerase chain reaction (PCR) to detect fungal nucleic acids are increasingly being investigated.
OBJECTIVES: To provide an overall summary of the diagnostic accuracy of PCR-based tests on blood specimens for the diagnosis of IA in immunocompromised people.
SEARCH METHOD …
СтатьяМетаанализСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIM: Sexually transmitted infections are a very frequent and under-diagnosed cause of illness worldwide. A high number of detection methods and a large range of specimens in which sexually transmitted infections can be determined are available at the moment. Polymerase chain reaction performed on first void urine offers the advantage of being non-invasive, self-collectable and has high sensitivity and specificity. We looked to determine the frequency of Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Trichomonas vaginalis, Mycoplasma hominis, Mycoplasma genitalium and Ureaplasma u…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To assess utility of PCR in the diagnosis of bacterial corneal ulcer and to compare sensitivity and specificity of this technique with conventional laboratory methods. A prospective nonrandomized investigative study conducted on 122 eyes of presumed bacterial keratitis. Samples were collected for bacterial and fungal culture and Gram stain smear. A separate sample was taken for PCR with 26 gauge needle and was dipped directly into Eppendorff tube with lysis buffer in it. Diagnosis of culture proven bacterial keratitis was established in 53 (43.4 %) and most common bacterial isolate was staphyl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MYD88 L265P mutation has been reported in ∼90% of Waldenström's Macroglobulinemia (WM) patients and immunoglobulin M (IgM) monoclonal gammopathies of uncertain significance (MGUS), as well as in some cases of lymphoma and chronic lymphocytic leukemia. The present study aimed to develop a real-time allele-specific oligonucleotide PCR (ASO-RQ-PCR) to detect the MYD88 L265P mutation. We first evaluated the reproducibility and sensitivity of the technique with a diluting experiment of a previously known positive sample. Then, we evaluated the applicability of the methodology by analyzing 30 select
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: In this study, it was aimed to determine the prevalence of E. granulosus in the Aydın district.
METHODS: Clean and fresh faeces samples were collected off the ground from owned dogs (n=100; 25 female, 75 male) with the range of 6-16 months old. These faeces samples were obtained in 13 villages from five different locations (Centre, Söke, Çine, Bozdoğan and Kuyucak) of the Aydın district. The prevalence of E. granulosus was investigated with PCR and prior to applications of molecular techniques, faeces samples were investigated with macroscopic and floatation methods
RESULTS: E. gr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To measure the genomic DNA of ocular infectious pathogens in ocular fluids and to analyze the clinical relevance of these pathogens … eria, fungi, parasites, and viruses in collected intraocular samples were examined by comprehensive polymerase chain reaction (PCR). Samples were analyzed first by multiplex PCR and quantitative real-time PCR for human herpes viruses (HHVs) 1 through 8 and toxoplasma. Subsequently, samples were examined by broad-range real-time PCR for bacterial 16S and fungal 18S/28S ribo …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Prosthetic infection is the worst complication in joint arthroplasty. The diagnostic procedure is time consuming and in many cases … fe. Specimens were investigated with conventional culture methods and with 16S ribosomal DNA (rDNA) polymerase chain reaction (PCR) and sequencing.
RESULTS: In 123 cases, no pathogen could be identified by routine culture methods. In three of these culture-negative cases, bacteria could be identified with 16S rDNA sequencing of the removed biofilm. In 34 cases, bacteria c …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Early diagnosis of tuberculosis is important in its control. The conventional techniques like smear microscopy and culture suffer from low sensitivity for diagnosis of extra-pulmonary tuberculosis like Pleural Tuberculosis (PTB) due to paucibacillary nature of the fluid. Polymerase Chain Reaction (PCR) is presently seen as a promising alternative to conventional techniques. In this study we have evaluated IS6110 sequence based nested PCR (nPCR) for the detection of Mycobacterium tuberculosis (MTB) DNA directly from clinical samples. The results of PCR were compared with the results…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
European archives of oto-rhino-laryngology : official journal of the European Federation of Oto-Rhino-Laryngological Societies (EUFOS) : affiliated with the German Society for Oto-Rhino-Laryngology - Head and Neck Surgery2011eng
The aim of this study was to identify the presence of Helicobacter pylori in nasal polyp specimens of patients with nasal polyposis. A cross-sectional study with control group was performed on fresh tissue samples from 25 patients with nasal polyps, and 25 persons with concha bollusa (control group). Patients with symptoms of gastroesophageal reflux (GERD) were not enrolled. Samples were studied by three methods: polymerase chain reaction (PCR), culture, and urease test. All the diagnostic tests were negative for H. pylori in both the case and control groups. In conclusion, there was no associ…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aims of this study were to determine HPV in a male population and its correlation with penile gross inspection and urethral pap smears. Fifty male volunteers were included in the study; all of them were sexual partners of women with evidence of HPV-related cervical diseases. Urethral Pap smear features and polymerase chain reaction (PCR; HPV detection) of urethral samples were correlated. Statistical analyses were conducted to identify variables associated with high and low-risk HPV types. Mean age of participants was 33.14 ± 1.52 (range, 23-50 years), and the mean age for those with high …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: An early initiation of antifungal therapy in invasive fungal infections (IFIs) is critical in reducing the high mortality rate. Current diagnosis of fungal infection relies on microscopy, culture, antigen, antibody specific tests and histological diagnosis. However, these tests either lack sensitivity or specificity. There is thus the need for a rapid, specific and accurate diagnostic method.
