In amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and frontotemporal dementia (FTD), the nuclear RNA-binding protein TDP-43 mislocalises to the cytoplasm and forms insoluble aggregates, but the mechanisms controlling this remain unclear. We define a native TDP-43 interactome in human SH-SY5Y cells and identify proteins linked to the 5-methylcytosine (m5C) RNA modification as highly enriched. Using a Drosophila model of TDP-43 pathology, we show that aberrant activity of m5C-RNA methyltransferases Nsun1 drives TDP-43-induced m5C-RNA hypermethylation, whereas Nsun1 down-regulation alleviates TDP-43-induced
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ancestral RNA polymerase III (Pol III) is a multi-subunit polymerase responsible for transcription of short non-coding RNA, such as double-stranded short interspersed nuclear elements (SINEs). Although SINE ncRNAs are generally transcriptionally repressed, they can be induced in response to viral infections and can stimulate immune signaling pathways. Indeed, mutations in RNA Pol III have been associated with poor antiviral interferon response following infection with varicella zoster virus (VZV). In this study, we probed the role of Pol III transcripts in the detection and initial immune resp
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Formaldehyde is an environmental and occupational chemical carcinogen implicated in the damage of proteins and nucleic acids. However, whether formaldehyde provokes modifications of RNAs such as 8-oxo-7,8-dihydroguanine (8-oxoG) and the role that these modifications play on conferring long-term adverse health effects remains unexplored. Here, we profile 8-oxoG modifications using RNA-immunoprecipitation and RNA sequencing (8-oxoG RIP-seq) to identify 343 RNA transcripts heavily enriched in oxidations in human bronchial epithelial BEAS-2B cell cultures exposed to 1 ppm formaldehyde for 2 h. RNA
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nod-like receptor protein 3 (NLRP3) inflammasome has been implicated in alcoholic liver disease. Chronic alcohol consumption enhances gut permeability and causes microbial translocation. The present study explored the activation of the NLRP3 inflammasome by Escherichia coli RNA in hepatic stellate cells (HSCs), and the potential role of NLRP3 inflammasome in hepatic fibrosis. E. coli RNA transfection induced HSC-T6 cells to secrete and express mature interleukin-1 beta (IL-1β), which was abolished by NLRP3 siRNA pretreatment. In addition, E. coli RNA transfection enhanced caspase-1 expression,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present study was undertaken to estimate the approximate size of nuclear regions occupied by nucleolar bodies during the cell differentiation and maturation. The differentiation and maturation of human leukemic granulocytic cells in patients suffering from the chronic phase of the chronic granulocytic leukemia (CML) represented a convenient model for such study because of the large number of cells for the diameter measurements at the single cell level. Early and advanced differentiation or maturation stages of these cells are well defined and nucleolar bodies and nuclear outlines are easil
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viruses make extensive use of host cell machinery, however, most systematic studies of virus-host interactions focused on proteins with less attention to nucleic acids. RNA plays important roles in storing, conveying, and regulating genetic information. Our understanding of functional interactions between viral and host RNA is dominated by interactions with micro-RNAs (miRNAs), such as the interaction between hepatitis C virus (HCV) and the liver specific miR-122, critical for viral replication. Methodological developments, however, allow for broader exploration of the RNA interaction landscap
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viruses encode diverse regulatory elements, but their breadth and mechanisms remain poorly defined. To address this gap, we performed massively parallel reporter assays spanning ∼200,000 genomic segments from 297 vertebrate-infecting viral genera. We identified numerous viral elements that enhance RNA stability and translation through TENT4-mediated mixed tailing, distributed across 19 genera and grouped into six distinct subclasses, indicating extensive convergent evolution. We also found diverse TENT4-independent elements acting through alternative pathways. One such element, Pt1 from Potami
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The proteinopathy of the RNA-binding protein TDP-43, characterized by nuclear clearance and cytoplasmic inclusion, is a hallmark of multiple neurodegenerative diseases, including amyotrophic lateral sclerosis (ALS), frontotemporal dementia (FTD), and Alzheimer's disease (AD). Through CRISPR interference (CRISPRi) screening in human neurons, we identified the decapping scavenger enzyme (DCPS) as a novel genetic modifier of TDP-43 loss-of-function (LOF)-mediated neurotoxicity. Our findings reveal that TDP-43 LOF leads to aberrant mRNA degradation via dysregulating the properties and activity of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA cleavage and processing are highly conserved regulatory mechanisms across bacteria. We recently discovered a novel family of RNases called YicC, conserved across all bacteria but unrelated to known RNase families. The cryo-EM structure of RNA bound to Escherichia coli YicC endonuclease suggested a clamshell-like ribonuclease mechanism for cleavage, although its exact mechanism and function remain elusive. Here, we report new cryo-EM structures that provide snapshots of the closing of the complex and also capture a surprising dimeric-RNA:protein complex. We further characterize the RNA clea
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pre-mRNA splicing is essential for gene expression. In human cells, the cap-binding complex (CBC) has long been known to facilitate first intron splicing, but it is by an unknown mechanism. The CBC also promotes early RNA decay by recruiting the nuclear exosome targeting (NEXT) complex via the linker proteins ARS2 and ZC3H18. How the CBC orchestrates these opposite activities is elusive. Here, we show that ZC3H18 interacts with three splicing factors, PRPF40A, PRP4K, and FNBP4, to stimulate first intron splicing genome wide. Linking this unexpected function of ZC3H18 to the CBC, disruption of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The eukaryotic translation elongation factor 1 (eEF1) family exhibits critical roles in RNA viral infection beyond its canonical function in protein synthesis. This review analyzes the structural characteristics of eEF1A and the eEF1B complex, and their regulatory mechanisms during viral infection. eEF1A impacts viral replication by stabilizing viral RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) complexes, modulating genomic RNA synthesis, and facilitating viral assembly through cytoskeletal regulation. eEF1B subunits contribute through enhancing viral mRNA translation, regulating nuclear transport of v
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Several cancer types have increased PFKFB3, a glycolytic enzyme for which potent inhibitors have been found. Inhibition of PFKFB3 impairs DNA repair after irradiation of cancer cells, making it a possible radiosensitization target. The SweBCG91RT trial, in which breast cancer patients were randomized to postoperative radiotherapy or not, was used to investigate PFKFB3 as a clinical marker of sensitivity to adjuvant radiotherapy.