OBJECTIVE: The aim of our study was to establish PCR for the rapid detection of Candida and Aspergillus species in clinical specimens with improved sensitivity and specificity.
MATERIALS AND
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mucopolysaccharidosis type IIID is caused by a deficiency of N-acetylglucosamine-6-sulfatase, which is one of the enzymes involved in the catabolism of heparin sulfate. Simple molecular marker assays underpin modern routine animal breeding and research activities worldwide. With the rapid growth of single nucleotide polymorphism (SNP) resources for many important animal genetic disorders, the availability of routine assays for genotyping SNPs is of increased importance. In the current study, real-time polymerase chain reaction (PCR) is demonstrated to provide a valuable approach as a rapid and…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This paper reports a quantitative real-time polymerase chain reaction (q-PCR) based on the msa2c gene and standardized with Platinum SYBR Green/ROX for the detection of Babesia bovis in cattle. The msa2c q-PCR amplified a DNA fragment with average dissociation temperature of 77.41°C (± 0.25°C). No amplification was detected when DNA from B. bigemina, A. marginale or Bos taurus was used as the template. The detection limit of the msa2c q-PCR was 1000 copies per ml of blood sample, with a linear correlation between the number of msa2c copies and threshold cycle. The comparison between msa2c q-PC…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The main aim of our study was to determine the added value of real-time polymerase chain reaction (PCR) for the diagnosis of Histoplasma capsulatum in routine biologic practice. No amplification signal was observed with the 18 non-H. capsulatum strains used to test the specificity of the protocol. The sensitivity threshold of the real-time PCR assay was about 10 fg of H. capsulatum DNA per microliter, tested with a 10-fold serial dilution of the positive control. We analyzed 348 human samples submitted for the routine diagnosis of systemic mycosis. Real-time PCR using the TaqMan system was eva…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Adenoviral keratoconjunctivitis is recognized as one of the major pathogens of ophthalmological nosocomial infection worldwide. N-Chlorotaurine (Cl-HN-CH(2)-CH(2)-SO(3)H, NCT) is the N-chloro derivative of the amino acid taurine, which is an oxidant produced by human granulocytes and monocytes during inflammatory reactions. Using conventional viral plaque assay, it was previously shown that NCT causes inactivation of several human adenovirus (HAdV) serotypes. In this study, we evaluated the antiadenoviral effect of NCT by quantitative polymerase chain reaction (PCR) methods.
METHODS:…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To create and test the complex of polymerase chain reaction-based methods for detection of pathogens vectored by ticks in clinical and environmental samples.
MATERIALS AND METHODS: Real time PCR methods with hybridization-fluorescent detection were developed for detection of tick-borne encephalitis virus, Borrelia burgdorferi sensu lato, Anaplasma phagocytophillum, Erlichia muris/E. chaffeensis, and B. miyamotoi. First four methods were combined in one assay in multiprime format. Efficacy of the assay was assessed by testing of blood samples from patients with tickborreliosis (166 patien…
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have developed an immuno-polymerase chain reaction protocol which includes a highly purified streptavidin-DNA conjugate. The protocol comprises standard ELISA methodology and washing buffers together with a real-time PCR read-out system. The conjugate was employed in both indirect and capture assay formats, which can be completed in a single day using standard laboratory equipment. The immuno-PCR is reproducible, with a larger dynamic range and a sensitivity several orders of magnitude greater than the corresponding conventional ELISA. The minimum concentration of analyte detected was of th…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To improve timely ante-mortem human rabies diagnosis, methods to detect viral RNA by TaqMan-based quantitative reverse transcriptase polymerase chain reactions (qRT-PCRs) have been developed. Three sets of two primers and one internal dual-labeled probe for each primer set that target distinct conserved regions of the rabies virus N gene were designed and evaluated. Using a collection of 203 isolates representative of the world-wide diversity of rabies virus, all three primers/probe sets were shown to detect a wide range of rabies virus strains with very few detection failures; the RABVD1 set …
Клинический случайСравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We evaluated the clinical value of polymerase chain reaction (PCR) for screening Pneumocystis carinii pneumonia (PCP) in non-HIV-infected immunocompromised patients. We retrospectively analyzed PCR and Grocott's methenamine silver (GMS) staining on 1044 clinical specimens obtained from 756 patients. Positive rates of PCR and GMS staining in sputum specimens were 21.1% and 9.5%, respectively (P < 0.01), and in bronchoalveolar lavage (BAL), specimens were 31.9% and 25.5%, respectively. Among 5 patient groups, the highest GMS staining and PCR positive rates were observed in immunosuppressed patie…
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.