METHODS: Nuclear protein levels of PFKFB3 were assessed with immunohistochemistry in primary breast tumors (n = 970) and whole-cell RNA levels with microa
СтатьяРандомизированное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human corneal fibroblasts (HCFs) are implicated in corneal neovascularization (CRNV). The mechanisms underlying the inflammatory response in HCFs and the development of CRNV were explored in this study. Alkali burns were applied to the corneas of rats to establish a CRNV model. The expression of long noncoding RNA (lncRNA) nuclear enriched abundant transcript 1 (NEAT1) and mRNA and protein levels of nuclear factor kappa B (NF-κB)- activating protein (NKAP) were examined by quantitative real-time (qRT-PCR) and Western blot methods, respectively. Lipopolysaccharide (LPS) is used to stimulate HCF
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA-binding proteins (RBP) are important for the initiation and resolution of inflammation, so better understanding of RBP-RNA interactions and their crosstalk with metabolism may provide alternate targets to controlling inflammation. Here we establish global RNA-protein interactome purification (GRPIp) to profile the RBP landscape in inflammatory primary macrophages and identify ribosomal RNA processing 1 (RRP1) as a suppressor of inflammatory innate responses. Mechanistically, RRP1 binds nuclear thymidylate synthetase (Tyms) transcript and decreases TYMS expression post-transcriptionally in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We previously demonstrated that the polycomb repressive complex 2 chromatin-modifying enzyme can directly transfer between RNA and DNA without a free-enzyme intermediate state. Simulations suggested that such a direct transfer mechanism may be generally necessary for RNA to recruit proteins to chromatin, but the prevalence of direct transfer capability is unknown. Herein, we used fluorescence polarization assays and observed direct transfer for several well-characterized nucleic acid-binding proteins: three-prime repair exonuclease 1, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U, Fem-3-binding fa
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding how RNA binding proteins control the splicing code is fundamental to human biology and disease. Here, we present a comprehensive study to elucidate how heterogeneous nuclear ribonucleoparticle (hnRNP) proteins, among the most abundant RNA binding proteins, coordinate to regulate alternative pre-mRNA splicing (AS) in human cells. Using splicing-sensitive microarrays, crosslinking and immunoprecipitation coupled with high-throughput sequencing (CLIP-seq), and cDNA sequencing, we find that more than half of all AS events are regulated by multiple hnRNP proteins and that some combina
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
1alpha,25-dihydroxyvitamin D(3) was examined for its ability to affect the DNA-dependent RNA polymerases (nucleosidetriphosphate:RNA nucleotidyltransferase, EC 2.7.7.6) of rachitic chick intestinal cell nuclei in vivo. Nucleoplasmic (form II) RNA polymerase activity was stimulated 2-fold (P < 0.05) within 2-3 hr after an oral dose of 0.27 mug (0.65 nmol) of 1alpha,25-dihydroxyvitamin D(3) to rachitic chicks. The form II polymerase activity returned to control values by 5-9 hr after dosing with the sterol. In contrast, the nucleolar (form I) RNA polymerase was not increased within this period.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Некоторые пикорнавирусы, например полиомиелитвирус, увеличивают двунаправленную проницаемость ядерного пакета и подавляют активный нуклеоцитоплазмический транспорт. Эти виды деятельности требуют вирусного протеза 2A(pro). Здесь мы изучали нуклеоцитоплазмический трафик в клетках, инфицированных вирусом энцефаломиокардита (EMCV; кардиовирус), у которого нет белка, связанного с полиомиелитом 2A(pro). EMCV также усилил двунаправленный нуклеоцитоплазмический трафик. Используя флуоресцентный белок «Таймер», который содержит сигнал ядерной локализации, мы показали, что цитоплазмическое накопление яде
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-I) is a human retrovirus that is etiologically linked to adult T-cell leukemia (ATL), an aggressive and fatal lymphoproliferative disease. The viral transactivator, Tax, is thought to play an important role during the initial stages of CD4+ T-cell immortalization by HTLV-1. Tax has been shown to activate transcription through CREB/ATF and NF-KB, and to alter numerous signaling pathways. These pleiotropic effects of Tax modify the expression of a wide array of cellular genes. Another viral protein encoded by HTLV-I, p30, has been shown to aff
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Silver nanoparticles (AgNPs) have been reported to inhibit specification and differentiation of erythroid cells, chromatophores, and myofibrils during zebrafish embryogenesis. However, the knowledge of biological effects of AgNPs on eye development, especially on lens development is scarce. In this study, embryos were exposed to or injected with 0.4 mg/L AgNPs, and the results indicate that no obvious morphological changes in eye formation were observed in the stressed embryos compared to the controls. However, clefts and vacuoles were observed in lens of embryos from AgNPs stressed group. Add
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования